MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 4042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014643	GCT	2	6	112	117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014643	GCG	2	6	211	216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014643	TTA	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014643	CCA	2	6	440	445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014643	AGT	2	6	478	483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014643	GGT	2	6	607	612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014643	CTT	2	6	653	658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014643	CTG	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014643	ACG	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014643	TCA	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014643	CTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014643	TCT	2	6	907	912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014643	CTT	2	6	931	936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014643	TCG	2	6	990	995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014643	TCT	3	9	1027	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014643	GTT	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014643	TCT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014643	GCT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014643	TCT	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014643	CTC	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014643	ATT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014643	TCA	3	9	1496	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014643	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014643	GGA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014643	CTT	2	6	6182	6187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014643	CAT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014643	ATT	2	6	6259	6264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014643	TTG	2	6	6312	6317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014643	CTG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014643	GGT	2	6	7935	7940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014643	ATG	2	6	9683	9688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014643	TTC	2	6	9751	9756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014643	TTA	2	6	9772	9777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014643	TGG	2	6	10293	10298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014643	GTT	2	6	11862	11867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014643	TGC	2	6	11880	11885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014643	TAG	2	6	13878	13883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014643	GAG	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014643	ATA	2	6	14928	14933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014643	TAT	2	6	15417	15422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014643	ATA	2	6	15488	15493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014643	GTG	2	6	15531	15536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014643	GAG	2	6	15587	15592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014643	GAT	2	6	17212	17217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014643	TTA	2	6	17260	17265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014643	TAA	2	6	17272	17277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014643	TCA	2	6	17317	17322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014643	TAG	2	6	17424	17429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014643	ATG	2	6	17577	17582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014643	AGG	2	6	18191	18196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014643	TCT	2	6	18200	18205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014643	CGC	2	6	19250	19255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014643	AAT	2	6	19310	19315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014643	GAT	2	6	19870	19875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014643	TAG	2	6	19923	19928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014643	GCG	2	6	20521	20526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014643	ATG	2	6	20531	20536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014643	CAG	2	6	21391	21396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014643	CAA	2	6	21397	21402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014643	CAT	2	6	21454	21459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014643	CAC	2	6	21463	21468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014643	AAT	2	6	21529	21534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014643	CAC	2	6	22732	22737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014643	TAA	2	6	22748	22753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014643	TCT	2	6	26362	26367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014643	GCG	2	6	26375	26380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014643	ACG	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014643	AAC	2	6	26493	26498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014643	TCA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014643	GAC	2	6	28974	28979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014643	GAA	2	6	29205	29210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014643	CCG	2	6	29224	29229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014643	TCA	2	6	33256	33261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014643	GAG	2	6	33282	33287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014643	GAA	2	6	33367	33372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014643	AGG	2	6	34164	34169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014643	CGT	2	6	34205	34210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014643	GGC	2	6	34214	34219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014643	GGT	2	6	34276	34281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014643	AAT	2	6	34351	34356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014643	GAA	2	6	35114	35119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014643	TAC	2	6	35454	35459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014643	TTC	2	6	35499	35504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014643	ATA	2	6	35516	35521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014643	GAC	2	6	38290	38295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014643	TGA	2	6	38296	38301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014643	TTC	2	6	39125	39130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014643	TCT	2	6	39943	39948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014643	GCC	2	6	40054	40059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014643	CTG	2	6	40071	40076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014643	GGC	2	6	40080	40085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014643	TAA	2	6	40262	40267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014643	ACG	2	6	40285	40290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014643	CAG	2	6	40299	40304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014643	TCG	2	6	40485	40490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014643	ATC	2	6	40497	40502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014643	GCC	2	6	40526	40531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014643	TTC	2	6	40629	40634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014643	ACA	2	6	42081	42086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014643	CTC	2	6	42688	42693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014643	TGT	2	6	42711	42716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014643	CCG	2	6	44564	44569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014643	CGG	2	6	45946	45951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014643	TGC	2	6	45952	45957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014643	AAT	2	6	49453	49458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014643	AAC	2	6	49521	49526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014643	GTT	2	6	49534	49539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014643	TGT	2	6	54511	54516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014643	TCG	2	6	54800	54805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014643	TTA	2	6	54806	54811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014643	TCA	2	6	54847	54852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014643	CAA	2	6	54885	54890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014643	ACA	2	6	55059	55064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014643	AGA	2	6	55128	55133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014643	TCC	2	6	55500	55505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014643	TTC	2	6	55542	55547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014643	CTT	2	6	59820	59825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014643	CAC	2	6	59985	59990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014643	TTG	2	6	60043	60048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014643	AGG	2	6	60094	60099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014643	TTC	2	6	60434	60439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014643	AAG	2	6	62038	62043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014643	TTC	2	6	64400	64405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014643	TAT	2	6	64435	64440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014643	TCA	2	6	64510	64515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014643	CAC	2	6	64541	64546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014643	ATT	2	6	64566	64571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014643	ATC	2	6	64589	64594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014643	ATA	2	6	64606	64611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014643	TAG	2	6	64699	64704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014643	GCT	2	6	64727	64732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014643	ATT	2	6	65669	65674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014643	TCT	2	6	66827	66832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014643	ATA	2	6	67552	67557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014643	GAA	2	6	67566	67571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014643	TTG	2	6	70200	70205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014643	ATA	2	6	70330	70335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014643	ATT	2	6	70336	70341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014643	TAA	2	6	70419	70424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014643	GAG	2	6	70426	70431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014643	ATT	2	6	71157	71162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014643	CGC	2	6	167578	167583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_014643	TGC	2	6	167623	167628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_014643	CGG	2	6	168789	168794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_014643	CCG	2	6	173115	173120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_014643	CGT	2	6	173848	173853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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