MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y4.1MC1 chromosome

Total Repeats: 3127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014650	GAAAA	2	10	468	477	80 %	0 %	20 %	0 %	312109152
2	NC_014650	AAGAA	2	10	1557	1566	80 %	0 %	20 %	0 %	312109152
3	NC_014650	AAAAC	2	10	2656	2665	80 %	0 %	0 %	20 %	312109153
4	NC_014650	TAAAA	2	10	3152	3161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014650	TACGA	2	10	6835	6844	40 %	20 %	20 %	20 %	312109157
6	NC_014650	GGTGA	2	10	7141	7150	20 %	20 %	60 %	0 %	312109157
7	NC_014650	GAAAA	2	10	7423	7432	80 %	0 %	20 %	0 %	312109157
8	NC_014650	TGCAA	2	10	7548	7557	40 %	20 %	20 %	20 %	312109157
9	NC_014650	TAATC	2	10	7758	7767	40 %	40 %	0 %	20 %	312109157
10	NC_014650	AATTA	2	10	9639	9648	60 %	40 %	0 %	0 %	312109158
11	NC_014650	TCGTG	2	10	11724	11733	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014650	GAAAA	2	10	12233	12242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014650	TTTAT	2	10	15909	15918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014650	TAAAA	2	10	16723	16732	80 %	20 %	0 %	0 %	312109159
15	NC_014650	CTATT	2	10	18527	18536	20 %	60 %	0 %	20 %	312109160
16	NC_014650	CCGTT	2	10	20510	20519	0 %	40 %	20 %	40 %	312109162
17	NC_014650	GCTTG	2	10	21063	21072	0 %	40 %	40 %	20 %	312109163
18	NC_014650	GGCAA	2	10	21519	21528	40 %	0 %	40 %	20 %	312109163
19	NC_014650	TTTTA	2	10	21925	21934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014650	ATGTA	2	10	24251	24260	40 %	40 %	20 %	0 %	312109166
21	NC_014650	TAACG	2	10	25730	25739	40 %	20 %	20 %	20 %	312109167
22	NC_014650	AAAAT	2	10	27334	27343	80 %	20 %	0 %	0 %	312109169
23	NC_014650	GAAAT	2	10	28248	28257	60 %	20 %	20 %	0 %	312109169
24	NC_014650	TCGTG	2	10	31901	31910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014650	GAAAA	2	10	32410	32419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014650	TTTAT	2	10	36008	36017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014650	TTTCA	2	10	38523	38532	20 %	60 %	0 %	20 %	312109176
28	NC_014650	GAAAA	2	10	38768	38777	80 %	0 %	20 %	0 %	312109176
29	NC_014650	AGACA	2	10	40587	40596	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014650	GGATT	2	10	41393	41402	20 %	40 %	40 %	0 %	312109178
31	NC_014650	GAAAT	2	10	41939	41948	60 %	20 %	20 %	0 %	312109179
32	NC_014650	GAAAA	2	10	42678	42687	80 %	0 %	20 %	0 %	312109180
33	NC_014650	ATATT	2	10	44437	44446	40 %	60 %	0 %	0 %	312109182
34	NC_014650	CTCTC	2	10	44886	44895	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_014650	TAAAA	2	10	45240	45249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014650	AAAAT	2	10	47247	47256	80 %	20 %	0 %	0 %	312109184
37	NC_014650	GAAAC	2	10	48043	48052	60 %	0 %	20 %	20 %	312109185
38	NC_014650	TGACG	2	10	48494	48503	20 %	20 %	40 %	20 %	312109187
39	NC_014650	AAGAA	2	10	48587	48596	80 %	0 %	20 %	0 %	312109187
40	NC_014650	GAAAA	2	10	51117	51126	80 %	0 %	20 %	0 %	312109189
41	NC_014650	CCGTT	2	10	52201	52210	0 %	40 %	20 %	40 %	312109190
42	NC_014650	GGATG	2	10	53755	53764	20 %	20 %	60 %	0 %	312109193
43	NC_014650	GAGCA	2	10	56053	56062	40 %	0 %	40 %	20 %	312109197
44	NC_014650	ATTGC	2	10	58107	58116	20 %	40 %	20 %	20 %	312109198
45	NC_014650	ATGAA	2	10	58192	58201	60 %	20 %	20 %	0 %	312109198
46	NC_014650	GCATT	2	10	59630	59639	20 %	40 %	20 %	20 %	312109201
47	NC_014650	GGCTG	2	10	60056	60065	0 %	20 %	60 %	20 %	312109202
48	NC_014650	TTTCA	2	10	60110	60119	20 %	60 %	0 %	20 %	312109202
49	NC_014650	GTTTT	2	10	68449	68458	0 %	80 %	20 %	0 %	312109208
50	NC_014650	GGATT	2	10	69966	69975	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014650	CTTTT	2	10	72255	72264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014650	TTTGC	2	10	72524	72533	0 %	60 %	20 %	20 %	312109212
53	NC_014650	GTTGC	2	10	72587	72596	0 %	40 %	40 %	20 %	312109212
54	NC_014650	TTCGG	2	10	74087	74096	0 %	40 %	40 %	20 %	312109212
55	NC_014650	CGAGG	2	10	75220	75229	20 %	0 %	60 %	20 %	312109213
56	NC_014650	ATGTT	2	10	76278	76287	20 %	60 %	20 %	0 %	312109214
57	NC_014650	GAAAA	2	10	77657	77666	80 %	0 %	20 %	0 %	312109215
58	NC_014650	CGCAG	2	10	78996	79005	20 %	0 %	40 %	40 %	312109217
59	NC_014650	GCCGG	2	10	79930	79939	0 %	0 %	60 %	40 %	312109217
60	NC_014650	GATAT	2	10	80671	80680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014650	GAAGA	2	10	82064	82073	60 %	0 %	40 %	0 %	312109219
62	NC_014650	GCGCG	2	10	82866	82875	0 %	0 %	60 %	40 %	312109220
63	NC_014650	GACAA	2	10	86163	86172	60 %	0 %	20 %	20 %	312109223
64	NC_014650	TCGTG	2	10	92343	92352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014650	AGCGA	2	10	93067	93076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014650	TCGTG	2	10	98387	98396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014650	ATGAT	2	10	102475	102484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014650	CCAAT	2	10	102870	102879	40 %	20 %	0 %	40 %	312109230
69	NC_014650	AGGGG	2	10	103049	103058	20 %	0 %	80 %	0 %	312109230
70	NC_014650	TCTGC	2	10	103227	103236	0 %	40 %	20 %	40 %	312109231
71	NC_014650	CTGGA	2	10	106155	106164	20 %	20 %	40 %	20 %	312109233
72	NC_014650	GTTGT	2	10	106546	106555	0 %	60 %	40 %	0 %	312109233
73	NC_014650	AGATG	2	10	106557	106566	40 %	20 %	40 %	0 %	312109233
74	NC_014650	GAAAG	2	10	106764	106773	60 %	0 %	40 %	0 %	312109233
75	NC_014650	TCGAT	2	10	107748	107757	20 %	40 %	20 %	20 %	312109234
76	NC_014650	CAAAA	2	10	107845	107854	80 %	0 %	0 %	20 %	312109234
77	NC_014650	GATTA	2	10	111095	111104	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014650	TGATT	2	10	112216	112225	20 %	60 %	20 %	0 %	312109238
79	NC_014650	GAAAA	2	10	112539	112548	80 %	0 %	20 %	0 %	312109238
80	NC_014650	AAAGG	2	10	113557	113566	60 %	0 %	40 %	0 %	312109239
81	NC_014650	TGAAG	2	10	113759	113768	40 %	20 %	40 %	0 %	312109240
82	NC_014650	TTTAA	2	10	114549	114558	40 %	60 %	0 %	0 %	312109240
83	NC_014650	AGGAA	2	10	115386	115395	60 %	0 %	40 %	0 %	312109241
84	NC_014650	GACAA	2	10	117037	117046	60 %	0 %	20 %	20 %	312109244
85	NC_014650	ATCGG	2	10	117103	117112	20 %	20 %	40 %	20 %	312109244
86	NC_014650	TGTTT	2	10	117911	117920	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014650	AAACC	2	10	117929	117938	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014650	AAAAG	2	10	118143	118152	80 %	0 %	20 %	0 %	312109247
89	NC_014650	AAAAG	2	10	118425	118434	80 %	0 %	20 %	0 %	312109247
90	NC_014650	GAACC	2	10	119024	119033	40 %	0 %	20 %	40 %	312109248
91	NC_014650	CGCGG	2	10	119464	119473	0 %	0 %	60 %	40 %	312109249
92	NC_014650	GCCGC	2	10	122351	122360	0 %	0 %	40 %	60 %	312109253
93	NC_014650	GGAAT	2	10	124067	124076	40 %	20 %	40 %	0 %	312109253
94	NC_014650	AGATG	2	10	128382	128391	40 %	20 %	40 %	0 %	312109254
95	NC_014650	TGGCG	2	10	135889	135898	0 %	20 %	60 %	20 %	312109262
96	NC_014650	AATTT	2	10	136320	136329	40 %	60 %	0 %	0 %	312109263
97	NC_014650	AAACG	2	10	137734	137743	60 %	0 %	20 %	20 %	312109265
98	NC_014650	GTTCC	2	10	142370	142379	0 %	40 %	20 %	40 %	312109277
99	NC_014650	ACGGA	2	10	143638	143647	40 %	0 %	40 %	20 %	312109280
100	NC_014650	TCGAT	2	10	148495	148504	20 %	40 %	20 %	20 %	312109288
101	NC_014650	TGCCG	2	10	151143	151152	0 %	20 %	40 %	40 %	312109291
102	NC_014650	TTCAT	2	10	152328	152337	20 %	60 %	0 %	20 %	312109293
103	NC_014650	CGGAC	2	10	154547	154556	20 %	0 %	40 %	40 %	312109297
104	NC_014650	GTTTT	2	10	158266	158275	0 %	80 %	20 %	0 %	312109301
105	NC_014650	TCGTG	2	10	160106	160115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014650	TATGT	2	10	164918	164927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014650	ATATG	2	10	167848	167857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014650	AGTGA	2	10	168550	168559	40 %	20 %	40 %	0 %	312109306
109	NC_014650	TCTTT	2	10	168774	168783	0 %	80 %	0 %	20 %	312109307
110	NC_014650	TTGAT	2	10	169170	169179	20 %	60 %	20 %	0 %	312109307
111	NC_014650	CAAAC	2	10	169228	169237	60 %	0 %	0 %	40 %	312109307
112	NC_014650	AAGTG	2	10	171090	171099	40 %	20 %	40 %	0 %	312109308
113	NC_014650	GGAAC	2	10	171238	171247	40 %	0 %	40 %	20 %	312109308
114	NC_014650	TAAAA	2	10	171346	171355	80 %	20 %	0 %	0 %	312109308
115	NC_014650	ATTCT	2	10	171391	171400	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014650	TGCGG	2	10	175578	175587	0 %	20 %	60 %	20 %	312109311
117	NC_014650	ATAAA	2	10	177153	177162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014650	TGAAG	2	10	177871	177880	40 %	20 %	40 %	0 %	312109312
119	NC_014650	CGAAT	2	10	179257	179266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014650	AAAAT	2	10	181060	181069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014650	CCAGC	2	10	182846	182855	20 %	0 %	20 %	60 %	312109315
122	NC_014650	AATGG	2	10	182904	182913	40 %	20 %	40 %	0 %	312109315
123	NC_014650	CGAAT	2	10	184090	184099	40 %	20 %	20 %	20 %	312109316
124	NC_014650	TGCTT	2	10	184116	184125	0 %	60 %	20 %	20 %	312109316
125	NC_014650	TGCCT	2	10	184154	184163	0 %	40 %	20 %	40 %	312109316
126	NC_014650	GATTT	2	10	184243	184252	20 %	60 %	20 %	0 %	312109316
127	NC_014650	ATGGC	2	10	184831	184840	20 %	20 %	40 %	20 %	312109316
128	NC_014650	CTTTC	2	10	186670	186679	0 %	60 %	0 %	40 %	312109318
129	NC_014650	CAGCG	2	10	186694	186703	20 %	0 %	40 %	40 %	312109318
130	NC_014650	TTCGC	2	10	186941	186950	0 %	40 %	20 %	40 %	312109318
131	NC_014650	CCGCT	2	10	187310	187319	0 %	20 %	20 %	60 %	312109318
132	NC_014650	ATTGC	2	10	188565	188574	20 %	40 %	20 %	20 %	312109318
133	NC_014650	ATCAA	2	10	188988	188997	60 %	20 %	0 %	20 %	312109318
134	NC_014650	AGCAA	2	10	189135	189144	60 %	0 %	20 %	20 %	312109318
135	NC_014650	AGATC	2	10	192212	192221	40 %	20 %	20 %	20 %	312109318
136	NC_014650	TGGAG	2	10	192685	192694	20 %	20 %	60 %	0 %	312109318
137	NC_014650	AAAGT	2	10	196495	196504	60 %	20 %	20 %	0 %	312109321
138	NC_014650	TCTAT	2	10	198116	198125	20 %	60 %	0 %	20 %	312109324
139	NC_014650	GAATG	2	10	198469	198478	40 %	20 %	40 %	0 %	312109324
140	NC_014650	ATTTA	2	10	199011	199020	40 %	60 %	0 %	0 %	312109324
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148	NC_014650	TTACA	2	10	215254	215263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_014650	TGCAA	2	10	216997	217006	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014650	TGTTT	2	10	217792	217801	0 %	80 %	20 %	0 %	312109342
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163	NC_014650	TGCAT	2	10	229415	229424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_014650	ATTAT	2	10	230725	230734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_014650	CTTTT	2	10	314310	314319	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
239	NC_014650	ATAAA	2	10	314333	314342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_014650	CAAAA	2	10	315878	315887	80 %	0 %	0 %	20 %	312109422
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242	NC_014650	TACCA	2	10	316332	316341	40 %	20 %	0 %	40 %	312109423
243	NC_014650	TGATG	2	10	323259	323268	20 %	40 %	40 %	0 %	312109431
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247	NC_014650	ATATA	2	10	328728	328737	60 %	40 %	0 %	0 %	312109437
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249	NC_014650	AAATT	2	10	329990	329999	60 %	40 %	0 %	0 %	312109438
250	NC_014650	GGATA	2	10	330236	330245	40 %	20 %	40 %	0 %	312109438
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254	NC_014650	CAGAT	2	10	335398	335407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
255	NC_014650	AAAAT	2	10	335782	335791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014650	CTTAT	2	10	336858	336867	20 %	60 %	0 %	20 %	312109441
257	NC_014650	GATGT	2	10	337234	337243	20 %	40 %	40 %	0 %	312109441
258	NC_014650	ATATT	2	10	338936	338945	40 %	60 %	0 %	0 %	312109444
259	NC_014650	AAAAG	2	10	339281	339290	80 %	0 %	20 %	0 %	312109445
260	NC_014650	AGGCA	2	10	345350	345359	40 %	0 %	40 %	20 %	312109449
261	NC_014650	GTTTT	2	10	345618	345627	0 %	80 %	20 %	0 %	312109449
262	NC_014650	CATAA	2	10	345876	345885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014650	TGTTT	2	10	348688	348697	0 %	80 %	20 %	0 %	312109450
264	NC_014650	CGGCG	2	10	348732	348741	0 %	0 %	60 %	40 %	312109450
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266	NC_014650	TTTTC	2	10	351701	351710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_014650	TAAAA	2	10	351876	351885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014650	AAGGA	2	10	351994	352003	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_014650	GAAAG	2	10	353038	353047	60 %	0 %	40 %	0 %	312109454
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