MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	TTTG	2	8	23	30	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014651	TGTT	2	8	148	155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014651	TGTT	2	8	190	197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014651	AACA	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014651	TGAA	2	8	443	450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014651	CCAA	2	8	961	968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014651	CTTA	2	8	1681	1688	25 %	50 %	0 %	25 %	312193410
8	NC_014651	CAAA	2	8	1759	1766	75 %	0 %	0 %	25 %	312193410
9	NC_014651	TTTA	2	8	1915	1922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014651	TAAA	2	8	2047	2054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014651	CGGC	2	8	2368	2375	0 %	0 %	50 %	50 %	312193411
12	NC_014651	CAAT	2	8	2594	2601	50 %	25 %	0 %	25 %	312193411
13	NC_014651	GATC	2	8	2834	2841	25 %	25 %	25 %	25 %	312193411
14	NC_014651	TAAA	2	8	3165	3172	75 %	25 %	0 %	0 %	312193412
15	NC_014651	TCTG	2	8	4069	4076	0 %	50 %	25 %	25 %	312193413
16	NC_014651	CAAG	2	8	4527	4534	50 %	0 %	25 %	25 %	312193413
17	NC_014651	GCGA	2	8	4744	4751	25 %	0 %	50 %	25 %	312193414
18	NC_014651	AAAG	2	8	4974	4981	75 %	0 %	25 %	0 %	312193414
19	NC_014651	CTTA	2	8	5182	5189	25 %	50 %	0 %	25 %	312193414
20	NC_014651	TAAA	2	8	5519	5526	75 %	25 %	0 %	0 %	312193414
21	NC_014651	CCCT	2	8	5846	5853	0 %	25 %	0 %	75 %	312193414
22	NC_014651	AGAA	2	8	5933	5940	75 %	0 %	25 %	0 %	312193414
23	NC_014651	CGAG	2	8	8518	8525	25 %	0 %	50 %	25 %	312193416
24	NC_014651	TGCC	2	8	9062	9069	0 %	25 %	25 %	50 %	312193417
25	NC_014651	CATC	2	8	9124	9131	25 %	25 %	0 %	50 %	312193417
26	NC_014651	CGGC	2	8	9517	9524	0 %	0 %	50 %	50 %	312193417
27	NC_014651	GCGG	2	8	9853	9860	0 %	0 %	75 %	25 %	312193417
28	NC_014651	GAAA	2	8	11051	11058	75 %	0 %	25 %	0 %	312193418
29	NC_014651	CAAA	2	8	11357	11364	75 %	0 %	0 %	25 %	312193418
30	NC_014651	GCCG	2	8	12103	12110	0 %	0 %	50 %	50 %	312193419
31	NC_014651	TCCG	2	8	12411	12418	0 %	25 %	25 %	50 %	312193419
32	NC_014651	GACA	2	8	12454	12461	50 %	0 %	25 %	25 %	312193419
33	NC_014651	GAAA	2	8	12492	12499	75 %	0 %	25 %	0 %	312193419
34	NC_014651	CAAG	2	8	12620	12627	50 %	0 %	25 %	25 %	312193420
35	NC_014651	CTTG	2	8	12641	12648	0 %	50 %	25 %	25 %	312193420
36	NC_014651	GTTT	2	8	14248	14255	0 %	75 %	25 %	0 %	312193421
37	NC_014651	GGCA	2	8	14901	14908	25 %	0 %	50 %	25 %	312193422
38	NC_014651	TTCG	2	8	15114	15121	0 %	50 %	25 %	25 %	312193422
39	NC_014651	GGCT	2	8	15403	15410	0 %	25 %	50 %	25 %	312193423
40	NC_014651	GCGG	2	8	15650	15657	0 %	0 %	75 %	25 %	312193423
41	NC_014651	GCCG	2	8	15705	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	312193423
42	NC_014651	CAAA	2	8	16001	16008	75 %	0 %	0 %	25 %	312193424
43	NC_014651	GAAA	2	8	16358	16365	75 %	0 %	25 %	0 %	312193424
44	NC_014651	CGCC	2	8	17065	17072	0 %	0 %	25 %	75 %	312193424
45	NC_014651	CGCC	2	8	17105	17112	0 %	0 %	25 %	75 %	312193424
46	NC_014651	TTCG	2	8	17211	17218	0 %	50 %	25 %	25 %	312193425
47	NC_014651	GCTG	2	8	17359	17366	0 %	25 %	50 %	25 %	312193425
48	NC_014651	ACGA	2	8	17608	17615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014651	CCAT	2	8	17898	17905	25 %	25 %	0 %	50 %	312193426
50	NC_014651	AGTT	2	8	18188	18195	25 %	50 %	25 %	0 %	312193427
51	NC_014651	TTTA	2	8	18438	18445	25 %	75 %	0 %	0 %	312193427
52	NC_014651	TTGT	2	8	18751	18758	0 %	75 %	25 %	0 %	312193427
53	NC_014651	TGAT	2	8	18944	18951	25 %	50 %	25 %	0 %	312193427
54	NC_014651	ATTC	2	8	19297	19304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014651	CGTT	2	8	19464	19471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014651	ATGA	2	8	19728	19735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014651	ATTT	2	8	20121	20128	25 %	75 %	0 %	0 %	312193428
58	NC_014651	AAAT	2	8	20318	20325	75 %	25 %	0 %	0 %	312193428
59	NC_014651	TTAT	2	8	20337	20344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014651	GTTG	2	8	20968	20975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014651	TTGA	2	8	20981	20988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014651	ATTC	2	8	21183	21190	25 %	50 %	0 %	25 %	312193429
63	NC_014651	AAAT	2	8	21221	21228	75 %	25 %	0 %	0 %	312193429
64	NC_014651	CTTT	2	8	21325	21332	0 %	75 %	0 %	25 %	312193429
65	NC_014651	TCGC	2	8	21780	21787	0 %	25 %	25 %	50 %	312193430
66	NC_014651	TTCG	2	8	22070	22077	0 %	50 %	25 %	25 %	312193430
67	NC_014651	CTTT	2	8	22251	22258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014651	ATTT	2	8	22267	22274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014651	TTTA	2	8	22288	22295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014651	ATCG	2	8	23295	23302	25 %	25 %	25 %	25 %	312193431
71	NC_014651	GAAA	2	8	23428	23435	75 %	0 %	25 %	0 %	312193431
72	NC_014651	TAAC	2	8	24453	24460	50 %	25 %	0 %	25 %	312193432
73	NC_014651	GGGC	2	8	24488	24495	0 %	0 %	75 %	25 %	312193432
74	NC_014651	AAGC	2	8	24540	24547	50 %	0 %	25 %	25 %	312193432
75	NC_014651	AAGC	2	8	24617	24624	50 %	0 %	25 %	25 %	312193432
76	NC_014651	GGAA	2	8	24904	24911	50 %	0 %	50 %	0 %	312193432
77	NC_014651	ATTT	2	8	25901	25908	25 %	75 %	0 %	0 %	312193433
78	NC_014651	GAAA	2	8	26092	26099	75 %	0 %	25 %	0 %	312193433
79	NC_014651	GCGT	2	8	26124	26131	0 %	25 %	50 %	25 %	312193433
80	NC_014651	TGGA	2	8	26405	26412	25 %	25 %	50 %	0 %	312193433
81	NC_014651	TTGT	2	8	27112	27119	0 %	75 %	25 %	0 %	312193434
82	NC_014651	TTGA	2	8	27580	27587	25 %	50 %	25 %	0 %	312193434
83	NC_014651	GGAT	2	8	27616	27623	25 %	25 %	50 %	0 %	312193434
84	NC_014651	AAAC	2	8	27980	27987	75 %	0 %	0 %	25 %	312193434
85	NC_014651	TTTA	2	8	28437	28444	25 %	75 %	0 %	0 %	312193435
86	NC_014651	TTGC	2	8	28862	28869	0 %	50 %	25 %	25 %	312193435
87	NC_014651	CAGC	2	8	29430	29437	25 %	0 %	25 %	50 %	312193436
88	NC_014651	ATTC	2	8	29971	29978	25 %	50 %	0 %	25 %	312193436
89	NC_014651	CGAT	2	8	30299	30306	25 %	25 %	25 %	25 %	312193436
90	NC_014651	AGAA	2	8	30712	30719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014651	CGGC	2	8	30757	30764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014651	GGAA	2	8	30941	30948	50 %	0 %	50 %	0 %	312193437
93	NC_014651	CGAT	2	8	31918	31925	25 %	25 %	25 %	25 %	312193439
94	NC_014651	CAAG	2	8	33807	33814	50 %	0 %	25 %	25 %	312193442
95	NC_014651	AAAC	2	8	34115	34122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014651	AAAT	2	8	34131	34138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014651	CAAT	2	8	34155	34162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014651	AAAT	2	8	34163	34170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014651	ATAA	2	8	34189	34196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014651	GCAA	2	8	34865	34872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014651	GACA	2	8	35062	35069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014651	CTTT	2	8	35433	35440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014651	CGAC	2	8	35620	35627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014651	AAGC	2	8	35786	35793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014651	TGAT	2	8	35963	35970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014651	ATCA	2	8	36037	36044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014651	GGAT	2	8	36056	36063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014651	GCGG	2	8	36213	36220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014651	AAGA	2	8	36296	36303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014651	ATTT	2	8	36572	36579	25 %	75 %	0 %	0 %	312193443
111	NC_014651	TATT	2	8	36686	36693	25 %	75 %	0 %	0 %	312193443
112	NC_014651	ATTG	2	8	36726	36733	25 %	50 %	25 %	0 %	312193443
113	NC_014651	AACG	2	8	36807	36814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014651	TCGG	2	8	36881	36888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014651	AAGA	2	8	36927	36934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014651	ATTG	2	8	37235	37242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014651	CTTC	2	8	37879	37886	0 %	50 %	0 %	50 %	312193444
118	NC_014651	CTTT	2	8	37960	37967	0 %	75 %	0 %	25 %	312193444
119	NC_014651	GATT	2	8	38142	38149	25 %	50 %	25 %	0 %	312193444
120	NC_014651	GAAG	2	8	38271	38278	50 %	0 %	50 %	0 %	312193444
121	NC_014651	TCCG	2	8	38536	38543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014651	AGCG	2	8	38708	38715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014651	GAGC	2	8	38746	38753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014651	CCAT	2	8	38803	38810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014651	ATCC	2	8	38818	38825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014651	AGCC	2	8	38986	38993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014651	TCAT	2	8	39048	39055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014651	CAAC	2	8	39272	39279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014651	CCTC	2	8	39364	39371	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_014651	GAAA	2	8	39446	39453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014651	GCCC	2	8	39593	39600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_014651	TAAA	2	8	39713	39720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014651	CGTA	2	8	41044	41051	25 %	25 %	25 %	25 %	312193445
134	NC_014651	CAGC	2	8	41356	41363	25 %	0 %	25 %	50 %	312193445
135	NC_014651	TTCT	2	8	41506	41513	0 %	75 %	0 %	25 %	312193445
136	NC_014651	GCAA	2	8	41515	41522	50 %	0 %	25 %	25 %	312193445
137	NC_014651	AGAA	2	8	42212	42219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014651	AAGA	2	8	42417	42424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014651	ACTT	2	8	42682	42689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014651	AGCA	2	8	43009	43016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014651	ATAA	2	8	43256	43263	75 %	25 %	0 %	0 %	312193446
142	NC_014651	GTCC	2	8	43343	43350	0 %	25 %	25 %	50 %	312193446
143	NC_014651	ACGG	2	8	43674	43681	25 %	0 %	50 %	25 %	312193447
144	NC_014651	CTTT	2	8	44121	44128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014651	TTGT	2	8	44357	44364	0 %	75 %	25 %	0 %	312193448
146	NC_014651	TAAA	2	8	44761	44768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014651	CTTT	2	8	44808	44815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_014651	TATT	2	8	58538	58545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.