MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 chromosome

Total Repeats: 6162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014640	GTGCT	2	10	3509	3518	0 %	40 %	40 %	20 %	311103227
2	NC_014640	GGCCT	2	10	3665	3674	0 %	20 %	40 %	40 %	311103227
3	NC_014640	CCAAG	2	10	5697	5706	40 %	0 %	20 %	40 %	311103228
4	NC_014640	GCCGC	2	10	6395	6404	0 %	0 %	40 %	60 %	311103229
5	NC_014640	CGAAG	2	10	7391	7400	40 %	0 %	40 %	20 %	311103230
6	NC_014640	CGGGC	2	10	7462	7471	0 %	0 %	60 %	40 %	311103230
7	NC_014640	AGACC	2	10	9950	9959	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014640	CAGCG	2	10	10020	10029	20 %	0 %	40 %	40 %	311103234
9	NC_014640	CGCTG	2	10	11666	11675	0 %	20 %	40 %	40 %	311103235
10	NC_014640	CGCCT	2	10	13435	13444	0 %	20 %	20 %	60 %	311103237
11	NC_014640	CGCAG	2	10	13748	13757	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014640	CCAGA	2	10	14803	14812	40 %	0 %	20 %	40 %	311103239
13	NC_014640	ACGCG	2	10	14819	14828	20 %	0 %	40 %	40 %	311103239
14	NC_014640	CGGCG	2	10	15324	15333	0 %	0 %	60 %	40 %	311103239
15	NC_014640	CTGGG	2	10	15907	15916	0 %	20 %	60 %	20 %	311103239
16	NC_014640	GCGCT	2	10	16327	16336	0 %	20 %	40 %	40 %	311103239
17	NC_014640	TGCGC	2	10	16587	16596	0 %	20 %	40 %	40 %	311103240
18	NC_014640	ACGCC	2	10	17575	17584	20 %	0 %	20 %	60 %	311103242
19	NC_014640	GCGCT	2	10	18078	18087	0 %	20 %	40 %	40 %	311103242
20	NC_014640	TGAAC	2	10	18274	18283	40 %	20 %	20 %	20 %	311103242
21	NC_014640	CGCGT	2	10	18932	18941	0 %	20 %	40 %	40 %	311103242
22	NC_014640	CGGTG	2	10	19653	19662	0 %	20 %	60 %	20 %	311103243
23	NC_014640	GCCGC	2	10	20627	20636	0 %	0 %	40 %	60 %	311103244
24	NC_014640	ATGGC	2	10	21379	21388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014640	CGTCG	2	10	21904	21913	0 %	20 %	40 %	40 %	311103245
26	NC_014640	GCGCT	2	10	22172	22181	0 %	20 %	40 %	40 %	311103245
27	NC_014640	CGGCG	2	10	23185	23194	0 %	0 %	60 %	40 %	311103246
28	NC_014640	TGCCT	2	10	24821	24830	0 %	40 %	20 %	40 %	311103247
29	NC_014640	ACGCC	2	10	25391	25400	20 %	0 %	20 %	60 %	311103248
30	NC_014640	TGCGC	2	10	27247	27256	0 %	20 %	40 %	40 %	311103250
31	NC_014640	GCGCC	2	10	28985	28994	0 %	0 %	40 %	60 %	311103252
32	NC_014640	GCCGC	2	10	31408	31417	0 %	0 %	40 %	60 %	311103255
33	NC_014640	CGGCG	2	10	33137	33146	0 %	0 %	60 %	40 %	311103257
34	NC_014640	AACGC	2	10	34786	34795	40 %	0 %	20 %	40 %	311103259
35	NC_014640	GCGAT	2	10	35156	35165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014640	GCCGC	2	10	35498	35507	0 %	0 %	40 %	60 %	311103260
37	NC_014640	CGTGG	2	10	36365	36374	0 %	20 %	60 %	20 %	311103261
38	NC_014640	CGCGG	2	10	42538	42547	0 %	0 %	60 %	40 %	311103267
39	NC_014640	GCCGC	2	10	42635	42644	0 %	0 %	40 %	60 %	311103267
40	NC_014640	GCCCT	2	10	42880	42889	0 %	20 %	20 %	60 %	311103267
41	NC_014640	CCAGG	2	10	42955	42964	20 %	0 %	40 %	40 %	311103267
42	NC_014640	CAGGC	2	10	44298	44307	20 %	0 %	40 %	40 %	311103268
43	NC_014640	CGCGC	2	10	44730	44739	0 %	0 %	40 %	60 %	311103269
44	NC_014640	AATGG	2	10	47865	47874	40 %	20 %	40 %	0 %	311103271
45	NC_014640	CTGGA	2	10	48421	48430	20 %	20 %	40 %	20 %	311103271
46	NC_014640	CTGGC	2	10	50600	50609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014640	CTTCC	2	10	50632	50641	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014640	CGGCG	2	10	54743	54752	0 %	0 %	60 %	40 %	311103279
49	NC_014640	GCGCC	2	10	59113	59122	0 %	0 %	40 %	60 %	311103284
50	NC_014640	GCACG	2	10	59311	59320	20 %	0 %	40 %	40 %	311103284
51	NC_014640	CGCGG	2	10	59554	59563	0 %	0 %	60 %	40 %	311103284
52	NC_014640	GACGA	2	10	60245	60254	40 %	0 %	40 %	20 %	311103284
53	NC_014640	CGGGC	2	10	61857	61866	0 %	0 %	60 %	40 %	311103286
54	NC_014640	ACGCG	2	10	63848	63857	20 %	0 %	40 %	40 %	311103288
55	NC_014640	AGGTC	2	10	65818	65827	20 %	20 %	40 %	20 %	311103289
56	NC_014640	CTGGC	2	10	68620	68629	0 %	20 %	40 %	40 %	311103290
57	NC_014640	AGGCC	2	10	69282	69291	20 %	0 %	40 %	40 %	311103290
58	NC_014640	GCGCC	2	10	69407	69416	0 %	0 %	40 %	60 %	311103291
59	NC_014640	GGGCG	2	10	69530	69539	0 %	0 %	80 %	20 %	311103291
60	NC_014640	CCGCG	2	10	69667	69676	0 %	0 %	40 %	60 %	311103291
61	NC_014640	CAGGC	2	10	70071	70080	20 %	0 %	40 %	40 %	311103291
62	NC_014640	GCGCG	3	15	70286	70300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014640	TTTAC	2	10	70863	70872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014640	GCCGC	2	10	71665	71674	0 %	0 %	40 %	60 %	311103293
65	NC_014640	GCCGA	2	10	72316	72325	20 %	0 %	40 %	40 %	311103293
66	NC_014640	GTGAT	2	10	74168	74177	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014640	CGGCG	2	10	76050	76059	0 %	0 %	60 %	40 %	311103296
68	NC_014640	CCGGC	2	10	76189	76198	0 %	0 %	40 %	60 %	311103296
69	NC_014640	CCGCG	2	10	79703	79712	0 %	0 %	40 %	60 %	311103301
70	NC_014640	GCAGG	2	10	82066	82075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014640	ATCGA	2	10	82488	82497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014640	GCCGC	2	10	83290	83299	0 %	0 %	40 %	60 %	311103305
73	NC_014640	GGCCC	2	10	83694	83703	0 %	0 %	40 %	60 %	311103305
74	NC_014640	TGGCG	2	10	90738	90747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014640	GGCGC	2	10	91215	91224	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014640	GGCAC	2	10	93481	93490	20 %	0 %	40 %	40 %	311103312
77	NC_014640	TGGCC	2	10	93661	93670	0 %	20 %	40 %	40 %	311103312
78	NC_014640	GACCT	2	10	95973	95982	20 %	20 %	20 %	40 %	311103315
79	NC_014640	GGATT	2	10	96000	96009	20 %	40 %	40 %	0 %	311103315
80	NC_014640	GCCTG	2	10	96751	96760	0 %	20 %	40 %	40 %	311103316
81	NC_014640	CGCGC	2	10	97818	97827	0 %	0 %	40 %	60 %	311103318
82	NC_014640	GCTCC	2	10	98865	98874	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014640	GGCTG	2	10	102950	102959	0 %	20 %	60 %	20 %	311103323
84	NC_014640	GGCGG	2	10	106588	106597	0 %	0 %	80 %	20 %	311103325
85	NC_014640	GCCGG	2	10	108361	108370	0 %	0 %	60 %	40 %	311103327
86	NC_014640	TGCAG	2	10	108538	108547	20 %	20 %	40 %	20 %	311103327
87	NC_014640	GCACG	2	10	109450	109459	20 %	0 %	40 %	40 %	311103328
88	NC_014640	GGTGT	2	10	109868	109877	0 %	40 %	60 %	0 %	311103328
89	NC_014640	GCGCC	2	10	110420	110429	0 %	0 %	40 %	60 %	311103329
90	NC_014640	AGCGC	2	10	110733	110742	20 %	0 %	40 %	40 %	311103329
91	NC_014640	TCAGG	2	10	110763	110772	20 %	20 %	40 %	20 %	311103329
92	NC_014640	GCGCT	2	10	111006	111015	0 %	20 %	40 %	40 %	311103330
93	NC_014640	GGCCG	2	10	113138	113147	0 %	0 %	60 %	40 %	311103331
94	NC_014640	AGCGC	2	10	113844	113853	20 %	0 %	40 %	40 %	311103332
95	NC_014640	TGCGC	2	10	118277	118286	0 %	20 %	40 %	40 %	311103336
96	NC_014640	CGCGG	2	10	120210	120219	0 %	0 %	60 %	40 %	311103337
97	NC_014640	GCTGC	2	10	122382	122391	0 %	20 %	40 %	40 %	311103338
98	NC_014640	TGGCC	2	10	123026	123035	0 %	20 %	40 %	40 %	311103339
99	NC_014640	GCGCG	2	10	124286	124295	0 %	0 %	60 %	40 %	311103340
100	NC_014640	GCCCG	2	10	126913	126922	0 %	0 %	40 %	60 %	311103343
101	NC_014640	TGAAG	2	10	127419	127428	40 %	20 %	40 %	0 %	311103344
102	NC_014640	GCGCG	2	10	129324	129333	0 %	0 %	60 %	40 %	311103346
103	NC_014640	GCCTG	2	10	129825	129834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014640	GCGAG	2	10	131095	131104	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014640	GCCAG	2	10	132108	132117	20 %	0 %	40 %	40 %	311103349
106	NC_014640	CGGCG	2	10	134447	134456	0 %	0 %	60 %	40 %	311103351
107	NC_014640	GGCCG	2	10	134561	134570	0 %	0 %	60 %	40 %	311103351
108	NC_014640	GGACG	2	10	134624	134633	20 %	0 %	60 %	20 %	311103351
109	NC_014640	CCCGG	2	10	136311	136320	0 %	0 %	40 %	60 %	311103352
110	NC_014640	GCGGA	2	10	136631	136640	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014640	TTTCC	2	10	140650	140659	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014640	AAGCC	2	10	140992	141001	40 %	0 %	20 %	40 %	311103358
113	NC_014640	CGGCG	2	10	142697	142706	0 %	0 %	60 %	40 %	311103360
114	NC_014640	GAACA	2	10	142953	142962	60 %	0 %	20 %	20 %	311103360
115	NC_014640	TGCCC	2	10	144760	144769	0 %	20 %	20 %	60 %	311103361
116	NC_014640	CCGGG	2	10	147719	147728	0 %	0 %	60 %	40 %	311103363
117	NC_014640	CGTTC	2	10	149083	149092	0 %	40 %	20 %	40 %	311103364
118	NC_014640	AGGTC	2	10	150708	150717	20 %	20 %	40 %	20 %	311103366
119	NC_014640	GCGCG	2	10	152263	152272	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014640	GCATG	2	10	153810	153819	20 %	20 %	40 %	20 %	311103370
121	NC_014640	ACGCG	2	10	154443	154452	20 %	0 %	40 %	40 %	311103370
122	NC_014640	AGCCG	2	10	154723	154732	20 %	0 %	40 %	40 %	311103370
123	NC_014640	ACGGC	2	10	154884	154893	20 %	0 %	40 %	40 %	311103370
124	NC_014640	GCACG	2	10	158540	158549	20 %	0 %	40 %	40 %	311103373
125	NC_014640	TGTCG	2	10	160748	160757	0 %	40 %	40 %	20 %	311103374
126	NC_014640	TCGGC	2	10	161260	161269	0 %	20 %	40 %	40 %	311103375
127	NC_014640	GAAGC	2	10	163135	163144	40 %	0 %	40 %	20 %	311103376
128	NC_014640	CCAGC	2	10	164871	164880	20 %	0 %	20 %	60 %	311103378
129	NC_014640	CTGGT	2	10	164890	164899	0 %	40 %	40 %	20 %	311103378
130	NC_014640	GCCGC	2	10	165181	165190	0 %	0 %	40 %	60 %	311103378
131	NC_014640	GGCCA	2	10	168251	168260	20 %	0 %	40 %	40 %	311103380
132	NC_014640	GCGCC	2	10	169038	169047	0 %	0 %	40 %	60 %	311103380
133	NC_014640	CAGCG	2	10	170234	170243	20 %	0 %	40 %	40 %	311103381
134	NC_014640	CGCGC	2	10	170817	170826	0 %	0 %	40 %	60 %	311103382
135	NC_014640	GCTCT	2	10	171115	171124	0 %	40 %	20 %	40 %	311103382
136	NC_014640	CGCAG	2	10	171774	171783	20 %	0 %	40 %	40 %	311103383
137	NC_014640	GCCGC	2	10	171904	171913	0 %	0 %	40 %	60 %	311103383
138	NC_014640	ACGCC	2	10	172685	172694	20 %	0 %	20 %	60 %	311103384
139	NC_014640	GGCGC	2	10	173765	173774	0 %	0 %	60 %	40 %	311103385
140	NC_014640	CGACA	2	10	178750	178759	40 %	0 %	20 %	40 %	311103391
141	NC_014640	CGGCG	2	10	180247	180256	0 %	0 %	60 %	40 %	311103393
142	NC_014640	GCCCG	2	10	181676	181685	0 %	0 %	40 %	60 %	311103395
143	NC_014640	AATCC	2	10	182217	182226	40 %	20 %	0 %	40 %	311103395
144	NC_014640	GCCGC	2	10	182707	182716	0 %	0 %	40 %	60 %	311103396
145	NC_014640	CAGGA	2	10	183455	183464	40 %	0 %	40 %	20 %	311103396
146	NC_014640	CTTGT	2	10	184046	184055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014640	TATTC	2	10	185832	185841	20 %	60 %	0 %	20 %	311103399
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150	NC_014640	ATGCC	2	10	187826	187835	20 %	20 %	20 %	40 %	311103401
151	NC_014640	TGGGC	2	10	188051	188060	0 %	20 %	60 %	20 %	311103401
152	NC_014640	TCAGT	2	10	188713	188722	20 %	40 %	20 %	20 %	311103402
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155	NC_014640	TGCCC	2	10	202757	202766	0 %	20 %	20 %	60 %	311103422
156	NC_014640	GCGCC	2	10	203679	203688	0 %	0 %	40 %	60 %	311103423
157	NC_014640	GATGG	2	10	204693	204702	20 %	20 %	60 %	0 %	311103423
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159	NC_014640	GTTTT	2	10	205747	205756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014640	GGAGC	2	10	207784	207793	20 %	0 %	60 %	20 %	311103426
161	NC_014640	TTCTC	2	10	208582	208591	0 %	60 %	0 %	40 %	311103427
162	NC_014640	CTTGG	2	10	210124	210133	0 %	40 %	40 %	20 %	311103428
163	NC_014640	GGCCA	2	10	211137	211146	20 %	0 %	40 %	40 %	311103429
164	NC_014640	GGCGC	2	10	213554	213563	0 %	0 %	60 %	40 %	311103429
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166	NC_014640	CCGCG	2	10	214772	214781	0 %	0 %	40 %	60 %	311103429
167	NC_014640	TGCAG	2	10	215025	215034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_014640	TCCCC	2	10	219319	219328	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
169	NC_014640	CTGAA	2	10	219614	219623	40 %	20 %	20 %	20 %	311103434
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171	NC_014640	GCAAG	2	10	221802	221811	40 %	0 %	40 %	20 %	311103435
172	NC_014640	CGGGA	2	10	223264	223273	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014640	TTGGC	2	10	223835	223844	0 %	40 %	40 %	20 %	311103436
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176	NC_014640	GGGCG	2	10	229382	229391	0 %	0 %	80 %	20 %	311103443
177	NC_014640	TGGCG	2	10	230822	230831	0 %	20 %	60 %	20 %	311103445
178	NC_014640	CGGCC	2	10	231357	231366	0 %	0 %	40 %	60 %	311103445
179	NC_014640	CCAGC	2	10	233702	233711	20 %	0 %	20 %	60 %	311103449
180	NC_014640	ACCGG	2	10	234916	234925	20 %	0 %	40 %	40 %	311103450
181	NC_014640	ACCGT	2	10	236189	236198	20 %	20 %	20 %	40 %	311103451
182	NC_014640	CTGGA	2	10	237012	237021	20 %	20 %	40 %	20 %	311103452
183	NC_014640	GCCGC	2	10	239621	239630	0 %	0 %	40 %	60 %	311103454
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192	NC_014640	TGTGC	2	10	255143	255152	0 %	40 %	40 %	20 %	311103464
193	NC_014640	CGCGC	2	10	255275	255284	0 %	0 %	40 %	60 %	311103464
194	NC_014640	ACGTC	2	10	255685	255694	20 %	20 %	20 %	40 %	311103465
195	NC_014640	CGATT	2	10	256139	256148	20 %	40 %	20 %	20 %	311103465
196	NC_014640	ACGCA	2	10	256323	256332	40 %	0 %	20 %	40 %	311103465
197	NC_014640	AGCGC	2	10	256411	256420	20 %	0 %	40 %	40 %	311103465
198	NC_014640	GCGCG	2	10	257160	257169	0 %	0 %	60 %	40 %	311103466
199	NC_014640	GCTGG	2	10	258674	258683	0 %	20 %	60 %	20 %	311103467
200	NC_014640	TTCTG	2	10	259423	259432	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
201	NC_014640	CGGCG	2	10	260847	260856	0 %	0 %	60 %	40 %	311103470
202	NC_014640	GGCAT	2	10	261633	261642	20 %	20 %	40 %	20 %	311103471
203	NC_014640	GTCCG	2	10	262787	262796	0 %	20 %	40 %	40 %	311103472
204	NC_014640	CGATG	2	10	263135	263144	20 %	20 %	40 %	20 %	311103472
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236	NC_014640	GGCCC	2	10	322193	322202	0 %	0 %	40 %	60 %	311103527
237	NC_014640	CCGCG	2	10	323603	323612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
238	NC_014640	GCTGC	2	10	324870	324879	0 %	20 %	40 %	40 %	311103531
239	NC_014640	GTGGC	2	10	327718	327727	0 %	20 %	60 %	20 %	311103534
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241	NC_014640	ACCGC	2	10	329283	329292	20 %	0 %	20 %	60 %	311103535
242	NC_014640	TGGGC	2	10	330115	330124	0 %	20 %	60 %	20 %	311103536
243	NC_014640	CCGGC	2	10	332176	332185	0 %	0 %	40 %	60 %	311103539
244	NC_014640	CGGCG	2	10	333553	333562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
245	NC_014640	AGGAG	2	10	333800	333809	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
246	NC_014640	CGCGA	2	10	334239	334248	20 %	0 %	40 %	40 %	311103540
247	NC_014640	CCGCG	2	10	335021	335030	0 %	0 %	40 %	60 %	311103541
248	NC_014640	GCTGG	2	10	335045	335054	0 %	20 %	60 %	20 %	311103541
249	NC_014640	TGCGC	2	10	335147	335156	0 %	20 %	40 %	40 %	311103541
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254	NC_014640	CGGCG	2	10	341833	341842	0 %	0 %	60 %	40 %	311103546
255	NC_014640	TCCAG	2	10	343063	343072	20 %	20 %	20 %	40 %	311103547
256	NC_014640	CAGGG	2	10	343500	343509	20 %	0 %	60 %	20 %	311103547
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259	NC_014640	GGCGC	2	10	352036	352045	0 %	0 %	60 %	40 %	311103556
260	NC_014640	CCTGT	2	10	352292	352301	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
261	NC_014640	GCGCC	2	10	352706	352715	0 %	0 %	40 %	60 %	311103557
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263	NC_014640	GCGCG	2	10	353896	353905	0 %	0 %	60 %	40 %	311103557
264	NC_014640	CGCGG	2	10	354243	354252	0 %	0 %	60 %	40 %	311103557
265	NC_014640	GCCTT	2	10	355078	355087	0 %	40 %	20 %	40 %	311103558
266	NC_014640	CGCGC	2	10	355284	355293	0 %	0 %	40 %	60 %	311103559
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