MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	TTTG	2	8	23	30	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014651	TGTT	2	8	148	155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014651	TGTT	2	8	190	197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014651	AACA	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014651	TGAA	2	8	443	450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014651	CCAA	2	8	961	968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014651	TTTA	2	8	1915	1922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014651	TAAA	2	8	2047	2054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014651	ACGA	2	8	17608	17615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014651	ATTC	2	8	19297	19304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014651	CGTT	2	8	19464	19471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014651	ATGA	2	8	19728	19735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014651	TTAT	2	8	20337	20344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014651	GTTG	2	8	20968	20975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014651	TTGA	2	8	20981	20988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014651	CTTT	2	8	22251	22258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014651	ATTT	2	8	22267	22274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014651	TTTA	2	8	22288	22295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014651	AGAA	2	8	30712	30719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014651	CGGC	2	8	30757	30764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014651	AAAC	2	8	34115	34122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014651	AAAT	2	8	34131	34138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014651	CAAT	2	8	34155	34162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014651	AAAT	2	8	34163	34170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014651	ATAA	2	8	34189	34196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014651	GCAA	2	8	34865	34872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014651	GACA	2	8	35062	35069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014651	CTTT	2	8	35433	35440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014651	CGAC	2	8	35620	35627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014651	AAGC	2	8	35786	35793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014651	TGAT	2	8	35963	35970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014651	ATCA	2	8	36037	36044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014651	GGAT	2	8	36056	36063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014651	GCGG	2	8	36213	36220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014651	AAGA	2	8	36296	36303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014651	AACG	2	8	36807	36814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014651	TCGG	2	8	36881	36888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014651	AAGA	2	8	36927	36934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014651	ATTG	2	8	37235	37242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014651	TCCG	2	8	38536	38543	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014651	AGCG	2	8	38708	38715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014651	GAGC	2	8	38746	38753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014651	CCAT	2	8	38803	38810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014651	ATCC	2	8	38818	38825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014651	AGCC	2	8	38986	38993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014651	TCAT	2	8	39048	39055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014651	CAAC	2	8	39272	39279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014651	CCTC	2	8	39364	39371	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_014651	GAAA	2	8	39446	39453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014651	GCCC	2	8	39593	39600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014651	TAAA	2	8	39713	39720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014651	AGAA	2	8	42212	42219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014651	AAGA	2	8	42417	42424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014651	ACTT	2	8	42682	42689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014651	AGCA	2	8	43009	43016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014651	CTTT	2	8	44121	44128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014651	TAAA	2	8	44761	44768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014651	CTTT	2	8	44808	44815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014651	TGTT	2	8	44917	44924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014651	TGAA	2	8	45541	45548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014651	AGGA	2	8	46524	46531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014651	GTAG	2	8	46641	46648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014651	ATTT	2	8	46708	46715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014651	AAGA	2	8	47546	47553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014651	CTTT	2	8	47567	47574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014651	AAAC	2	8	48037	48044	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014651	GCTT	2	8	50670	50677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014651	GGAT	2	8	50948	50955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014651	AGTA	2	8	51414	51421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014651	ACAT	2	8	54033	54040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014651	ATAA	2	8	54122	54129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014651	TAAT	2	8	54138	54145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014651	TTTA	2	8	54198	54205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014651	ATTA	2	8	54395	54402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014651	TGTT	2	8	55914	55921	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014651	CTTT	2	8	56000	56007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014651	CTTT	2	8	56013	56020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014651	GATT	2	8	56082	56089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014651	ATGG	2	8	57136	57143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014651	GTTT	2	8	57304	57311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014651	AGGG	2	8	58318	58325	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014651	TTAA	2	8	58519	58526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014651	TATT	2	8	58538	58545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014651	GGCA	2	8	59710	59717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014651	GACA	2	8	59839	59846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014651	TCAA	2	8	60725	60732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014651	ACGA	2	8	60771	60778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014651	TGTC	2	8	62648	62655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014651	GTTT	2	8	64192	64199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014651	CGCA	2	8	64469	64476	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014651	AAAC	2	8	64585	64592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014651	CAAA	2	8	64612	64619	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014651	GAAA	2	8	64647	64654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014651	GAAA	2	8	69683	69690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014651	GAAA	2	8	69922	69929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.