MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014643	CTCGTC	2	12	1013	1024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014643	CAATAT	2	12	4592	4603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014643	GGCGAG	2	12	21331	21342	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014643	TTTTAC	2	12	40651	40662	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014643	ACAGTC	2	12	70290	70301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014643	TCTAAA	2	12	70400	70411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014643	TACCTT	2	12	104905	104916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014643	TCTAAC	2	12	144065	144076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014643	GTAATT	2	12	421116	421127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014643	AGTATT	2	12	513974	513985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014643	CGCGCT	2	12	618727	618738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014643	GGTGAG	2	12	668669	668680	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014643	ACCCGA	2	12	791061	791072	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014643	CCCGCT	2	12	800585	800596	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014643	TAAATA	2	12	801398	801409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014643	AGAAAT	2	12	807310	807321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014643	TCACAA	2	12	926513	926524	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014643	ATGCAT	2	12	935909	935920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014643	CATCAG	2	12	962161	962172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014643	TTTTTG	2	12	985092	985103	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014643	TGCTGG	2	12	986840	986851	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014643	GGTGTT	2	12	986862	986873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014643	GGATAG	2	12	992513	992524	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014643	ACGGTC	2	12	1017053	1017064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014643	AGCGGG	2	12	1020510	1020521	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014643	GACAAG	2	12	1032146	1032157	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014643	AAGTAT	2	12	1096860	1096871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014643	TAGGGG	2	12	1121206	1121217	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014643	TGAAGG	2	12	1154744	1154755	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014643	GTGCGC	2	12	1258484	1258495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014643	GTACTA	2	12	1295994	1296005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014643	AGGGTG	2	12	1306854	1306865	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014643	TTTTTG	2	12	1324225	1324236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014643	GGGTGT	2	12	1381625	1381636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014643	TTTTTG	2	12	1382128	1382139	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014643	TGCTGG	2	12	1383878	1383889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014643	GGTGTT	2	12	1383900	1383911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014643	ACCTTC	2	12	1396740	1396751	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014643	AATCAG	2	12	1396855	1396866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014643	CCCGGA	2	12	1396867	1396878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014643	ATTTTT	2	12	1427742	1427753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014643	AAAAAT	2	12	1515234	1515245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014643	TTGAGT	2	12	1571040	1571051	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014643	TTGAAA	2	12	1576860	1576871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014643	GGGCAC	2	12	1580150	1580161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014643	CGTAGC	2	12	1689809	1689820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014643	GAGCGT	2	12	1746789	1746800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014643	ATTTAA	2	12	1764039	1764050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014643	TAAGGC	2	12	1768106	1768117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014643	GGGTGT	2	12	1776906	1776917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014643	TTTTTG	2	12	1777409	1777420	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014643	TGCTGG	2	12	1779157	1779168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014643	GGTGTT	2	12	1779179	1779190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014643	ATTTAT	2	12	1879553	1879564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014643	AAACCG	2	12	1977683	1977694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014643	ATTTCT	2	12	1983602	1983613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014643	TACGAA	2	12	2073154	2073165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014643	ATTTAA	2	12	2085541	2085552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014643	GTGCGT	2	12	2199090	2199101	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014643	ATTACA	2	12	2214753	2214764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014643	CCGCAG	2	12	2323876	2323887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014643	CACATA	2	12	2354381	2354392	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014643	AATCGT	2	12	2368615	2368626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014643	GGTTAG	2	12	2422084	2422095	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014643	TAGCTC	2	12	2423191	2423202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014643	CTCAGG	2	12	2482052	2482063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014643	GATGTG	2	12	2505538	2505549	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.