MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 plasmid pA81

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014641	GAACGT	2	12	543	554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311109685
2	NC_014641	CTTCAT	2	12	5148	5159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	311109691
3	NC_014641	CAACAC	2	12	5244	5255	50 %	0 %	0 %	50 %	311109691
4	NC_014641	CTGGCC	2	12	6640	6651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311109691
5	NC_014641	CCCTGG	2	12	7638	7649	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311109693
6	NC_014641	CCTGCG	2	12	8035	8046	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311109693
7	NC_014641	CCGCAT	2	12	9348	9359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311109695
8	NC_014641	TCGGCA	2	12	12050	12061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311109698
9	NC_014641	CGCTGC	2	12	15160	15171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311109702
10	NC_014641	GATGCC	2	12	17297	17308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311109705
11	NC_014641	TGACGC	2	12	19097	19108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311109708
12	NC_014641	TGGTCT	2	12	28130	28141	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	311109718
13	NC_014641	TTGCCC	2	12	32852	32863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	311109724
14	NC_014641	GGGCAA	2	12	38087	38098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	311109730
15	NC_014641	GTGACG	2	12	39169	39180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311109732
16	NC_014641	CTGGCG	2	12	39953	39964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311109733
17	NC_014641	AGCAAC	2	12	43138	43149	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	311109735
18	NC_014641	CAGCGC	2	12	45104	45115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311109738
19	NC_014641	GATGCC	2	12	50426	50437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311109742
20	NC_014641	GCGCTC	2	12	62038	62049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311109747
21	NC_014641	TCGCGG	2	12	62603	62614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311109747
22	NC_014641	CGGTGG	2	12	65236	65247	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	311109749
23	NC_014641	GCTTCG	2	12	65638	65649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311109749
24	NC_014641	GATGTG	2	12	67594	67605	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	311109750
25	NC_014641	GCCTGC	2	12	70776	70787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311109757
26	NC_014641	GGCGCG	2	12	76060	76071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311109764
27	NC_014641	CCCAGC	2	12	76837	76848	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	311109766
28	NC_014641	GCCGCG	2	12	84470	84481	0 %	0 %	50 %	50 %	311109777
29	NC_014641	TTGCCG	2	12	93005	93016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311109786

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.