MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus atrophaeus 1942 chromosome

Total Repeats: 574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014639	ATGTG	2	10	142	151	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014639	TATAT	2	10	880	889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014639	TTATT	2	10	6684	6693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014639	GATTA	2	10	12134	12143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014639	AATAC	2	10	24482	24491	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014639	AAAGG	2	10	25127	25136	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014639	TATCT	2	10	28930	28939	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014639	GAACG	2	10	31436	31445	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014639	CTAAA	2	10	37146	37155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014639	TCATT	2	10	44418	44427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014639	TTTTG	2	10	44442	44451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014639	TAAAA	2	10	47664	47673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014639	TTTTA	3	15	51165	51179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014639	AGGAT	2	10	61354	61363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014639	TTTTC	2	10	64351	64360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014639	ATGAA	2	10	71641	71650	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014639	TTTCA	2	10	80034	80043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014639	AAAAT	2	10	81605	81614	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014639	ATATT	2	10	94985	94994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014639	AAATA	2	10	95196	95205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014639	TCGTG	2	10	96835	96844	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014639	GGACG	2	10	97542	97551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014639	AAACG	2	10	100811	100820	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014639	TTTTA	2	10	104623	104632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014639	CGCCT	2	10	112433	112442	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_014639	TCTTT	2	10	115080	115089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014639	TTTAT	2	10	125952	125961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014639	AAACT	2	10	129035	129044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014639	GGAAA	2	10	131252	131261	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014639	TATAA	2	10	132827	132836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014639	AAATA	2	10	136197	136206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014639	AAATT	2	10	143438	143447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014639	GAAAA	2	10	144714	144723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014639	TGACT	2	10	156078	156087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014639	TGCAA	2	10	158496	158505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014639	TTTTA	2	10	171840	171849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014639	AATCT	2	10	173509	173518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014639	TTATG	2	10	184870	184879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014639	ATATA	2	10	199124	199133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014639	TTATT	2	10	200356	200365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014639	CAAAG	2	10	207011	207020	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014639	TGATA	2	10	209839	209848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014639	AAAAG	2	10	209874	209883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014639	TAAAA	2	10	222892	222901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014639	ATGGG	2	10	249960	249969	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014639	GAATT	2	10	268458	268467	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014639	GAAAA	2	10	278333	278342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014639	TAAAA	2	10	289589	289598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014639	GCAAA	2	10	299933	299942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014639	ACTGT	2	10	304970	304979	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014639	GATTT	2	10	343864	343873	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014639	TTTTC	2	10	345010	345019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014639	AAAAT	2	10	345270	345279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014639	CAAAA	2	10	345812	345821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014639	AAATA	2	10	345939	345948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014639	TTTTA	2	10	356505	356514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014639	ATGTA	2	10	356680	356689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014639	ATAAA	2	10	363234	363243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014639	AAGAA	2	10	371119	371128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014639	CAAAG	2	10	383157	383166	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014639	GCCTG	2	10	403188	403197	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014639	TCGTG	2	10	406616	406625	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014639	GGACG	2	10	407322	407331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014639	TTCAA	2	10	418638	418647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014639	GTTTC	2	10	425738	425747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014639	ACAAA	2	10	442834	442843	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014639	ATCTT	4	20	443571	443590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014639	GGTAA	2	10	443748	443757	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014639	GGGGA	2	10	448773	448782	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014639	ATATT	2	10	449093	449102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014639	ATCAT	2	10	459871	459880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014639	GTTTA	2	10	474866	474875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014639	ATGAC	2	10	475001	475010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014639	CATTT	2	10	476941	476950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014639	TGTTT	2	10	476984	476993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014639	TGAAA	2	10	482558	482567	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014639	AAGTC	2	10	482632	482641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014639	ATATT	2	10	484581	484590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014639	GTCAT	2	10	490007	490016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014639	ACTGG	2	10	490292	490301	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014639	AAAAT	2	10	495801	495810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014639	TACAA	2	10	516002	516011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014639	ATAGG	2	10	521877	521886	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014639	AATTT	2	10	527504	527513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014639	AAATT	2	10	543934	543943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014639	TTTAT	2	10	544321	544330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014639	ATTAC	2	10	544643	544652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014639	AATAA	2	10	546436	546445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014639	AATAT	2	10	547925	547934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014639	TTAAG	2	10	549758	549767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014639	ATAAA	2	10	593599	593608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014639	AATAA	2	10	621275	621284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014639	ATTCT	2	10	669940	669949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014639	AGTAG	2	10	669973	669982	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014639	TTCAT	2	10	670005	670014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014639	TAAAA	2	10	670042	670051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014639	CATAG	2	10	670129	670138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014639	TGCTT	2	10	670956	670965	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014639	GTGTC	2	10	677153	677162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014639	AAGGG	2	10	680218	680227	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014639	ATTTT	2	10	680249	680258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014639	GAAGG	2	10	694348	694357	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014639	TGATA	2	10	698720	698729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014639	TCATA	2	10	700407	700416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014639	TGATA	2	10	701863	701872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014639	TTATT	2	10	705514	705523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014639	TATGA	2	10	713108	713117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014639	TTATG	2	10	723376	723385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014639	TATGT	2	10	725224	725233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014639	TTTGC	2	10	725434	725443	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014639	ACCGT	2	10	731441	731450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014639	TATAT	2	10	732404	732413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014639	AGTGA	2	10	732681	732690	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014639	TATAC	2	10	733631	733640	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014639	CAGCT	2	10	734227	734236	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014639	TCTTT	2	10	738582	738591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014639	TTTAT	2	10	743516	743525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014639	TATGA	2	10	755855	755864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014639	TTTTC	2	10	770485	770494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014639	ACGTA	2	10	775771	775780	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014639	ATTTT	2	10	802708	802717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014639	AATTT	2	10	807361	807370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014639	GAAAT	2	10	841730	841739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014639	ATAGA	2	10	846411	846420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014639	ATTAC	2	10	855019	855028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014639	GTGAC	2	10	873083	873092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014639	GAAAA	2	10	873202	873211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014639	AAAGA	2	10	873217	873226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014639	TAATT	2	10	874857	874866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014639	TAAAA	2	10	879408	879417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014639	GACAT	2	10	906226	906235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014639	GATTA	2	10	933345	933354	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014639	AAATT	2	10	936395	936404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014639	CATTT	2	10	937212	937221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014639	ATTAG	2	10	937303	937312	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014639	TTCCT	2	10	948308	948317	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014639	TATAT	2	10	951826	951835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014639	ATGAT	2	10	952465	952474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014639	AAATT	2	10	959880	959889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014639	GGTTA	2	10	967630	967639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014639	TAAAG	2	10	967662	967671	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014639	TTTTA	2	10	970532	970541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014639	GAAAA	2	10	972930	972939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014639	CAGCT	2	10	983866	983875	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014639	TAATA	2	10	991597	991606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014639	AAAAG	2	10	999541	999550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014639	ACAAG	2	10	1027135	1027144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014639	TTTGG	2	10	1044463	1044472	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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