MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 6381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	AATG	2	8	305	312	50 %	25 %	25 %	0 %	312142409
2	NC_014654	TTTA	2	8	587	594	25 %	75 %	0 %	0 %	312142409
3	NC_014654	ACAG	2	8	864	871	50 %	0 %	25 %	25 %	312142409
4	NC_014654	TTAT	2	8	1047	1054	25 %	75 %	0 %	0 %	312142409
5	NC_014654	TATT	2	8	1855	1862	25 %	75 %	0 %	0 %	312142410
6	NC_014654	AAAT	2	8	2052	2059	75 %	25 %	0 %	0 %	312142410
7	NC_014654	AATT	2	8	2632	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	312142410
8	NC_014654	GAAG	2	8	2645	2652	50 %	0 %	50 %	0 %	312142410
9	NC_014654	ATTT	3	12	2833	2844	25 %	75 %	0 %	0 %	312142410
10	NC_014654	ATGG	2	8	4893	4900	25 %	25 %	50 %	0 %	312142414
11	NC_014654	AGAT	2	8	5051	5058	50 %	25 %	25 %	0 %	312142414
12	NC_014654	TAAA	2	8	5894	5901	75 %	25 %	0 %	0 %	312142414
13	NC_014654	ATAA	2	8	5971	5978	75 %	25 %	0 %	0 %	312142414
14	NC_014654	GTAG	2	8	6543	6550	25 %	25 %	50 %	0 %	312142415
15	NC_014654	ATAA	2	8	6867	6874	75 %	25 %	0 %	0 %	312142415
16	NC_014654	ATTA	2	8	7043	7050	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
17	NC_014654	TAAA	2	8	7255	7262	75 %	25 %	0 %	0 %	312142415
18	NC_014654	AAAG	2	8	7526	7533	75 %	0 %	25 %	0 %	312142415
19	NC_014654	TAGA	2	8	7573	7580	50 %	25 %	25 %	0 %	312142415
20	NC_014654	AGAA	2	8	7757	7764	75 %	0 %	25 %	0 %	312142415
21	NC_014654	AAGG	2	8	8137	8144	50 %	0 %	50 %	0 %	312142415
22	NC_014654	TTAA	2	8	8310	8317	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
23	NC_014654	AATT	2	8	8389	8396	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
24	NC_014654	TTAG	2	8	8433	8440	25 %	50 %	25 %	0 %	312142415
25	NC_014654	GTAG	2	8	8487	8494	25 %	25 %	50 %	0 %	312142415
26	NC_014654	ATTT	2	8	15416	15423	25 %	75 %	0 %	0 %	312142416
27	NC_014654	AAGT	2	8	15802	15809	50 %	25 %	25 %	0 %	312142416
28	NC_014654	AATT	2	8	15871	15878	50 %	50 %	0 %	0 %	312142416
29	NC_014654	ATGA	2	8	17578	17585	50 %	25 %	25 %	0 %	312142417
30	NC_014654	TGGT	2	8	18254	18261	0 %	50 %	50 %	0 %	312142418
31	NC_014654	ATCC	2	8	18643	18650	25 %	25 %	0 %	50 %	312142418
32	NC_014654	ATCA	2	8	18697	18704	50 %	25 %	0 %	25 %	312142418
33	NC_014654	AAAG	2	8	19080	19087	75 %	0 %	25 %	0 %	312142418
34	NC_014654	TGAT	2	8	19439	19446	25 %	50 %	25 %	0 %	312142418
35	NC_014654	AGAA	2	8	19810	19817	75 %	0 %	25 %	0 %	312142419
36	NC_014654	CTGT	2	8	19998	20005	0 %	50 %	25 %	25 %	312142419
37	NC_014654	GTTA	2	8	20471	20478	25 %	50 %	25 %	0 %	312142419
38	NC_014654	TTCT	2	8	20602	20609	0 %	75 %	0 %	25 %	312142419
39	NC_014654	GAAA	2	8	20731	20738	75 %	0 %	25 %	0 %	312142420
40	NC_014654	TGGA	2	8	21337	21344	25 %	25 %	50 %	0 %	312142421
41	NC_014654	ATTA	2	8	21627	21634	50 %	50 %	0 %	0 %	312142421
42	NC_014654	AGAA	2	8	22594	22601	75 %	0 %	25 %	0 %	312142422
43	NC_014654	TGTT	2	8	22731	22738	0 %	75 %	25 %	0 %	312142422
44	NC_014654	AAAG	2	8	23362	23369	75 %	0 %	25 %	0 %	312142423
45	NC_014654	TAAT	2	8	23578	23585	50 %	50 %	0 %	0 %	312142423
46	NC_014654	AAAT	2	8	25273	25280	75 %	25 %	0 %	0 %	312142426
47	NC_014654	TTCT	2	8	25363	25370	0 %	75 %	0 %	25 %	312142426
48	NC_014654	TAAA	2	8	25390	25397	75 %	25 %	0 %	0 %	312142426
49	NC_014654	ATTA	2	8	25894	25901	50 %	50 %	0 %	0 %	312142426
50	NC_014654	TTAA	2	8	25945	25952	50 %	50 %	0 %	0 %	312142427
51	NC_014654	TGAT	2	8	25997	26004	25 %	50 %	25 %	0 %	312142427
52	NC_014654	TTAT	2	8	26205	26212	25 %	75 %	0 %	0 %	312142427
53	NC_014654	TTAA	2	8	26756	26763	50 %	50 %	0 %	0 %	312142428
54	NC_014654	AAAG	2	8	26844	26851	75 %	0 %	25 %	0 %	312142428
55	NC_014654	GAAA	2	8	27190	27197	75 %	0 %	25 %	0 %	312142428
56	NC_014654	TAAA	2	8	27420	27427	75 %	25 %	0 %	0 %	312142428
57	NC_014654	AGAT	2	8	27547	27554	50 %	25 %	25 %	0 %	312142428
58	NC_014654	CAGG	2	8	28226	28233	25 %	0 %	50 %	25 %	312142429
59	NC_014654	ACAG	2	8	28313	28320	50 %	0 %	25 %	25 %	312142429
60	NC_014654	AATT	2	8	28333	28340	50 %	50 %	0 %	0 %	312142429
61	NC_014654	AAGT	2	8	28420	28427	50 %	25 %	25 %	0 %	312142429
62	NC_014654	GAAT	2	8	29051	29058	50 %	25 %	25 %	0 %	312142429
63	NC_014654	AATC	2	8	29284	29291	50 %	25 %	0 %	25 %	312142430
64	NC_014654	GTGG	2	8	29458	29465	0 %	25 %	75 %	0 %	312142430
65	NC_014654	ATAA	2	8	29896	29903	75 %	25 %	0 %	0 %	312142430
66	NC_014654	TTTG	2	8	30012	30019	0 %	75 %	25 %	0 %	312142430
67	NC_014654	TGCT	2	8	31584	31591	0 %	50 %	25 %	25 %	312142431
68	NC_014654	TAGG	2	8	31976	31983	25 %	25 %	50 %	0 %	312142431
69	NC_014654	TTAT	2	8	33113	33120	25 %	75 %	0 %	0 %	312142433
70	NC_014654	TATT	2	8	33285	33292	25 %	75 %	0 %	0 %	312142433
71	NC_014654	GCCA	2	8	33307	33314	25 %	0 %	25 %	50 %	312142433
72	NC_014654	TGAT	2	8	34170	34177	25 %	50 %	25 %	0 %	312142434
73	NC_014654	TTAA	2	8	34436	34443	50 %	50 %	0 %	0 %	312142434
74	NC_014654	CTTT	2	8	34605	34612	0 %	75 %	0 %	25 %	312142434
75	NC_014654	GTAA	2	8	34916	34923	50 %	25 %	25 %	0 %	312142434
76	NC_014654	ATTT	2	8	35692	35699	25 %	75 %	0 %	0 %	312142435
77	NC_014654	ATTT	2	8	35967	35974	25 %	75 %	0 %	0 %	312142435
78	NC_014654	AAGC	2	8	36702	36709	50 %	0 %	25 %	25 %	312142435
79	NC_014654	GATT	2	8	36939	36946	25 %	50 %	25 %	0 %	312142435
80	NC_014654	ACAA	2	8	38526	38533	75 %	0 %	0 %	25 %	312142437
81	NC_014654	GAAA	2	8	38904	38911	75 %	0 %	25 %	0 %	312142437
82	NC_014654	TGAT	2	8	39114	39121	25 %	50 %	25 %	0 %	312142437
83	NC_014654	TAAT	2	8	39159	39166	50 %	50 %	0 %	0 %	312142437
84	NC_014654	ATTG	2	8	39936	39943	25 %	50 %	25 %	0 %	312142438
85	NC_014654	TCTT	2	8	40035	40042	0 %	75 %	0 %	25 %	312142438
86	NC_014654	TTCT	2	8	40190	40197	0 %	75 %	0 %	25 %	312142439
87	NC_014654	TCTT	2	8	40259	40266	0 %	75 %	0 %	25 %	312142439
88	NC_014654	ATTT	2	8	40465	40472	25 %	75 %	0 %	0 %	312142439
89	NC_014654	ACCT	2	8	40921	40928	25 %	25 %	0 %	50 %	312142439
90	NC_014654	ATAG	2	8	42014	42021	50 %	25 %	25 %	0 %	312142441
91	NC_014654	ATAA	2	8	42122	42129	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
92	NC_014654	AAGT	2	8	42462	42469	50 %	25 %	25 %	0 %	312142441
93	NC_014654	AAAT	2	8	42628	42635	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
94	NC_014654	AAAT	2	8	43158	43165	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
95	NC_014654	AATT	2	8	43386	43393	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
96	NC_014654	AAAT	2	8	43503	43510	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
97	NC_014654	AAAT	2	8	43533	43540	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
98	NC_014654	ATTT	2	8	43563	43570	25 %	75 %	0 %	0 %	312142441
99	NC_014654	AAAC	2	8	43726	43733	75 %	0 %	0 %	25 %	312142441
100	NC_014654	AATA	2	8	43955	43962	75 %	25 %	0 %	0 %	312142441
101	NC_014654	GAAA	2	8	44356	44363	75 %	0 %	25 %	0 %	312142441
102	NC_014654	GATA	2	8	44365	44372	50 %	25 %	25 %	0 %	312142441
103	NC_014654	GAAA	2	8	44434	44441	75 %	0 %	25 %	0 %	312142441
104	NC_014654	TTAC	2	8	46682	46689	25 %	50 %	0 %	25 %	312142442
105	NC_014654	GAAA	2	8	46787	46794	75 %	0 %	25 %	0 %	312142442
106	NC_014654	GAGC	2	8	46833	46840	25 %	0 %	50 %	25 %	312142442
107	NC_014654	TCTT	2	8	47024	47031	0 %	75 %	0 %	25 %	312142442
108	NC_014654	GATA	2	8	47162	47169	50 %	25 %	25 %	0 %	312142442
109	NC_014654	AGTT	2	8	47218	47225	25 %	50 %	25 %	0 %	312142442
110	NC_014654	AAGG	2	8	47868	47875	50 %	0 %	50 %	0 %	312142443
111	NC_014654	AACT	2	8	48047	48054	50 %	25 %	0 %	25 %	312142443
112	NC_014654	GGTA	2	8	48362	48369	25 %	25 %	50 %	0 %	312142444
113	NC_014654	AGAA	2	8	48635	48642	75 %	0 %	25 %	0 %	312142444
114	NC_014654	ATCA	2	8	48765	48772	50 %	25 %	0 %	25 %	312142444
115	NC_014654	ATTT	2	8	48916	48923	25 %	75 %	0 %	0 %	312142445
116	NC_014654	TATT	2	8	49438	49445	25 %	75 %	0 %	0 %	312142445
117	NC_014654	ATTT	2	8	49467	49474	25 %	75 %	0 %	0 %	312142445
118	NC_014654	AAAT	2	8	49523	49530	75 %	25 %	0 %	0 %	312142445
119	NC_014654	GTTT	2	8	49780	49787	0 %	75 %	25 %	0 %	312142445
120	NC_014654	TGCC	2	8	49810	49817	0 %	25 %	25 %	50 %	312142445
121	NC_014654	AGTT	2	8	49838	49845	25 %	50 %	25 %	0 %	312142445
122	NC_014654	TAGA	2	8	49870	49877	50 %	25 %	25 %	0 %	312142445
123	NC_014654	GAAA	2	8	49928	49935	75 %	0 %	25 %	0 %	312142445
124	NC_014654	CTAG	2	8	50418	50425	25 %	25 %	25 %	25 %	312142445
125	NC_014654	AGTT	2	8	50638	50645	25 %	50 %	25 %	0 %	312142445
126	NC_014654	TTTA	2	8	50947	50954	25 %	75 %	0 %	0 %	312142446
127	NC_014654	TAAA	2	8	51127	51134	75 %	25 %	0 %	0 %	312142446
128	NC_014654	AATA	2	8	51575	51582	75 %	25 %	0 %	0 %	312142446
129	NC_014654	AGAA	2	8	51680	51687	75 %	0 %	25 %	0 %	312142446
130	NC_014654	AATT	2	8	52060	52067	50 %	50 %	0 %	0 %	312142446
131	NC_014654	AAAT	2	8	52233	52240	75 %	25 %	0 %	0 %	312142446
132	NC_014654	TTGG	2	8	52541	52548	0 %	50 %	50 %	0 %	312142447
133	NC_014654	AAGA	2	8	52702	52709	75 %	0 %	25 %	0 %	312142447
134	NC_014654	AGAA	2	8	52893	52900	75 %	0 %	25 %	0 %	312142447
135	NC_014654	CTTT	2	8	53047	53054	0 %	75 %	0 %	25 %	312142447
136	NC_014654	GTGG	2	8	53119	53126	0 %	25 %	75 %	0 %	312142447
137	NC_014654	TTAT	2	8	53341	53348	25 %	75 %	0 %	0 %	312142447
138	NC_014654	TTAA	2	8	53565	53572	50 %	50 %	0 %	0 %	312142448
139	NC_014654	AATT	2	8	53599	53606	50 %	50 %	0 %	0 %	312142448
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