MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 16957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	GCT	2	6	127	132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136231
2	NC_014658	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
3	NC_014658	TCC	2	6	324	329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136231
4	NC_014658	TAA	2	6	363	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
5	NC_014658	GTT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
6	NC_014658	TAT	2	6	393	398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136231
7	NC_014658	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
8	NC_014658	AAG	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
9	NC_014658	AGA	2	6	519	524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
10	NC_014658	TAA	2	6	572	577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
11	NC_014658	ATA	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
12	NC_014658	GTT	2	6	631	636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
13	NC_014658	CAG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136231
14	NC_014658	ATG	3	9	743	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
15	NC_014658	ATT	2	6	778	783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136231
16	NC_014658	TTG	2	6	959	964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
17	NC_014658	TAG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
18	NC_014658	GTT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136231
19	NC_014658	TGC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136231
20	NC_014658	AAT	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136231
21	NC_014658	ATG	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
22	NC_014658	GCA	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136231
23	NC_014658	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
24	NC_014658	AGA	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136231
25	NC_014658	AGT	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136231
26	NC_014658	TGA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
27	NC_014658	TGA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
28	NC_014658	ATC	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136232
29	NC_014658	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
30	NC_014658	ACC	2	6	2043	2048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136232
31	NC_014658	ATG	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
32	NC_014658	TGA	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
33	NC_014658	AGT	2	6	2458	2463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
34	NC_014658	CCA	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136232
35	NC_014658	AGA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
36	NC_014658	GAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136232
37	NC_014658	GCA	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136232
38	NC_014658	AGC	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136232
39	NC_014658	AGA	2	6	2604	2609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
40	NC_014658	ATA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136232
41	NC_014658	GAA	2	6	2812	2817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
42	NC_014658	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
43	NC_014658	ATT	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136232
44	NC_014658	ATA	2	6	2977	2982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136232
45	NC_014658	AGA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136232
46	NC_014658	ATA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136233
47	NC_014658	ATC	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136233
48	NC_014658	TCT	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
49	NC_014658	TCT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
50	NC_014658	TTC	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
51	NC_014658	AGG	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136233
52	NC_014658	CAA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136233
53	NC_014658	CCT	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136233
54	NC_014658	CAT	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136233
55	NC_014658	TCT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136233
56	NC_014658	TTG	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136234
57	NC_014658	GCA	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136234
58	NC_014658	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136234
59	NC_014658	ATT	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136234
60	NC_014658	GTA	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136234
61	NC_014658	CTA	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
62	NC_014658	TCA	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
63	NC_014658	ATT	2	6	4316	4321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136235
64	NC_014658	TAT	2	6	4373	4378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136235
65	NC_014658	TCA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
66	NC_014658	AAT	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136235
67	NC_014658	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
68	NC_014658	CCT	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136235
69	NC_014658	TCA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
70	NC_014658	CAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
71	NC_014658	TTC	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136235
72	NC_014658	TGT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136235
73	NC_014658	AAG	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136235
74	NC_014658	TGT	2	6	4805	4810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136235
75	NC_014658	ACT	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136235
76	NC_014658	TAA	2	6	4925	4930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136236
77	NC_014658	TCG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136236
78	NC_014658	CAA	2	6	5146	5151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136236
79	NC_014658	TAT	2	6	5210	5215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136236
80	NC_014658	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136236
81	NC_014658	GCT	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136237
82	NC_014658	CAT	3	9	5601	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136237
83	NC_014658	CAA	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136237
84	NC_014658	CTG	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136237
85	NC_014658	ACT	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136237
86	NC_014658	AAC	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136237
87	NC_014658	TTC	2	6	5775	5780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136237
88	NC_014658	TTA	2	6	5810	5815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136237
89	NC_014658	AGC	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136237
90	NC_014658	GCA	2	6	5938	5943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136237
91	NC_014658	TTA	2	6	5966	5971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136237
92	NC_014658	CAT	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136237
93	NC_014658	GGC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312136237
94	NC_014658	TGA	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136237
95	NC_014658	ACA	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136237
96	NC_014658	TCC	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136237
97	NC_014658	ACA	2	6	6205	6210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136237
98	NC_014658	TTG	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136237
99	NC_014658	TCC	2	6	6635	6640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136238
100	NC_014658	ATT	2	6	6828	6833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136238
101	NC_014658	TCA	2	6	6858	6863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136238
102	NC_014658	TAC	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136238
103	NC_014658	TGC	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136238
104	NC_014658	GCT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136238
105	NC_014658	AAT	2	6	7159	7164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136238
106	NC_014658	TAC	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136238
107	NC_014658	TCT	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136238
108	NC_014658	ACA	2	6	7599	7604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136239
109	NC_014658	CAA	2	6	7804	7809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136239
110	NC_014658	ACA	2	6	7881	7886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136239
111	NC_014658	AAT	2	6	7895	7900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
112	NC_014658	TCT	2	6	7991	7996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
113	NC_014658	TAC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136239
114	NC_014658	CTT	2	6	8266	8271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
115	NC_014658	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136239
116	NC_014658	CAA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136239
117	NC_014658	GAG	2	6	8410	8415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136239
118	NC_014658	TCA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136239
119	NC_014658	TCT	2	6	8475	8480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
120	NC_014658	TCT	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
121	NC_014658	GGA	2	6	8628	8633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312136239
122	NC_014658	AAG	2	6	8654	8659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136239
123	NC_014658	TCT	2	6	8676	8681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
124	NC_014658	CAA	2	6	8758	8763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136239
125	NC_014658	TAT	3	9	8809	8817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136239
126	NC_014658	TTC	2	6	8846	8851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
127	NC_014658	TAA	2	6	8870	8875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
128	NC_014658	CCA	2	6	8880	8885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136239
129	NC_014658	CTT	2	6	8890	8895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
130	NC_014658	CAT	2	6	9013	9018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136239
131	NC_014658	ATA	2	6	9044	9049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136239
132	NC_014658	TCT	2	6	9087	9092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136239
133	NC_014658	GCA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136239
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136	NC_014658	ACA	2	6	9414	9419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136239
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251	NC_014658	AAC	2	6	17220	17225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136249
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255	NC_014658	TAC	2	6	17506	17511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136249
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259	NC_014658	TAA	2	6	17832	17837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136250
260	NC_014658	AGT	2	6	17908	17913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136250
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383	NC_014658	TCT	2	6	32504	32509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136258
384	NC_014658	ATC	2	6	32632	32637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136258
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499	NC_014658	CTA	2	6	41313	41318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136269
500	NC_014658	ATT	2	6	41608	41613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136270

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