MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 5241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014638	CGTT	2	8	581	588	0 %	50 %	25 %	25 %	311063460
2	NC_014638	CGCA	2	8	609	616	25 %	0 %	25 %	50 %	311063460
3	NC_014638	CCGA	2	8	1300	1307	25 %	0 %	25 %	50 %	311063460
4	NC_014638	ACAT	2	8	1746	1753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014638	CTGC	2	8	2431	2438	0 %	25 %	25 %	50 %	311063461
6	NC_014638	ACCT	2	8	2446	2453	25 %	25 %	0 %	50 %	311063461
7	NC_014638	CGAC	2	8	2456	2463	25 %	0 %	25 %	50 %	311063461
8	NC_014638	CGAC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	25 %	50 %	311063461
9	NC_014638	GGCG	2	8	3858	3865	0 %	0 %	75 %	25 %	311063462
10	NC_014638	CACG	2	8	3945	3952	25 %	0 %	25 %	50 %	311063462
11	NC_014638	GGCG	2	8	4155	4162	0 %	0 %	75 %	25 %	311063462
12	NC_014638	GCAG	2	8	4212	4219	25 %	0 %	50 %	25 %	311063462
13	NC_014638	CGGG	2	8	4741	4748	0 %	0 %	75 %	25 %	311063463
14	NC_014638	ACCT	2	8	5160	5167	25 %	25 %	0 %	50 %	311063463
15	NC_014638	AGGA	2	8	5419	5426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014638	TCAC	2	8	6218	6225	25 %	25 %	0 %	50 %	311063464
17	NC_014638	CGGC	2	8	6873	6880	0 %	0 %	50 %	50 %	311063464
18	NC_014638	CGGT	2	8	7092	7099	0 %	25 %	50 %	25 %	311063464
19	NC_014638	ACCG	2	8	7316	7323	25 %	0 %	25 %	50 %	311063464
20	NC_014638	CCGC	2	8	8177	8184	0 %	0 %	25 %	75 %	311063465
21	NC_014638	CCAG	2	8	9036	9043	25 %	0 %	25 %	50 %	311063465
22	NC_014638	CGGA	2	8	10545	10552	25 %	0 %	50 %	25 %	311063466
23	NC_014638	GAGC	2	8	10659	10666	25 %	0 %	50 %	25 %	311063466
24	NC_014638	CATA	2	8	11055	11062	50 %	25 %	0 %	25 %	311063466
25	NC_014638	GACG	2	8	11609	11616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014638	TGGC	2	8	12364	12371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014638	CGTG	2	8	12435	12442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014638	GGTG	2	8	12756	12763	0 %	25 %	75 %	0 %	311063468
29	NC_014638	GCCG	2	8	15231	15238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014638	GGGC	2	8	15888	15895	0 %	0 %	75 %	25 %	311063470
31	NC_014638	TTTC	2	8	16149	16156	0 %	75 %	0 %	25 %	311063470
32	NC_014638	CGGC	2	8	16402	16409	0 %	0 %	50 %	50 %	311063470
33	NC_014638	CGGC	2	8	16593	16600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014638	TCGG	2	8	16649	16656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014638	TGGC	2	8	16793	16800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014638	GTTT	2	8	16894	16901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014638	GTCA	2	8	17252	17259	25 %	25 %	25 %	25 %	311063471
38	NC_014638	GACC	2	8	17888	17895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014638	GCTC	2	8	18056	18063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014638	GCAT	2	8	18515	18522	25 %	25 %	25 %	25 %	311063472
41	NC_014638	CGGC	2	8	18715	18722	0 %	0 %	50 %	50 %	311063472
42	NC_014638	CCAC	2	8	19220	19227	25 %	0 %	0 %	75 %	311063472
43	NC_014638	GACC	2	8	19997	20004	25 %	0 %	25 %	50 %	311063473
44	NC_014638	CATT	2	8	20280	20287	25 %	50 %	0 %	25 %	311063473
45	NC_014638	GCAC	2	8	20430	20437	25 %	0 %	25 %	50 %	311063473
46	NC_014638	GCTT	2	8	21271	21278	0 %	50 %	25 %	25 %	311063474
47	NC_014638	AACG	2	8	21503	21510	50 %	0 %	25 %	25 %	311063474
48	NC_014638	TGCC	2	8	21619	21626	0 %	25 %	25 %	50 %	311063474
49	NC_014638	GTTG	2	8	22106	22113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014638	CCTC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	0 %	75 %	311063475
51	NC_014638	CAGC	2	8	22802	22809	25 %	0 %	25 %	50 %	311063475
52	NC_014638	GCGT	2	8	23050	23057	0 %	25 %	50 %	25 %	311063475
53	NC_014638	TGCG	2	8	23276	23283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014638	GCGA	2	8	25288	25295	25 %	0 %	50 %	25 %	311063477
55	NC_014638	CCAC	2	8	25387	25394	25 %	0 %	0 %	75 %	311063477
56	NC_014638	GCCT	2	8	25758	25765	0 %	25 %	25 %	50 %	311063477
57	NC_014638	CGGC	2	8	26372	26379	0 %	0 %	50 %	50 %	311063478
58	NC_014638	GACG	2	8	26513	26520	25 %	0 %	50 %	25 %	311063478
59	NC_014638	GTCG	2	8	27055	27062	0 %	25 %	50 %	25 %	311063479
60	NC_014638	CCTT	2	8	27933	27940	0 %	50 %	0 %	50 %	311063480
61	NC_014638	AGCG	2	8	28064	28071	25 %	0 %	50 %	25 %	311063480
62	NC_014638	ACCG	2	8	28130	28137	25 %	0 %	25 %	50 %	311063480
63	NC_014638	CAGA	2	8	28360	28367	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
64	NC_014638	CAGA	2	8	28465	28472	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
65	NC_014638	CGAG	2	8	28663	28670	25 %	0 %	50 %	25 %	311063480
66	NC_014638	TGCC	2	8	28837	28844	0 %	25 %	25 %	50 %	311063480
67	NC_014638	CGCC	2	8	28879	28886	0 %	0 %	25 %	75 %	311063480
68	NC_014638	CCGT	2	8	29064	29071	0 %	25 %	25 %	50 %	311063480
69	NC_014638	GTTC	2	8	29296	29303	0 %	50 %	25 %	25 %	311063480
70	NC_014638	ACGA	2	8	29352	29359	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
71	NC_014638	GTCG	2	8	30653	30660	0 %	25 %	50 %	25 %	311063480
72	NC_014638	CGGC	2	8	30711	30718	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
73	NC_014638	GCCG	2	8	30977	30984	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
74	NC_014638	CCGT	2	8	33419	33426	0 %	25 %	25 %	50 %	311063481
75	NC_014638	CGGC	2	8	33530	33537	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
76	NC_014638	GACG	2	8	33691	33698	25 %	0 %	50 %	25 %	311063481
77	NC_014638	CGGG	2	8	33759	33766	0 %	0 %	75 %	25 %	311063481
78	NC_014638	GCTG	2	8	34332	34339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014638	ATCT	2	8	34504	34511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014638	TAGA	2	8	34622	34629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014638	GAAA	2	8	36032	36039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014638	CGTC	2	8	36323	36330	0 %	25 %	25 %	50 %	311063483
83	NC_014638	GAAA	2	8	36668	36675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014638	CGGC	2	8	36973	36980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014638	CCAG	2	8	37304	37311	25 %	0 %	25 %	50 %	311063485
86	NC_014638	GTTC	2	8	37826	37833	0 %	50 %	25 %	25 %	311063485
87	NC_014638	GCCC	2	8	37963	37970	0 %	0 %	25 %	75 %	311063485
88	NC_014638	GCCG	2	8	38232	38239	0 %	0 %	50 %	50 %	311063485
89	NC_014638	CTGC	2	8	38361	38368	0 %	25 %	25 %	50 %	311063485
90	NC_014638	CGAT	2	8	39263	39270	25 %	25 %	25 %	25 %	311063486
91	NC_014638	GCCG	2	8	39585	39592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014638	CATG	2	8	39718	39725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014638	CTGC	2	8	39726	39733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014638	GTCA	2	8	40573	40580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014638	TGGC	2	8	40698	40705	0 %	25 %	50 %	25 %	311063488
96	NC_014638	GGCC	2	8	40708	40715	0 %	0 %	50 %	50 %	311063488
97	NC_014638	GCCG	2	8	40878	40885	0 %	0 %	50 %	50 %	311063488
98	NC_014638	CAGC	2	8	41637	41644	25 %	0 %	25 %	50 %	311063488
99	NC_014638	CCCG	2	8	41770	41777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_014638	GATC	2	8	42999	43006	25 %	25 %	25 %	25 %	311063489
101	NC_014638	GCCG	2	8	43307	43314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014638	CTCG	2	8	44158	44165	0 %	25 %	25 %	50 %	311063491
103	NC_014638	CCGA	2	8	44204	44211	25 %	0 %	25 %	50 %	311063491
104	NC_014638	TCGC	2	8	45962	45969	0 %	25 %	25 %	50 %	311063493
105	NC_014638	GCCC	2	8	46935	46942	0 %	0 %	25 %	75 %	311063493
106	NC_014638	CCCG	2	8	47060	47067	0 %	0 %	25 %	75 %	311063493
107	NC_014638	GCCG	2	8	47370	47377	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
108	NC_014638	TTCG	2	8	47451	47458	0 %	50 %	25 %	25 %	311063493
109	NC_014638	CGTG	2	8	47631	47638	0 %	25 %	50 %	25 %	311063493
110	NC_014638	ACGA	2	8	48234	48241	50 %	0 %	25 %	25 %	311063494
111	NC_014638	CGTG	2	8	48295	48302	0 %	25 %	50 %	25 %	311063494
112	NC_014638	CGGC	2	8	48537	48544	0 %	0 %	50 %	50 %	311063494
113	NC_014638	GCGA	2	8	49212	49219	25 %	0 %	50 %	25 %	311063494
114	NC_014638	CTCA	2	8	49436	49443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014638	TGAT	2	8	49642	49649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014638	TGCG	2	8	49759	49766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014638	AGAT	2	8	49923	49930	50 %	25 %	25 %	0 %	311063495
118	NC_014638	CGGG	2	8	50417	50424	0 %	0 %	75 %	25 %	311063495
119	NC_014638	CGAC	2	8	50766	50773	25 %	0 %	25 %	50 %	311063495
120	NC_014638	GCTC	2	8	51556	51563	0 %	25 %	25 %	50 %	311063495
121	NC_014638	TCGG	2	8	52077	52084	0 %	25 %	50 %	25 %	311063495
122	NC_014638	GGCC	2	8	52139	52146	0 %	0 %	50 %	50 %	311063495
123	NC_014638	GTTC	2	8	52183	52190	0 %	50 %	25 %	25 %	311063495
124	NC_014638	CTCA	2	8	52262	52269	25 %	25 %	0 %	50 %	311063495
125	NC_014638	GGCC	2	8	53187	53194	0 %	0 %	50 %	50 %	311063496
126	NC_014638	GACG	2	8	53712	53719	25 %	0 %	50 %	25 %	311063496
127	NC_014638	CGCC	2	8	54240	54247	0 %	0 %	25 %	75 %	311063496
128	NC_014638	GCCG	2	8	54720	54727	0 %	0 %	50 %	50 %	311063496
129	NC_014638	CTGC	2	8	54963	54970	0 %	25 %	25 %	50 %	311063496
130	NC_014638	CGCC	2	8	55911	55918	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_014638	GCGG	2	8	56086	56093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014638	GCGT	2	8	57270	57277	0 %	25 %	50 %	25 %	311063497
133	NC_014638	GCTG	2	8	57859	57866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014638	ATCT	2	8	57937	57944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014638	TAGA	2	8	58055	58062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014638	GCGG	2	8	58535	58542	0 %	0 %	75 %	25 %	311063498
137	NC_014638	TCGG	2	8	58576	58583	0 %	25 %	50 %	25 %	311063498
138	NC_014638	CGGC	2	8	58982	58989	0 %	0 %	50 %	50 %	311063498
139	NC_014638	CGGT	2	8	59095	59102	0 %	25 %	50 %	25 %	311063498
140	NC_014638	TGCT	2	8	59369	59376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014638	GCCG	2	8	59773	59780	0 %	0 %	50 %	50 %	311063499
142	NC_014638	GGCG	2	8	60170	60177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014638	CGGC	2	8	60657	60664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014638	GCGG	2	8	61255	61262	0 %	0 %	75 %	25 %	311063500
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