MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 3223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	AGTA	2	8	249	256	50 %	25 %	25 %	0 %	312136231
2	NC_014658	CTCA	2	8	350	357	25 %	25 %	0 %	50 %	312136231
3	NC_014658	AAAG	2	8	417	424	75 %	0 %	25 %	0 %	312136231
4	NC_014658	AAAG	2	8	502	509	75 %	0 %	25 %	0 %	312136231
5	NC_014658	AAAT	2	8	696	703	75 %	25 %	0 %	0 %	312136231
6	NC_014658	TCAG	2	8	1110	1117	25 %	25 %	25 %	25 %	312136231
7	NC_014658	AAAT	2	8	1158	1165	75 %	25 %	0 %	0 %	312136231
8	NC_014658	TTTC	2	8	1750	1757	0 %	75 %	0 %	25 %	312136231
9	NC_014658	GAAA	2	8	2118	2125	75 %	0 %	25 %	0 %	312136232
10	NC_014658	GGAC	2	8	2358	2365	25 %	0 %	50 %	25 %	312136232
11	NC_014658	TTTA	2	8	2792	2799	25 %	75 %	0 %	0 %	312136232
12	NC_014658	TAAT	2	8	3031	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	312136232
13	NC_014658	TTCC	2	8	3169	3176	0 %	50 %	0 %	50 %	312136233
14	NC_014658	TCTT	2	8	3239	3246	0 %	75 %	0 %	25 %	312136233
15	NC_014658	AATG	2	8	3423	3430	50 %	25 %	25 %	0 %	312136233
16	NC_014658	ATTT	2	8	3479	3486	25 %	75 %	0 %	0 %	312136233
17	NC_014658	ATTT	2	8	4224	4231	25 %	75 %	0 %	0 %	312136235
18	NC_014658	TGAT	2	8	4721	4728	25 %	50 %	25 %	0 %	312136235
19	NC_014658	ATCT	2	8	4996	5003	25 %	50 %	0 %	25 %	312136236
20	NC_014658	TGTT	2	8	5049	5056	0 %	75 %	25 %	0 %	312136236
21	NC_014658	CTTT	2	8	5311	5318	0 %	75 %	0 %	25 %	312136236
22	NC_014658	TTCC	2	8	5356	5363	0 %	50 %	0 %	50 %	312136236
23	NC_014658	TCCT	2	8	5464	5471	0 %	50 %	0 %	50 %	312136237
24	NC_014658	ATTT	2	8	6185	6192	25 %	75 %	0 %	0 %	312136237
25	NC_014658	ACCA	2	8	6571	6578	50 %	0 %	0 %	50 %	312136238
26	NC_014658	AACT	2	8	6964	6971	50 %	25 %	0 %	25 %	312136238
27	NC_014658	GATG	2	8	7020	7027	25 %	25 %	50 %	0 %	312136238
28	NC_014658	CCTT	2	8	7209	7216	0 %	50 %	0 %	50 %	312136238
29	NC_014658	ATCT	2	8	7423	7430	25 %	50 %	0 %	25 %	312136238
30	NC_014658	ATAG	2	8	7585	7592	50 %	25 %	25 %	0 %	312136239
31	NC_014658	CCTA	2	8	7655	7662	25 %	25 %	0 %	50 %	312136239
32	NC_014658	ACCA	2	8	7810	7817	50 %	0 %	0 %	50 %	312136239
33	NC_014658	AAAT	2	8	7831	7838	75 %	25 %	0 %	0 %	312136239
34	NC_014658	GAAT	2	8	8098	8105	50 %	25 %	25 %	0 %	312136239
35	NC_014658	TTTC	2	8	8985	8992	0 %	75 %	0 %	25 %	312136239
36	NC_014658	TTTA	2	8	9125	9132	25 %	75 %	0 %	0 %	312136239
37	NC_014658	AGTA	2	8	9478	9485	50 %	25 %	25 %	0 %	312136239
38	NC_014658	TAAA	2	8	9661	9668	75 %	25 %	0 %	0 %	312136239
39	NC_014658	CCAT	2	8	10188	10195	25 %	25 %	0 %	50 %	312136239
40	NC_014658	TTAT	2	8	10360	10367	25 %	75 %	0 %	0 %	312136240
41	NC_014658	TAAC	2	8	10423	10430	50 %	25 %	0 %	25 %	312136240
42	NC_014658	AGAT	2	8	10613	10620	50 %	25 %	25 %	0 %	312136240
43	NC_014658	TAAA	2	8	10672	10679	75 %	25 %	0 %	0 %	312136240
44	NC_014658	TTTA	2	8	10891	10898	25 %	75 %	0 %	0 %	312136240
45	NC_014658	GAAT	2	8	11378	11385	50 %	25 %	25 %	0 %	312136241
46	NC_014658	GAGG	2	8	11791	11798	25 %	0 %	75 %	0 %	312136241
47	NC_014658	ATGA	2	8	11904	11911	50 %	25 %	25 %	0 %	312136242
48	NC_014658	GAAT	2	8	12487	12494	50 %	25 %	25 %	0 %	312136242
49	NC_014658	CAAA	2	8	12985	12992	75 %	0 %	0 %	25 %	312136242
50	NC_014658	TGGA	2	8	13172	13179	25 %	25 %	50 %	0 %	312136243
51	NC_014658	CATC	2	8	13741	13748	25 %	25 %	0 %	50 %	312136244
52	NC_014658	ATTT	2	8	13850	13857	25 %	75 %	0 %	0 %	312136244
53	NC_014658	ATCT	2	8	15705	15712	25 %	50 %	0 %	25 %	312136248
54	NC_014658	CATC	2	8	15934	15941	25 %	25 %	0 %	50 %	312136248
55	NC_014658	GTAT	2	8	16030	16037	25 %	50 %	25 %	0 %	312136248
56	NC_014658	TAGG	2	8	16481	16488	25 %	25 %	50 %	0 %	312136248
57	NC_014658	GTAA	2	8	17199	17206	50 %	25 %	25 %	0 %	312136249
58	NC_014658	TGAA	2	8	17364	17371	50 %	25 %	25 %	0 %	312136249
59	NC_014658	AAGC	2	8	17452	17459	50 %	0 %	25 %	25 %	312136249
60	NC_014658	GAAA	2	8	18463	18470	75 %	0 %	25 %	0 %	312136250
61	NC_014658	CTAC	2	8	18946	18953	25 %	25 %	0 %	50 %	312136251
62	NC_014658	TTTC	2	8	19180	19187	0 %	75 %	0 %	25 %	312136251
63	NC_014658	TAAT	2	8	19216	19223	50 %	50 %	0 %	0 %	312136251
64	NC_014658	ATTT	2	8	19289	19296	25 %	75 %	0 %	0 %	312136251
65	NC_014658	TTTC	2	8	19679	19686	0 %	75 %	0 %	25 %	312136252
66	NC_014658	GATA	2	8	19855	19862	50 %	25 %	25 %	0 %	312136252
67	NC_014658	GAAG	2	8	19928	19935	50 %	0 %	50 %	0 %	312136252
68	NC_014658	TATC	2	8	20381	20388	25 %	50 %	0 %	25 %	312136252
69	NC_014658	ATTT	2	8	21339	21346	25 %	75 %	0 %	0 %	312136254
70	NC_014658	TAAA	2	8	21372	21379	75 %	25 %	0 %	0 %	312136254
71	NC_014658	CTAT	2	8	21513	21520	25 %	50 %	0 %	25 %	312136254
72	NC_014658	ATTA	2	8	21670	21677	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
73	NC_014658	GAAA	2	8	21785	21792	75 %	0 %	25 %	0 %	312136254
74	NC_014658	TAAA	2	8	21921	21928	75 %	25 %	0 %	0 %	312136254
75	NC_014658	ATAA	2	8	22157	22164	75 %	25 %	0 %	0 %	312136254
76	NC_014658	ACTT	2	8	29872	29879	25 %	50 %	0 %	25 %	312136256
77	NC_014658	CTTC	2	8	30273	30280	0 %	50 %	0 %	50 %	312136257
78	NC_014658	AATT	2	8	30838	30845	50 %	50 %	0 %	0 %	312136258
79	NC_014658	TCTT	2	8	30914	30921	0 %	75 %	0 %	25 %	312136258
80	NC_014658	GGTT	2	8	30994	31001	0 %	50 %	50 %	0 %	312136258
81	NC_014658	TCTT	2	8	31631	31638	0 %	75 %	0 %	25 %	312136258
82	NC_014658	TAAA	2	8	32105	32112	75 %	25 %	0 %	0 %	312136258
83	NC_014658	AAAG	2	8	32383	32390	75 %	0 %	25 %	0 %	312136258
84	NC_014658	ATTT	2	8	32463	32470	25 %	75 %	0 %	0 %	312136258
85	NC_014658	ACAA	2	8	32599	32606	75 %	0 %	0 %	25 %	312136258
86	NC_014658	TTAT	2	8	32735	32742	25 %	75 %	0 %	0 %	312136258
87	NC_014658	TTTA	2	8	32872	32879	25 %	75 %	0 %	0 %	312136258
88	NC_014658	CCAT	2	8	33281	33288	25 %	25 %	0 %	50 %	312136259
89	NC_014658	TTTC	2	8	33535	33542	0 %	75 %	0 %	25 %	312136259
90	NC_014658	AACT	2	8	34148	34155	50 %	25 %	0 %	25 %	312136259
91	NC_014658	TATT	2	8	34672	34679	25 %	75 %	0 %	0 %	312136260
92	NC_014658	ATAA	2	8	34716	34723	75 %	25 %	0 %	0 %	312136260
93	NC_014658	TCCT	2	8	34917	34924	0 %	50 %	0 %	50 %	312136260
94	NC_014658	TTAA	2	8	34978	34985	50 %	50 %	0 %	0 %	312136260
95	NC_014658	CTTT	2	8	35191	35198	0 %	75 %	0 %	25 %	312136261
96	NC_014658	TCTA	2	8	35303	35310	25 %	50 %	0 %	25 %	312136261
97	NC_014658	TCTT	2	8	35582	35589	0 %	75 %	0 %	25 %	312136261
98	NC_014658	ATTT	2	8	35699	35706	25 %	75 %	0 %	0 %	312136261
99	NC_014658	ATTT	2	8	36149	36156	25 %	75 %	0 %	0 %	312136261
100	NC_014658	CATA	2	8	36698	36705	50 %	25 %	0 %	25 %	312136262
101	NC_014658	ATTC	2	8	37016	37023	25 %	50 %	0 %	25 %	312136263
102	NC_014658	TAAC	2	8	37162	37169	50 %	25 %	0 %	25 %	312136263
103	NC_014658	ACTT	2	8	37244	37251	25 %	50 %	0 %	25 %	312136263
104	NC_014658	TGTA	2	8	37442	37449	25 %	50 %	25 %	0 %	312136263
105	NC_014658	GTCT	2	8	37606	37613	0 %	50 %	25 %	25 %	312136263
106	NC_014658	CTTG	2	8	38384	38391	0 %	50 %	25 %	25 %	312136264
107	NC_014658	AATA	2	8	38743	38750	75 %	25 %	0 %	0 %	312136264
108	NC_014658	TAAT	2	8	39233	39240	50 %	50 %	0 %	0 %	312136266
109	NC_014658	ATTT	2	8	39335	39342	25 %	75 %	0 %	0 %	312136266
110	NC_014658	CATC	2	8	39667	39674	25 %	25 %	0 %	50 %	312136266
111	NC_014658	AACA	2	8	39745	39752	75 %	0 %	0 %	25 %	312136266
112	NC_014658	AAAT	2	8	40230	40237	75 %	25 %	0 %	0 %	312136267
113	NC_014658	TATT	2	8	40436	40443	25 %	75 %	0 %	0 %	312136267
114	NC_014658	AAAT	2	8	40715	40722	75 %	25 %	0 %	0 %	312136268
115	NC_014658	GAAA	2	8	40728	40735	75 %	0 %	25 %	0 %	312136268
116	NC_014658	TTGT	2	8	40873	40880	0 %	75 %	25 %	0 %	312136268
117	NC_014658	ATTT	2	8	41156	41163	25 %	75 %	0 %	0 %	312136269
118	NC_014658	ATCA	2	8	41587	41594	50 %	25 %	0 %	25 %	312136270
119	NC_014658	CTTT	2	8	42255	42262	0 %	75 %	0 %	25 %	312136271
120	NC_014658	TCTA	2	8	42331	42338	25 %	50 %	0 %	25 %	312136271
121	NC_014658	TAAA	2	8	42542	42549	75 %	25 %	0 %	0 %	312136271
122	NC_014658	GTAT	2	8	43142	43149	25 %	50 %	25 %	0 %	312136272
123	NC_014658	TTTA	2	8	44820	44827	25 %	75 %	0 %	0 %	312136274
124	NC_014658	AAGG	2	8	45663	45670	50 %	0 %	50 %	0 %	312136274
125	NC_014658	AATT	2	8	46643	46650	50 %	50 %	0 %	0 %	312136274
126	NC_014658	ATGA	2	8	47208	47215	50 %	25 %	25 %	0 %	312136274
127	NC_014658	TAAT	2	8	47591	47598	50 %	50 %	0 %	0 %	312136275
128	NC_014658	AAGG	2	8	47671	47678	50 %	0 %	50 %	0 %	312136275
129	NC_014658	TACA	2	8	48094	48101	50 %	25 %	0 %	25 %	312136276
130	NC_014658	TGGA	2	8	48125	48132	25 %	25 %	50 %	0 %	312136276
131	NC_014658	TAAT	2	8	48274	48281	50 %	50 %	0 %	0 %	312136276
132	NC_014658	TCAT	2	8	48318	48325	25 %	50 %	0 %	25 %	312136276
133	NC_014658	TCTT	2	8	48864	48871	0 %	75 %	0 %	25 %	312136277
134	NC_014658	CTTT	2	8	49046	49053	0 %	75 %	0 %	25 %	312136277
135	NC_014658	CCTT	2	8	49217	49224	0 %	50 %	0 %	50 %	312136277
136	NC_014658	ATCT	2	8	49883	49890	25 %	50 %	0 %	25 %	312136277
137	NC_014658	TCCA	2	8	49971	49978	25 %	25 %	0 %	50 %	312136277
138	NC_014658	GCTT	2	8	50323	50330	0 %	50 %	25 %	25 %	312136277
139	NC_014658	TGCC	2	8	51748	51755	0 %	25 %	25 %	50 %	312136278
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