MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 1154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	AAAAT	2	10	1391	1400	80 %	20 %	0 %	0 %	312136231
2	NC_014658	TAACA	2	10	2049	2058	60 %	20 %	0 %	20 %	312136232
3	NC_014658	AATTA	2	10	4613	4622	60 %	40 %	0 %	0 %	312136235
4	NC_014658	CCTTT	2	10	4760	4769	0 %	60 %	0 %	40 %	312136235
5	NC_014658	CCTTT	2	10	7381	7390	0 %	60 %	0 %	40 %	312136238
6	NC_014658	ACCAT	2	10	7954	7963	40 %	20 %	0 %	40 %	312136239
7	NC_014658	TTAAG	2	10	8062	8071	40 %	40 %	20 %	0 %	312136239
8	NC_014658	ATTTA	2	10	8699	8708	40 %	60 %	0 %	0 %	312136239
9	NC_014658	AAATA	2	10	9932	9941	80 %	20 %	0 %	0 %	312136239
10	NC_014658	ACAAA	2	10	11113	11122	80 %	0 %	0 %	20 %	312136241
11	NC_014658	AAATT	2	10	11944	11953	60 %	40 %	0 %	0 %	312136242
12	NC_014658	CAAAA	2	10	12305	12314	80 %	0 %	0 %	20 %	312136242
13	NC_014658	GTTAA	2	10	12330	12339	40 %	40 %	20 %	0 %	312136242
14	NC_014658	ACGAC	2	10	12390	12399	40 %	0 %	20 %	40 %	312136242
15	NC_014658	TAAAT	2	10	16422	16431	60 %	40 %	0 %	0 %	312136248
16	NC_014658	TTTCT	2	10	17300	17309	0 %	80 %	0 %	20 %	312136249
17	NC_014658	AAAAT	2	10	18874	18883	80 %	20 %	0 %	0 %	312136251
18	NC_014658	TAAAA	2	10	19436	19445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014658	AAATA	2	10	20691	20700	80 %	20 %	0 %	0 %	312136253
20	NC_014658	AGGAG	2	10	21358	21367	40 %	0 %	60 %	0 %	312136254
21	NC_014658	AAGAA	2	10	21412	21421	80 %	0 %	20 %	0 %	312136254
22	NC_014658	ATTTT	2	10	22392	22401	20 %	80 %	0 %	0 %	312136254
23	NC_014658	AAAGT	2	10	22501	22510	60 %	20 %	20 %	0 %	312136254
24	NC_014658	AAAAT	2	10	22712	22721	80 %	20 %	0 %	0 %	312136255
25	NC_014658	ACCGG	2	10	27937	27946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014658	TATTT	2	10	29108	29117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014658	AATCC	2	10	29894	29903	40 %	20 %	0 %	40 %	312136256
28	NC_014658	TGATA	2	10	30583	30592	40 %	40 %	20 %	0 %	312136258
29	NC_014658	ATTTT	2	10	37988	37997	20 %	80 %	0 %	0 %	312136264
30	NC_014658	AAATT	2	10	40252	40261	60 %	40 %	0 %	0 %	312136267
31	NC_014658	TAAAA	2	10	41095	41104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014658	ATCAA	2	10	43303	43312	60 %	20 %	0 %	20 %	312136272
33	NC_014658	AAAAT	2	10	44108	44117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014658	AATAA	2	10	44562	44571	80 %	20 %	0 %	0 %	312136274
35	NC_014658	ATTCT	2	10	44944	44953	20 %	60 %	0 %	20 %	312136274
36	NC_014658	AAAAT	2	10	45564	45573	80 %	20 %	0 %	0 %	312136274
37	NC_014658	GATTT	2	10	46672	46681	20 %	60 %	20 %	0 %	312136274
38	NC_014658	TAACA	2	10	49488	49497	60 %	20 %	0 %	20 %	312136277
39	NC_014658	CATGT	2	10	50223	50232	20 %	40 %	20 %	20 %	312136277
40	NC_014658	TTTCA	2	10	50860	50869	20 %	60 %	0 %	20 %	312136278
41	NC_014658	CTTTT	2	10	52296	52305	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014658	TTCTT	2	10	53294	53303	0 %	80 %	0 %	20 %	312136280
43	NC_014658	CATAA	2	10	53766	53775	60 %	20 %	0 %	20 %	312136280
44	NC_014658	TATTT	2	10	54071	54080	20 %	80 %	0 %	0 %	312136280
45	NC_014658	AATGA	2	10	57718	57727	60 %	20 %	20 %	0 %	312136283
46	NC_014658	TAAAT	2	10	58759	58768	60 %	40 %	0 %	0 %	312136284
47	NC_014658	ATTGT	2	10	59757	59766	20 %	60 %	20 %	0 %	312136286
48	NC_014658	ATTCT	2	10	60344	60353	20 %	60 %	0 %	20 %	312136288
49	NC_014658	TATGT	2	10	63652	63661	20 %	60 %	20 %	0 %	312136292
50	NC_014658	ATTAT	2	10	65384	65393	40 %	60 %	0 %	0 %	312136294
51	NC_014658	TAAAG	2	10	66022	66031	60 %	20 %	20 %	0 %	312136294
52	NC_014658	CACCC	2	10	66199	66208	20 %	0 %	0 %	80 %	312136295
53	NC_014658	GCATT	2	10	67970	67979	20 %	40 %	20 %	20 %	312136297
54	NC_014658	GATAT	2	10	70282	70291	40 %	40 %	20 %	0 %	312136298
55	NC_014658	AAAAT	2	10	70510	70519	80 %	20 %	0 %	0 %	312136299
56	NC_014658	AATTT	2	10	70763	70772	40 %	60 %	0 %	0 %	312136299
57	NC_014658	ATTTT	2	10	70779	70788	20 %	80 %	0 %	0 %	312136299
58	NC_014658	ATCAA	2	10	72051	72060	60 %	20 %	0 %	20 %	312136301
59	NC_014658	CAAAA	2	10	72808	72817	80 %	0 %	0 %	20 %	312136302
60	NC_014658	AAAAT	2	10	73728	73737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014658	AAAAT	2	10	75702	75711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014658	TTTTC	2	10	76292	76301	0 %	80 %	0 %	20 %	312136304
63	NC_014658	CCTTT	2	10	77341	77350	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014658	ATCCT	2	10	78490	78499	20 %	40 %	0 %	40 %	312136306
65	NC_014658	TATTT	2	10	78809	78818	20 %	80 %	0 %	0 %	312136306
66	NC_014658	CAATA	2	10	80088	80097	60 %	20 %	0 %	20 %	312136307
67	NC_014658	TAAAA	2	10	81126	81135	80 %	20 %	0 %	0 %	312136307
68	NC_014658	CTTTC	2	10	86713	86722	0 %	60 %	0 %	40 %	312136312
69	NC_014658	ATATT	2	10	88374	88383	40 %	60 %	0 %	0 %	312136313
70	NC_014658	TCTTT	2	10	88927	88936	0 %	80 %	0 %	20 %	312136314
71	NC_014658	TGAAT	2	10	89525	89534	40 %	40 %	20 %	0 %	312136314
72	NC_014658	ATGTC	2	10	93947	93956	20 %	40 %	20 %	20 %	312136319
73	NC_014658	ATATT	2	10	95989	95998	40 %	60 %	0 %	0 %	312136322
74	NC_014658	TATAA	2	10	96442	96451	60 %	40 %	0 %	0 %	312136322
75	NC_014658	CAATC	2	10	97401	97410	40 %	20 %	0 %	40 %	312136323
76	NC_014658	TAAAT	2	10	98153	98162	60 %	40 %	0 %	0 %	312136324
77	NC_014658	TTTAT	2	10	100517	100526	20 %	80 %	0 %	0 %	312136327
78	NC_014658	AATTG	2	10	102221	102230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014658	TATAG	2	10	103937	103946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014658	TATTT	2	10	105785	105794	20 %	80 %	0 %	0 %	312136330
81	NC_014658	ATTTT	2	10	106740	106749	20 %	80 %	0 %	0 %	312136330
82	NC_014658	TTTTA	2	10	106763	106772	20 %	80 %	0 %	0 %	312136330
83	NC_014658	TATTT	2	10	107027	107036	20 %	80 %	0 %	0 %	312136330
84	NC_014658	AAAAT	2	10	107742	107751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014658	TATGC	2	10	108971	108980	20 %	40 %	20 %	20 %	312136332
86	NC_014658	GTGGC	2	10	109463	109472	0 %	20 %	60 %	20 %	312136332
87	NC_014658	AAGTT	2	10	111600	111609	40 %	40 %	20 %	0 %	312136336
88	NC_014658	TATGG	2	10	113375	113384	20 %	40 %	40 %	0 %	312136337
89	NC_014658	AAATT	2	10	116296	116305	60 %	40 %	0 %	0 %	312136339
90	NC_014658	AGATT	2	10	117980	117989	40 %	40 %	20 %	0 %	312136341
91	NC_014658	TACAT	2	10	119030	119039	40 %	40 %	0 %	20 %	312136342
92	NC_014658	TTTTC	2	10	122031	122040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014658	TTAAA	2	10	124105	124114	60 %	40 %	0 %	0 %	312136346
94	NC_014658	AGAGA	2	10	124410	124419	60 %	0 %	40 %	0 %	312136346
95	NC_014658	TATTT	2	10	124660	124669	20 %	80 %	0 %	0 %	312136347
96	NC_014658	CTTCT	2	10	124778	124787	0 %	60 %	0 %	40 %	312136347
97	NC_014658	CAAAT	2	10	125920	125929	60 %	20 %	0 %	20 %	312136348
98	NC_014658	AGAAA	2	10	127254	127263	80 %	0 %	20 %	0 %	312136350
99	NC_014658	TTTCT	2	10	128983	128992	0 %	80 %	0 %	20 %	312136353
100	NC_014658	TGTTC	2	10	129746	129755	0 %	60 %	20 %	20 %	312136353
101	NC_014658	GCATG	2	10	130031	130040	20 %	20 %	40 %	20 %	312136353
102	NC_014658	TATTT	2	10	130363	130372	20 %	80 %	0 %	0 %	312136353
103	NC_014658	GTTTT	2	10	132199	132208	0 %	80 %	20 %	0 %	312136355
104	NC_014658	ATATT	2	10	134763	134772	40 %	60 %	0 %	0 %	312136357
105	NC_014658	CCATT	2	10	135879	135888	20 %	40 %	0 %	40 %	312136358
106	NC_014658	ATATT	2	10	136778	136787	40 %	60 %	0 %	0 %	312136359
107	NC_014658	TGAAT	2	10	138769	138778	40 %	40 %	20 %	0 %	312136362
108	NC_014658	TAATA	2	10	140157	140166	60 %	40 %	0 %	0 %	312136363
109	NC_014658	TAAAA	2	10	145922	145931	80 %	20 %	0 %	0 %	312136373
110	NC_014658	TTTAT	2	10	148020	148029	20 %	80 %	0 %	0 %	312136375
111	NC_014658	AGAAA	2	10	148440	148449	80 %	0 %	20 %	0 %	312136375
112	NC_014658	TATAT	2	10	148458	148467	40 %	60 %	0 %	0 %	312136375
113	NC_014658	ATCGT	2	10	150562	150571	20 %	40 %	20 %	20 %	312136377
114	NC_014658	GTAGG	2	10	150683	150692	20 %	20 %	60 %	0 %	312136377
115	NC_014658	TGTAT	2	10	151126	151135	20 %	60 %	20 %	0 %	312136377
116	NC_014658	CTACT	2	10	151848	151857	20 %	40 %	0 %	40 %	312136379
117	NC_014658	CCATG	2	10	152568	152577	20 %	20 %	20 %	40 %	312136380
118	NC_014658	ATGTA	2	10	153785	153794	40 %	40 %	20 %	0 %	312136382
119	NC_014658	CTTTA	2	10	154111	154120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014658	TTCTT	2	10	155111	155120	0 %	80 %	0 %	20 %	312136384
121	NC_014658	TATCA	2	10	156184	156193	40 %	40 %	0 %	20 %	312136385
122	NC_014658	ATTCA	2	10	156573	156582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014658	TAATT	2	10	159954	159963	40 %	60 %	0 %	0 %	312136388
124	NC_014658	TTTTC	2	10	162220	162229	0 %	80 %	0 %	20 %	312136389
125	NC_014658	TTTTC	2	10	162662	162671	0 %	80 %	0 %	20 %	312136389
126	NC_014658	TATTT	2	10	164115	164124	20 %	80 %	0 %	0 %	312136389
127	NC_014658	TTTAT	2	10	164504	164513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014658	ATTTA	2	10	166156	166165	40 %	60 %	0 %	0 %	312136391
129	NC_014658	TTCTT	2	10	166300	166309	0 %	80 %	0 %	20 %	312136392
130	NC_014658	TATTT	2	10	170303	170312	20 %	80 %	0 %	0 %	312136402
131	NC_014658	ATTAA	2	10	170897	170906	60 %	40 %	0 %	0 %	312136403
132	NC_014658	ATATT	2	10	171740	171749	40 %	60 %	0 %	0 %	312136404
133	NC_014658	ATAAA	2	10	173663	173672	80 %	20 %	0 %	0 %	312136405
134	NC_014658	TTTTC	2	10	173717	173726	0 %	80 %	0 %	20 %	312136405
135	NC_014658	TATTT	2	10	177581	177590	20 %	80 %	0 %	0 %	312136407
136	NC_014658	TTATT	2	10	178857	178866	20 %	80 %	0 %	0 %	312136408
137	NC_014658	AAGGT	2	10	179623	179632	40 %	20 %	40 %	0 %	312136409
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