MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 3702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	AT	3	6	262	267	50 %	50 %	0 %	0 %	312142409
2	NC_014654	TA	3	6	3087	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	312142411
3	NC_014654	AT	3	6	3187	3192	50 %	50 %	0 %	0 %	312142412
4	NC_014654	AG	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	312142412
5	NC_014654	GA	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	312142412
6	NC_014654	CT	3	6	3642	3647	0 %	50 %	0 %	50 %	312142412
7	NC_014654	AT	3	6	3787	3792	50 %	50 %	0 %	0 %	312142412
8	NC_014654	CA	3	6	3907	3912	50 %	0 %	0 %	50 %	312142412
9	NC_014654	CA	3	6	4330	4335	50 %	0 %	0 %	50 %	312142413
10	NC_014654	GA	3	6	4416	4421	50 %	0 %	50 %	0 %	312142413
11	NC_014654	AT	3	6	4424	4429	50 %	50 %	0 %	0 %	312142413
12	NC_014654	AG	3	6	4512	4517	50 %	0 %	50 %	0 %	312142414
13	NC_014654	TA	3	6	4588	4593	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
14	NC_014654	TA	3	6	4931	4936	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
15	NC_014654	TA	3	6	5780	5785	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
16	NC_014654	TA	3	6	6119	6124	50 %	50 %	0 %	0 %	312142414
17	NC_014654	TA	3	6	7411	7416	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
18	NC_014654	AT	3	6	7991	7996	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
19	NC_014654	AT	3	6	8089	8094	50 %	50 %	0 %	0 %	312142415
20	NC_014654	TA	3	6	18512	18517	50 %	50 %	0 %	0 %	312142418
21	NC_014654	AG	3	6	21602	21607	50 %	0 %	50 %	0 %	312142421
22	NC_014654	TA	3	6	22350	22355	50 %	50 %	0 %	0 %	312142422
23	NC_014654	AT	3	6	22807	22812	50 %	50 %	0 %	0 %	312142422
24	NC_014654	TA	3	6	23209	23214	50 %	50 %	0 %	0 %	312142423
25	NC_014654	GA	3	6	23488	23493	50 %	0 %	50 %	0 %	312142423
26	NC_014654	TA	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	312142423
27	NC_014654	TA	3	6	24455	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	312142425
28	NC_014654	AG	3	6	25553	25558	50 %	0 %	50 %	0 %	312142426
29	NC_014654	AT	3	6	26707	26712	50 %	50 %	0 %	0 %	312142428
30	NC_014654	AG	3	6	27328	27333	50 %	0 %	50 %	0 %	312142428
31	NC_014654	AG	3	6	29032	29037	50 %	0 %	50 %	0 %	312142429
32	NC_014654	AG	3	6	29073	29078	50 %	0 %	50 %	0 %	312142429
33	NC_014654	TA	3	6	29558	29563	50 %	50 %	0 %	0 %	312142430
34	NC_014654	AG	4	8	30228	30235	50 %	0 %	50 %	0 %	312142430
35	NC_014654	AT	3	6	30432	30437	50 %	50 %	0 %	0 %	312142430
36	NC_014654	TG	3	6	31105	31110	0 %	50 %	50 %	0 %	312142431
37	NC_014654	AG	3	6	31329	31334	50 %	0 %	50 %	0 %	312142431
38	NC_014654	AT	3	6	32055	32060	50 %	50 %	0 %	0 %	312142431
39	NC_014654	AT	3	6	32605	32610	50 %	50 %	0 %	0 %	312142432
40	NC_014654	GA	3	6	33047	33052	50 %	0 %	50 %	0 %	312142433
41	NC_014654	AT	3	6	33883	33888	50 %	50 %	0 %	0 %	312142433
42	NC_014654	AT	3	6	34258	34263	50 %	50 %	0 %	0 %	312142434
43	NC_014654	TA	3	6	34535	34540	50 %	50 %	0 %	0 %	312142434
44	NC_014654	GA	4	8	34984	34991	50 %	0 %	50 %	0 %	312142434
45	NC_014654	AG	3	6	35345	35350	50 %	0 %	50 %	0 %	312142435
46	NC_014654	TA	3	6	35555	35560	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
47	NC_014654	TA	3	6	35562	35567	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
48	NC_014654	TA	3	6	36539	36544	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
49	NC_014654	AG	3	6	37031	37036	50 %	0 %	50 %	0 %	312142435
50	NC_014654	TA	3	6	37178	37183	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
51	NC_014654	AT	3	6	37621	37626	50 %	50 %	0 %	0 %	312142435
52	NC_014654	TA	3	6	37901	37906	50 %	50 %	0 %	0 %	312142436
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54	NC_014654	AT	3	6	40397	40402	50 %	50 %	0 %	0 %	312142439
55	NC_014654	TA	3	6	40564	40569	50 %	50 %	0 %	0 %	312142439
56	NC_014654	AT	3	6	40694	40699	50 %	50 %	0 %	0 %	312142439
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58	NC_014654	AT	4	8	42034	42041	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
59	NC_014654	TA	5	10	42076	42085	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
60	NC_014654	TA	4	8	42322	42329	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
61	NC_014654	TA	3	6	43263	43268	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
62	NC_014654	TA	3	6	43541	43546	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
63	NC_014654	TA	3	6	43659	43664	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
64	NC_014654	AT	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
65	NC_014654	GA	3	6	43829	43834	50 %	0 %	50 %	0 %	312142441
66	NC_014654	AT	3	6	43943	43948	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
67	NC_014654	TA	3	6	43961	43966	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
68	NC_014654	AT	3	6	44394	44399	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
69	NC_014654	AG	3	6	44462	44467	50 %	0 %	50 %	0 %	312142441
70	NC_014654	TA	3	6	44621	44626	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
71	NC_014654	TA	3	6	44672	44677	50 %	50 %	0 %	0 %	312142441
72	NC_014654	AT	3	6	46856	46861	50 %	50 %	0 %	0 %	312142442
73	NC_014654	AT	3	6	47744	47749	50 %	50 %	0 %	0 %	312142443
74	NC_014654	AT	3	6	47932	47937	50 %	50 %	0 %	0 %	312142443
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80	NC_014654	AT	4	8	50215	50222	50 %	50 %	0 %	0 %	312142445
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82	NC_014654	AT	3	6	52089	52094	50 %	50 %	0 %	0 %	312142446
83	NC_014654	AT	3	6	52670	52675	50 %	50 %	0 %	0 %	312142447
84	NC_014654	AT	3	6	52949	52954	50 %	50 %	0 %	0 %	312142447
85	NC_014654	AT	4	8	52997	53004	50 %	50 %	0 %	0 %	312142447
86	NC_014654	AT	3	6	53315	53320	50 %	50 %	0 %	0 %	312142447
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88	NC_014654	TA	3	6	53511	53516	50 %	50 %	0 %	0 %	312142448
89	NC_014654	TA	4	8	53634	53641	50 %	50 %	0 %	0 %	312142448
90	NC_014654	AT	3	6	54245	54250	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
91	NC_014654	AT	3	6	54407	54412	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
92	NC_014654	AT	3	6	54441	54446	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
93	NC_014654	AT	3	6	54636	54641	50 %	50 %	0 %	0 %	312142449
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102	NC_014654	CT	3	6	55900	55905	0 %	50 %	0 %	50 %	312142450
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104	NC_014654	AT	3	6	56753	56758	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
105	NC_014654	TA	3	6	57074	57079	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
106	NC_014654	AT	3	6	57096	57101	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
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108	NC_014654	AT	3	6	57197	57202	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
109	NC_014654	AG	3	6	57549	57554	50 %	0 %	50 %	0 %	312142451
110	NC_014654	TA	3	6	57599	57604	50 %	50 %	0 %	0 %	312142451
111	NC_014654	AT	3	6	59992	59997	50 %	50 %	0 %	0 %	312142452
112	NC_014654	TA	3	6	60112	60117	50 %	50 %	0 %	0 %	312142452
113	NC_014654	TA	3	6	60218	60223	50 %	50 %	0 %	0 %	312142452
114	NC_014654	AG	3	6	60919	60924	50 %	0 %	50 %	0 %	312142452
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121	NC_014654	AT	3	6	68833	68838	50 %	50 %	0 %	0 %	312142458
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129	NC_014654	TA	3	6	70734	70739	50 %	50 %	0 %	0 %	312142460
130	NC_014654	AT	3	6	70843	70848	50 %	50 %	0 %	0 %	312142460
131	NC_014654	TA	3	6	71046	71051	50 %	50 %	0 %	0 %	312142460
132	NC_014654	TA	3	6	71553	71558	50 %	50 %	0 %	0 %	312142461
133	NC_014654	TA	3	6	71821	71826	50 %	50 %	0 %	0 %	312142461
134	NC_014654	AT	3	6	72249	72254	50 %	50 %	0 %	0 %	312142462
135	NC_014654	TA	3	6	72259	72264	50 %	50 %	0 %	0 %	312142462
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139	NC_014654	TG	3	6	73872	73877	0 %	50 %	50 %	0 %	312142463
140	NC_014654	TA	3	6	74808	74813	50 %	50 %	0 %	0 %	312142464
141	NC_014654	AG	3	6	75501	75506	50 %	0 %	50 %	0 %	312142464
142	NC_014654	AT	6	12	75832	75843	50 %	50 %	0 %	0 %	312142465
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