MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus atrophaeus 1942 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014639	TATTTT	2	12	24011	24022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014639	TATGGA	2	12	56584	56595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014639	TTTTTA	2	12	59291	59302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014639	AATCTA	2	12	66602	66613	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014639	TTTGTT	2	12	88037	88048	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014639	AACAAA	2	12	112556	112567	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014639	TAAAAA	2	12	117722	117733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014639	AAAAAC	2	12	135783	135794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014639	ATCATG	2	12	198979	198990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014639	GAAAAC	2	12	207187	207198	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014639	TTTGCC	2	12	209690	209701	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014639	TCAAAG	2	12	246893	246904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014639	GTTTAC	2	12	274140	274151	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014639	ATGTAA	2	12	279669	279680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014639	TAACAA	2	12	296450	296461	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014639	TACTTT	2	12	315950	315961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014639	AAATTT	2	12	343472	343483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014639	ATAAAT	2	12	433683	433694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014639	CAGGTT	2	12	503984	503995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014639	TCTAAA	2	12	516312	516323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014639	GGAGAT	2	12	516422	516433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014639	GAAATA	2	12	527718	527729	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014639	TTTTGT	2	12	599797	599808	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014639	GATTGC	2	12	676998	677009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014639	ACAAAA	2	12	682190	682201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014639	AGGGGC	2	12	731389	731400	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014639	CCATAT	2	12	741563	741574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014639	AAAACG	2	12	754192	754203	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014639	AAAAGT	2	12	761606	761617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014639	GTTAAC	2	12	761729	761740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014639	TTTTTA	2	12	872762	872773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014639	ATAATT	2	12	909224	909235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014639	ATCATT	2	12	939092	939103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014639	ATCATT	2	12	943226	943237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014639	GTGCGA	2	12	974868	974879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014639	AATTTT	2	12	997394	997405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014639	AAACTC	2	12	1010632	1010643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014639	GTAAAA	2	12	1035657	1035668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014639	TAAATT	2	12	1207644	1207655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014639	AAAAAT	2	12	1228969	1228980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014639	ACATAT	2	12	1239915	1239926	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014639	GTTTTA	2	12	1346993	1347004	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014639	CTTTTT	2	12	1350979	1350990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014639	ATTGAA	2	12	1364485	1364496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014639	AATTAT	2	12	1367283	1367294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014639	AATAAA	2	12	1368903	1368914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014639	TCGAAA	2	12	1371608	1371619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014639	TTTTGT	2	12	1395886	1395897	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014639	TGATCT	2	12	1416973	1416984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014639	ATGACA	2	12	1423768	1423779	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014639	GATTTT	2	12	1434278	1434289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014639	GGAATT	2	12	1437441	1437452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014639	ACAAAA	2	12	1488161	1488172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014639	CTTTTT	2	12	1493162	1493173	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014639	GATTAG	2	12	1553457	1553468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014639	TATAAA	2	12	1559812	1559823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014639	GTCCAA	2	12	1565677	1565688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014639	TTTAAA	2	12	1576592	1576603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014639	GACTAA	2	12	1588664	1588675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014639	TCCCTC	2	12	1603912	1603923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014639	TTTTTA	2	12	1605774	1605785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014639	AATGAT	2	12	1608677	1608688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014639	GTGTGA	2	12	1609269	1609280	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014639	AGGTTA	2	12	1636142	1636153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014639	ACAAAA	2	12	1636793	1636804	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014639	ATGTAT	2	12	1656701	1656712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014639	CTTTTA	2	12	1661863	1661874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014639	ATCTTA	2	12	1707547	1707558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014639	TAACAA	2	12	1741609	1741620	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014639	TGTCCC	2	12	1745909	1745920	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014639	AAAAAG	2	12	1759471	1759482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014639	TTATGT	2	12	1765710	1765721	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014639	GAAAAT	2	12	1779544	1779555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014639	CAATTA	2	12	1805617	1805628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014639	TAAAAT	2	12	1904234	1904245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014639	GTCTGT	2	12	1910363	1910374	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014639	GCCTTA	2	12	1910612	1910623	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014639	GAATGG	2	12	1987587	1987598	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014639	TTCATT	2	12	2039652	2039663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014639	TGAAAA	2	12	2065612	2065623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014639	CCTTTA	2	12	2092503	2092514	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014639	AAATCA	2	12	2109237	2109248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014639	AATTCT	2	12	2120324	2120335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014639	TGACTT	2	12	2146503	2146514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014639	GAGAAA	2	12	2153313	2153324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014639	TCTCCC	2	12	2165978	2165989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014639	AATAAA	2	12	2176099	2176110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014639	ATATGA	2	12	2177137	2177148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014639	TGAAGA	2	12	2177173	2177184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014639	TTATTC	2	12	2184001	2184012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014639	ATATTT	2	12	2187578	2187589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014639	TCTGCT	2	12	2195239	2195250	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014639	TTTTGA	2	12	2198796	2198807	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014639	TCATTT	2	12	2236458	2236469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014639	TGCTTT	2	12	2256951	2256962	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014639	CTTTTT	2	12	2256993	2257004	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014639	AAAAGT	2	12	2324550	2324561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014639	TGTTTT	2	12	2327055	2327066	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014639	CCCTCT	2	12	2335193	2335204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014639	CTCTTT	2	12	2387010	2387021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014639	TTTCAT	2	12	2441746	2441757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014639	ATTTTC	2	12	2468804	2468815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014639	CTTATC	2	12	2477739	2477750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014639	CATTAT	2	12	2487289	2487300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014639	AAGTAA	3	18	2507972	2507989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014639	AAAAGA	2	12	2519589	2519600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014639	CTAAAA	2	12	2531648	2531659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014639	AGGCTG	2	12	2574253	2574264	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014639	TTGTTT	2	12	2632314	2632325	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014639	ATTTTT	2	12	2635377	2635388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014639	AAATAA	2	12	2661134	2661145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014639	GAAAAG	2	12	2696802	2696813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014639	TGATAA	2	12	2717680	2717691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014639	ATAAAT	2	12	2753338	2753349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014639	TTCCCA	2	12	2755352	2755363	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014639	TTTAGG	2	12	2775137	2775148	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014639	TTCCAT	2	12	2784616	2784627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014639	ATGAAA	2	12	2881432	2881443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014639	CTTTTT	2	12	2920500	2920511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014639	CATTAT	2	12	2962247	2962258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014639	TTCTTT	2	12	2996438	2996449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014639	TTTCAT	2	12	3025891	3025902	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014639	ATAGGA	2	12	3039961	3039972	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014639	TTTTCG	2	12	3044801	3044812	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014639	GTATAT	2	12	3049466	3049477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014639	TGCCAT	2	12	3176356	3176367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014639	CCTTTT	2	12	3183598	3183609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014639	TTTTTG	2	12	3197235	3197246	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014639	GCAAGA	2	12	3229504	3229515	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014639	ATTTTT	2	12	3245339	3245350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014639	AAAAAG	2	12	3267788	3267799	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014639	TTTATT	2	12	3268563	3268574	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.