MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leadbetterella byssophila DSM 17132 chromosome

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014655	ATCAA	2	10	3787	3796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014655	AAACC	2	10	8574	8583	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014655	AACAA	2	10	78055	78064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014655	TAGAT	2	10	84287	84296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014655	ATTTT	2	10	88841	88850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014655	TTTAT	2	10	103641	103650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014655	TATAT	2	10	103688	103697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014655	TCTGC	2	10	130428	130437	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014655	AAATC	2	10	134885	134894	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014655	TAGAA	2	10	135540	135549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014655	TTGTC	2	10	139564	139573	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014655	ACATG	2	10	161965	161974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014655	AGGTT	2	10	162179	162188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014655	GAAAC	2	10	164076	164085	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014655	AAGAA	2	10	169928	169937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014655	AAAGT	2	10	209314	209323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014655	TAAAT	2	10	216736	216745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014655	AACTC	2	10	218905	218914	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014655	ATCTT	2	10	224960	224969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014655	GTAGC	2	10	271547	271556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014655	GTAGC	2	10	271759	271768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014655	GTAAG	2	10	273296	273305	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014655	GTCAA	2	10	304085	304094	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014655	TGATT	2	10	312376	312385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014655	GGATT	2	10	314395	314404	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014655	TAGGC	2	10	314487	314496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014655	TTGAC	2	10	318819	318828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014655	CTTTC	2	10	338453	338462	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014655	TTTGA	2	10	340422	340431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014655	TTAAT	2	10	341383	341392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014655	AAAGT	2	10	342399	342408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014655	AAGGC	2	10	342438	342447	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014655	GAGAA	2	10	343625	343634	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014655	AAAAG	2	10	343635	343644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014655	CTAAA	2	10	351405	351414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014655	TGTTT	2	10	376742	376751	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014655	TGTGG	2	10	438612	438621	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014655	AGAAT	2	10	443573	443582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014655	TGTGG	2	10	449210	449219	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014655	CATAT	2	10	457207	457216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014655	AAAAT	2	10	457760	457769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014655	TTAAA	2	10	475026	475035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014655	ATTAT	2	10	478927	478936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014655	TTTGT	2	10	483205	483214	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014655	AATAA	2	10	486481	486490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014655	TAGGA	2	10	489092	489101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014655	AGTTT	2	10	493316	493325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014655	AAAAC	2	10	496885	496894	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014655	GCAGG	2	10	568592	568601	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014655	GAATT	2	10	572434	572443	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014655	TAAAT	2	10	575703	575712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014655	CATAT	2	10	577783	577792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014655	TTTAA	2	10	578624	578633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014655	TTAAT	2	10	579436	579445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014655	GCACC	2	10	587961	587970	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014655	TGCAC	2	10	593211	593220	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014655	AATCA	2	10	594067	594076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014655	ATTAC	2	10	607525	607534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014655	GTAAT	2	10	612403	612412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014655	TTATA	2	10	612916	612925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014655	AGTTC	2	10	613052	613061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014655	ATTTT	2	10	613722	613731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014655	CAGAT	2	10	621451	621460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014655	AGCTC	2	10	621547	621556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014655	GGAAG	2	10	648498	648507	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014655	ATTTG	2	10	648651	648660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014655	GATGG	2	10	649042	649051	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014655	GAATA	2	10	649153	649162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014655	ATTTT	2	10	716080	716089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014655	TAAAA	2	10	716097	716106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014655	GTATT	2	10	742762	742771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014655	TGAAT	2	10	765673	765682	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014655	CAAAA	2	10	773000	773009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014655	TTTAG	2	10	774844	774853	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014655	ATATT	2	10	783021	783030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014655	AGCAG	2	10	783382	783391	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014655	TATAA	2	10	785259	785268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014655	TTTTC	2	10	790135	790144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014655	ATTTA	2	10	798044	798053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014655	CAAAC	2	10	843752	843761	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014655	GTACT	2	10	847975	847984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014655	GTACT	2	10	852435	852444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014655	ATGCT	2	10	859027	859036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014655	TGGAA	2	10	862409	862418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014655	AAAGT	2	10	864226	864235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014655	TTTGT	2	10	864952	864961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014655	ATCCC	2	10	872978	872987	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014655	CATAC	2	10	877504	877513	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014655	GACAA	2	10	877516	877525	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014655	TAAAT	2	10	896444	896453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014655	AAAGT	2	10	904935	904944	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014655	TAAAA	2	10	945223	945232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014655	AAAAC	2	10	953828	953837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014655	AATAA	2	10	956486	956495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014655	TTCCT	2	10	956672	956681	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014655	ACCAT	2	10	956717	956726	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014655	ATTTT	2	10	957491	957500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014655	AAAAT	2	10	959925	959934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014655	GATTT	2	10	963628	963637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014655	TGGGT	2	10	964171	964180	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014655	AATAA	2	10	973859	973868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014655	TGTCC	2	10	974790	974799	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014655	ATACA	2	10	976095	976104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014655	CATAC	2	10	976184	976193	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014655	ATTTA	2	10	976639	976648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014655	TAAAA	2	10	977162	977171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014655	GAAAT	2	10	977255	977264	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014655	TGAAT	2	10	977586	977595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014655	AAGCA	2	10	977745	977754	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014655	CAAAA	2	10	977773	977782	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014655	AGTAT	2	10	991940	991949	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014655	TAAAA	2	10	999343	999352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014655	AGTAC	2	10	1001616	1001625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014655	AGTTT	2	10	1022504	1022513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014655	TTATT	2	10	1026843	1026852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014655	TTCCA	2	10	1027153	1027162	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_014655	GCAAT	2	10	1032431	1032440	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014655	AACAA	2	10	1043498	1043507	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014655	TCCAA	2	10	1082123	1082132	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014655	GATCA	2	10	1085370	1085379	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014655	AGTGC	2	10	1092825	1092834	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014655	GGCAA	2	10	1097446	1097455	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014655	ATTTT	2	10	1101852	1101861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014655	TCCTT	2	10	1112403	1112412	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014655	ATAAA	2	10	1120891	1120900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014655	AAGTA	2	10	1160792	1160801	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014655	ATTTT	2	10	1160815	1160824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014655	AATCA	2	10	1205892	1205901	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014655	AATTT	2	10	1205990	1205999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014655	AATTT	2	10	1206081	1206090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014655	AAAAC	2	10	1215385	1215394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014655	ACCAA	2	10	1215444	1215453	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014655	TAATT	2	10	1233963	1233972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014655	TATAA	2	10	1244722	1244731	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014655	CTTTT	2	10	1244819	1244828	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014655	TAAAA	2	10	1273372	1273381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014655	GAAAA	2	10	1308505	1308514	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014655	CTTTT	2	10	1324317	1324326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014655	CTTTA	2	10	1326914	1326923	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014655	ATCAA	2	10	1329698	1329707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014655	TTACT	2	10	1330941	1330950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014655	TGAAT	2	10	1352583	1352592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014655	TTTAA	2	10	1358851	1358860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014655	ATTTC	2	10	1367347	1367356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014655	TAACT	2	10	1384794	1384803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014655	GAAAC	2	10	1391137	1391146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014655	GAAAA	2	10	1394246	1394255	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014655	ACTAT	2	10	1397160	1397169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014655	TTAAG	2	10	1407952	1407961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014655	ATGGA	2	10	1409317	1409326	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014655	CGCAA	2	10	1939907	1939916	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_014655	AGTAC	2	10	2676848	2676857	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_014655	ACTAG	2	10	2677228	2677237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_014655	ATCCC	2	10	4035964	4035973	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.