MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 1661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014638	TCGAT	2	10	431	440	20 %	40 %	20 %	20 %	311063460
2	NC_014638	TCCGG	2	10	513	522	0 %	20 %	40 %	40 %	311063460
3	NC_014638	AACGC	2	10	3017	3026	40 %	0 %	20 %	40 %	311063461
4	NC_014638	CGAAT	2	10	3340	3349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014638	ATGAC	2	10	3382	3391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014638	CAAGG	2	10	7346	7355	40 %	0 %	40 %	20 %	311063464
7	NC_014638	GGGCA	2	10	8144	8153	20 %	0 %	60 %	20 %	311063465
8	NC_014638	TTCGG	2	10	8156	8165	0 %	40 %	40 %	20 %	311063465
9	NC_014638	TCGTC	2	10	10883	10892	0 %	40 %	20 %	40 %	311063466
10	NC_014638	ACGCC	2	10	12795	12804	20 %	0 %	20 %	60 %	311063468
11	NC_014638	TTCGA	2	10	14717	14726	20 %	40 %	20 %	20 %	311063469
12	NC_014638	CGCGA	2	10	15401	15410	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014638	TGGCG	2	10	16457	16466	0 %	20 %	60 %	20 %	311063470
14	NC_014638	ACGGC	2	10	17038	17047	20 %	0 %	40 %	40 %	311063471
15	NC_014638	ACGCC	2	10	17581	17590	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014638	AAAGC	2	10	18971	18980	60 %	0 %	20 %	20 %	311063472
17	NC_014638	CAAGG	2	10	20353	20362	40 %	0 %	40 %	20 %	311063473
18	NC_014638	CCGAG	2	10	23926	23935	20 %	0 %	40 %	40 %	311063476
19	NC_014638	CACGG	2	10	24961	24970	20 %	0 %	40 %	40 %	311063477
20	NC_014638	AGCTG	2	10	26009	26018	20 %	20 %	40 %	20 %	311063478
21	NC_014638	GCGGT	2	10	26931	26940	0 %	20 %	60 %	20 %	311063479
22	NC_014638	CGAGC	2	10	28502	28511	20 %	0 %	40 %	40 %	311063480
23	NC_014638	GTGAT	2	10	31150	31159	20 %	40 %	40 %	0 %	311063480
24	NC_014638	CGGGC	2	10	36578	36587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014638	AAGAA	2	10	37007	37016	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014638	AGCGC	2	10	37127	37136	20 %	0 %	40 %	40 %	311063485
27	NC_014638	TCGCG	2	10	40685	40694	0 %	20 %	40 %	40 %	311063488
28	NC_014638	ACGCC	2	10	41613	41622	20 %	0 %	20 %	60 %	311063488
29	NC_014638	CGTTG	2	10	42286	42295	0 %	40 %	40 %	20 %	311063489
30	NC_014638	GTCGG	2	10	44721	44730	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014638	CGAGC	2	10	45504	45513	20 %	0 %	40 %	40 %	311063492
32	NC_014638	AGCGC	2	10	46955	46964	20 %	0 %	40 %	40 %	311063493
33	NC_014638	AGGGC	2	10	49680	49689	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014638	AACGC	2	10	49987	49996	40 %	0 %	20 %	40 %	311063495
35	NC_014638	CAGAT	2	10	51339	51348	40 %	20 %	20 %	20 %	311063495
36	NC_014638	CATCG	2	10	52331	52340	20 %	20 %	20 %	40 %	311063495
37	NC_014638	ATGGC	2	10	55649	55658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014638	ATCAG	2	10	56381	56390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014638	GGTCG	2	10	59019	59028	0 %	20 %	60 %	20 %	311063498
40	NC_014638	GGCGT	2	10	60141	60150	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014638	TCTTG	2	10	66595	66604	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014638	GTGAT	2	10	66722	66731	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014638	GCCCA	2	10	67342	67351	20 %	0 %	20 %	60 %	311063504
44	NC_014638	TTGTT	2	10	68463	68472	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014638	GATCC	2	10	69866	69875	20 %	20 %	20 %	40 %	311063507
46	NC_014638	GCCGT	2	10	70078	70087	0 %	20 %	40 %	40 %	311063507
47	NC_014638	TTTCC	2	10	70712	70721	0 %	60 %	0 %	40 %	311063507
48	NC_014638	GTGAT	2	10	75498	75507	20 %	40 %	40 %	0 %	311063512
49	NC_014638	GTCTT	2	10	77625	77634	0 %	60 %	20 %	20 %	311063513
50	NC_014638	ATGTG	2	10	79196	79205	20 %	40 %	40 %	0 %	311063515
51	NC_014638	AGGAA	2	10	79339	79348	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014638	GGCCT	2	10	79764	79773	0 %	20 %	40 %	40 %	311063516
53	NC_014638	CGCCT	2	10	81008	81017	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_014638	AAGGA	2	10	81079	81088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014638	CGCGA	2	10	81700	81709	20 %	0 %	40 %	40 %	311063518
56	NC_014638	ATGGC	2	10	82101	82110	20 %	20 %	40 %	20 %	311063518
57	NC_014638	GCAGC	2	10	83734	83743	20 %	0 %	40 %	40 %	311063520
58	NC_014638	AACAA	2	10	84216	84225	80 %	0 %	0 %	20 %	311063520
59	NC_014638	ACTGG	2	10	85217	85226	20 %	20 %	40 %	20 %	311063521
60	NC_014638	GAATC	2	10	85883	85892	40 %	20 %	20 %	20 %	311063522
61	NC_014638	GAATC	2	10	86398	86407	40 %	20 %	20 %	20 %	311063522
62	NC_014638	GGGTC	2	10	87340	87349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014638	CGGCC	2	10	88323	88332	0 %	0 %	40 %	60 %	311063524
64	NC_014638	GGCGC	2	10	89309	89318	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014638	GCATG	2	10	93537	93546	20 %	20 %	40 %	20 %	311063530
66	NC_014638	GCCGG	2	10	95852	95861	0 %	0 %	60 %	40 %	311063532
67	NC_014638	GCCGC	2	10	96067	96076	0 %	0 %	40 %	60 %	311063532
68	NC_014638	GATGT	2	10	97509	97518	20 %	40 %	40 %	0 %	311063534
69	NC_014638	TGCGA	2	10	98701	98710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014638	GATGG	2	10	100334	100343	20 %	20 %	60 %	0 %	311063535
71	NC_014638	TCAAT	2	10	102434	102443	40 %	40 %	0 %	20 %	311063537
72	NC_014638	CGCTG	2	10	104045	104054	0 %	20 %	40 %	40 %	311063539
73	NC_014638	GCGCA	2	10	107082	107091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014638	CTTGC	2	10	107389	107398	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014638	ACATG	2	10	109253	109262	40 %	20 %	20 %	20 %	311063543
76	NC_014638	CATGA	2	10	110635	110644	40 %	20 %	20 %	20 %	311063544
77	NC_014638	GTCAT	2	10	111071	111080	20 %	40 %	20 %	20 %	311063544
78	NC_014638	GAGCT	2	10	113356	113365	20 %	20 %	40 %	20 %	311063547
79	NC_014638	ACGAG	2	10	113854	113863	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014638	GTCGC	2	10	114886	114895	0 %	20 %	40 %	40 %	311063549
81	NC_014638	TCACG	2	10	116465	116474	20 %	20 %	20 %	40 %	311063549
82	NC_014638	GACGG	2	10	117667	117676	20 %	0 %	60 %	20 %	311063550
83	NC_014638	TCGTG	2	10	118682	118691	0 %	40 %	40 %	20 %	311063551
84	NC_014638	TTGCG	2	10	119123	119132	0 %	40 %	40 %	20 %	311063551
85	NC_014638	TCGCG	2	10	121494	121503	0 %	20 %	40 %	40 %	311063553
86	NC_014638	GCCGG	2	10	122738	122747	0 %	0 %	60 %	40 %	311063554
87	NC_014638	GGTCA	2	10	123106	123115	20 %	20 %	40 %	20 %	311063555
88	NC_014638	CCCCG	2	10	125993	126002	0 %	0 %	20 %	80 %	311063556
89	NC_014638	CGGCT	2	10	126911	126920	0 %	20 %	40 %	40 %	311063557
90	NC_014638	GCCAC	2	10	129533	129542	20 %	0 %	20 %	60 %	311063558
91	NC_014638	GCTCG	2	10	130200	130209	0 %	20 %	40 %	40 %	311063558
92	NC_014638	GCGCT	2	10	130474	130483	0 %	20 %	40 %	40 %	311063558
93	NC_014638	ACTCG	2	10	130908	130917	20 %	20 %	20 %	40 %	311063558
94	NC_014638	CGATG	2	10	131649	131658	20 %	20 %	40 %	20 %	311063558
95	NC_014638	CGTGC	2	10	132774	132783	0 %	20 %	40 %	40 %	311063559
96	NC_014638	GGTGC	2	10	133346	133355	0 %	20 %	60 %	20 %	311063560
97	NC_014638	GGCGT	2	10	133550	133559	0 %	20 %	60 %	20 %	311063560
98	NC_014638	CGGTG	2	10	133957	133966	0 %	20 %	60 %	20 %	311063560
99	NC_014638	AGCGC	2	10	135608	135617	20 %	0 %	40 %	40 %	311063562
100	NC_014638	AACGC	2	10	135692	135701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014638	ACCGT	2	10	137661	137670	20 %	20 %	20 %	40 %	311063565
102	NC_014638	ACTCT	2	10	141872	141881	20 %	40 %	0 %	40 %	311063567
103	NC_014638	GGACG	2	10	142114	142123	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014638	GCATG	2	10	142699	142708	20 %	20 %	40 %	20 %	311063569
105	NC_014638	GCCGA	2	10	143063	143072	20 %	0 %	40 %	40 %	311063569
106	NC_014638	CTCAC	2	10	144580	144589	20 %	20 %	0 %	60 %	311063571
107	NC_014638	GCCGC	2	10	145853	145862	0 %	0 %	40 %	60 %	311063571
108	NC_014638	CGGGC	2	10	150016	150025	0 %	0 %	60 %	40 %	311063573
109	NC_014638	TCATC	2	10	150146	150155	20 %	40 %	0 %	40 %	311063573
110	NC_014638	GCACC	2	10	151861	151870	20 %	0 %	20 %	60 %	311063574
111	NC_014638	TCATT	2	10	152448	152457	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014638	GGTCT	2	10	152654	152663	0 %	40 %	40 %	20 %	311063575
113	NC_014638	GAACT	2	10	154742	154751	40 %	20 %	20 %	20 %	311063576
114	NC_014638	CAGCA	2	10	155683	155692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014638	TCGCA	2	10	157259	157268	20 %	20 %	20 %	40 %	311063579
116	NC_014638	GCCGC	2	10	157441	157450	0 %	0 %	40 %	60 %	311063579
117	NC_014638	CCTCG	2	10	158201	158210	0 %	20 %	20 %	60 %	311063581
118	NC_014638	CGCTG	2	10	161375	161384	0 %	20 %	40 %	40 %	311063585
119	NC_014638	GCGGT	2	10	162099	162108	0 %	20 %	60 %	20 %	311063585
120	NC_014638	CGGCC	2	10	163023	163032	0 %	0 %	40 %	60 %	311063586
121	NC_014638	GACCA	2	10	163174	163183	40 %	0 %	20 %	40 %	311063586
122	NC_014638	GACTC	2	10	164112	164121	20 %	20 %	20 %	40 %	311063587
123	NC_014638	TTCCA	2	10	164243	164252	20 %	40 %	0 %	40 %	311063587
124	NC_014638	CGATA	2	10	164347	164356	40 %	20 %	20 %	20 %	311063587
125	NC_014638	ACGCG	2	10	166961	166970	20 %	0 %	40 %	40 %	311063590
126	NC_014638	AAGAG	2	10	167049	167058	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014638	TTCGC	2	10	168190	168199	0 %	40 %	20 %	40 %	311063591
128	NC_014638	CATCG	2	10	168249	168258	20 %	20 %	20 %	40 %	311063591
129	NC_014638	CCGGT	2	10	168383	168392	0 %	20 %	40 %	40 %	311063591
130	NC_014638	CGATG	2	10	169939	169948	20 %	20 %	40 %	20 %	311063592
131	NC_014638	CTCCG	2	10	172022	172031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_014638	AAGTC	2	10	172626	172635	40 %	20 %	20 %	20 %	311063594
133	NC_014638	CGCTG	2	10	177451	177460	0 %	20 %	40 %	40 %	311063596
134	NC_014638	CCACA	2	10	179521	179530	40 %	0 %	0 %	60 %	311063597
135	NC_014638	GGGCC	2	10	181066	181075	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014638	CCGCG	2	10	183405	183414	0 %	0 %	40 %	60 %	311063600
137	NC_014638	TGGCA	2	10	183693	183702	20 %	20 %	40 %	20 %	311063600
138	NC_014638	CGATG	2	10	185598	185607	20 %	20 %	40 %	20 %	311063600
139	NC_014638	GCTCG	2	10	185611	185620	0 %	20 %	40 %	40 %	311063600
140	NC_014638	CGGCG	2	10	186667	186676	0 %	0 %	60 %	40 %	311063601
141	NC_014638	GGGGC	2	10	187692	187701	0 %	0 %	80 %	20 %	311063602
142	NC_014638	AGGCG	2	10	189063	189072	20 %	0 %	60 %	20 %	311063605
143	NC_014638	CGCGG	2	10	189137	189146	0 %	0 %	60 %	40 %	311063605
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145	NC_014638	GGCAT	2	10	195168	195177	20 %	20 %	40 %	20 %	311063609
146	NC_014638	CTGAT	2	10	198072	198081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014638	GACGG	2	10	200602	200611	20 %	0 %	60 %	20 %	311063612
148	NC_014638	GTGGA	2	10	202777	202786	20 %	20 %	60 %	0 %	311063615
149	NC_014638	CGTCC	2	10	204924	204933	0 %	20 %	20 %	60 %	311063618
150	NC_014638	CACGG	2	10	205089	205098	20 %	0 %	40 %	40 %	311063618
151	NC_014638	AAAAG	2	10	205865	205874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014638	GGCAT	2	10	208223	208232	20 %	20 %	40 %	20 %	311063620
153	NC_014638	TTGTC	2	10	210259	210268	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_014638	ACCCG	2	10	213396	213405	20 %	0 %	20 %	60 %	311063623
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161	NC_014638	CCGAT	2	10	218371	218380	20 %	20 %	20 %	40 %	311063625
162	NC_014638	CGGCG	2	10	220898	220907	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_014638	TTGTC	2	10	221319	221328	0 %	60 %	20 %	20 %	311063628
164	NC_014638	CGGCG	2	10	223818	223827	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_014638	CCGAT	2	10	227674	227683	20 %	20 %	20 %	40 %	311063632
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172	NC_014638	CGAAG	2	10	242726	242735	40 %	0 %	40 %	20 %	311063639
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179	NC_014638	TCGCA	2	10	249082	249091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_014638	CGCTG	2	10	262535	262544	0 %	20 %	40 %	40 %	311063653
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251	NC_014638	AAGCC	2	10	340062	340071	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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253	NC_014638	CGTCG	2	10	340928	340937	0 %	20 %	40 %	40 %	311063713
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264	NC_014638	AAACA	2	10	351292	351301	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014638	TGCGC	2	10	352913	352922	0 %	20 %	40 %	40 %	311063720
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267	NC_014638	CGATC	2	10	356269	356278	20 %	20 %	20 %	40 %	311063723
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270	NC_014638	CGAGC	2	10	358607	358616	20 %	0 %	40 %	40 %	311063724
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