MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans A8 chromosome

Total Repeats: 5546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014640	GCGCC	2	10	6955911	6955920	0 %	0 %	40 %	60 %	311109632
5502	NC_014640	GGCGC	2	10	6957014	6957023	0 %	0 %	60 %	40 %	311109633
5503	NC_014640	CCGAT	2	10	6959679	6959688	20 %	20 %	20 %	40 %	311109635
5504	NC_014640	TTGCG	2	10	6959881	6959890	0 %	40 %	40 %	20 %	311109635
5505	NC_014640	CATGC	2	10	6959893	6959902	20 %	20 %	20 %	40 %	311109635
5506	NC_014640	CGCGG	2	10	6960355	6960364	0 %	0 %	60 %	40 %	311109635
5507	NC_014640	ACGCG	2	10	6964816	6964825	20 %	0 %	40 %	40 %	311109639
5508	NC_014640	ATGGA	2	10	6964922	6964931	40 %	20 %	40 %	0 %	311109639
5509	NC_014640	CCAGG	2	10	6967623	6967632	20 %	0 %	40 %	40 %	311109642
5510	NC_014640	GCGCG	2	10	6968897	6968906	0 %	0 %	60 %	40 %	311109642
5511	NC_014640	GCCGC	2	10	6971391	6971400	0 %	0 %	40 %	60 %	311109644
5512	NC_014640	ACGTA	2	10	6971803	6971812	40 %	20 %	20 %	20 %	311109644
5513	NC_014640	CGCGG	2	10	6972127	6972136	0 %	0 %	60 %	40 %	311109645
5514	NC_014640	GGCGA	2	10	6972392	6972401	20 %	0 %	60 %	20 %	311109645
5515	NC_014640	TTTTC	2	10	6975856	6975865	0 %	80 %	0 %	20 %	311109649
5516	NC_014640	CCCGA	2	10	6975936	6975945	20 %	0 %	20 %	60 %	311109649
5517	NC_014640	TTGCC	2	10	6976623	6976632	0 %	40 %	20 %	40 %	311109650
5518	NC_014640	CACGC	2	10	6976864	6976873	20 %	0 %	20 %	60 %	311109650
5519	NC_014640	CGGCG	2	10	6981293	6981302	0 %	0 %	60 %	40 %	311109652
5520	NC_014640	CGCGG	2	10	6981384	6981393	0 %	0 %	60 %	40 %	311109652
5521	NC_014640	GATCC	2	10	6982259	6982268	20 %	20 %	20 %	40 %	311109653
5522	NC_014640	TGCCG	2	10	6982652	6982661	0 %	20 %	40 %	40 %	311109653
5523	NC_014640	TCAGC	2	10	6983009	6983018	20 %	20 %	20 %	40 %	311109653
5524	NC_014640	GGCGC	2	10	6983793	6983802	0 %	0 %	60 %	40 %	311109654
5525	NC_014640	AGCGA	2	10	6984067	6984076	40 %	0 %	40 %	20 %	311109654
5526	NC_014640	CGCCA	2	10	6985032	6985041	20 %	0 %	20 %	60 %	311109654
5527	NC_014640	AAAAG	2	10	6985234	6985243	80 %	0 %	20 %	0 %	311109655
5528	NC_014640	AGGTC	2	10	6986570	6986579	20 %	20 %	40 %	20 %	311109656
5529	NC_014640	GCCTG	2	10	6987098	6987107	0 %	20 %	40 %	40 %	311109657
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5531	NC_014640	GCGCG	2	10	6989784	6989793	0 %	0 %	60 %	40 %	311109659
5532	NC_014640	CGCAT	2	10	6990755	6990764	20 %	20 %	20 %	40 %	311109659
5533	NC_014640	TGCGC	2	10	6992557	6992566	0 %	20 %	40 %	40 %	311109663
5534	NC_014640	CGCGC	2	10	6993175	6993184	0 %	0 %	40 %	60 %	311109664
5535	NC_014640	GGCGC	2	10	6993895	6993904	0 %	0 %	60 %	40 %	311109664
5536	NC_014640	GGCCG	2	10	6993985	6993994	0 %	0 %	60 %	40 %	311109664
5537	NC_014640	CCGGC	2	10	6994872	6994881	0 %	0 %	40 %	60 %	311109665
5538	NC_014640	TCGTG	2	10	6994950	6994959	0 %	40 %	40 %	20 %	311109665
5539	NC_014640	CTGGG	2	10	6996429	6996438	0 %	20 %	60 %	20 %	311109666
5540	NC_014640	GCGCA	2	10	6998121	6998130	20 %	0 %	40 %	40 %	311109668
5541	NC_014640	TCGCG	2	10	6998562	6998571	0 %	20 %	40 %	40 %	311109668
5542	NC_014640	CATGC	2	10	6999792	6999801	20 %	20 %	20 %	40 %	311109669
5543	NC_014640	GGCCA	2	10	7001935	7001944	20 %	0 %	40 %	40 %	311109672
5544	NC_014640	ATCGC	2	10	7006040	7006049	20 %	20 %	20 %	40 %	311109676
5545	NC_014640	CCCTG	2	10	7007573	7007582	0 %	20 %	20 %	60 %	311109678
5546	NC_014640	CGGTG	2	10	7011887	7011896	0 %	20 %	60 %	20 %	311109681

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.