MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 6716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014652	AT	3	6	190	195	50 %	50 %	0 %	0 %	312126263
2	NC_014652	CT	3	6	305	310	0 %	50 %	0 %	50 %	312126263
3	NC_014652	GA	4	8	538	545	50 %	0 %	50 %	0 %	312126263
4	NC_014652	CA	3	6	810	815	50 %	0 %	0 %	50 %	312126263
5	NC_014652	AG	3	6	1056	1061	50 %	0 %	50 %	0 %	312126263
6	NC_014652	TG	3	6	1493	1498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014652	AT	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014652	GT	3	6	1785	1790	0 %	50 %	50 %	0 %	312126264
9	NC_014652	GA	3	6	2693	2698	50 %	0 %	50 %	0 %	312126264
10	NC_014652	TA	3	6	3880	3885	50 %	50 %	0 %	0 %	312126265
11	NC_014652	TA	3	6	4327	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	312126267
12	NC_014652	GA	3	6	4564	4569	50 %	0 %	50 %	0 %	312126267
13	NC_014652	GC	3	6	5281	5286	0 %	0 %	50 %	50 %	312126267
14	NC_014652	GC	3	6	5389	5394	0 %	0 %	50 %	50 %	312126267
15	NC_014652	AG	3	6	5413	5418	50 %	0 %	50 %	0 %	312126267
16	NC_014652	AG	3	6	6097	6102	50 %	0 %	50 %	0 %	312126267
17	NC_014652	AT	3	6	6140	6145	50 %	50 %	0 %	0 %	312126267
18	NC_014652	AG	3	6	6220	6225	50 %	0 %	50 %	0 %	312126268
19	NC_014652	TA	3	6	6480	6485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014652	AT	3	6	6823	6828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014652	CT	3	6	6880	6885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014652	GA	3	6	8062	8067	50 %	0 %	50 %	0 %	312126269
23	NC_014652	AG	3	6	8236	8241	50 %	0 %	50 %	0 %	312126269
24	NC_014652	TA	3	6	8631	8636	50 %	50 %	0 %	0 %	312126270
25	NC_014652	GA	3	6	8681	8686	50 %	0 %	50 %	0 %	312126270
26	NC_014652	AG	3	6	9788	9793	50 %	0 %	50 %	0 %	312126270
27	NC_014652	TA	3	6	10110	10115	50 %	50 %	0 %	0 %	312126270
28	NC_014652	TC	3	6	10891	10896	0 %	50 %	0 %	50 %	312126270
29	NC_014652	TA	5	10	11615	11624	50 %	50 %	0 %	0 %	312126271
30	NC_014652	AT	4	8	12107	12114	50 %	50 %	0 %	0 %	312126271
31	NC_014652	AT	3	6	12133	12138	50 %	50 %	0 %	0 %	312126271
32	NC_014652	GT	3	6	12214	12219	0 %	50 %	50 %	0 %	312126271
33	NC_014652	GA	4	8	12585	12592	50 %	0 %	50 %	0 %	312126271
34	NC_014652	AT	3	6	12593	12598	50 %	50 %	0 %	0 %	312126271
35	NC_014652	CT	3	6	13159	13164	0 %	50 %	0 %	50 %	312126271
36	NC_014652	GA	3	6	15180	15185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014652	TC	3	6	15211	15216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014652	GA	3	6	16856	16861	50 %	0 %	50 %	0 %	312126276
39	NC_014652	AT	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	312126277
40	NC_014652	TA	3	6	17241	17246	50 %	50 %	0 %	0 %	312126277
41	NC_014652	TC	3	6	17606	17611	0 %	50 %	0 %	50 %	312126278
42	NC_014652	TG	3	6	17826	17831	0 %	50 %	50 %	0 %	312126278
43	NC_014652	AT	3	6	18131	18136	50 %	50 %	0 %	0 %	312126278
44	NC_014652	CT	3	6	18802	18807	0 %	50 %	0 %	50 %	312126278
45	NC_014652	AT	3	6	19558	19563	50 %	50 %	0 %	0 %	312126278
46	NC_014652	AT	3	6	20679	20684	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
47	NC_014652	TA	3	6	20971	20976	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
48	NC_014652	AT	3	6	21240	21245	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
49	NC_014652	AT	4	8	21422	21429	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
50	NC_014652	AT	3	6	21532	21537	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
51	NC_014652	AT	3	6	21720	21725	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
52	NC_014652	TA	3	6	21926	21931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014652	TA	4	8	22026	22033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014652	AT	3	6	23035	23040	50 %	50 %	0 %	0 %	312126280
55	NC_014652	TC	3	6	23407	23412	0 %	50 %	0 %	50 %	312126280
56	NC_014652	TA	3	6	24722	24727	50 %	50 %	0 %	0 %	312126281
57	NC_014652	TA	3	6	24967	24972	50 %	50 %	0 %	0 %	312126281
58	NC_014652	AC	3	6	25360	25365	50 %	0 %	0 %	50 %	312126282
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62	NC_014652	GA	3	6	26579	26584	50 %	0 %	50 %	0 %	312126283
63	NC_014652	AG	3	6	26966	26971	50 %	0 %	50 %	0 %	312126283
64	NC_014652	AT	3	6	27274	27279	50 %	50 %	0 %	0 %	312126283
65	NC_014652	AG	3	6	27338	27343	50 %	0 %	50 %	0 %	312126283
66	NC_014652	AG	3	6	27802	27807	50 %	0 %	50 %	0 %	312126284
67	NC_014652	TA	3	6	28032	28037	50 %	50 %	0 %	0 %	312126284
68	NC_014652	GA	3	6	28924	28929	50 %	0 %	50 %	0 %	312126284
69	NC_014652	GC	3	6	29247	29252	0 %	0 %	50 %	50 %	312126284
70	NC_014652	TA	3	6	29952	29957	50 %	50 %	0 %	0 %	312126285
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72	NC_014652	GC	3	6	30709	30714	0 %	0 %	50 %	50 %	312126285
73	NC_014652	AT	3	6	31123	31128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014652	TG	3	6	31184	31189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014652	TA	3	6	32249	32254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014652	TA	3	6	32701	32706	50 %	50 %	0 %	0 %	312126287
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78	NC_014652	AT	3	6	33165	33170	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
79	NC_014652	AT	3	6	33242	33247	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
80	NC_014652	TC	4	8	33387	33394	0 %	50 %	0 %	50 %	312126288
81	NC_014652	AT	3	6	33671	33676	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
82	NC_014652	GA	3	6	33719	33724	50 %	0 %	50 %	0 %	312126288
83	NC_014652	GA	3	6	33894	33899	50 %	0 %	50 %	0 %	312126288
84	NC_014652	AT	3	6	34318	34323	50 %	50 %	0 %	0 %	312126288
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92	NC_014652	AT	3	6	36939	36944	50 %	50 %	0 %	0 %	312126290
93	NC_014652	AT	3	6	37472	37477	50 %	50 %	0 %	0 %	312126290
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104	NC_014652	TA	3	6	41535	41540	50 %	50 %	0 %	0 %	312126294
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106	NC_014652	AT	3	6	42076	42081	50 %	50 %	0 %	0 %	312126295
107	NC_014652	GA	3	6	42360	42365	50 %	0 %	50 %	0 %	312126295
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111	NC_014652	GA	3	6	43311	43316	50 %	0 %	50 %	0 %	312126296
112	NC_014652	TA	3	6	43681	43686	50 %	50 %	0 %	0 %	312126296
113	NC_014652	TA	3	6	43754	43759	50 %	50 %	0 %	0 %	312126296
114	NC_014652	TA	3	6	44153	44158	50 %	50 %	0 %	0 %	312126296
115	NC_014652	TA	3	6	44276	44281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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117	NC_014652	TC	3	6	44901	44906	0 %	50 %	0 %	50 %	312126297
118	NC_014652	TA	3	6	44930	44935	50 %	50 %	0 %	0 %	312126297
119	NC_014652	TA	3	6	45303	45308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_014652	TA	3	6	47541	47546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_014652	CT	4	8	47905	47912	0 %	50 %	0 %	50 %	312126301
125	NC_014652	CT	3	6	48137	48142	0 %	50 %	0 %	50 %	312126301
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127	NC_014652	TA	3	6	50063	50068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014652	AT	3	6	50194	50199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014652	TA	3	6	50387	50392	50 %	50 %	0 %	0 %	312126304
130	NC_014652	AG	3	6	50887	50892	50 %	0 %	50 %	0 %	312126304
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139	NC_014652	TC	3	6	55212	55217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014652	AT	3	6	55365	55370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014652	GC	3	6	55491	55496	0 %	0 %	50 %	50 %	312126305
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