MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus atrophaeus 1942 chromosome

Total Repeats: 3288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014639	ATGTG	2	10	142	151	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014639	ATGAA	2	10	520	529	60 %	20 %	20 %	0 %	311066970
3	NC_014639	TATAT	2	10	880	889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014639	ATGAA	2	10	2116	2125	60 %	20 %	20 %	0 %	311066971
5	NC_014639	AAAGA	2	10	5899	5908	80 %	0 %	20 %	0 %	311066978
6	NC_014639	CCTAT	2	10	6360	6369	20 %	40 %	0 %	40 %	311066978
7	NC_014639	TTATT	2	10	6684	6693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014639	ATTGC	2	10	6820	6829	20 %	40 %	20 %	20 %	311066979
9	NC_014639	CTTCC	2	10	10094	10103	0 %	40 %	0 %	60 %	311066985
10	NC_014639	GGTTG	2	10	10571	10580	0 %	40 %	60 %	0 %	311066985
11	NC_014639	GATTA	2	10	12134	12143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014639	TCTGT	2	10	12570	12579	0 %	60 %	20 %	20 %	311066987
13	NC_014639	CAGCT	2	10	14284	14293	20 %	20 %	20 %	40 %	311066987
14	NC_014639	AAAAG	2	10	17627	17636	80 %	0 %	20 %	0 %	311066992
15	NC_014639	ATTTT	2	10	18212	18221	20 %	80 %	0 %	0 %	311066992
16	NC_014639	ATTCA	2	10	18311	18320	40 %	40 %	0 %	20 %	311066992
17	NC_014639	ACTAT	2	10	20601	20610	40 %	40 %	0 %	20 %	311066994
18	NC_014639	TTAAA	2	10	20836	20845	60 %	40 %	0 %	0 %	311066994
19	NC_014639	AATAA	2	10	20936	20945	80 %	20 %	0 %	0 %	311066994
20	NC_014639	GATTC	2	10	22336	22345	20 %	40 %	20 %	20 %	311066996
21	NC_014639	AATAC	2	10	24482	24491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014639	AAAGG	2	10	25127	25136	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014639	ATTTT	2	10	28652	28661	20 %	80 %	0 %	0 %	311067003
24	NC_014639	TATCT	2	10	28930	28939	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014639	GAACG	2	10	31436	31445	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014639	TAGCA	2	10	31956	31965	40 %	20 %	20 %	20 %	311067008
27	NC_014639	TTTCT	2	10	32990	32999	0 %	80 %	0 %	20 %	311067010
28	NC_014639	CTAAA	2	10	34374	34383	60 %	20 %	0 %	20 %	311067011
29	NC_014639	CTAAA	2	10	37146	37155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014639	TGAAG	2	10	41272	41281	40 %	20 %	40 %	0 %	311067015
31	NC_014639	TCATT	2	10	44418	44427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014639	TTTTG	2	10	44442	44451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014639	TAAAA	2	10	47664	47673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014639	ATTCG	2	10	49518	49527	20 %	40 %	20 %	20 %	311067024
35	NC_014639	TTTTA	3	15	51165	51179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014639	GCTCA	2	10	51429	51438	20 %	20 %	20 %	40 %	311067025
37	NC_014639	AAAAG	2	10	51750	51759	80 %	0 %	20 %	0 %	311067025
38	NC_014639	TGATT	2	10	51776	51785	20 %	60 %	20 %	0 %	311067025
39	NC_014639	GGAGA	2	10	53512	53521	40 %	0 %	60 %	0 %	311067026
40	NC_014639	CCATT	2	10	54518	54527	20 %	40 %	0 %	40 %	311067026
41	NC_014639	AAAGA	2	10	55353	55362	80 %	0 %	20 %	0 %	311067027
42	NC_014639	GTATC	2	10	56245	56254	20 %	40 %	20 %	20 %	311067027
43	NC_014639	TAAAA	2	10	56262	56271	80 %	20 %	0 %	0 %	311067027
44	NC_014639	CAGCA	2	10	57483	57492	40 %	0 %	20 %	40 %	311067028
45	NC_014639	GTCTT	2	10	60946	60955	0 %	60 %	20 %	20 %	311067031
46	NC_014639	AGGAT	2	10	61354	61363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014639	TGAAC	2	10	62046	62055	40 %	20 %	20 %	20 %	311067033
48	NC_014639	TTCGT	2	10	62347	62356	0 %	60 %	20 %	20 %	311067034
49	NC_014639	CAAAT	2	10	62861	62870	60 %	20 %	0 %	20 %	311067034
50	NC_014639	GCTTT	2	10	63217	63226	0 %	60 %	20 %	20 %	311067034
51	NC_014639	CTTCA	2	10	63917	63926	20 %	40 %	0 %	40 %	311067034
52	NC_014639	TTTTC	2	10	64351	64360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014639	GAAAT	2	10	66109	66118	60 %	20 %	20 %	0 %	311067037
54	NC_014639	TGCTT	2	10	66454	66463	0 %	60 %	20 %	20 %	311067038
55	NC_014639	AATGG	2	10	66503	66512	40 %	20 %	40 %	0 %	311067038
56	NC_014639	ACTCT	2	10	67667	67676	20 %	40 %	0 %	40 %	311067039
57	NC_014639	TGATA	2	10	68578	68587	40 %	40 %	20 %	0 %	311067041
58	NC_014639	TATTC	2	10	69354	69363	20 %	60 %	0 %	20 %	311067041
59	NC_014639	AACGA	2	10	69688	69697	60 %	0 %	20 %	20 %	311067041
60	NC_014639	ATTAA	2	10	71369	71378	60 %	40 %	0 %	0 %	311067042
61	NC_014639	ATGAA	2	10	71641	71650	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014639	CTTAC	2	10	72712	72721	20 %	40 %	0 %	40 %	311067043
63	NC_014639	ATCAA	2	10	72748	72757	60 %	20 %	0 %	20 %	311067043
64	NC_014639	TTTTC	2	10	78882	78891	0 %	80 %	0 %	20 %	311067047
65	NC_014639	TTTCA	2	10	80034	80043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014639	TTATT	2	10	81434	81443	20 %	80 %	0 %	0 %	311067049
67	NC_014639	AAAAT	2	10	81605	81614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014639	ATTCA	2	10	81855	81864	40 %	40 %	0 %	20 %	311067050
69	NC_014639	GAAAG	2	10	82834	82843	60 %	0 %	40 %	0 %	311067051
70	NC_014639	AAGAA	2	10	84153	84162	80 %	0 %	20 %	0 %	311067051
71	NC_014639	TCAAT	2	10	93796	93805	40 %	40 %	0 %	20 %	311067061
72	NC_014639	TATCA	2	10	94236	94245	40 %	40 %	0 %	20 %	311067061
73	NC_014639	ATATT	2	10	94985	94994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014639	AAATA	2	10	95196	95205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014639	TCGTG	2	10	96835	96844	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014639	GGACG	2	10	97542	97551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014639	AAACG	2	10	100811	100820	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014639	GTGAT	2	10	103118	103127	20 %	40 %	40 %	0 %	311067065
79	NC_014639	TTTTA	2	10	104623	104632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014639	GCTTT	2	10	105799	105808	0 %	60 %	20 %	20 %	311067067
81	NC_014639	GTCTT	2	10	106254	106263	0 %	60 %	20 %	20 %	311067067
82	NC_014639	AAAGG	2	10	108061	108070	60 %	0 %	40 %	0 %	311067069
83	NC_014639	AAAAG	2	10	110320	110329	80 %	0 %	20 %	0 %	311067074
84	NC_014639	AACTC	2	10	111757	111766	40 %	20 %	0 %	40 %	311067075
85	NC_014639	GTATC	2	10	111785	111794	20 %	40 %	20 %	20 %	311067075
86	NC_014639	CGCCT	2	10	112433	112442	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_014639	ATGAG	2	10	113358	113367	40 %	20 %	40 %	0 %	311067076
88	NC_014639	ATCGT	2	10	113879	113888	20 %	40 %	20 %	20 %	311067076
89	NC_014639	AAACA	2	10	114109	114118	80 %	0 %	0 %	20 %	311067076
90	NC_014639	TCTTT	2	10	115080	115089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014639	AAAGA	2	10	115627	115636	80 %	0 %	20 %	0 %	311067078
92	NC_014639	TCAAC	2	10	118580	118589	40 %	20 %	0 %	40 %	311067080
93	NC_014639	ATTCG	2	10	119117	119126	20 %	40 %	20 %	20 %	311067080
94	NC_014639	TCTGT	2	10	120428	120437	0 %	60 %	20 %	20 %	311067080
95	NC_014639	CACAA	2	10	121187	121196	60 %	0 %	0 %	40 %	311067081
96	NC_014639	CGGAT	2	10	121279	121288	20 %	20 %	40 %	20 %	311067081
97	NC_014639	GAATT	2	10	122061	122070	40 %	40 %	20 %	0 %	311067081
98	NC_014639	GGAAG	2	10	124343	124352	40 %	0 %	60 %	0 %	311067083
99	NC_014639	TTTAT	2	10	125952	125961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014639	CTGAT	2	10	127491	127500	20 %	40 %	20 %	20 %	311067086
101	NC_014639	TCCAA	2	10	128344	128353	40 %	20 %	0 %	40 %	311067087
102	NC_014639	AAACT	2	10	129035	129044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014639	TTATT	2	10	129205	129214	20 %	80 %	0 %	0 %	311067088
104	NC_014639	CTCTT	2	10	130035	130044	0 %	60 %	0 %	40 %	311067088
105	NC_014639	GGAAA	2	10	131252	131261	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014639	CTTTT	2	10	131751	131760	0 %	80 %	0 %	20 %	311067091
107	NC_014639	TATAA	2	10	132827	132836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014639	GATAC	2	10	133209	133218	40 %	20 %	20 %	20 %	311067093
109	NC_014639	GTTTT	2	10	133394	133403	0 %	80 %	20 %	0 %	311067093
110	NC_014639	GGAAG	2	10	134800	134809	40 %	0 %	60 %	0 %	311067094
111	NC_014639	AAATA	2	10	136197	136206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014639	TTTTA	2	10	136288	136297	20 %	80 %	0 %	0 %	311067095
113	NC_014639	ATTTG	2	10	137132	137141	20 %	60 %	20 %	0 %	311067096
114	NC_014639	GCAAG	2	10	139626	139635	40 %	0 %	40 %	20 %	311067099
115	NC_014639	ATGGT	2	10	141630	141639	20 %	40 %	40 %	0 %	311067100
116	NC_014639	AAAAG	2	10	142758	142767	80 %	0 %	20 %	0 %	311067101
117	NC_014639	AAATT	2	10	143438	143447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014639	AGAGT	2	10	143656	143665	40 %	20 %	40 %	0 %	311067102
119	NC_014639	GAAAA	2	10	144714	144723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014639	CAATA	2	10	145366	145375	60 %	20 %	0 %	20 %	311067103
121	NC_014639	TCTGA	2	10	145723	145732	20 %	40 %	20 %	20 %	311067103
122	NC_014639	TTTTA	2	10	147125	147134	20 %	80 %	0 %	0 %	311067105
123	NC_014639	TGCAA	2	10	147189	147198	40 %	20 %	20 %	20 %	311067105
124	NC_014639	TGAAG	2	10	147501	147510	40 %	20 %	40 %	0 %	311067105
125	NC_014639	ATTTT	2	10	148660	148669	20 %	80 %	0 %	0 %	311067106
126	NC_014639	GGCAA	2	10	149057	149066	40 %	0 %	40 %	20 %	311067106
127	NC_014639	CAAAG	2	10	149559	149568	60 %	0 %	20 %	20 %	311067106
128	NC_014639	GAAAA	2	10	150240	150249	80 %	0 %	20 %	0 %	311067106
129	NC_014639	CGTGT	2	10	152096	152105	0 %	40 %	40 %	20 %	311067107
130	NC_014639	AAACA	2	10	153809	153818	80 %	0 %	0 %	20 %	311067109
131	NC_014639	TTTCA	2	10	154961	154970	20 %	60 %	0 %	20 %	311067110
132	NC_014639	AAAGG	2	10	155868	155877	60 %	0 %	40 %	0 %	311067110
133	NC_014639	TAAAA	2	10	155941	155950	80 %	20 %	0 %	0 %	311067110
134	NC_014639	TGACT	2	10	156078	156087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014639	AGAAA	2	10	156188	156197	80 %	0 %	20 %	0 %	311067111
136	NC_014639	GCTCG	2	10	156328	156337	0 %	20 %	40 %	40 %	311067111
137	NC_014639	TGCAA	2	10	158496	158505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014639	GCACT	2	10	159287	159296	20 %	20 %	20 %	40 %	311067116
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140	NC_014639	CTCAT	2	10	165810	165819	20 %	40 %	0 %	40 %	311067122
141	NC_014639	GGAGC	2	10	167204	167213	20 %	0 %	60 %	20 %	311067123
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147	NC_014639	AATCT	2	10	173509	173518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014639	AAATG	2	10	174487	174496	60 %	20 %	20 %	0 %	311067130
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177	NC_014639	AAAAG	2	10	209874	209883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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