MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 chromosome

Total Repeats: 616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014640	AGACC	2	10	9950	9959	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014640	CGCAG	2	10	13748	13757	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014640	ATGGC	2	10	21379	21388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014640	GCGAT	2	10	35156	35165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014640	CTGGC	2	10	50600	50609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014640	CTTCC	2	10	50632	50641	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_014640	GCGCG	3	15	70286	70300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014640	TTTAC	2	10	70863	70872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014640	GTGAT	2	10	74168	74177	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014640	GCAGG	2	10	82066	82075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014640	ATCGA	2	10	82488	82497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014640	TGGCG	2	10	90738	90747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014640	GGCGC	2	10	91215	91224	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014640	GCTCC	2	10	98865	98874	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014640	GCCTG	2	10	129825	129834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014640	GCGAG	2	10	131095	131104	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014640	GCGGA	2	10	136631	136640	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014640	TTTCC	2	10	140650	140659	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014640	GCGCG	2	10	152263	152272	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014640	CTTGT	2	10	184046	184055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014640	GTTTT	2	10	205747	205756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014640	TGCAG	2	10	215025	215034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014640	TCCCC	2	10	219319	219328	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_014640	CGGGA	2	10	223264	223273	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014640	CACGA	2	10	243291	243300	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014640	TTCTG	2	10	259423	259432	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014640	CCGCG	2	10	323603	323612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014640	CGGCG	2	10	333553	333562	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014640	AGGAG	2	10	333800	333809	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014640	CCTGT	2	10	352292	352301	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014640	GGGGC	2	10	356892	356901	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014640	GGCCC	2	10	360176	360185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014640	TCCGC	2	10	363153	363162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_014640	TGCCG	2	10	375520	375529	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014640	CAACG	2	10	382216	382225	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014640	CGGCG	2	10	382417	382426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014640	CATTG	2	10	382610	382619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014640	CGGCG	2	10	386858	386867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014640	CGCGG	2	10	415919	415928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014640	GCGCG	2	10	419033	419042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014640	CCGGC	2	10	420467	420476	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014640	AAATT	2	10	431818	431827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014640	TGCGC	2	10	438057	438066	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014640	CAGCC	2	10	452554	452563	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014640	GCCGT	2	10	459891	459900	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014640	CCGCG	2	10	474784	474793	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014640	CGGCG	2	10	521292	521301	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014640	GCCCG	2	10	556301	556310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_014640	GGCCG	2	10	566307	566316	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014640	CGTTG	2	10	569933	569942	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014640	ATCGC	2	10	571031	571040	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014640	CGTCG	2	10	574886	574895	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014640	GAAGG	2	10	575646	575655	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014640	ATGGG	2	10	583399	583408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014640	AGGCC	2	10	595340	595349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014640	AGGCG	2	10	608466	608475	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014640	CGGCG	2	10	631068	631077	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014640	CGGGA	2	10	632426	632435	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014640	GAAGG	2	10	648937	648946	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014640	AGGCT	2	10	661299	661308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014640	GAAGG	2	10	661901	661910	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014640	TCCTG	2	10	666051	666060	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014640	GGCGC	2	10	666095	666104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014640	TGTTT	2	10	669127	669136	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014640	ACGTT	2	10	673423	673432	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014640	CGGGG	2	10	673626	673635	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014640	TGTAG	2	10	684043	684052	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014640	CGGCG	2	10	691339	691348	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014640	AATGG	2	10	700677	700686	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014640	CGGCC	2	10	720456	720465	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_014640	ATGCG	2	10	727959	727968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014640	TGGCG	2	10	733658	733667	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014640	CCGCG	2	10	752288	752297	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014640	GCAAA	2	10	758141	758150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014640	CGCAT	2	10	758329	758338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014640	CGCGG	2	10	762218	762227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014640	GCCGC	2	10	782271	782280	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014640	AGCGA	2	10	817686	817695	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014640	GAAGT	2	10	817836	817845	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014640	TCGTG	2	10	819015	819024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014640	CTCAT	2	10	822578	822587	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014640	TTTTG	2	10	824206	824215	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014640	GCGCC	2	10	824335	824344	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_014640	GGCTT	2	10	824451	824460	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014640	CAGGG	2	10	829440	829449	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014640	CGGGC	2	10	845963	845972	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014640	TTGCA	2	10	887913	887922	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014640	CATCA	2	10	897117	897126	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014640	TCCCG	2	10	919418	919427	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_014640	ACTGA	2	10	930521	930530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014640	GGCGG	2	10	945910	945919	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014640	CCAGG	2	10	1005271	1005280	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014640	GGCGG	2	10	1030156	1030165	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014640	CGGCC	2	10	1040847	1040856	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_014640	CGTCA	2	10	1040890	1040899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014640	GCCAG	2	10	1047454	1047463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014640	ACGGC	2	10	1048054	1048063	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014640	CCGGC	2	10	1059423	1059432	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_014640	TGCCT	2	10	1062718	1062727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014640	GCCGG	2	10	1089930	1089939	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014640	CGGCG	2	10	1092841	1092850	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014640	AGTGC	2	10	1094296	1094305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014640	GTTGC	2	10	1100325	1100334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014640	CAGAG	2	10	1101139	1101148	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014640	GCGCC	2	10	1102312	1102321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_014640	GCATG	2	10	1116732	1116741	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014640	GAGAC	2	10	1127778	1127787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014640	CCATC	2	10	1136672	1136681	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_014640	CGTCC	2	10	1138927	1138936	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_014640	CACCG	2	10	1141773	1141782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_014640	CGCAT	2	10	1141980	1141989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014640	GGTGC	2	10	1144857	1144866	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014640	CGCTG	2	10	1178134	1178143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014640	TGGCC	2	10	1178983	1178992	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014640	TGAAT	2	10	1197654	1197663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014640	CGCGC	2	10	1208650	1208659	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014640	CGCGG	2	10	1211169	1211178	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014640	CCCGG	2	10	1230894	1230903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014640	TGGCA	2	10	1244357	1244366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014640	GCAAG	2	10	1252752	1252761	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014640	GTCTG	2	10	1277658	1277667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014640	CGGCG	2	10	1283292	1283301	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014640	GCATG	2	10	1304834	1304843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014640	GTGGC	2	10	1309113	1309122	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014640	GAAAG	2	10	1309224	1309233	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014640	GCTCC	2	10	1312663	1312672	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_014640	CAAAA	2	10	1313522	1313531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014640	GCGGG	2	10	1314121	1314130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014640	AGACA	2	10	1330757	1330766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014640	TTCCG	2	10	1333531	1333540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014640	CGGCG	2	10	1339005	1339014	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014640	CCCAA	2	10	1339272	1339281	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_014640	CGGGC	2	10	1341568	1341577	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014640	GAGGG	2	10	1347828	1347837	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014640	GCCCA	2	10	1372859	1372868	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_014640	GAACA	2	10	1386702	1386711	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014640	GGAGG	2	10	1430941	1430950	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014640	GGGCG	2	10	1455473	1455482	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014640	TCCTT	2	10	1485213	1485222	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014640	CATTG	2	10	1501005	1501014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014640	CGGGC	2	10	1568096	1568105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014640	CCGGC	2	10	1586727	1586736	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_014640	ATGCA	2	10	1605753	1605762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014640	GGGGC	2	10	1607167	1607176	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014640	ACCCA	2	10	1611307	1611316	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_014640	CGGGC	2	10	1615500	1615509	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014640	GGCGT	2	10	1639458	1639467	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014640	GGCGC	2	10	1668389	1668398	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014640	ATACA	2	10	1679316	1679325	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014640	ATCCC	2	10	1703071	1703080	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
151	NC_014640	GCGCC	2	10	1706015	1706024	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_014640	CCACG	2	10	1709637	1709646	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_014640	GGAAA	2	10	1735264	1735273	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014640	GGCTG	2	10	1744564	1744573	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014640	CGCGC	2	10	1749571	1749580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_014640	GATTT	2	10	1749595	1749604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014640	CCCGG	2	10	1750896	1750905	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_014640	GGGCG	2	10	1750962	1750971	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014640	GGCGG	2	10	1762728	1762737	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
160	NC_014640	CAGGG	2	10	1762751	1762760	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
161	NC_014640	GCGCG	2	10	1819248	1819257	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
162	NC_014640	GGCGC	2	10	1821016	1821025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_014640	CCCGG	2	10	1823859	1823868	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
164	NC_014640	CGGCC	2	10	1849224	1849233	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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167	NC_014640	CGGGC	2	10	1886681	1886690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_014640	GGGCG	2	10	1892750	1892759	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_014640	GCGGG	2	10	1987658	1987667	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_014640	CATTT	2	10	2028640	2028649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_014640	CCCAT	2	10	2028817	2028826	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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191	NC_014640	CGCCA	2	10	2079098	2079107	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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193	NC_014640	GCCAA	2	10	2105912	2105921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_014640	GGCTG	2	10	2133178	2133187	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
196	NC_014640	GGCCC	2	10	2147497	2147506	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
197	NC_014640	AATCG	2	10	2152224	2152233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_014640	GGCAT	2	10	2170369	2170378	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_014640	GCGGT	2	10	2199908	2199917	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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206	NC_014640	GTTTT	2	10	2211714	2211723	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_014640	CGGCG	2	10	2608559	2608568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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250	NC_014640	AAGAG	2	10	2857062	2857071	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_014640	GCAAA	2	10	2920123	2920132	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_014640	TGCGA	2	10	2945808	2945817	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_014640	TCTGG	2	10	2977030	2977039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
258	NC_014640	GCGAT	2	10	2982460	2982469	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_014640	TAGGC	2	10	3001656	3001665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_014640	TTACT	2	10	3010278	3010287	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_014640	CGGCA	2	10	3028466	3028475	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_014640	AGCAT	2	10	3037282	3037291	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014640	GGCGG	2	10	3052096	3052105	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_014640	GTTTC	2	10	3149058	3149067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_014640	CGGGC	2	10	3194199	3194208	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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275	NC_014640	TGGCC	2	10	3209014	3209023	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_014640	GGGCA	2	10	3302795	3302804	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_014640	CAATC	2	10	3340822	3340831	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_014640	CAGGT	2	10	3351215	3351224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
281	NC_014640	CCCGG	2	10	3365669	3365678	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
282	NC_014640	GGACG	2	10	3378824	3378833	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_014640	TTTTA	2	10	3401450	3401459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_014640	TGGAC	2	10	4712790	4712799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
421	NC_014640	GCGCG	2	10	4724365	4724374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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423	NC_014640	TTTTC	2	10	4729098	4729107	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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456	NC_014640	CCTCG	2	10	5152921	5152930	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
457	NC_014640	CAAAA	2	10	5156245	5156254	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_014640	CGGCT	2	10	5407662	5407671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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486	NC_014640	CGGCG	2	10	5474331	5474340	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
487	NC_014640	ATCAG	2	10	5486125	5486134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
488	NC_014640	CGGGC	2	10	5493129	5493138	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_014640	GCCCC	2	10	5607592	5607601	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

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