MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 1336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	TTC	2	6	55	60	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014658	AAG	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014658	GAA	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014658	TCC	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014658	ATT	2	6	10273	10278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014658	AGG	2	6	11031	11036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014658	TAA	2	6	14956	14961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014658	ACA	2	6	15010	15015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014658	TTA	2	6	15041	15046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014658	AAG	2	6	15171	15176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014658	TGG	3	9	15306	15314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014658	CCA	2	6	15325	15330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014658	AGG	2	6	15440	15445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014658	ATA	2	6	15448	15453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014658	CCT	2	6	19420	19425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014658	ATC	2	6	19466	19471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014658	TTC	2	6	20504	20509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014658	TGT	2	6	20521	20526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014658	TAT	2	6	20536	20541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014658	AAC	2	6	20872	20877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014658	TTG	2	6	20887	20892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014658	TAA	2	6	20924	20929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014658	ACC	2	6	23650	23655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014658	GAC	2	6	23968	23973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014658	CGG	2	6	23991	23996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014658	ACG	2	6	24072	24077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014658	AAC	2	6	24113	24118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014658	GCT	2	6	24132	24137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014658	GAG	2	6	24151	24156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014658	ACC	2	6	24208	24213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014658	GAG	2	6	24258	24263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014658	CGG	2	6	24351	24356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014658	GCC	2	6	24413	24418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014658	CTG	2	6	24439	24444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014658	CCA	2	6	24503	24508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014658	CAG	2	6	24570	24575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014658	CCG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014658	TTA	2	6	24860	24865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014658	CTT	2	6	24920	24925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014658	CGC	2	6	25213	25218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014658	CGG	2	6	25337	25342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014658	TGC	2	6	25363	25368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014658	TAC	2	6	25369	25374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014658	GCT	2	6	25562	25567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014658	CCT	2	6	25578	25583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014658	ACC	2	6	25602	25607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014658	GTT	2	6	25651	25656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014658	CGG	2	6	25706	25711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014658	ACA	2	6	25894	25899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014658	CCA	2	6	25913	25918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014658	TGC	2	6	26021	26026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014658	CAC	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014658	CGC	2	6	26205	26210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014658	TCC	2	6	26565	26570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014658	CTA	2	6	26573	26578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014658	CCT	2	6	26604	26609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014658	CCT	2	6	26621	26626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014658	AGG	2	6	26638	26643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014658	TCG	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014658	GGC	2	6	26745	26750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014658	ATC	2	6	26808	26813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014658	ATC	2	6	26818	26823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014658	CAT	2	6	26837	26842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014658	GCG	2	6	26902	26907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014658	ATT	3	9	26980	26988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014658	AGG	2	6	26992	26997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014658	CTC	2	6	27045	27050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014658	TAC	2	6	27173	27178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014658	TCC	2	6	27343	27348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014658	CGG	2	6	27468	27473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014658	CCT	2	6	27481	27486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014658	TCA	2	6	27506	27511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014658	CAT	2	6	27519	27524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014658	GGC	2	6	27643	27648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014658	GGT	2	6	27810	27815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014658	CCA	2	6	27977	27982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014658	CGG	2	6	28004	28009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014658	CTG	2	6	28132	28137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014658	TTG	2	6	28556	28561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014658	TTC	2	6	28579	28584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014658	ATC	2	6	28718	28723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014658	ACC	2	6	28810	28815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014658	GCT	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014658	GCA	2	6	28913	28918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014658	GCC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014658	TCC	2	6	39965	39970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014658	TCT	2	6	39976	39981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014658	ATA	2	6	40008	40013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014658	ATA	2	6	40058	40063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014658	AAG	2	6	40064	40069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014658	AAT	2	6	43876	43881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014658	TAA	2	6	43885	43890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014658	ATA	2	6	43987	43992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014658	TGG	2	6	44085	44090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014658	AAT	2	6	44096	44101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014658	TCC	2	6	53268	53273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014658	CCT	2	6	54613	54618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014658	TAA	2	6	54644	54649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014658	AGG	2	6	56892	56897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014658	ATC	2	6	56899	56904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014658	ATT	2	6	62613	62618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014658	TTA	2	6	62668	62673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014658	ACC	2	6	64463	64468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014658	GTT	2	6	64547	64552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014658	TCA	2	6	64591	64596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014658	ACC	2	6	64745	64750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014658	GAA	2	6	64784	64789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014658	TAA	2	6	64946	64951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014658	GAA	2	6	64967	64972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014658	CCT	2	6	72464	72469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014658	TCT	2	6	72470	72475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014658	ATT	2	6	72484	72489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014658	TAT	2	6	72528	72533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014658	TTA	2	6	72552	72557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014658	ATT	2	6	72565	72570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014658	ATT	4	12	73588	73599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014658	TTA	2	6	73601	73606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014658	GTA	2	6	73633	73638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014658	TCA	2	6	73667	73672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014658	ACA	2	6	73685	73690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014658	CCA	2	6	75649	75654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014658	TAA	2	6	77365	77370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014658	TCC	2	6	79378	79383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014658	AGA	2	6	79486	79491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014658	TAT	2	6	79508	79513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014658	TTA	2	6	79523	79528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014658	TAA	2	6	79572	79577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014658	TAA	2	6	79658	79663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014658	TCT	2	6	79726	79731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014658	TAA	2	6	79839	79844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014658	TCA	2	6	83667	83672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014658	TCA	2	6	83694	83699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014658	TCA	2	6	83728	83733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014658	GAA	2	6	83815	83820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014658	CTT	2	6	85480	85485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014658	CTT	2	6	87706	87711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014658	GCG	2	6	87862	87867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014658	CGC	2	6	87929	87934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_014658	AAT	2	6	87961	87966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014658	ACT	2	6	87977	87982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014658	CGT	2	6	88033	88038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014658	TCA	2	6	88043	88048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014658	TCA	2	6	90554	90559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014658	TAT	2	6	90571	90576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014658	ATT	2	6	90577	90582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014658	TCA	2	6	90609	90614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014658	TCA	2	6	90639	90644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014658	CCT	2	6	90677	90682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_014658	TCA	2	6	90683	90688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014658	TCA	2	6	90711	90716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014658	ATT	2	6	90723	90728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014658	ATT	2	6	90746	90751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014658	TCC	2	6	93753	93758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_014658	TAA	2	6	93840	93845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014658	TAT	2	6	93860	93865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014658	TGG	2	6	101366	101371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014658	TGT	2	6	102006	102011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014658	AAC	2	6	102101	102106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_014658	CTT	2	6	121769	121774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_014658	AAT	2	6	245724	245729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014658	TAT	2	6	246207	246212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014658	ATA	2	6	247365	247370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_014658	GGA	2	6	269360	269365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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