MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 plasmid pA81

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014641	CTCA	2	8	1221	1228	25 %	25 %	0 %	50 %	311109685
2	NC_014641	TCCT	2	8	1876	1883	0 %	50 %	0 %	50 %	311109687
3	NC_014641	CGAG	2	8	2052	2059	25 %	0 %	50 %	25 %	311109687
4	NC_014641	AAGA	2	8	2146	2153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014641	TGCT	2	8	2358	2365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014641	TGCG	2	8	2406	2413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014641	GTGC	2	8	2889	2896	0 %	25 %	50 %	25 %	311109688
8	NC_014641	CCGA	2	8	2985	2992	25 %	0 %	25 %	50 %	311109688
9	NC_014641	GCCG	2	8	4553	4560	0 %	0 %	50 %	50 %	311109691
10	NC_014641	GATG	2	8	5367	5374	25 %	25 %	50 %	0 %	311109691
11	NC_014641	GTCG	2	8	5406	5413	0 %	25 %	50 %	25 %	311109691
12	NC_014641	GCCG	2	8	5516	5523	0 %	0 %	50 %	50 %	311109691
13	NC_014641	CAAT	2	8	5828	5835	50 %	25 %	0 %	25 %	311109691
14	NC_014641	GCCG	2	8	6285	6292	0 %	0 %	50 %	50 %	311109691
15	NC_014641	CTGG	2	8	6732	6739	0 %	25 %	50 %	25 %	311109691
16	NC_014641	ATGA	2	8	7275	7282	50 %	25 %	25 %	0 %	311109692
17	NC_014641	CCGC	2	8	7405	7412	0 %	0 %	25 %	75 %	311109692
18	NC_014641	GATG	2	8	7978	7985	25 %	25 %	50 %	0 %	311109693
19	NC_014641	ACCG	2	8	8147	8154	25 %	0 %	25 %	50 %	311109693
20	NC_014641	CCCG	2	8	8879	8886	0 %	0 %	25 %	75 %	311109694
21	NC_014641	GTGG	2	8	9610	9617	0 %	25 %	75 %	0 %	311109695
22	NC_014641	CGCC	2	8	10746	10753	0 %	0 %	25 %	75 %	311109696
23	NC_014641	GCGA	2	8	10787	10794	25 %	0 %	50 %	25 %	311109696
24	NC_014641	GCCA	2	8	11367	11374	25 %	0 %	25 %	50 %	311109698
25	NC_014641	TGGC	2	8	11404	11411	0 %	25 %	50 %	25 %	311109698
26	NC_014641	GGCC	2	8	12660	12667	0 %	0 %	50 %	50 %	311109698
27	NC_014641	GGCC	2	8	12771	12778	0 %	0 %	50 %	50 %	311109698
28	NC_014641	TCGG	2	8	13144	13151	0 %	25 %	50 %	25 %	311109699
29	NC_014641	CCCG	2	8	13229	13236	0 %	0 %	25 %	75 %	311109699
30	NC_014641	ACCA	2	8	13501	13508	50 %	0 %	0 %	50 %	311109699
31	NC_014641	AACG	2	8	13615	13622	50 %	0 %	25 %	25 %	311109699
32	NC_014641	GAAG	2	8	13786	13793	50 %	0 %	50 %	0 %	311109700
33	NC_014641	GCTG	2	8	13919	13926	0 %	25 %	50 %	25 %	311109700
34	NC_014641	CACG	2	8	14016	14023	25 %	0 %	25 %	50 %	311109700
35	NC_014641	TCCA	2	8	14233	14240	25 %	25 %	0 %	50 %	311109700
36	NC_014641	GGGC	2	8	14311	14318	0 %	0 %	75 %	25 %	311109700
37	NC_014641	GGCC	2	8	14729	14736	0 %	0 %	50 %	50 %	311109702
38	NC_014641	CCGG	2	8	15476	15483	0 %	0 %	50 %	50 %	311109703
39	NC_014641	CGCT	2	8	15769	15776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014641	AACC	2	8	15844	15851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014641	TCCA	2	8	16286	16293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014641	GGCT	2	8	16578	16585	0 %	25 %	50 %	25 %	311109705
43	NC_014641	CGTG	2	8	17129	17136	0 %	25 %	50 %	25 %	311109705
44	NC_014641	CCTG	2	8	17356	17363	0 %	25 %	25 %	50 %	311109705
45	NC_014641	CCGG	2	8	17411	17418	0 %	0 %	50 %	50 %	311109705
46	NC_014641	GAAG	2	8	18931	18938	50 %	0 %	50 %	0 %	311109707
47	NC_014641	CGCC	2	8	19577	19584	0 %	0 %	25 %	75 %	311109708
48	NC_014641	CAAT	2	8	20066	20073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014641	CTTC	2	8	20228	20235	0 %	50 %	0 %	50 %	311109709
50	NC_014641	CGAT	2	8	20240	20247	25 %	25 %	25 %	25 %	311109709
51	NC_014641	GGTC	2	8	20528	20535	0 %	25 %	50 %	25 %	311109709
52	NC_014641	GATG	2	8	20784	20791	25 %	25 %	50 %	0 %	311109709
53	NC_014641	GCGT	2	8	21205	21212	0 %	25 %	50 %	25 %	311109710
54	NC_014641	TCGT	2	8	21363	21370	0 %	50 %	25 %	25 %	311109710
55	NC_014641	GATA	2	8	21851	21858	50 %	25 %	25 %	0 %	311109710
56	NC_014641	TCAG	2	8	21864	21871	25 %	25 %	25 %	25 %	311109710
57	NC_014641	CAGG	2	8	22973	22980	25 %	0 %	50 %	25 %	311109712
58	NC_014641	AGGG	2	8	23068	23075	25 %	0 %	75 %	0 %	311109712
59	NC_014641	CGGT	2	8	24256	24263	0 %	25 %	50 %	25 %	311109713
60	NC_014641	GTCG	2	8	24353	24360	0 %	25 %	50 %	25 %	311109713
61	NC_014641	TCGT	2	8	24761	24768	0 %	50 %	25 %	25 %	311109713
62	NC_014641	CGGC	2	8	25512	25519	0 %	0 %	50 %	50 %	311109714
63	NC_014641	CAAG	2	8	25991	25998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014641	CTCG	2	8	26031	26038	0 %	25 %	25 %	50 %	311109715
65	NC_014641	CAGA	2	8	26384	26391	50 %	0 %	25 %	25 %	311109716
66	NC_014641	ATAA	2	8	26670	26677	75 %	25 %	0 %	0 %	311109716
67	NC_014641	TCCC	2	8	27125	27132	0 %	25 %	0 %	75 %	311109717
68	NC_014641	ATCA	2	8	27339	27346	50 %	25 %	0 %	25 %	311109718
69	NC_014641	CCGC	2	8	28176	28183	0 %	0 %	25 %	75 %	311109718
70	NC_014641	CCTG	2	8	28502	28509	0 %	25 %	25 %	50 %	311109719
71	NC_014641	GCAC	2	8	28840	28847	25 %	0 %	25 %	50 %	311109720
72	NC_014641	CTGC	2	8	29324	29331	0 %	25 %	25 %	50 %	311109720
73	NC_014641	TTGC	2	8	29443	29450	0 %	50 %	25 %	25 %	311109720
74	NC_014641	CAAC	2	8	31333	31340	50 %	0 %	0 %	50 %	311109722
75	NC_014641	GGCA	2	8	31441	31448	25 %	0 %	50 %	25 %	311109722
76	NC_014641	GTTC	2	8	33632	33639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014641	TTGC	2	8	33722	33729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014641	CCAA	2	8	34818	34825	50 %	0 %	0 %	50 %	311109726
79	NC_014641	ATAA	2	8	35745	35752	75 %	25 %	0 %	0 %	311109727
80	NC_014641	GCCA	2	8	35985	35992	25 %	0 %	25 %	50 %	311109727
81	NC_014641	GGTC	2	8	36612	36619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014641	TTTA	2	8	36654	36661	25 %	75 %	0 %	0 %	311109728
83	NC_014641	GAAC	2	8	37311	37318	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014641	CCTT	2	8	38457	38464	0 %	50 %	0 %	50 %	311109731
85	NC_014641	CTTT	2	8	39092	39099	0 %	75 %	0 %	25 %	311109732
86	NC_014641	TTGT	2	8	39817	39824	0 %	75 %	25 %	0 %	311109732
87	NC_014641	ATAA	2	8	40053	40060	75 %	25 %	0 %	0 %	311109733
88	NC_014641	GCGA	2	8	40227	40234	25 %	0 %	50 %	25 %	311109733
89	NC_014641	ATGG	2	8	40249	40256	25 %	25 %	50 %	0 %	311109733
90	NC_014641	CACG	2	8	40284	40291	25 %	0 %	25 %	50 %	311109733
91	NC_014641	CCGC	2	8	40319	40326	0 %	0 %	25 %	75 %	311109733
92	NC_014641	GTGG	2	8	40603	40610	0 %	25 %	75 %	0 %	311109733
93	NC_014641	TTAA	2	8	40993	41000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014641	GACC	2	8	41351	41358	25 %	0 %	25 %	50 %	311109734
95	NC_014641	CGGC	2	8	41644	41651	0 %	0 %	50 %	50 %	311109734
96	NC_014641	CCAA	2	8	42023	42030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014641	ACTT	2	8	42032	42039	25 %	50 %	0 %	25 %	311109735
98	NC_014641	CGCA	2	8	43461	43468	25 %	0 %	25 %	50 %	311109736
99	NC_014641	CCGC	2	8	43550	43557	0 %	0 %	25 %	75 %	311109736
100	NC_014641	AAAT	2	8	43738	43745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014641	CGGC	2	8	43931	43938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014641	CAAA	2	8	44430	44437	75 %	0 %	0 %	25 %	311109737
103	NC_014641	TTGC	2	8	45259	45266	0 %	50 %	25 %	25 %	311109738
104	NC_014641	GCCA	2	8	45308	45315	25 %	0 %	25 %	50 %	311109738
105	NC_014641	GTCA	2	8	45638	45645	25 %	25 %	25 %	25 %	311109738
106	NC_014641	CGCC	2	8	46731	46738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_014641	TGCC	2	8	47093	47100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014641	GCTG	2	8	47621	47628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014641	GTGC	2	8	47977	47984	0 %	25 %	50 %	25 %	311109740
110	NC_014641	TCCA	2	8	49415	49422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014641	GGCT	2	8	49707	49714	0 %	25 %	50 %	25 %	311109742
112	NC_014641	CGTG	2	8	50258	50265	0 %	25 %	50 %	25 %	311109742
113	NC_014641	CCTG	2	8	50485	50492	0 %	25 %	25 %	50 %	311109742
114	NC_014641	CCGG	2	8	50540	50547	0 %	0 %	50 %	50 %	311109742
115	NC_014641	CAGG	2	8	51940	51947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014641	CAAG	2	8	52298	52305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014641	CCGG	2	8	53008	53015	0 %	0 %	50 %	50 %	311109744
118	NC_014641	GCTG	2	8	53448	53455	0 %	25 %	50 %	25 %	311109744
119	NC_014641	CGCC	2	8	53496	53503	0 %	0 %	25 %	75 %	311109744
120	NC_014641	CTGC	2	8	54183	54190	0 %	25 %	25 %	50 %	311109744
121	NC_014641	ATCA	2	8	54520	54527	50 %	25 %	0 %	25 %	311109744
122	NC_014641	GCTC	2	8	55278	55285	0 %	25 %	25 %	50 %	311109744
123	NC_014641	ATTG	2	8	55522	55529	25 %	50 %	25 %	0 %	311109744
124	NC_014641	AGGG	2	8	55982	55989	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014641	GCTC	2	8	56181	56188	0 %	25 %	25 %	50 %	311109745
126	NC_014641	TCCT	2	8	56554	56561	0 %	50 %	0 %	50 %	311109745
127	NC_014641	CGGT	2	8	56669	56676	0 %	25 %	50 %	25 %	311109745
128	NC_014641	CCGG	3	12	56923	56934	0 %	0 %	50 %	50 %	311109745
129	NC_014641	CGGC	2	8	57345	57352	0 %	0 %	50 %	50 %	311109745
130	NC_014641	CTGG	2	8	57505	57512	0 %	25 %	50 %	25 %	311109745
131	NC_014641	CGTC	2	8	57756	57763	0 %	25 %	25 %	50 %	311109745
132	NC_014641	CCGG	2	8	58104	58111	0 %	0 %	50 %	50 %	311109745
133	NC_014641	GGTC	2	8	58332	58339	0 %	25 %	50 %	25 %	311109745
134	NC_014641	GGCG	2	8	58902	58909	0 %	0 %	75 %	25 %	311109745
135	NC_014641	GCCG	2	8	59008	59015	0 %	0 %	50 %	50 %	311109745
136	NC_014641	GTCG	2	8	59560	59567	0 %	25 %	50 %	25 %	311109745
137	NC_014641	GCGT	2	8	59597	59604	0 %	25 %	50 %	25 %	311109745
138	NC_014641	GCCG	2	8	59790	59797	0 %	0 %	50 %	50 %	311109745
139	NC_014641	TGCC	2	8	60042	60049	0 %	25 %	25 %	50 %	311109745
140	NC_014641	ATGA	2	8	60254	60261	50 %	25 %	25 %	0 %	311109745
141	NC_014641	CGGC	2	8	60459	60466	0 %	0 %	50 %	50 %	311109745
142	NC_014641	GCTC	2	8	60969	60976	0 %	25 %	25 %	50 %	311109746
143	NC_014641	GGCC	2	8	61220	61227	0 %	0 %	50 %	50 %	311109747
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229	NC_014641	GCAT	2	8	96853	96860	25 %	25 %	25 %	25 %	311109787
230	NC_014641	CGGA	2	8	97241	97248	25 %	0 %	50 %	25 %	311109787
231	NC_014641	CGGC	2	8	97819	97826	0 %	0 %	50 %	50 %	311109788
232	NC_014641	GGTG	2	8	98085	98092	0 %	25 %	75 %	0 %	311109788

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.