MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 plasmid pA81

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014641	CGTCG	2	10	1209	1218	0 %	20 %	40 %	40 %	311109685
2	NC_014641	AGGGA	2	10	2158	2167	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014641	AACAC	2	10	2473	2482	60 %	0 %	0 %	40 %	311109688
4	NC_014641	CTTCG	2	10	2637	2646	0 %	40 %	20 %	40 %	311109688
5	NC_014641	AGGCG	2	10	3299	3308	20 %	0 %	60 %	20 %	311109688
6	NC_014641	GCCTG	2	10	5091	5100	0 %	20 %	40 %	40 %	311109691
7	NC_014641	GCGCT	2	10	7617	7626	0 %	20 %	40 %	40 %	311109693
8	NC_014641	TCGCA	2	10	8048	8057	20 %	20 %	20 %	40 %	311109693
9	NC_014641	GCTGT	2	10	8620	8629	0 %	40 %	40 %	20 %	311109694
10	NC_014641	GGTCG	2	10	9891	9900	0 %	20 %	60 %	20 %	311109695
11	NC_014641	TCGGC	2	10	10064	10073	0 %	20 %	40 %	40 %	311109695
12	NC_014641	ATGTC	2	10	12392	12401	20 %	40 %	20 %	20 %	311109698
13	NC_014641	GGACG	2	10	13449	13458	20 %	0 %	60 %	20 %	311109699
14	NC_014641	GCGCG	2	10	14801	14810	0 %	0 %	60 %	40 %	311109702
15	NC_014641	CTTCG	2	10	15662	15671	0 %	40 %	20 %	40 %	311109703
16	NC_014641	GCTGC	2	10	15922	15931	0 %	20 %	40 %	40 %	311109704
17	NC_014641	GTGTC	2	10	16216	16225	0 %	40 %	40 %	20 %	311109704
18	NC_014641	ATGGC	2	10	17987	17996	20 %	20 %	40 %	20 %	311109706
19	NC_014641	GCGCG	2	10	19671	19680	0 %	0 %	60 %	40 %	311109708
20	NC_014641	GGTAC	2	10	22546	22555	20 %	20 %	40 %	20 %	311109711
21	NC_014641	CATCC	2	10	23420	23429	20 %	20 %	0 %	60 %	311109712
22	NC_014641	CCAAT	2	10	26320	26329	40 %	20 %	0 %	40 %	311109716
23	NC_014641	CAAAC	2	10	36012	36021	60 %	0 %	0 %	40 %	311109727
24	NC_014641	ACGAT	2	10	37069	37078	40 %	20 %	20 %	20 %	311109729
25	NC_014641	GACGA	2	10	37638	37647	40 %	0 %	40 %	20 %	311109730
26	NC_014641	GCGTT	2	10	45834	45843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014641	AGCAA	2	10	45856	45865	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014641	CCGGC	2	10	48478	48487	0 %	0 %	40 %	60 %	311109740
29	NC_014641	ATGGC	2	10	51116	51125	20 %	20 %	40 %	20 %	311109743
30	NC_014641	TGCGT	2	10	52634	52643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014641	GAACC	2	10	53180	53189	40 %	0 %	20 %	40 %	311109744
32	NC_014641	GCACC	2	10	54621	54630	20 %	0 %	20 %	60 %	311109744
33	NC_014641	TGTTC	2	10	59811	59820	0 %	60 %	20 %	20 %	311109745
34	NC_014641	CCGAT	2	10	64663	64672	20 %	20 %	20 %	40 %	311109749
35	NC_014641	CACTT	2	10	66091	66100	20 %	40 %	0 %	40 %	311109750
36	NC_014641	CGCTT	2	10	67154	67163	0 %	40 %	20 %	40 %	311109750
37	NC_014641	CGGGT	2	10	67568	67577	0 %	20 %	60 %	20 %	311109750
38	NC_014641	GCGCG	2	10	70447	70456	0 %	0 %	60 %	40 %	311109756
39	NC_014641	CCGGC	2	10	72277	72286	0 %	0 %	40 %	60 %	311109759
40	NC_014641	CGCTC	2	10	72385	72394	0 %	20 %	20 %	60 %	311109759
41	NC_014641	CGGGC	2	10	73253	73262	0 %	0 %	60 %	40 %	311109760
42	NC_014641	CGGGT	2	10	73306	73315	0 %	20 %	60 %	20 %	311109760
43	NC_014641	CGTTG	2	10	73746	73755	0 %	40 %	40 %	20 %	311109760
44	NC_014641	AAGGG	2	10	74574	74583	40 %	0 %	60 %	0 %	311109761
45	NC_014641	CCGGC	2	10	76332	76341	0 %	0 %	40 %	60 %	311109765
46	NC_014641	CGCGC	2	10	77568	77577	0 %	0 %	40 %	60 %	311109767
47	NC_014641	GCAGG	2	10	80503	80512	20 %	0 %	60 %	20 %	311109772
48	NC_014641	CCTTG	2	10	82822	82831	0 %	40 %	20 %	40 %	311109776
49	NC_014641	CTGGC	2	10	83669	83678	0 %	20 %	40 %	40 %	311109777
50	NC_014641	CGGCG	2	10	84227	84236	0 %	0 %	60 %	40 %	311109777
51	NC_014641	GCCCA	2	10	86615	86624	20 %	0 %	20 %	60 %	311109781
52	NC_014641	CACGC	2	10	90843	90852	20 %	0 %	20 %	60 %	311109784
53	NC_014641	GCACC	2	10	91449	91458	20 %	0 %	20 %	60 %	311109784
54	NC_014641	TCGCC	2	10	97249	97258	0 %	20 %	20 %	60 %	311109787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.