MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	TGAAA	2	10	699	708	60 %	20 %	20 %	0 %	312193407
2	NC_014651	TTGTT	2	10	1715	1724	0 %	80 %	20 %	0 %	312193410
3	NC_014651	TGCAT	2	10	4006	4015	20 %	40 %	20 %	20 %	312193413
4	NC_014651	GATGC	2	10	4107	4116	20 %	20 %	40 %	20 %	312193413
5	NC_014651	TTTCA	2	10	4126	4135	20 %	60 %	0 %	20 %	312193413
6	NC_014651	TTATT	2	10	4701	4710	20 %	80 %	0 %	0 %	312193414
7	NC_014651	TCCTT	2	10	5062	5071	0 %	60 %	0 %	40 %	312193414
8	NC_014651	GCTAA	2	10	7383	7392	40 %	20 %	20 %	20 %	312193415
9	NC_014651	CCCGA	2	10	7974	7983	20 %	0 %	20 %	60 %	312193416
10	NC_014651	TTTAC	2	10	14879	14888	20 %	60 %	0 %	20 %	312193422
11	NC_014651	TCCCG	2	10	16664	16673	0 %	20 %	20 %	60 %	312193424
12	NC_014651	GCGCT	2	10	16983	16992	0 %	20 %	40 %	40 %	312193424
13	NC_014651	ACGAA	2	10	17031	17040	60 %	0 %	20 %	20 %	312193424
14	NC_014651	TTTTA	2	10	18412	18421	20 %	80 %	0 %	0 %	312193427
15	NC_014651	TCAAA	2	10	18495	18504	60 %	20 %	0 %	20 %	312193427
16	NC_014651	AAGAA	2	10	22506	22515	80 %	0 %	20 %	0 %	312193431
17	NC_014651	GATTT	2	10	25004	25013	20 %	60 %	20 %	0 %	312193432
18	NC_014651	TGCGC	2	10	25945	25954	0 %	20 %	40 %	40 %	312193433
19	NC_014651	ATTGG	2	10	27932	27941	20 %	40 %	40 %	0 %	312193434
20	NC_014651	AAGCA	2	10	27964	27973	60 %	0 %	20 %	20 %	312193434
21	NC_014651	GGGAA	2	10	30495	30504	40 %	0 %	60 %	0 %	312193436
22	NC_014651	AAGGA	2	10	31661	31670	60 %	0 %	40 %	0 %	312193438
23	NC_014651	GGACA	2	10	32101	32110	40 %	0 %	40 %	20 %	312193440
24	NC_014651	TTTCC	2	10	32138	32147	0 %	60 %	0 %	40 %	312193440
25	NC_014651	CGGAA	2	10	32704	32713	40 %	0 %	40 %	20 %	312193441
26	NC_014651	ATCCT	2	10	33493	33502	20 %	40 %	0 %	40 %	312193442
27	NC_014651	CAAGC	2	10	33854	33863	40 %	0 %	20 %	40 %	312193442
28	NC_014651	TTCAT	2	10	41465	41474	20 %	60 %	0 %	20 %	312193445
29	NC_014651	ATAAA	2	10	47344	47353	80 %	20 %	0 %	0 %	312193450
30	NC_014651	AAATG	2	10	49898	49907	60 %	20 %	20 %	0 %	312193453
31	NC_014651	TCTAT	2	10	52878	52887	20 %	60 %	0 %	20 %	312193455
32	NC_014651	TTTGT	2	10	53132	53141	0 %	80 %	20 %	0 %	312193455
33	NC_014651	CTAAG	2	10	55425	55434	40 %	20 %	20 %	20 %	312193457
34	NC_014651	CGATG	2	10	55492	55501	20 %	20 %	40 %	20 %	312193457
35	NC_014651	TTGGT	2	10	55618	55627	0 %	60 %	40 %	0 %	312193457
36	NC_014651	TTCCC	2	10	56494	56503	0 %	40 %	0 %	60 %	312193458
37	NC_014651	ACGTA	2	10	56908	56917	40 %	20 %	20 %	20 %	312193458
38	NC_014651	CAAAA	2	10	59005	59014	80 %	0 %	0 %	20 %	312193460
39	NC_014651	TTTTC	2	10	60458	60467	0 %	80 %	0 %	20 %	312193461
40	NC_014651	CAATG	2	10	61467	61476	40 %	20 %	20 %	20 %	312193462
41	NC_014651	TCCGG	2	10	64759	64768	0 %	20 %	40 %	40 %	312193465
42	NC_014651	CGTAT	2	10	65857	65866	20 %	40 %	20 %	20 %	312193466
43	NC_014651	CTGGA	2	10	66611	66620	20 %	20 %	40 %	20 %	312193466
44	NC_014651	GGAAA	2	10	66830	66839	60 %	0 %	40 %	0 %	312193467
45	NC_014651	TTAAG	2	10	68444	68453	40 %	40 %	20 %	0 %	312193469
46	NC_014651	GAAAA	2	10	69143	69152	80 %	0 %	20 %	0 %	312193469
47	NC_014651	ATTTT	2	10	70573	70582	20 %	80 %	0 %	0 %	312193470
48	NC_014651	AACCG	2	10	71197	71206	40 %	0 %	20 %	40 %	312193470

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.