MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanothermus fervidus DSM 2088 chromosome

Total Repeats: 2817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014658	AT	3	6	10	15	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014658	TG	3	6	89	94	0 %	50 %	50 %	0 %	312136231
3	NC_014658	CA	3	6	330	335	50 %	0 %	0 %	50 %	312136231
4	NC_014658	GA	4	8	718	725	50 %	0 %	50 %	0 %	312136231
5	NC_014658	AT	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	312136232
6	NC_014658	AT	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	312136232
7	NC_014658	AC	3	6	2372	2377	50 %	0 %	0 %	50 %	312136232
8	NC_014658	AG	3	6	2473	2478	50 %	0 %	50 %	0 %	312136232
9	NC_014658	TA	3	6	3508	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	312136233
10	NC_014658	TA	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014658	TC	3	6	5348	5353	0 %	50 %	0 %	50 %	312136236
12	NC_014658	AT	3	6	5503	5508	50 %	50 %	0 %	0 %	312136237
13	NC_014658	TG	3	6	6387	6392	0 %	50 %	50 %	0 %	312136237
14	NC_014658	CT	3	6	6454	6459	0 %	50 %	0 %	50 %	312136238
15	NC_014658	AT	3	6	7142	7147	50 %	50 %	0 %	0 %	312136238
16	NC_014658	AT	3	6	7223	7228	50 %	50 %	0 %	0 %	312136238
17	NC_014658	AC	3	6	7500	7505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014658	TA	3	6	8171	8176	50 %	50 %	0 %	0 %	312136239
19	NC_014658	CT	3	6	8315	8320	0 %	50 %	0 %	50 %	312136239
20	NC_014658	CT	3	6	8967	8972	0 %	50 %	0 %	50 %	312136239
21	NC_014658	AT	3	6	9722	9727	50 %	50 %	0 %	0 %	312136239
22	NC_014658	AC	3	6	9865	9870	50 %	0 %	0 %	50 %	312136239
23	NC_014658	AT	3	6	10251	10256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014658	TA	3	6	11198	11203	50 %	50 %	0 %	0 %	312136241
25	NC_014658	AT	3	6	11697	11702	50 %	50 %	0 %	0 %	312136241
26	NC_014658	AG	3	6	11887	11892	50 %	0 %	50 %	0 %	312136241
27	NC_014658	AT	4	8	13429	13436	50 %	50 %	0 %	0 %	312136243
28	NC_014658	GT	3	6	13439	13444	0 %	50 %	50 %	0 %	312136243
29	NC_014658	AT	3	6	14307	14312	50 %	50 %	0 %	0 %	312136244
30	NC_014658	AT	3	6	14651	14656	50 %	50 %	0 %	0 %	312136245
31	NC_014658	TA	4	8	15242	15249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014658	AT	4	8	15259	15266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014658	AT	3	6	17157	17162	50 %	50 %	0 %	0 %	312136249
34	NC_014658	GA	3	6	18043	18048	50 %	0 %	50 %	0 %	312136250
35	NC_014658	AT	3	6	18217	18222	50 %	50 %	0 %	0 %	312136250
36	NC_014658	AT	3	6	18388	18393	50 %	50 %	0 %	0 %	312136250
37	NC_014658	TC	3	6	18513	18518	0 %	50 %	0 %	50 %	312136251
38	NC_014658	AG	3	6	18645	18650	50 %	0 %	50 %	0 %	312136251
39	NC_014658	CT	3	6	19274	19279	0 %	50 %	0 %	50 %	312136251
40	NC_014658	TC	3	6	19402	19407	0 %	50 %	0 %	50 %	312136251
41	NC_014658	TA	3	6	19741	19746	50 %	50 %	0 %	0 %	312136252
42	NC_014658	AT	3	6	20225	20230	50 %	50 %	0 %	0 %	312136252
43	NC_014658	GA	3	6	20235	20240	50 %	0 %	50 %	0 %	312136252
44	NC_014658	TA	3	6	20786	20791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014658	AT	3	6	21063	21068	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
46	NC_014658	TA	4	8	21450	21457	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
47	NC_014658	TA	5	10	21632	21641	50 %	50 %	0 %	0 %	312136254
48	NC_014658	GA	3	6	21686	21691	50 %	0 %	50 %	0 %	312136254
49	NC_014658	CA	3	6	22118	22123	50 %	0 %	0 %	50 %	312136254
50	NC_014658	GA	3	6	22280	22285	50 %	0 %	50 %	0 %	312136254
51	NC_014658	GA	3	6	22384	22389	50 %	0 %	50 %	0 %	312136254
52	NC_014658	GT	3	6	22457	22462	0 %	50 %	50 %	0 %	312136254
53	NC_014658	CA	3	6	22644	22649	50 %	0 %	0 %	50 %	312136255
54	NC_014658	CT	3	6	22769	22774	0 %	50 %	0 %	50 %	312136255
55	NC_014658	GA	3	6	23346	23351	50 %	0 %	50 %	0 %	312136255
56	NC_014658	GT	3	6	27123	27128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014658	CG	3	6	28701	28706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014658	TA	3	6	29418	29423	50 %	50 %	0 %	0 %	312136256
59	NC_014658	AT	3	6	29600	29605	50 %	50 %	0 %	0 %	312136256
60	NC_014658	AT	3	6	29653	29658	50 %	50 %	0 %	0 %	312136256
61	NC_014658	AT	3	6	29975	29980	50 %	50 %	0 %	0 %	312136257
62	NC_014658	AT	4	8	30130	30137	50 %	50 %	0 %	0 %	312136257
63	NC_014658	TA	4	8	30260	30267	50 %	50 %	0 %	0 %	312136257
64	NC_014658	TA	3	6	30937	30942	50 %	50 %	0 %	0 %	312136258
65	NC_014658	CT	3	6	31827	31832	0 %	50 %	0 %	50 %	312136258
66	NC_014658	TA	3	6	32476	32481	50 %	50 %	0 %	0 %	312136258
67	NC_014658	TC	3	6	33364	33369	0 %	50 %	0 %	50 %	312136259
68	NC_014658	TA	3	6	33869	33874	50 %	50 %	0 %	0 %	312136259
69	NC_014658	AT	4	8	34074	34081	50 %	50 %	0 %	0 %	312136259
70	NC_014658	AT	3	6	34157	34162	50 %	50 %	0 %	0 %	312136259
71	NC_014658	AT	3	6	35371	35376	50 %	50 %	0 %	0 %	312136261
72	NC_014658	TA	3	6	36549	36554	50 %	50 %	0 %	0 %	312136262
73	NC_014658	TA	3	6	37463	37468	50 %	50 %	0 %	0 %	312136263
74	NC_014658	TG	3	6	38082	38087	0 %	50 %	50 %	0 %	312136264
75	NC_014658	AT	3	6	38806	38811	50 %	50 %	0 %	0 %	312136265
76	NC_014658	AT	3	6	39193	39198	50 %	50 %	0 %	0 %	312136266
77	NC_014658	TC	3	6	39733	39738	0 %	50 %	0 %	50 %	312136266
78	NC_014658	TA	4	8	39987	39994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014658	CT	3	6	41895	41900	0 %	50 %	0 %	50 %	312136270
80	NC_014658	CA	4	8	42818	42825	50 %	0 %	0 %	50 %	312136272
81	NC_014658	AT	3	6	43148	43153	50 %	50 %	0 %	0 %	312136272
82	NC_014658	TA	3	6	43779	43784	50 %	50 %	0 %	0 %	312136273
83	NC_014658	GT	4	8	44451	44458	0 %	50 %	50 %	0 %	312136274
84	NC_014658	AT	3	6	46802	46807	50 %	50 %	0 %	0 %	312136274
85	NC_014658	AT	3	6	46823	46828	50 %	50 %	0 %	0 %	312136274
86	NC_014658	GA	3	6	47214	47219	50 %	0 %	50 %	0 %	312136274
87	NC_014658	GA	3	6	47264	47269	50 %	0 %	50 %	0 %	312136274
88	NC_014658	AT	3	6	47280	47285	50 %	50 %	0 %	0 %	312136274
89	NC_014658	AT	3	6	47613	47618	50 %	50 %	0 %	0 %	312136275
90	NC_014658	TA	4	8	47851	47858	50 %	50 %	0 %	0 %	312136276
91	NC_014658	AT	3	6	48420	48425	50 %	50 %	0 %	0 %	312136277
92	NC_014658	AC	3	6	49620	49625	50 %	0 %	0 %	50 %	312136277
93	NC_014658	CT	3	6	49810	49815	0 %	50 %	0 %	50 %	312136277
94	NC_014658	CT	3	6	50085	50090	0 %	50 %	0 %	50 %	312136277
95	NC_014658	TA	3	6	50944	50949	50 %	50 %	0 %	0 %	312136278
96	NC_014658	TA	4	8	51348	51355	50 %	50 %	0 %	0 %	312136278
97	NC_014658	AT	3	6	51494	51499	50 %	50 %	0 %	0 %	312136278
98	NC_014658	TC	3	6	51932	51937	0 %	50 %	0 %	50 %	312136278
99	NC_014658	TA	4	8	52210	52217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014658	CA	3	6	52600	52605	50 %	0 %	0 %	50 %	312136279
101	NC_014658	AG	3	6	53063	53068	50 %	0 %	50 %	0 %	312136279
102	NC_014658	TC	3	6	53355	53360	0 %	50 %	0 %	50 %	312136280
103	NC_014658	TA	3	6	53421	53426	50 %	50 %	0 %	0 %	312136280
104	NC_014658	TA	3	6	53597	53602	50 %	50 %	0 %	0 %	312136280
105	NC_014658	AC	3	6	53606	53611	50 %	0 %	0 %	50 %	312136280
106	NC_014658	TC	3	6	53660	53665	0 %	50 %	0 %	50 %	312136280
107	NC_014658	TA	4	8	54619	54626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014658	AT	3	6	54793	54798	50 %	50 %	0 %	0 %	312136281
109	NC_014658	AT	3	6	54926	54931	50 %	50 %	0 %	0 %	312136281
110	NC_014658	GA	3	6	56650	56655	50 %	0 %	50 %	0 %	312136282
111	NC_014658	AT	3	6	56721	56726	50 %	50 %	0 %	0 %	312136282
112	NC_014658	TA	3	6	56884	56889	50 %	50 %	0 %	0 %	312136282
113	NC_014658	AT	3	6	57616	57621	50 %	50 %	0 %	0 %	312136283
114	NC_014658	AG	3	6	57766	57771	50 %	0 %	50 %	0 %	312136283
115	NC_014658	AG	3	6	57817	57822	50 %	0 %	50 %	0 %	312136283
116	NC_014658	AT	3	6	58857	58862	50 %	50 %	0 %	0 %	312136284
117	NC_014658	AT	3	6	59731	59736	50 %	50 %	0 %	0 %	312136286
118	NC_014658	TA	3	6	60101	60106	50 %	50 %	0 %	0 %	312136287
119	NC_014658	TA	3	6	60995	61000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014658	TA	3	6	62032	62037	50 %	50 %	0 %	0 %	312136290
121	NC_014658	AT	3	6	62274	62279	50 %	50 %	0 %	0 %	312136290
122	NC_014658	TA	3	6	62698	62703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014658	GT	3	6	63168	63173	0 %	50 %	50 %	0 %	312136292
124	NC_014658	AT	3	6	63548	63553	50 %	50 %	0 %	0 %	312136292
125	NC_014658	AT	4	8	64112	64119	50 %	50 %	0 %	0 %	312136293
126	NC_014658	TA	3	6	64475	64480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014658	TA	4	8	64493	64500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014658	AT	3	6	64555	64560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014658	TC	3	6	64617	64622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014658	AT	3	6	64690	64695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014658	CA	3	6	65270	65275	50 %	0 %	0 %	50 %	312136294
132	NC_014658	GA	3	6	66571	66576	50 %	0 %	50 %	0 %	312136295
133	NC_014658	AT	3	6	67595	67600	50 %	50 %	0 %	0 %	312136296
134	NC_014658	GT	3	6	68719	68724	0 %	50 %	50 %	0 %	312136297
135	NC_014658	TA	3	6	68998	69003	50 %	50 %	0 %	0 %	312136297
136	NC_014658	TA	3	6	70163	70168	50 %	50 %	0 %	0 %	312136298
137	NC_014658	AG	4	8	70223	70230	50 %	0 %	50 %	0 %	312136298
138	NC_014658	AT	4	8	70746	70753	50 %	50 %	0 %	0 %	312136299
139	NC_014658	AT	3	6	71070	71075	50 %	50 %	0 %	0 %	312136299
140	NC_014658	AT	3	6	71243	71248	50 %	50 %	0 %	0 %	312136299
141	NC_014658	AT	3	6	71358	71363	50 %	50 %	0 %	0 %	312136299
142	NC_014658	TC	3	6	72083	72088	0 %	50 %	0 %	50 %	312136301
143	NC_014658	TA	3	6	73299	73304	50 %	50 %	0 %	0 %	312136302
144	NC_014658	AT	3	6	74663	74668	50 %	50 %	0 %	0 %	312136303
145	NC_014658	TA	3	6	74705	74710	50 %	50 %	0 %	0 %	312136303
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