MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 chromosome

Total Repeats: 1236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014650	CCGTTT	2	12	2411	2422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312109153
2	NC_014650	AGTCGA	2	12	3370	3381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109154
3	NC_014650	TTTTGC	2	12	4025	4036	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312109155
4	NC_014650	TGGCGG	2	12	4919	4930	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312109156
5	NC_014650	ATTTAT	2	12	8408	8419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109157
6	NC_014650	TCTTTC	2	12	16285	16296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312109159
7	NC_014650	CGATGT	2	12	17159	17170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109160
8	NC_014650	AACTGG	2	12	19347	19358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109161
9	NC_014650	GACAGG	2	12	22580	22591	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312109164
10	NC_014650	GAAAAA	2	12	26761	26772	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312109168
11	NC_014650	ACTTTT	2	12	44085	44096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312109182
12	NC_014650	TCGAAA	2	12	46209	46220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312109184
13	NC_014650	TACACG	2	12	48317	48328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312109186
14	NC_014650	AAACAA	2	12	48861	48872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312109187
15	NC_014650	TCGAAA	2	12	51853	51864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312109190
16	NC_014650	TAAAAA	2	12	57755	57766	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312109198
17	NC_014650	GACGCG	2	12	57809	57820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312109198
18	NC_014650	ATTGAA	2	12	58493	58504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312109199
19	NC_014650	ATTGAT	2	12	58728	58739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312109199
20	NC_014650	TATTCA	2	12	61583	61594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312109202
21	NC_014650	ATTCGG	2	12	63383	63394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109202
22	NC_014650	TAGCAG	2	12	65743	65754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109204
23	NC_014650	AAAAGA	2	12	67180	67191	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312109205
24	NC_014650	TCGCAA	2	12	69115	69126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312109209
25	NC_014650	TAAACA	2	12	72880	72891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312109212
26	NC_014650	TGCGAT	2	12	74200	74211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109212
27	NC_014650	TTAATA	2	12	75277	75288	50 %	50 %	0 %	0 %	312109213
28	NC_014650	CATTCC	2	12	76388	76399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312109214
29	NC_014650	ATTATC	2	12	79621	79632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312109217
30	NC_014650	CAATAC	2	12	80744	80755	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312109218
31	NC_014650	CGGTAA	2	12	88755	88766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109228
32	NC_014650	CAAATT	2	12	89692	89703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312109229
33	NC_014650	GTTTCA	2	12	109027	109038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312109235
34	NC_014650	AAGGAA	2	12	115991	116002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109242
35	NC_014650	ATGGAG	2	12	116525	116536	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312109243
36	NC_014650	GGGGAT	2	12	116810	116821	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	312109244
37	NC_014650	CATTTA	2	12	118947	118958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312109248
38	NC_014650	TGACGA	2	12	120787	120798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109251
39	NC_014650	TTGGCT	2	12	122682	122693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312109253
40	NC_014650	GGAAGT	2	12	128523	128534	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312109254
41	NC_014650	AAAATC	2	12	129925	129936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312109256
42	NC_014650	GACAAC	2	12	131016	131027	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312109258
43	NC_014650	ACAAGA	2	12	131109	131120	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109258
44	NC_014650	AGCGTT	2	12	131874	131885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109258
45	NC_014650	AAACGC	2	12	131980	131991	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312109258
46	NC_014650	TTCGAA	2	12	132508	132519	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312109258
47	NC_014650	AAAAGG	2	12	135319	135330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109261
48	NC_014650	AAAAGC	2	12	135595	135606	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109261
49	NC_014650	CAGCTA	2	12	135927	135938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312109262
50	NC_014650	ATTGAA	2	12	138270	138281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312109267
51	NC_014650	GTCGGT	2	12	141970	141981	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	312109276
52	NC_014650	AAAGGA	2	12	142174	142185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109276
53	NC_014650	GGCAAA	2	12	143454	143465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312109280
54	NC_014650	TGCTTC	2	12	144465	144476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312109281
55	NC_014650	TGAAAT	2	12	145837	145848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312109283
56	NC_014650	ATTGAA	2	12	148002	148013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312109288
57	NC_014650	AAAAAG	2	12	148729	148740	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312109288
58	NC_014650	TTACCC	2	12	152427	152438	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312109293
59	NC_014650	ATTGTT	2	12	154443	154454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312109297
60	NC_014650	AAAATT	2	12	169949	169960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312109307
61	NC_014650	ACAAGA	2	12	170367	170378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109308
62	NC_014650	CATTAA	2	12	170628	170639	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312109308
63	NC_014650	TGTGAA	2	12	171120	171131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109308
64	NC_014650	GCGAAA	2	12	173064	173075	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312109309
65	NC_014650	TCAAGA	2	12	177774	177785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312109312
66	NC_014650	TTTGAT	2	12	179766	179777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312109313
67	NC_014650	AAACAA	2	12	182592	182603	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312109315
68	NC_014650	AACGCC	2	12	183553	183564	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312109315
69	NC_014650	TAAAAC	2	12	197402	197413	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312109323
70	NC_014650	AGCGAA	2	12	197604	197615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312109323
71	NC_014650	TCGCGC	2	12	198657	198668	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312109324
72	NC_014650	GCGGGA	2	12	199338	199349	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	312109325
73	NC_014650	GAAAAA	2	12	199767	199778	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312109325
74	NC_014650	GCATCG	2	12	199798	199809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312109325
75	NC_014650	TGAAAG	2	12	210555	210566	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312109336
76	NC_014650	TAACGC	2	12	212425	212436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312109337
77	NC_014650	CAAAAG	2	12	215648	215659	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109340
78	NC_014650	AAGTCG	2	12	218325	218336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109343
79	NC_014650	GAGGCA	2	12	218732	218743	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312109343
80	NC_014650	CGATTG	2	12	219938	219949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109344
81	NC_014650	GAAAGA	2	12	226233	226244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312109347
82	NC_014650	TTGGAG	2	12	227776	227787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312109349
83	NC_014650	TGAATT	2	12	232913	232924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312109351
84	NC_014650	TTGCCG	2	12	235177	235188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109353
85	NC_014650	CCATTT	2	12	236061	236072	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312109353
86	NC_014650	TTGCTT	2	12	237782	237793	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312109355
87	NC_014650	ACATAA	2	12	237836	237847	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312109355
88	NC_014650	TTTGGA	2	12	238272	238283	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312109355
89	NC_014650	CCAGCG	2	12	240587	240598	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312109358
90	NC_014650	GTGGAT	2	12	240680	240691	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312109358
91	NC_014650	CAGGAG	2	12	240801	240812	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312109358
92	NC_014650	ACGATG	2	12	243282	243293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109361
93	NC_014650	ATATGC	2	12	248823	248834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312109366
94	NC_014650	GGAAGC	2	12	249466	249477	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312109366
95	NC_014650	GACCAA	2	12	250041	250052	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312109367
96	NC_014650	AGTTTC	2	12	255663	255674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312109371
97	NC_014650	GCGGAA	2	12	256236	256247	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312109372
98	NC_014650	CATATT	2	12	256392	256403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312109372
99	NC_014650	CGTTAG	2	12	260290	260301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109375
100	NC_014650	CGCTGG	2	12	260860	260871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312109375
101	NC_014650	TTATTT	2	12	261743	261754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312109376
102	NC_014650	TCACGA	2	12	263227	263238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312109377
103	NC_014650	ATCTTT	2	12	266447	266458	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312109380
104	NC_014650	TCAGGC	2	12	270411	270422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312109384
105	NC_014650	CTTCGT	2	12	271312	271323	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312109384
106	NC_014650	GTCGCT	2	12	271422	271433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109384
107	NC_014650	CATCGG	2	12	278610	278621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312109392
108	NC_014650	ATTTTA	2	12	279103	279114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312109392
109	NC_014650	TGTGAA	2	12	291990	292001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312109409
110	NC_014650	GTTTTC	2	12	298143	298154	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312109414
111	NC_014650	GCAAAA	2	12	298546	298557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109414
112	NC_014650	TGTTTT	2	12	301155	301166	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312109416
113	NC_014650	TGTTTT	2	12	301629	301640	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312109416
114	NC_014650	TTTGAC	2	12	314115	314126	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312109421
115	NC_014650	AAAGAT	2	12	317736	317747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312109424
116	NC_014650	AAGTCA	2	12	318919	318930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312109426
117	NC_014650	AAAATA	2	12	323686	323697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312109431
118	NC_014650	CACTTC	2	12	328838	328849	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	312109437
119	NC_014650	TTTGCG	2	12	331972	331983	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312109439
120	NC_014650	AGATTT	2	12	332025	332036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312109439
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124	NC_014650	TGCCGA	2	12	343514	343525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312109448
125	NC_014650	CAGTTC	2	12	350649	350660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312109453
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133	NC_014650	GTTGCG	2	12	365447	365458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	312109464
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143	NC_014650	CTTGGC	2	12	408243	408254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109507
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148	NC_014650	CATTGA	2	12	424912	424923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312109522
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230	NC_014650	AATACC	2	12	712599	712610	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312109825
231	NC_014650	TTATCA	2	12	722539	722550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312109832
232	NC_014650	GCTTGT	2	12	723596	723607	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312109832
233	NC_014650	GCATTT	2	12	724237	724248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312109833
234	NC_014650	AGAAAC	2	12	728980	728991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109840
235	NC_014650	TGAATT	2	12	729076	729087	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312109840
236	NC_014650	GGGCTT	2	12	729239	729250	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	312109840
237	NC_014650	TGGCTA	2	12	731059	731070	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312109841
238	NC_014650	ACGAAA	2	12	731245	731256	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312109841
239	NC_014650	TGTTCA	2	12	733678	733689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312109842
240	NC_014650	CGCATC	2	12	733830	733841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312109842
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243	NC_014650	CTGCAG	2	12	751864	751875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312109862
244	NC_014650	CGTGAA	2	12	757097	757108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312109868
245	NC_014650	CGCTTG	2	12	760900	760911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312109871
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258	NC_014650	ATTACG	2	12	797961	797972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312109905
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262	NC_014650	ATTCCG	2	12	814315	814326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312109922
263	NC_014650	TCAATG	2	12	816633	816644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312109924
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335	NC_014650	GCGCCG	2	12	984748	984759	0 %	0 %	50 %	50 %	312110085
336	NC_014650	TTTGTT	2	12	989384	989395	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312110091
337	NC_014650	GGCGAT	2	12	991291	991302	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312110093
338	NC_014650	TGGCGG	2	12	996041	996052	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312110096
339	NC_014650	GGCTTC	2	12	996208	996219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312110096
340	NC_014650	GTGTTT	2	12	998879	998890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312110098
341	NC_014650	GAGATT	2	12	999665	999676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312110098
342	NC_014650	GCGATG	2	12	1001430	1001441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312110102
343	NC_014650	TTCTTT	2	12	1007270	1007281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312110105
344	NC_014650	GAAAAA	2	12	1009646	1009657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312110106
345	NC_014650	TTCGCG	2	12	1013461	1013472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312110109
346	NC_014650	CGGAAT	2	12	1017662	1017673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312110113
347	NC_014650	GACGAG	2	12	1018012	1018023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312110113
348	NC_014650	GTAAAA	2	12	1019587	1019598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312110115
349	NC_014650	TTAGGA	2	12	1019800	1019811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312110116
350	NC_014650	GAAAAA	2	12	1022521	1022532	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312110118
351	NC_014650	CGCGCC	2	12	1022686	1022697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312110118
352	NC_014650	AAGTGC	2	12	1027561	1027572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312110124
353	NC_014650	ATTGAA	2	12	1028565	1028576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312110125
354	NC_014650	GATCGC	2	12	1040449	1040460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312110138
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357	NC_014650	TTAATT	2	12	1045784	1045795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312110145
358	NC_014650	GGAATC	2	12	1047136	1047147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312110147
359	NC_014650	AGCGTT	2	12	1048603	1048614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312110148
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364	NC_014650	TCGGCA	2	12	1061317	1061328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312110164
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372	NC_014650	GCAATG	2	12	1072657	1072668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312110173
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375	NC_014650	TCTTTT	2	12	1077929	1077940	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312110180
376	NC_014650	AGGGAG	2	12	1079439	1079450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312110181
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380	NC_014650	CGATGC	2	12	1084438	1084449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312110189
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383	NC_014650	TATGGA	2	12	1088395	1088406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312110192
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442	NC_014650	ATTATG	2	12	1230268	1230279	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312110345
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450	NC_014650	GGAAGT	2	12	1247697	1247708	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312110363
451	NC_014650	TTTATG	2	12	1249365	1249376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312110366
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453	NC_014650	AAACAA	2	12	1256897	1256908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312110375
454	NC_014650	CGCTGA	2	12	1258284	1258295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312110377
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457	NC_014650	GCTTCC	2	12	1273981	1273992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312110390
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