MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 2124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	TGCTC	2	10	2620	2629	0 %	40 %	20 %	40 %	312134084
2	NC_014657	ATAAA	2	10	2903	2912	80 %	20 %	0 %	0 %	312134085
3	NC_014657	CTTCT	2	10	2945	2954	0 %	60 %	0 %	40 %	312134085
4	NC_014657	TCAGC	2	10	3369	3378	20 %	20 %	20 %	40 %	312134085
5	NC_014657	CAGGA	2	10	4047	4056	40 %	0 %	40 %	20 %	312134086
6	NC_014657	GGATA	2	10	4249	4258	40 %	20 %	40 %	0 %	312134087
7	NC_014657	ATAAA	2	10	6468	6477	80 %	20 %	0 %	0 %	312134088
8	NC_014657	GTTTT	2	10	6486	6495	0 %	80 %	20 %	0 %	312134088
9	NC_014657	AAAAG	2	10	6551	6560	80 %	0 %	20 %	0 %	312134088
10	NC_014657	AAGGT	2	10	6590	6599	40 %	20 %	40 %	0 %	312134088
11	NC_014657	AAAAG	2	10	8112	8121	80 %	0 %	20 %	0 %	312134089
12	NC_014657	TGTGT	2	10	8692	8701	0 %	60 %	40 %	0 %	312134089
13	NC_014657	AAAAC	2	10	8872	8881	80 %	0 %	0 %	20 %	312134089
14	NC_014657	TTTTG	2	10	9936	9945	0 %	80 %	20 %	0 %	312134090
15	NC_014657	ATATA	2	10	10143	10152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014657	AAACA	2	10	10381	10390	80 %	0 %	0 %	20 %	312134091
17	NC_014657	AAAAG	2	10	11041	11050	80 %	0 %	20 %	0 %	312134091
18	NC_014657	TTGAT	2	10	12291	12300	20 %	60 %	20 %	0 %	312134092
19	NC_014657	ATTGT	2	10	12365	12374	20 %	60 %	20 %	0 %	312134092
20	NC_014657	TCTTT	2	10	12615	12624	0 %	80 %	0 %	20 %	312134092
21	NC_014657	AAATT	2	10	15408	15417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014657	CAAAA	2	10	16443	16452	80 %	0 %	0 %	20 %	312134096
23	NC_014657	CAAGC	2	10	18536	18545	40 %	0 %	20 %	40 %	312134097
24	NC_014657	TAATT	2	10	18743	18752	40 %	60 %	0 %	0 %	312134098
25	NC_014657	GAAAA	2	10	21087	21096	80 %	0 %	20 %	0 %	312134100
26	NC_014657	TAACT	2	10	21965	21974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014657	AGAAA	2	10	22680	22689	80 %	0 %	20 %	0 %	312134101
28	NC_014657	AACAG	2	10	24108	24117	60 %	0 %	20 %	20 %	312134102
29	NC_014657	AGGAC	2	10	25423	25432	40 %	0 %	40 %	20 %	312134102
30	NC_014657	ATTTT	2	10	25853	25862	20 %	80 %	0 %	0 %	312134103
31	NC_014657	CTTTT	2	10	25970	25979	0 %	80 %	0 %	20 %	312134103
32	NC_014657	ATAAA	2	10	26196	26205	80 %	20 %	0 %	0 %	312134103
33	NC_014657	TAAAA	2	10	26831	26840	80 %	20 %	0 %	0 %	312134104
34	NC_014657	AGGCA	2	10	27665	27674	40 %	0 %	40 %	20 %	312134105
35	NC_014657	TGGCA	2	10	27779	27788	20 %	20 %	40 %	20 %	312134105
36	NC_014657	TTGGG	2	10	27800	27809	0 %	40 %	60 %	0 %	312134105
37	NC_014657	AAAAG	2	10	29785	29794	80 %	0 %	20 %	0 %	312134106
38	NC_014657	TTAGA	2	10	30264	30273	40 %	40 %	20 %	0 %	312134106
39	NC_014657	TTACT	2	10	30987	30996	20 %	60 %	0 %	20 %	312134107
40	NC_014657	ACGTT	2	10	31360	31369	20 %	40 %	20 %	20 %	312134107
41	NC_014657	AATTA	2	10	31640	31649	60 %	40 %	0 %	0 %	312134107
42	NC_014657	AATTT	2	10	31725	31734	40 %	60 %	0 %	0 %	312134107
43	NC_014657	AAAGA	2	10	32948	32957	80 %	0 %	20 %	0 %	312134108
44	NC_014657	ATAAC	2	10	33572	33581	60 %	20 %	0 %	20 %	312134109
45	NC_014657	AGAGA	2	10	36919	36928	60 %	0 %	40 %	0 %	312134112
46	NC_014657	GCAAG	2	10	37919	37928	40 %	0 %	40 %	20 %	312134113
47	NC_014657	AAGAG	2	10	39605	39614	60 %	0 %	40 %	0 %	312134116
48	NC_014657	GCTTT	2	10	40737	40746	0 %	60 %	20 %	20 %	312134116
49	NC_014657	GATAT	2	10	42595	42604	40 %	40 %	20 %	0 %	312134116
50	NC_014657	CAGAA	2	10	45397	45406	60 %	0 %	20 %	20 %	312134117
51	NC_014657	GAAAA	2	10	47081	47090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014657	AAGAG	2	10	47634	47643	60 %	0 %	40 %	0 %	312134119
53	NC_014657	GTACT	2	10	50635	50644	20 %	40 %	20 %	20 %	312134122
54	NC_014657	GATTC	2	10	50713	50722	20 %	40 %	20 %	20 %	312134122
55	NC_014657	CAGCA	2	10	53711	53720	40 %	0 %	20 %	40 %	312134125
56	NC_014657	AAACA	2	10	55671	55680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014657	TTTGT	2	10	56183	56192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014657	ATTTT	2	10	56335	56344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014657	ACATT	2	10	57249	57258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014657	AGGAG	2	10	57840	57849	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014657	ATTTC	2	10	59094	59103	20 %	60 %	0 %	20 %	312134127
62	NC_014657	AAAGA	2	10	59247	59256	80 %	0 %	20 %	0 %	312134127
63	NC_014657	AATCA	2	10	60021	60030	60 %	20 %	0 %	20 %	312134127
64	NC_014657	TAAAC	2	10	61037	61046	60 %	20 %	0 %	20 %	312134128
65	NC_014657	AATGC	2	10	61338	61347	40 %	20 %	20 %	20 %	312134128
66	NC_014657	ATATT	2	10	61483	61492	40 %	60 %	0 %	0 %	312134128
67	NC_014657	CTTTG	2	10	62046	62055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014657	TCCTG	2	10	62371	62380	0 %	40 %	20 %	40 %	312134129
69	NC_014657	CTTTG	2	10	63564	63573	0 %	60 %	20 %	20 %	312134130
70	NC_014657	TGGGT	2	10	63808	63817	0 %	40 %	60 %	0 %	312134130
71	NC_014657	GTTAT	2	10	65253	65262	20 %	60 %	20 %	0 %	312134131
72	NC_014657	TTTGC	2	10	65311	65320	0 %	60 %	20 %	20 %	312134131
73	NC_014657	AGTAT	2	10	65343	65352	40 %	40 %	20 %	0 %	312134131
74	NC_014657	TATTT	2	10	65606	65615	20 %	80 %	0 %	0 %	312134131
75	NC_014657	AAATT	2	10	65923	65932	60 %	40 %	0 %	0 %	312134131
76	NC_014657	GTATA	2	10	65934	65943	40 %	40 %	20 %	0 %	312134131
77	NC_014657	TATTT	2	10	65963	65972	20 %	80 %	0 %	0 %	312134131
78	NC_014657	ATTGA	2	10	65997	66006	40 %	40 %	20 %	0 %	312134131
79	NC_014657	TTATA	2	10	67140	67149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014657	CATTT	2	10	67861	67870	20 %	60 %	0 %	20 %	312134132
81	NC_014657	GTAAA	2	10	68025	68034	60 %	20 %	20 %	0 %	312134132
82	NC_014657	AATTT	2	10	68570	68579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014657	AAACA	2	10	69138	69147	80 %	0 %	0 %	20 %	312134133
84	NC_014657	AGAAA	2	10	69424	69433	80 %	0 %	20 %	0 %	312134133
85	NC_014657	CAAGG	2	10	72144	72153	40 %	0 %	40 %	20 %	312134135
86	NC_014657	TTATG	2	10	72520	72529	20 %	60 %	20 %	0 %	312134135
87	NC_014657	AGAAT	2	10	72827	72836	60 %	20 %	20 %	0 %	312134135
88	NC_014657	CAAAC	2	10	73046	73055	60 %	0 %	0 %	40 %	312134135
89	NC_014657	AAGTA	2	10	73231	73240	60 %	20 %	20 %	0 %	312134135
90	NC_014657	CTTTT	2	10	73869	73878	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014657	TTTGT	2	10	76731	76740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014657	GTAAT	2	10	77063	77072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014657	AGAAC	2	10	77670	77679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014657	ATTGC	2	10	77784	77793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014657	TTGTA	2	10	82680	82689	20 %	60 %	20 %	0 %	312134140
96	NC_014657	TTTAA	2	10	82769	82778	40 %	60 %	0 %	0 %	312134140
97	NC_014657	TTTCT	2	10	83464	83473	0 %	80 %	0 %	20 %	312134140
98	NC_014657	ACAGG	2	10	84536	84545	40 %	0 %	40 %	20 %	312134142
99	NC_014657	AGAAA	2	10	85057	85066	80 %	0 %	20 %	0 %	312134142
100	NC_014657	GGAAG	2	10	85453	85462	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014657	AAAAG	2	10	86576	86585	80 %	0 %	20 %	0 %	312134144
102	NC_014657	AAAAT	2	10	87019	87028	80 %	20 %	0 %	0 %	312134144
103	NC_014657	TTGTT	2	10	89877	89886	0 %	80 %	20 %	0 %	312134146
104	NC_014657	GGCTT	2	10	91183	91192	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014657	ATCCA	2	10	91511	91520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014657	GTTTT	2	10	93636	93645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014657	CTGGG	2	10	94352	94361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014657	GAAAA	2	10	95498	95507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014657	GTTAT	2	10	95571	95580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014657	ATTTT	2	10	96447	96456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014657	TAGCT	2	10	96506	96515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014657	ACAAA	2	10	97346	97355	80 %	0 %	0 %	20 %	312134148
113	NC_014657	TAAAT	2	10	97563	97572	60 %	40 %	0 %	0 %	312134148
114	NC_014657	GCAAG	2	10	97581	97590	40 %	0 %	40 %	20 %	312134148
115	NC_014657	GCAAC	2	10	100253	100262	40 %	0 %	20 %	40 %	312134149
116	NC_014657	TGGAG	2	10	102535	102544	20 %	20 %	60 %	0 %	312134150
117	NC_014657	AGCCA	2	10	106005	106014	40 %	0 %	20 %	40 %	312134153
118	NC_014657	ATTAT	2	10	107501	107510	40 %	60 %	0 %	0 %	312134154
119	NC_014657	TAAAA	2	10	108333	108342	80 %	20 %	0 %	0 %	312134155
120	NC_014657	GCTGA	2	10	110844	110853	20 %	20 %	40 %	20 %	312134159
121	NC_014657	AAGAA	2	10	112829	112838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014657	AAATC	2	10	113513	113522	60 %	20 %	0 %	20 %	312134160
123	NC_014657	ATTTT	2	10	114567	114576	20 %	80 %	0 %	0 %	312134161
124	NC_014657	TAATT	2	10	115031	115040	40 %	60 %	0 %	0 %	312134162
125	NC_014657	AAGCG	2	10	115664	115673	40 %	0 %	40 %	20 %	312134162
126	NC_014657	TTTTG	2	10	117372	117381	0 %	80 %	20 %	0 %	312134165
127	NC_014657	TTGAG	2	10	119790	119799	20 %	40 %	40 %	0 %	312134165
128	NC_014657	AAAAT	2	10	120672	120681	80 %	20 %	0 %	0 %	312134165
129	NC_014657	AACAA	2	10	120742	120751	80 %	0 %	0 %	20 %	312134165
130	NC_014657	TTTTC	2	10	122016	122025	0 %	80 %	0 %	20 %	312134167
131	NC_014657	TAAAA	2	10	122551	122560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014657	AATAA	2	10	124099	124108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014657	AGCAG	2	10	125248	125257	40 %	0 %	40 %	20 %	312134168
134	NC_014657	GTGGG	2	10	126565	126574	0 %	20 %	80 %	0 %	312134170
135	NC_014657	CATTG	2	10	127232	127241	20 %	40 %	20 %	20 %	312134171
136	NC_014657	GCAAG	2	10	128923	128932	40 %	0 %	40 %	20 %	312134172
137	NC_014657	TTTGA	2	10	130233	130242	20 %	60 %	20 %	0 %	312134173
138	NC_014657	TTGTC	2	10	131534	131543	0 %	60 %	20 %	20 %	312134174
139	NC_014657	GGATT	2	10	133422	133431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014657	TACAA	2	10	135631	135640	60 %	20 %	0 %	20 %	312134178
141	NC_014657	AGGAT	2	10	136072	136081	40 %	20 %	40 %	0 %	312134179
142	NC_014657	AGATG	2	10	136472	136481	40 %	20 %	40 %	0 %	312134179
143	NC_014657	AAAAG	2	10	137242	137251	80 %	0 %	20 %	0 %	312134180
144	NC_014657	AAATA	2	10	137375	137384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014657	ATTTC	2	10	137682	137691	20 %	60 %	0 %	20 %	312134181
146	NC_014657	TTTTA	2	10	138906	138915	20 %	80 %	0 %	0 %	312134182
147	NC_014657	AGATT	2	10	139165	139174	40 %	40 %	20 %	0 %	312134182
148	NC_014657	AAAGA	2	10	140237	140246	80 %	0 %	20 %	0 %	312134182
149	NC_014657	GGTTA	2	10	141213	141222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014657	TTTCA	2	10	142830	142839	20 %	60 %	0 %	20 %	312134184
151	NC_014657	AGACA	2	10	144782	144791	60 %	0 %	20 %	20 %	312134185
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175	NC_014657	ACAGT	2	10	172043	172052	40 %	20 %	20 %	20 %	312134205
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241	NC_014657	GATTA	2	10	234851	234860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_014657	TTCAG	2	10	240649	240658	20 %	40 %	20 %	20 %	312134266
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259	NC_014657	TTTTA	2	10	250677	250686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014657	GAAAT	2	10	250837	250846	60 %	20 %	20 %	0 %	312134276
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269	NC_014657	TTAAA	2	10	256706	256715	60 %	40 %	0 %	0 %	312134280
270	NC_014657	TATTT	2	10	256906	256915	20 %	80 %	0 %	0 %	312134281
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