MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 1088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	GAGG	2	8	6672	6679	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014657	TACT	2	8	13455	13462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014657	ATTT	2	8	13526	13533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014657	CAAT	2	8	15380	15387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014657	AAAT	2	8	15424	15431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014657	ATTT	2	8	16186	16193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014657	TTTA	2	8	19683	19690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014657	TAAT	2	8	21903	21910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014657	TTAA	2	8	26539	26546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014657	TTAT	2	8	37604	37611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014657	TTTG	2	8	44588	44595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014657	CTTG	2	8	49551	49558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014657	AAGA	2	8	52275	52282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014657	ATAA	2	8	53304	53311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014657	ATAA	3	12	54689	54700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014657	AATA	2	8	54842	54849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014657	TCCT	2	8	55085	55092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014657	TTAG	2	8	55836	55843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014657	TATT	2	8	55905	55912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014657	TTGA	2	8	56263	56270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014657	TAAA	2	8	56303	56310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014657	AAAG	2	8	56640	56647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014657	GAAA	2	8	56964	56971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014657	AAGG	2	8	57988	57995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014657	TTGC	2	8	58985	58992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014657	TAAA	2	8	66834	66841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014657	CCTC	2	8	67249	67256	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_014657	CAAA	2	8	67416	67423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014657	AATA	2	8	71321	71328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014657	ATTG	2	8	71372	71379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014657	TTAT	2	8	73708	73715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014657	ATGA	2	8	73748	73755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014657	CCTG	2	8	74101	74108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014657	TAAG	2	8	74300	74307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014657	CTTT	2	8	74561	74568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014657	TCTT	2	8	74607	74614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014657	AGTA	2	8	74724	74731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014657	TTTA	2	8	74784	74791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014657	CTTT	2	8	75245	75252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014657	TGAT	2	8	75308	75315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014657	AAGA	2	8	75653	75660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014657	ATTT	2	8	75669	75676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014657	TCTT	2	8	76385	76392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014657	GATT	2	8	76710	76717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014657	AGAT	2	8	77519	77526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014657	CAGA	2	8	78184	78191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014657	GAAG	2	8	78207	78214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014657	TTCA	2	8	81682	81689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014657	ATTT	2	8	90988	90995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014657	ATTG	2	8	91563	91570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014657	TTGT	2	8	91658	91665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014657	CAGT	2	8	92026	92033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014657	AAAC	2	8	92163	92170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014657	GTTC	2	8	93741	93748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014657	TGAA	2	8	93813	93820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014657	ACAG	2	8	94080	94087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014657	GTAA	2	8	95644	95651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014657	TCAA	2	8	95882	95889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014657	TTTG	2	8	96015	96022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014657	TCTT	2	8	100417	100424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014657	TAAT	2	8	100570	100577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014657	TAAG	2	8	102838	102845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014657	ATTA	2	8	102858	102865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014657	CAAA	2	8	106679	106686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014657	ATAA	2	8	106773	106780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014657	ATTC	2	8	106785	106792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014657	TGCC	2	8	110406	110413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014657	TTTA	2	8	112560	112567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014657	TTGC	2	8	112689	112696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014657	GGGT	2	8	122214	122221	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014657	ATAA	2	8	122614	122621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014657	TTAC	2	8	122780	122787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014657	CAAA	2	8	122983	122990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014657	GCTT	2	8	123295	123302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014657	TCTT	2	8	123683	123690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014657	TTGT	2	8	123782	123789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014657	ACCC	2	8	124027	124034	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_014657	AGAT	2	8	128674	128681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014657	CTCC	2	8	131991	131998	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_014657	GTTT	2	8	132003	132010	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014657	TAGT	2	8	132209	132216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014657	ATTT	2	8	133504	133511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014657	ATCA	2	8	135244	135251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014657	AATA	2	8	137788	137795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014657	AAAC	2	8	137929	137936	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014657	TCTT	2	8	141223	141230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014657	TTAA	2	8	153255	153262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014657	TTAA	2	8	153290	153297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014657	AATA	2	8	159508	159515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014657	AGGA	2	8	162955	162962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014657	TAAT	2	8	163012	163019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014657	TATT	2	8	166059	166066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014657	AAAG	2	8	167979	167986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014657	TGGT	2	8	167989	167996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014657	CAAT	2	8	171631	171638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014657	CTTT	2	8	171715	171722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014657	AAAT	2	8	171827	171834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014657	AAAT	2	8	178022	178029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014657	GCAA	2	8	178093	178100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014657	GGAT	2	8	185860	185867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014657	AAAC	2	8	199015	199022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014657	AAAG	2	8	199251	199258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014657	GGTG	2	8	200235	200242	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014657	AATT	2	8	200431	200438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014657	AAGA	2	8	203126	203133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014657	ATAA	2	8	205131	205138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014657	AAAG	3	12	207303	207314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014657	GTTG	2	8	231537	231544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014657	TCAA	2	8	231831	231838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014657	TTGC	2	8	231919	231926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014657	AGTT	2	8	231935	231942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014657	ACTC	2	8	234011	234018	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014657	TAAA	2	8	234054	234061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014657	ATTT	2	8	234105	234112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014657	AGAA	2	8	234863	234870	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014657	ATTT	2	8	240954	240961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014657	GAAA	2	8	245833	245840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014657	ATTT	2	8	245854	245861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014657	ATTG	2	8	245867	245874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014657	GATA	2	8	254957	254964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014657	ATTC	2	8	255113	255120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014657	GAAA	2	8	256745	256752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014657	AAAT	2	8	261253	261260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014657	AAAG	2	8	266950	266957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014657	GATA	2	8	271314	271321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014657	GGCA	2	8	273265	273272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014657	CAAG	2	8	280824	280831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014657	CTAT	2	8	280837	280844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014657	GAAA	2	8	280890	280897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014657	TTTA	2	8	281193	281200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014657	ACAA	2	8	281907	281914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014657	ATTT	2	8	282014	282021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014657	AAAG	2	8	282044	282051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014657	TTTG	2	8	282177	282184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014657	ATTT	2	8	294241	294248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014657	AAGA	2	8	295163	295170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014657	AAAT	2	8	297059	297066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014657	GAAT	2	8	300266	300273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014657	GATG	2	8	301134	301141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014657	GCGA	2	8	301582	301589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014657	TTAC	2	8	302793	302800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014657	GACG	2	8	303868	303875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014657	GGAC	2	8	304876	304883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014657	TTTA	2	8	305453	305460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014657	GTAA	2	8	306507	306514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014657	AAGC	2	8	306853	306860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014657	GAAG	2	8	307004	307011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014657	AGGC	2	8	307058	307065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014657	TGTT	2	8	307820	307827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014657	ATTT	2	8	308120	308127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014657	ATTT	2	8	308341	308348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014657	CAAG	2	8	319336	319343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014657	TTGA	2	8	326566	326573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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