MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 chromosome

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014640	GGGATG	2	12	47163	47174	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014640	CTGTCT	2	12	103098	103109	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014640	AATGAT	2	12	107499	107510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014640	TTACGT	2	12	123985	123996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014640	ACGTAA	2	12	127161	127172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014640	CTCATT	2	12	152326	152337	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014640	GGCCCC	2	12	166212	166223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014640	GACTTC	2	12	166343	166354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014640	AAATGC	2	12	215283	215294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014640	GCACAA	2	12	240879	240890	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014640	GCGGCT	2	12	299119	299130	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014640	TTGGCA	2	12	388964	388975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014640	CAAGGA	2	12	442754	442765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014640	AGCAAT	2	12	474299	474310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014640	ATATTT	2	12	477297	477308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014640	GTCCGC	2	12	521359	521370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014640	TCTATA	2	12	525909	525920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014640	CATCCT	2	12	574954	574965	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014640	CCGGGT	2	12	575256	575267	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014640	CAGCGC	2	12	584932	584943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014640	GTTGCT	2	12	621901	621912	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014640	CATCCT	2	12	622011	622022	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014640	ATATAG	2	12	688302	688313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014640	CGTGCG	2	12	824245	824256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014640	CTGGAA	2	12	849154	849165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014640	GCGCCG	2	12	916679	916690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014640	CGTCGG	2	12	986471	986482	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014640	TCCTCG	2	12	1001550	1001561	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014640	GGCCGG	2	12	1059452	1059463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014640	CAGCGT	2	12	1077587	1077598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014640	TTCCTT	2	12	1092901	1092912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014640	CGGTGC	2	12	1139088	1139099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014640	CAAGCA	2	12	1149445	1149456	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014640	AGCGAC	2	12	1150625	1150636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014640	TCATCC	2	12	1157420	1157431	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014640	GCGATG	2	12	1200446	1200457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014640	TCAACT	2	12	1240782	1240793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014640	CCCGGC	2	12	1302703	1302714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014640	GAAAAA	2	12	1303180	1303191	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014640	GAAAAA	2	12	1319806	1319817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014640	AGGCGG	2	12	1367606	1367617	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014640	CGCGAG	2	12	1384510	1384521	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014640	CAAACG	2	12	1459721	1459732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014640	AAAGGC	2	12	1484974	1484985	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014640	AGGCAG	2	12	1550092	1550103	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014640	ATCATT	2	12	1668515	1668526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014640	CGGTTG	2	12	1673778	1673789	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014640	GTTTGG	2	12	1731187	1731198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014640	ACGCAA	2	12	1746518	1746529	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014640	CCCGGA	2	12	1772796	1772807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014640	TTCAGG	2	12	1777257	1777268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014640	GGAAGG	2	12	1796213	1796224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014640	CGGCGT	2	12	1866809	1866820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014640	CTTTTT	2	12	1870548	1870559	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014640	TGGAAA	2	12	1891217	1891228	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014640	GCCGGA	2	12	1934351	1934362	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014640	GGCGCC	2	12	1973269	1973280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014640	CGGCCC	2	12	1978136	1978147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014640	TTGATT	2	12	1989441	1989452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014640	GGACCG	2	12	2000463	2000474	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014640	TTTTAT	3	18	2030528	2030545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014640	ACGCAA	2	12	2042486	2042497	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014640	AATCGG	2	12	2056622	2056633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014640	CGACAA	2	12	2063444	2063455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014640	GTAGGC	2	12	2092141	2092152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014640	CGAGGA	2	12	2105799	2105810	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014640	CGGGCG	2	12	2112608	2112619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014640	GCGGTC	2	12	2117806	2117817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014640	GAAGGG	2	12	2202429	2202440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014640	TGGGGC	2	12	2312490	2312501	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014640	AGCGGC	2	12	2428519	2428530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014640	GTTTTT	2	12	2443970	2443981	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014640	GGCGCG	2	12	2444266	2444277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014640	TTTCAA	2	12	2482772	2482783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014640	ACGCAT	2	12	2508119	2508130	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014640	ATTGCA	2	12	2532835	2532846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014640	CGAGGA	2	12	2540288	2540299	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014640	GATAGC	2	12	2568304	2568315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014640	CCGCGC	2	12	2595718	2595729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014640	GAGCCT	2	12	2628209	2628220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014640	GCCGCG	2	12	2696336	2696347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014640	GGCACA	2	12	2783735	2783746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014640	TACGTA	2	12	2823862	2823873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014640	GGCGAG	2	12	2907119	2907130	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014640	TTTACG	2	12	3026009	3026020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014640	TAGCAA	2	12	3028503	3028514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014640	CCGCGC	2	12	3053834	3053845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014640	GCGCCT	2	12	3309083	3309094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014640	TGGTGT	2	12	3378942	3378953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014640	CAGGCC	2	12	3412433	3412444	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014640	TGCGGC	2	12	3413374	3413385	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014640	CGCCGG	2	12	3454020	3454031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014640	GCGGCC	2	12	3471607	3471618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014640	GGCACG	2	12	3506437	3506448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014640	ATATGA	2	12	3538673	3538684	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014640	GCAATG	2	12	3551417	3551428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014640	CAAAAA	2	12	3818886	3818897	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014640	GGGCTT	2	12	3825047	3825058	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014640	GTTTCA	2	12	3942412	3942423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014640	GCAAAG	2	12	3954478	3954489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014640	CGCCGG	2	12	3974643	3974654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014640	GGGATG	2	12	4039694	4039705	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014640	GGCCCA	2	12	4106081	4106092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014640	ATTGCC	2	12	4141466	4141477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014640	CCCGCG	2	12	4183752	4183763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014640	GGGTCC	2	12	4301187	4301198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014640	TTGGGT	2	12	4307047	4307058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014640	TAGAAA	2	12	4348224	4348235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014640	CCGGCG	2	12	4348281	4348292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014640	TGGTTC	2	12	4453955	4453966	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014640	ACAAGC	2	12	4455848	4455859	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014640	CCCGTT	2	12	4459602	4459613	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014640	ACGTTA	2	12	4465929	4465940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014640	TCTTTT	2	12	4517674	4517685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014640	GACCGC	2	12	4525244	4525255	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014640	TCCCCT	2	12	4563330	4563341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014640	GCCGGC	2	12	4631880	4631891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014640	CGGCGC	2	12	4657394	4657405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014640	GTGGAC	2	12	4708100	4708111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014640	ATTTTT	2	12	4816346	4816357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014640	GCGTTT	2	12	4859480	4859491	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014640	CCGCAA	2	12	4903990	4904001	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014640	ACCGCA	2	12	4920755	4920766	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014640	GCTTGC	2	12	4943368	4943379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014640	TTGTTT	2	12	4958358	4958369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014640	TTTGGC	2	12	5073819	5073830	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014640	CCGCGC	2	12	5141792	5141803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014640	CCTAAT	2	12	5200003	5200014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014640	GGCCGC	2	12	5211592	5211603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014640	GCCGCA	2	12	5331078	5331089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014640	TTGCCG	2	12	5368542	5368553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014640	TGGGCC	2	12	5391349	5391360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014640	CCACGC	2	12	5393357	5393368	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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139	NC_014640	ATCACA	2	12	5549439	5549450	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014640	CCCGCA	2	12	5572533	5572544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.