MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	ACTTAA	2	12	1488	1499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312136231
2	NC_014658	TAGAGG	2	12	2949	2960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312136232
3	NC_014658	TTTTAA	2	12	3923	3934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136233
4	NC_014658	AACAGG	2	12	4493	4504	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312136235
5	NC_014658	TGTCTG	2	12	5972	5983	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312136237
6	NC_014658	TAAAAT	2	12	10223	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
7	NC_014658	CATCGA	2	12	13716	13727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312136244
8	NC_014658	ACATTT	2	12	14867	14878	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312136246
9	NC_014658	TAAAAA	2	12	21984	21995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136254
10	NC_014658	ATTTTT	2	12	30332	30343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136257
11	NC_014658	ATTTTT	2	12	30399	30410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136257
12	NC_014658	ATTTAC	2	12	30687	30698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312136258
13	NC_014658	ATCAAC	2	12	31156	31167	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312136258
14	NC_014658	CTATAA	2	12	31860	31871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312136258
15	NC_014658	AAATTT	2	12	32278	32289	50 %	50 %	0 %	0 %	312136258
16	NC_014658	TTTTTC	2	12	33698	33709	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136259
17	NC_014658	TGGTAT	2	12	36206	36217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312136261
18	NC_014658	TCTCCA	2	12	37356	37367	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312136263
19	NC_014658	ATTTTA	2	12	43406	43417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136272
20	NC_014658	TGACCT	2	12	45461	45472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312136274
21	NC_014658	AGTTGA	2	12	46994	47005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136274
22	NC_014658	ATGAAA	2	12	47230	47241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312136274
23	NC_014658	CAACTT	2	12	47866	47877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136276
24	NC_014658	ACCATA	2	12	50171	50182	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312136277
25	NC_014658	CTGCAG	2	12	51669	51680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312136278
26	NC_014658	GGATTT	2	12	55914	55925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312136281
27	NC_014658	AACAGA	2	12	57462	57473	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312136283
28	NC_014658	ATAAAA	2	12	59588	59599	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136286
29	NC_014658	ATTTAA	2	12	60813	60824	50 %	50 %	0 %	0 %	312136288
30	NC_014658	TAATTG	2	12	64088	64099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312136293
31	NC_014658	ATTTTT	2	12	66650	66661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136295
32	NC_014658	AAGTTG	2	12	68378	68389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136297
33	NC_014658	TTTTCT	2	12	73130	73141	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136302
34	NC_014658	TATCTT	2	12	74137	74148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136303
35	NC_014658	CTGTTT	2	12	74398	74409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312136303
36	NC_014658	TTCTTT	2	12	75338	75349	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136303
37	NC_014658	TTTTTG	2	12	77285	77296	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136304
38	NC_014658	TTTATG	2	12	78881	78892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312136306
39	NC_014658	CAGATT	2	12	79949	79960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312136307
40	NC_014658	GCCCTG	2	12	80429	80440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312136307
41	NC_014658	TTGAAA	2	12	81522	81533	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312136307
42	NC_014658	AAAGAA	2	12	83347	83358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312136309
43	NC_014658	AGGTGA	2	12	85415	85426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312136310
44	NC_014658	CATAAT	2	12	87007	87018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312136312
45	NC_014658	CTATAT	2	12	88127	88138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312136313
46	NC_014658	AGAAAA	2	12	94768	94779	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312136320
47	NC_014658	CTTTTT	2	12	95058	95069	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136321
48	NC_014658	TTTAAT	2	12	95191	95202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136321
49	NC_014658	TTTATT	2	12	98435	98446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136324
50	NC_014658	TCCAGC	2	12	100045	100056	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312136327
51	NC_014658	TATTGC	2	12	100096	100107	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312136327
52	NC_014658	ATTTCT	2	12	104454	104465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136330
53	NC_014658	CTACAT	2	12	108986	108997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136332
54	NC_014658	GCAAAT	2	12	109402	109413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312136332
55	NC_014658	TAGCAT	2	12	110020	110031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312136333
56	NC_014658	GTGGAT	2	12	112799	112810	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312136337
57	NC_014658	GAAAAA	2	12	116535	116546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312136340
58	NC_014658	AAAAGA	2	12	117764	117775	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312136341
59	NC_014658	TAGATA	2	12	118768	118779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312136342
60	NC_014658	TCTTCC	2	12	119739	119750	0 %	50 %	0 %	50 %	312136343
61	NC_014658	AAAGGA	2	12	125501	125512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136348
62	NC_014658	GATAAA	2	12	127102	127113	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312136350
63	NC_014658	AAAAAT	2	12	127275	127286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136350
64	NC_014658	TTTTTA	2	12	127676	127687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136351
65	NC_014658	TTTTAA	2	12	128544	128555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136352
66	NC_014658	TTTACT	2	12	129821	129832	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136353
67	NC_014658	TAAAAT	2	12	132939	132950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136356
68	NC_014658	TAAAAC	2	12	136992	137003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136359
69	NC_014658	ATCCAT	2	12	139662	139673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136362
70	NC_014658	AGCTAA	2	12	141739	141750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312136366
71	NC_014658	GATGGA	2	12	143102	143113	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312136368
72	NC_014658	GATAAC	2	12	144447	144458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312136372
73	NC_014658	GTAAAG	2	12	145972	145983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312136373
74	NC_014658	AAAAAT	2	12	147724	147735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136375
75	NC_014658	GGCGGA	2	12	149050	149061	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	312136375
76	NC_014658	AGATGT	2	12	149261	149272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136376
77	NC_014658	CAATTC	2	12	149944	149955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136376
78	NC_014658	TTTTTC	2	12	153762	153773	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136382
79	NC_014658	TCATTA	2	12	155211	155222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312136384
80	NC_014658	TGCAGC	2	12	156136	156147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312136385
81	NC_014658	GAAAAT	2	12	158459	158470	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312136387
82	NC_014658	CTTTTA	2	12	159080	159091	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136388
83	NC_014658	ATTCTT	2	12	159325	159336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136388
84	NC_014658	CAATTT	2	12	162268	162279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312136389
85	NC_014658	ATGCCA	2	12	163857	163868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312136389
86	NC_014658	CTTGTG	2	12	166218	166229	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312136392
87	NC_014658	TTCTTT	2	12	167028	167039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136394
88	NC_014658	TTTAAT	2	12	168344	168355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136397
89	NC_014658	ATTCTT	2	12	168538	168549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136398
90	NC_014658	GTTTTT	2	12	169343	169354	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136400
91	NC_014658	GCTTCA	2	12	170139	170150	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312136402
92	NC_014658	ATTTAT	2	12	170402	170413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136402
93	NC_014658	CCTTTA	2	12	172199	172210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312136404
94	NC_014658	ATTTTT	2	12	176268	176279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136406
95	NC_014658	TTTCTC	2	12	176402	176413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136406
96	NC_014658	TAAGTG	2	12	180619	180630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136409
97	NC_014658	AGAAGC	2	12	182090	182101	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312136410
98	NC_014658	GGAATG	2	12	184506	184517	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312136412
99	NC_014658	TATGGA	2	12	184728	184739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136412
100	NC_014658	TTTTCC	2	12	187817	187828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136415
101	NC_014658	TTTTAT	2	12	189969	189980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136417
102	NC_014658	TCTATT	2	12	190396	190407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136417
103	NC_014658	AACTGC	2	12	190515	190526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312136417
104	NC_014658	AACTCC	2	12	193696	193707	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	312136422
105	NC_014658	ATGTGC	2	12	193879	193890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312136422
106	NC_014658	ATTTAA	2	12	194860	194871	50 %	50 %	0 %	0 %	312136423
107	NC_014658	TAACAA	2	12	195349	195360	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136423
108	NC_014658	ATCAAA	2	12	196286	196297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136424
109	NC_014658	ATCTTC	2	12	196563	196574	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312136424
110	NC_014658	TTTTCT	2	12	200932	200943	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312136430
111	NC_014658	AATTCC	2	12	203755	203766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136434
112	NC_014658	TTTTGT	2	12	206683	206694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312136437
113	NC_014658	AATTAT	2	12	208934	208945	50 %	50 %	0 %	0 %	312136439
114	NC_014658	GTTATT	2	12	209932	209943	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312136440
115	NC_014658	AACTAA	2	12	210261	210272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136440
116	NC_014658	ATTTTT	2	12	211050	211061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136441
117	NC_014658	TGGTTT	2	12	211286	211297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136441
118	NC_014658	TCACAA	2	12	217335	217346	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312136445
119	NC_014658	TTAAAT	2	12	219333	219344	50 %	50 %	0 %	0 %	312136447
120	NC_014658	AAATTT	2	12	220197	220208	50 %	50 %	0 %	0 %	312136449
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236	NC_014658	TTCCAT	2	12	388659	388670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312136631
237	NC_014658	ATTTTT	2	12	390725	390736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312136633
238	NC_014658	TAATTG	2	12	394352	394363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312136636
239	NC_014658	TAAAAT	2	12	395236	395247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136637
240	NC_014658	CATATC	2	12	397752	397763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136639
241	NC_014658	GCTCTT	2	12	398315	398326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312136639
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243	NC_014658	AAAGGT	2	12	400560	400571	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312136641
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340	NC_014658	TAAAAT	2	12	564198	564209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136803
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342	NC_014658	CTAAAA	2	12	571150	571161	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312136812
343	NC_014658	TAAATG	2	12	573447	573458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312136815
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345	NC_014658	CTGTAG	2	12	574932	574943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312136816
346	NC_014658	ACAAAA	2	12	576997	577008	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312136819
347	NC_014658	ATAAAA	2	12	577270	577281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312136819
348	NC_014658	TAAAAT	2	12	579043	579054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136821
349	NC_014658	CCAGTG	2	12	581212	581223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312136824
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351	NC_014658	AGATAT	2	12	583308	583319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312136827
352	NC_014658	ATTTGA	2	12	584148	584159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312136827
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453	NC_014658	TGCAGC	2	12	754900	754911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312137008
454	NC_014658	CTCCAG	2	12	757304	757315	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312137010
455	NC_014658	ATGCTG	2	12	758928	758939	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312137012
456	NC_014658	ACATCA	2	12	759107	759118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312137012
457	NC_014658	AAAATT	2	12	762673	762684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137015
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462	NC_014658	TTTAAA	2	12	774438	774449	50 %	50 %	0 %	0 %	312137023
463	NC_014658	TTTATT	2	12	776480	776491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312137026
464	NC_014658	TAAATA	2	12	779705	779716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137030
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466	NC_014658	AAATTA	2	12	780902	780913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312137031
467	NC_014658	AGTAAA	2	12	786254	786265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312137036
468	NC_014658	TAAGTT	2	12	786472	786483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312137036
469	NC_014658	TAATGA	2	12	786608	786619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312137036
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