MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	CTTA	2	8	1681	1688	25 %	50 %	0 %	25 %	312193410
2	NC_014651	CAAA	2	8	1759	1766	75 %	0 %	0 %	25 %	312193410
3	NC_014651	CGGC	2	8	2368	2375	0 %	0 %	50 %	50 %	312193411
4	NC_014651	CAAT	2	8	2594	2601	50 %	25 %	0 %	25 %	312193411
5	NC_014651	GATC	2	8	2834	2841	25 %	25 %	25 %	25 %	312193411
6	NC_014651	TAAA	2	8	3165	3172	75 %	25 %	0 %	0 %	312193412
7	NC_014651	TCTG	2	8	4069	4076	0 %	50 %	25 %	25 %	312193413
8	NC_014651	CAAG	2	8	4527	4534	50 %	0 %	25 %	25 %	312193413
9	NC_014651	GCGA	2	8	4744	4751	25 %	0 %	50 %	25 %	312193414
10	NC_014651	AAAG	2	8	4974	4981	75 %	0 %	25 %	0 %	312193414
11	NC_014651	CTTA	2	8	5182	5189	25 %	50 %	0 %	25 %	312193414
12	NC_014651	TAAA	2	8	5519	5526	75 %	25 %	0 %	0 %	312193414
13	NC_014651	CCCT	2	8	5846	5853	0 %	25 %	0 %	75 %	312193414
14	NC_014651	AGAA	2	8	5933	5940	75 %	0 %	25 %	0 %	312193414
15	NC_014651	CGAG	2	8	8518	8525	25 %	0 %	50 %	25 %	312193416
16	NC_014651	TGCC	2	8	9062	9069	0 %	25 %	25 %	50 %	312193417
17	NC_014651	CATC	2	8	9124	9131	25 %	25 %	0 %	50 %	312193417
18	NC_014651	CGGC	2	8	9517	9524	0 %	0 %	50 %	50 %	312193417
19	NC_014651	GCGG	2	8	9853	9860	0 %	0 %	75 %	25 %	312193417
20	NC_014651	GAAA	2	8	11051	11058	75 %	0 %	25 %	0 %	312193418
21	NC_014651	CAAA	2	8	11357	11364	75 %	0 %	0 %	25 %	312193418
22	NC_014651	GCCG	2	8	12103	12110	0 %	0 %	50 %	50 %	312193419
23	NC_014651	TCCG	2	8	12411	12418	0 %	25 %	25 %	50 %	312193419
24	NC_014651	GACA	2	8	12454	12461	50 %	0 %	25 %	25 %	312193419
25	NC_014651	GAAA	2	8	12492	12499	75 %	0 %	25 %	0 %	312193419
26	NC_014651	CAAG	2	8	12620	12627	50 %	0 %	25 %	25 %	312193420
27	NC_014651	CTTG	2	8	12641	12648	0 %	50 %	25 %	25 %	312193420
28	NC_014651	GTTT	2	8	14248	14255	0 %	75 %	25 %	0 %	312193421
29	NC_014651	GGCA	2	8	14901	14908	25 %	0 %	50 %	25 %	312193422
30	NC_014651	TTCG	2	8	15114	15121	0 %	50 %	25 %	25 %	312193422
31	NC_014651	GGCT	2	8	15403	15410	0 %	25 %	50 %	25 %	312193423
32	NC_014651	GCGG	2	8	15650	15657	0 %	0 %	75 %	25 %	312193423
33	NC_014651	GCCG	2	8	15705	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	312193423
34	NC_014651	CAAA	2	8	16001	16008	75 %	0 %	0 %	25 %	312193424
35	NC_014651	GAAA	2	8	16358	16365	75 %	0 %	25 %	0 %	312193424
36	NC_014651	CGCC	2	8	17065	17072	0 %	0 %	25 %	75 %	312193424
37	NC_014651	CGCC	2	8	17105	17112	0 %	0 %	25 %	75 %	312193424
38	NC_014651	TTCG	2	8	17211	17218	0 %	50 %	25 %	25 %	312193425
39	NC_014651	GCTG	2	8	17359	17366	0 %	25 %	50 %	25 %	312193425
40	NC_014651	CCAT	2	8	17898	17905	25 %	25 %	0 %	50 %	312193426
41	NC_014651	AGTT	2	8	18188	18195	25 %	50 %	25 %	0 %	312193427
42	NC_014651	TTTA	2	8	18438	18445	25 %	75 %	0 %	0 %	312193427
43	NC_014651	TTGT	2	8	18751	18758	0 %	75 %	25 %	0 %	312193427
44	NC_014651	TGAT	2	8	18944	18951	25 %	50 %	25 %	0 %	312193427
45	NC_014651	ATTT	2	8	20121	20128	25 %	75 %	0 %	0 %	312193428
46	NC_014651	AAAT	2	8	20318	20325	75 %	25 %	0 %	0 %	312193428
47	NC_014651	ATTC	2	8	21183	21190	25 %	50 %	0 %	25 %	312193429
48	NC_014651	AAAT	2	8	21221	21228	75 %	25 %	0 %	0 %	312193429
49	NC_014651	CTTT	2	8	21325	21332	0 %	75 %	0 %	25 %	312193429
50	NC_014651	TCGC	2	8	21780	21787	0 %	25 %	25 %	50 %	312193430
51	NC_014651	TTCG	2	8	22070	22077	0 %	50 %	25 %	25 %	312193430
52	NC_014651	ATCG	2	8	23295	23302	25 %	25 %	25 %	25 %	312193431
53	NC_014651	GAAA	2	8	23428	23435	75 %	0 %	25 %	0 %	312193431
54	NC_014651	TAAC	2	8	24453	24460	50 %	25 %	0 %	25 %	312193432
55	NC_014651	GGGC	2	8	24488	24495	0 %	0 %	75 %	25 %	312193432
56	NC_014651	AAGC	2	8	24540	24547	50 %	0 %	25 %	25 %	312193432
57	NC_014651	AAGC	2	8	24617	24624	50 %	0 %	25 %	25 %	312193432
58	NC_014651	GGAA	2	8	24904	24911	50 %	0 %	50 %	0 %	312193432
59	NC_014651	ATTT	2	8	25901	25908	25 %	75 %	0 %	0 %	312193433
60	NC_014651	GAAA	2	8	26092	26099	75 %	0 %	25 %	0 %	312193433
61	NC_014651	GCGT	2	8	26124	26131	0 %	25 %	50 %	25 %	312193433
62	NC_014651	TGGA	2	8	26405	26412	25 %	25 %	50 %	0 %	312193433
63	NC_014651	TTGT	2	8	27112	27119	0 %	75 %	25 %	0 %	312193434
64	NC_014651	TTGA	2	8	27580	27587	25 %	50 %	25 %	0 %	312193434
65	NC_014651	GGAT	2	8	27616	27623	25 %	25 %	50 %	0 %	312193434
66	NC_014651	AAAC	2	8	27980	27987	75 %	0 %	0 %	25 %	312193434
67	NC_014651	TTTA	2	8	28437	28444	25 %	75 %	0 %	0 %	312193435
68	NC_014651	TTGC	2	8	28862	28869	0 %	50 %	25 %	25 %	312193435
69	NC_014651	CAGC	2	8	29430	29437	25 %	0 %	25 %	50 %	312193436
70	NC_014651	ATTC	2	8	29971	29978	25 %	50 %	0 %	25 %	312193436
71	NC_014651	CGAT	2	8	30299	30306	25 %	25 %	25 %	25 %	312193436
72	NC_014651	GGAA	2	8	30941	30948	50 %	0 %	50 %	0 %	312193437
73	NC_014651	CGAT	2	8	31918	31925	25 %	25 %	25 %	25 %	312193439
74	NC_014651	CAAG	2	8	33807	33814	50 %	0 %	25 %	25 %	312193442
75	NC_014651	ATTT	2	8	36572	36579	25 %	75 %	0 %	0 %	312193443
76	NC_014651	TATT	2	8	36686	36693	25 %	75 %	0 %	0 %	312193443
77	NC_014651	ATTG	2	8	36726	36733	25 %	50 %	25 %	0 %	312193443
78	NC_014651	CTTC	2	8	37879	37886	0 %	50 %	0 %	50 %	312193444
79	NC_014651	CTTT	2	8	37960	37967	0 %	75 %	0 %	25 %	312193444
80	NC_014651	GATT	2	8	38142	38149	25 %	50 %	25 %	0 %	312193444
81	NC_014651	GAAG	2	8	38271	38278	50 %	0 %	50 %	0 %	312193444
82	NC_014651	CGTA	2	8	41044	41051	25 %	25 %	25 %	25 %	312193445
83	NC_014651	CAGC	2	8	41356	41363	25 %	0 %	25 %	50 %	312193445
84	NC_014651	TTCT	2	8	41506	41513	0 %	75 %	0 %	25 %	312193445
85	NC_014651	GCAA	2	8	41515	41522	50 %	0 %	25 %	25 %	312193445
86	NC_014651	ATAA	2	8	43256	43263	75 %	25 %	0 %	0 %	312193446
87	NC_014651	GTCC	2	8	43343	43350	0 %	25 %	25 %	50 %	312193446
88	NC_014651	ACGG	2	8	43674	43681	25 %	0 %	50 %	25 %	312193447
89	NC_014651	TTGT	2	8	44357	44364	0 %	75 %	25 %	0 %	312193448
90	NC_014651	GTAC	2	8	46912	46919	25 %	25 %	25 %	25 %	312193449
91	NC_014651	AGAA	3	12	47328	47339	75 %	0 %	25 %	0 %	312193450
92	NC_014651	AAAG	2	8	48845	48852	75 %	0 %	25 %	0 %	312193452
93	NC_014651	TATT	2	8	49155	49162	25 %	75 %	0 %	0 %	312193453
94	NC_014651	AGAA	2	8	49361	49368	75 %	0 %	25 %	0 %	312193453
95	NC_014651	GTGA	2	8	49416	49423	25 %	25 %	50 %	0 %	312193453
96	NC_014651	AGAA	2	8	49470	49477	75 %	0 %	25 %	0 %	312193453
97	NC_014651	TTTC	2	8	49542	49549	0 %	75 %	0 %	25 %	312193453
98	NC_014651	ATGG	2	8	49690	49697	25 %	25 %	50 %	0 %	312193453
99	NC_014651	ACGT	2	8	49704	49711	25 %	25 %	25 %	25 %	312193453
100	NC_014651	GTTT	2	8	49768	49775	0 %	75 %	25 %	0 %	312193453
101	NC_014651	TTTG	2	8	50120	50127	0 %	75 %	25 %	0 %	312193453
102	NC_014651	ATCA	2	8	52154	52161	50 %	25 %	0 %	25 %	312193454
103	NC_014651	AATC	2	8	52341	52348	50 %	25 %	0 %	25 %	312193454
104	NC_014651	AGTA	2	8	52693	52700	50 %	25 %	25 %	0 %	312193455
105	NC_014651	ATTA	2	8	52819	52826	50 %	50 %	0 %	0 %	312193455
106	NC_014651	ATTG	2	8	52894	52901	25 %	50 %	25 %	0 %	312193455
107	NC_014651	TTCT	2	8	53705	53712	0 %	75 %	0 %	25 %	312193456
108	NC_014651	TTTC	2	8	55284	55291	0 %	75 %	0 %	25 %	312193457
109	NC_014651	GCAT	2	8	55343	55350	25 %	25 %	25 %	25 %	312193457
110	NC_014651	CATC	2	8	55374	55381	25 %	25 %	0 %	50 %	312193457
111	NC_014651	GCTG	2	8	56365	56372	0 %	25 %	50 %	25 %	312193458
112	NC_014651	CACT	2	8	57662	57669	25 %	25 %	0 %	50 %	312193459
113	NC_014651	ATGG	2	8	58628	58635	25 %	25 %	50 %	0 %	312193460
114	NC_014651	ACAA	2	8	58794	58801	75 %	0 %	0 %	25 %	312193460
115	NC_014651	AAAG	2	8	59443	59450	75 %	0 %	25 %	0 %	312193460
116	NC_014651	CGAA	2	8	61658	61665	50 %	0 %	25 %	25 %	312193462
117	NC_014651	GAAA	2	8	61679	61686	75 %	0 %	25 %	0 %	312193462
118	NC_014651	ATTT	2	8	61863	61870	25 %	75 %	0 %	0 %	312193463
119	NC_014651	ATCA	2	8	62169	62176	50 %	25 %	0 %	25 %	312193463
120	NC_014651	GATT	2	8	62823	62830	25 %	50 %	25 %	0 %	312193464
121	NC_014651	TCTT	2	8	62917	62924	0 %	75 %	0 %	25 %	312193464
122	NC_014651	CATA	2	8	62986	62993	50 %	25 %	0 %	25 %	312193464
123	NC_014651	CAAT	2	8	63470	63477	50 %	25 %	0 %	25 %	312193464
124	NC_014651	TTTG	2	8	63497	63504	0 %	75 %	25 %	0 %	312193464
125	NC_014651	CCAT	2	8	65056	65063	25 %	25 %	0 %	50 %	312193465
126	NC_014651	TCAA	2	8	65158	65165	50 %	25 %	0 %	25 %	312193465
127	NC_014651	TCGA	2	8	66179	66186	25 %	25 %	25 %	25 %	312193466
128	NC_014651	TGGA	2	8	66404	66411	25 %	25 %	50 %	0 %	312193466
129	NC_014651	TCAT	2	8	66657	66664	25 %	50 %	0 %	25 %	312193466
130	NC_014651	GAAA	2	8	67321	67328	75 %	0 %	25 %	0 %	312193467
131	NC_014651	CTTG	2	8	67357	67364	0 %	50 %	25 %	25 %	312193467
132	NC_014651	ATTT	2	8	67550	67557	25 %	75 %	0 %	0 %	312193467
133	NC_014651	ATTT	2	8	68089	68096	25 %	75 %	0 %	0 %	312193468
134	NC_014651	ATGA	2	8	68412	68419	50 %	25 %	25 %	0 %	312193468
135	NC_014651	TGGC	2	8	68630	68637	0 %	25 %	50 %	25 %	312193469
136	NC_014651	TGCT	2	8	68771	68778	0 %	50 %	25 %	25 %	312193469
137	NC_014651	TTTC	2	8	70709	70716	0 %	75 %	0 %	25 %	312193470
138	NC_014651	ATGA	2	8	71121	71128	50 %	25 %	25 %	0 %	312193470
139	NC_014651	TTCA	2	8	71157	71164	25 %	50 %	0 %	25 %	312193470
140	NC_014651	CGAG	2	8	71483	71490	25 %	0 %	50 %	25 %	312193470

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.