MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 plasmid pGY4MC101

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014651	AT	3	6	1809	1814	50 %	50 %	0 %	0 %	312193410
2	NC_014651	TA	3	6	2266	2271	50 %	50 %	0 %	0 %	312193411
3	NC_014651	AG	3	6	4505	4510	50 %	0 %	50 %	0 %	312193413
4	NC_014651	AC	3	6	5042	5047	50 %	0 %	0 %	50 %	312193414
5	NC_014651	AG	3	6	5560	5565	50 %	0 %	50 %	0 %	312193414
6	NC_014651	TA	3	6	5579	5584	50 %	50 %	0 %	0 %	312193414
7	NC_014651	CG	3	6	7287	7292	0 %	0 %	50 %	50 %	312193415
8	NC_014651	GC	3	6	7329	7334	0 %	0 %	50 %	50 %	312193415
9	NC_014651	CG	3	6	8038	8043	0 %	0 %	50 %	50 %	312193416
10	NC_014651	GC	3	6	8547	8552	0 %	0 %	50 %	50 %	312193416
11	NC_014651	CG	3	6	9206	9211	0 %	0 %	50 %	50 %	312193417
12	NC_014651	AT	3	6	9392	9397	50 %	50 %	0 %	0 %	312193417
13	NC_014651	AT	3	6	11702	11707	50 %	50 %	0 %	0 %	312193419
14	NC_014651	CG	3	6	12934	12939	0 %	0 %	50 %	50 %	312193420
15	NC_014651	CG	3	6	13950	13955	0 %	0 %	50 %	50 %	312193421
16	NC_014651	TA	3	6	14184	14189	50 %	50 %	0 %	0 %	312193421
17	NC_014651	GC	3	6	15092	15097	0 %	0 %	50 %	50 %	312193422
18	NC_014651	TC	3	6	15149	15154	0 %	50 %	0 %	50 %	312193422
19	NC_014651	GT	3	6	15380	15385	0 %	50 %	50 %	0 %	312193423
20	NC_014651	GC	3	6	15440	15445	0 %	0 %	50 %	50 %	312193423
21	NC_014651	CG	3	6	16136	16141	0 %	0 %	50 %	50 %	312193424
22	NC_014651	CG	3	6	16559	16564	0 %	0 %	50 %	50 %	312193424
23	NC_014651	GC	3	6	16973	16978	0 %	0 %	50 %	50 %	312193424
24	NC_014651	TC	3	6	18398	18403	0 %	50 %	0 %	50 %	312193427
25	NC_014651	AT	3	6	18659	18664	50 %	50 %	0 %	0 %	312193427
26	NC_014651	TC	4	8	18741	18748	0 %	50 %	0 %	50 %	312193427
27	NC_014651	GA	3	6	22498	22503	50 %	0 %	50 %	0 %	312193431
28	NC_014651	AT	3	6	22701	22706	50 %	50 %	0 %	0 %	312193431
29	NC_014651	GA	3	6	23275	23280	50 %	0 %	50 %	0 %	312193431
30	NC_014651	AT	3	6	23586	23591	50 %	50 %	0 %	0 %	312193431
31	NC_014651	TC	3	6	23715	23720	0 %	50 %	0 %	50 %	312193431
32	NC_014651	CG	3	6	24141	24146	0 %	0 %	50 %	50 %	312193432
33	NC_014651	GA	3	6	24694	24699	50 %	0 %	50 %	0 %	312193432
34	NC_014651	AT	3	6	24812	24817	50 %	50 %	0 %	0 %	312193432
35	NC_014651	AT	3	6	24919	24924	50 %	50 %	0 %	0 %	312193432
36	NC_014651	TG	3	6	25535	25540	0 %	50 %	50 %	0 %	312193433
37	NC_014651	CG	3	6	25847	25852	0 %	0 %	50 %	50 %	312193433
38	NC_014651	AT	3	6	26386	26391	50 %	50 %	0 %	0 %	312193433
39	NC_014651	AG	3	6	28612	28617	50 %	0 %	50 %	0 %	312193435
40	NC_014651	GC	3	6	28970	28975	0 %	0 %	50 %	50 %	312193435
41	NC_014651	GC	3	6	29375	29380	0 %	0 %	50 %	50 %	312193436
42	NC_014651	GC	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	312193439
43	NC_014651	GC	3	6	32350	32355	0 %	0 %	50 %	50 %	312193441
44	NC_014651	CG	4	8	32481	32488	0 %	0 %	50 %	50 %	312193441
45	NC_014651	GA	3	6	32652	32657	50 %	0 %	50 %	0 %	312193441
46	NC_014651	GC	3	6	33423	33428	0 %	0 %	50 %	50 %	312193442
47	NC_014651	CG	3	6	33648	33653	0 %	0 %	50 %	50 %	312193442
48	NC_014651	TC	3	6	38200	38205	0 %	50 %	0 %	50 %	312193444
49	NC_014651	AT	3	6	38253	38258	50 %	50 %	0 %	0 %	312193444
50	NC_014651	AC	3	6	43182	43187	50 %	0 %	0 %	50 %	312193446
51	NC_014651	AT	3	6	43280	43285	50 %	50 %	0 %	0 %	312193446
52	NC_014651	GT	3	6	44306	44311	0 %	50 %	50 %	0 %	312193448
53	NC_014651	GC	3	6	46882	46887	0 %	0 %	50 %	50 %	312193449
54	NC_014651	GA	3	6	47306	47311	50 %	0 %	50 %	0 %	312193450
55	NC_014651	TA	3	6	49044	49049	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
56	NC_014651	TC	3	6	49287	49292	0 %	50 %	0 %	50 %	312193453
57	NC_014651	TA	3	6	49602	49607	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
58	NC_014651	TA	4	8	49712	49719	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
59	NC_014651	TA	3	6	50106	50111	50 %	50 %	0 %	0 %	312193453
60	NC_014651	GT	3	6	51662	51667	0 %	50 %	50 %	0 %	312193454
61	NC_014651	AT	3	6	51753	51758	50 %	50 %	0 %	0 %	312193454
62	NC_014651	TG	3	6	52079	52084	0 %	50 %	50 %	0 %	312193454
63	NC_014651	AT	3	6	52918	52923	50 %	50 %	0 %	0 %	312193455
64	NC_014651	TA	3	6	53359	53364	50 %	50 %	0 %	0 %	312193455
65	NC_014651	TC	3	6	56116	56121	0 %	50 %	0 %	50 %	312193458
66	NC_014651	AT	3	6	58902	58907	50 %	50 %	0 %	0 %	312193460
67	NC_014651	TA	5	10	61817	61826	50 %	50 %	0 %	0 %	312193462
68	NC_014651	TA	3	6	62238	62243	50 %	50 %	0 %	0 %	312193463
69	NC_014651	CG	3	6	63068	63073	0 %	0 %	50 %	50 %	312193464
70	NC_014651	TG	3	6	63606	63611	0 %	50 %	50 %	0 %	312193464
71	NC_014651	AT	3	6	65371	65376	50 %	50 %	0 %	0 %	312193466
72	NC_014651	GC	3	6	65579	65584	0 %	0 %	50 %	50 %	312193466
73	NC_014651	AT	3	6	66466	66471	50 %	50 %	0 %	0 %	312193466
74	NC_014651	AT	3	6	66793	66798	50 %	50 %	0 %	0 %	312193467
75	NC_014651	GA	3	6	67824	67829	50 %	0 %	50 %	0 %	312193468
76	NC_014651	TA	3	6	69153	69158	50 %	50 %	0 %	0 %	312193469
77	NC_014651	AT	3	6	70478	70483	50 %	50 %	0 %	0 %	312193470

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.