MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	TTTTTG	2	12	55792	55803	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014657	ATGTAA	2	12	57338	57349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014657	AAAATT	2	12	66593	66604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014657	ATACCT	2	12	76457	76468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014657	AGTAAT	2	12	77273	77284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014657	AAAGTA	2	12	100631	100642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014657	TAAAAT	2	12	105010	105021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014657	TTTTTA	2	12	112455	112466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014657	TTTTTG	2	12	164525	164536	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014657	GTTTTT	2	12	176744	176755	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014657	ATTGAG	2	12	199362	199373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014657	GTATTT	2	12	199410	199421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014657	TGTTGC	2	12	281178	281189	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014657	GATTTT	2	12	306767	306778	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014657	TGTCAT	2	12	307445	307456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014657	ATTTTC	2	12	334388	334399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014657	AGATAA	2	12	361382	361393	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014657	ATTGAG	2	12	361907	361918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014657	GTATTT	2	12	361955	361966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014657	ATTTTT	2	12	365532	365543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014657	ATGACA	2	12	366092	366103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014657	AAAAAC	2	12	367719	367730	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014657	ATTTTT	2	12	367752	367763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014657	ATTAAA	2	12	375337	375348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014657	AAGATT	2	12	377978	377989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014657	TTGAGT	2	12	378189	378200	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014657	ATTAAA	2	12	386207	386218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014657	ACTTTT	2	12	390847	390858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014657	TTTTAA	2	12	391071	391082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014657	AAATCA	2	12	391507	391518	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014657	TTTTAT	2	12	400028	400039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014657	TTCTTA	2	12	409207	409218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014657	TGAAGC	2	12	409319	409330	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014657	TCATTA	2	12	409440	409451	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014657	TTTGTG	2	12	409790	409801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014657	TGAAAA	2	12	413499	413510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014657	ATTGAG	2	12	423558	423569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014657	GTATTT	2	12	423606	423617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014657	ACAATC	2	12	438736	438747	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014657	TTTTAT	2	12	445531	445542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014657	AATTTC	2	12	503071	503082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014657	TTTCTT	2	12	615983	615994	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014657	AATTAA	2	12	616070	616081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014657	ATACAA	2	12	627014	627025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014657	TAAAAA	2	12	627067	627078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014657	ATCAAA	2	12	640439	640450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014657	TAAAAA	2	12	661005	661016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014657	AATTTT	2	12	669052	669063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014657	TGTTTT	2	12	673579	673590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014657	ATAATT	2	12	673667	673678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014657	TAAATA	2	12	679899	679910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014657	ACAAAA	2	12	682970	682981	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014657	CTTTTT	2	12	685886	685897	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014657	GTTTTT	2	12	696916	696927	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014657	ATTTGG	2	12	769002	769013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014657	GTTGCG	2	12	816032	816043	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014657	AGTAAA	2	12	833358	833369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014657	AGTAAA	2	12	834974	834985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014657	ATTGAG	2	12	902571	902582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014657	GTATTT	2	12	902619	902630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014657	TCGGGG	2	12	906405	906416	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014657	GAGGTG	2	12	918284	918295	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014657	TAAAAT	2	12	1008078	1008089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014657	TTGAGT	2	12	1009552	1009563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014657	AATCAA	2	12	1017856	1017867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014657	AAATTG	2	12	1038531	1038542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014657	TTAATT	2	12	1059777	1059788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014657	ATTGAG	2	12	1064931	1064942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014657	GTATTT	2	12	1064979	1064990	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014657	AGAAGT	2	12	1082454	1082465	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014657	TTTCTA	2	12	1124096	1124107	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014657	ACAAAA	2	12	1155068	1155079	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014657	GATTCA	2	12	1230541	1230552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014657	AAATAA	2	12	1235920	1235931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014657	TCTCCT	2	12	1337565	1337576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014657	GTAATT	2	12	1355672	1355683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014657	TTTTGA	2	12	1376888	1376899	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014657	ATAAAA	2	12	1380991	1381002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014657	TAATTT	2	12	1389156	1389167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014657	TGAAAA	2	12	1428964	1428975	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014657	TAAAAA	2	12	1443900	1443911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014657	TCGAAA	2	12	1490208	1490219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014657	AATTAT	2	12	1491229	1491240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014657	ACAAAA	2	12	1526530	1526541	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014657	ATTTTT	2	12	1569496	1569507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014657	AATTAT	2	12	1592879	1592890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014657	ATTCTT	2	12	1598157	1598168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014657	ATTTTT	2	12	1646208	1646219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014657	TTTTGA	2	12	1656326	1656337	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014657	ATTTTT	2	12	1699720	1699731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014657	ATATAA	2	12	1711285	1711296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014657	TTTTGA	2	12	1721034	1721045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014657	AAAATA	2	12	1749694	1749705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014657	TTTGTT	2	12	1765413	1765424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014657	TTTTTA	2	12	1768254	1768265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014657	AGGTGA	2	12	1772856	1772867	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014657	TCAAAT	2	12	1774246	1774257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014657	ATATAA	2	12	1776208	1776219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014657	AAAAAC	2	12	1780569	1780580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014657	TCCTCT	2	12	1787131	1787142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014657	AAAACT	2	12	1787977	1787988	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014657	CATTTG	2	12	1800011	1800022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014657	AAATTT	2	12	1814409	1814420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014657	TATTTT	2	12	1818716	1818727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014657	TGTCAA	2	12	1833269	1833280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014657	AAATAA	2	12	1855651	1855662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014657	TGTTTT	2	12	1856901	1856912	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014657	ATTTTT	2	12	1861293	1861304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014657	TTTGTT	2	12	1879019	1879030	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014657	GAAAAT	2	12	1879527	1879538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014657	TTTATT	2	12	1901486	1901497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014657	TAGAAG	2	12	1904347	1904358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014657	TAGTTA	2	12	1904712	1904723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014657	GTTTTT	2	12	1968981	1968992	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014657	ATTTTT	2	12	1976991	1977002	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014657	AAATAT	2	12	1979480	1979491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014657	TTTCTA	2	12	2043022	2043033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014657	CTTTTT	2	12	2048588	2048599	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014657	TTTTAA	2	12	2051496	2051507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014657	ATCAAA	2	12	2054127	2054138	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014657	AAATAC	2	12	2058037	2058048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014657	CTCAAT	2	12	2058085	2058096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014657	CAAAGG	2	12	2075857	2075868	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014657	AAATAC	2	12	2076932	2076943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014657	TAATTA	2	12	2085766	2085777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014657	TAAAAA	2	12	2090491	2090502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014657	TGTGTT	2	12	2098043	2098054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014657	CTGTTA	2	12	2099440	2099451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014657	CCCTTT	2	12	2131111	2131122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014657	GTTTAA	2	12	2131211	2131222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014657	AAAGAA	2	12	2142380	2142391	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014657	AGTACT	2	12	2147929	2147940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014657	TCATTT	2	12	2148608	2148619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014657	AATATA	2	12	2160362	2160373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014657	TTTCCA	2	12	2162198	2162209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014657	CCCTTT	2	12	2162448	2162459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014657	ACTCAA	2	12	2241893	2241904	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014657	AATCTT	2	12	2242105	2242116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_014657	ACAAAA	2	12	2290527	2290538	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_014657	TTTTGT	2	12	2397539	2397550	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014657	TGTATC	2	12	2401661	2401672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.