MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 4192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014638	CGTT	2	8	581	588	0 %	50 %	25 %	25 %	311063460
2	NC_014638	CGCA	2	8	609	616	25 %	0 %	25 %	50 %	311063460
3	NC_014638	CCGA	2	8	1300	1307	25 %	0 %	25 %	50 %	311063460
4	NC_014638	CTGC	2	8	2431	2438	0 %	25 %	25 %	50 %	311063461
5	NC_014638	ACCT	2	8	2446	2453	25 %	25 %	0 %	50 %	311063461
6	NC_014638	CGAC	2	8	2456	2463	25 %	0 %	25 %	50 %	311063461
7	NC_014638	CGAC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	25 %	50 %	311063461
8	NC_014638	GGCG	2	8	3858	3865	0 %	0 %	75 %	25 %	311063462
9	NC_014638	CACG	2	8	3945	3952	25 %	0 %	25 %	50 %	311063462
10	NC_014638	GGCG	2	8	4155	4162	0 %	0 %	75 %	25 %	311063462
11	NC_014638	GCAG	2	8	4212	4219	25 %	0 %	50 %	25 %	311063462
12	NC_014638	CGGG	2	8	4741	4748	0 %	0 %	75 %	25 %	311063463
13	NC_014638	ACCT	2	8	5160	5167	25 %	25 %	0 %	50 %	311063463
14	NC_014638	TCAC	2	8	6218	6225	25 %	25 %	0 %	50 %	311063464
15	NC_014638	CGGC	2	8	6873	6880	0 %	0 %	50 %	50 %	311063464
16	NC_014638	CGGT	2	8	7092	7099	0 %	25 %	50 %	25 %	311063464
17	NC_014638	ACCG	2	8	7316	7323	25 %	0 %	25 %	50 %	311063464
18	NC_014638	CCGC	2	8	8177	8184	0 %	0 %	25 %	75 %	311063465
19	NC_014638	CCAG	2	8	9036	9043	25 %	0 %	25 %	50 %	311063465
20	NC_014638	CGGA	2	8	10545	10552	25 %	0 %	50 %	25 %	311063466
21	NC_014638	GAGC	2	8	10659	10666	25 %	0 %	50 %	25 %	311063466
22	NC_014638	CATA	2	8	11055	11062	50 %	25 %	0 %	25 %	311063466
23	NC_014638	GGTG	2	8	12756	12763	0 %	25 %	75 %	0 %	311063468
24	NC_014638	GGGC	2	8	15888	15895	0 %	0 %	75 %	25 %	311063470
25	NC_014638	TTTC	2	8	16149	16156	0 %	75 %	0 %	25 %	311063470
26	NC_014638	CGGC	2	8	16402	16409	0 %	0 %	50 %	50 %	311063470
27	NC_014638	GTCA	2	8	17252	17259	25 %	25 %	25 %	25 %	311063471
28	NC_014638	GCAT	2	8	18515	18522	25 %	25 %	25 %	25 %	311063472
29	NC_014638	CGGC	2	8	18715	18722	0 %	0 %	50 %	50 %	311063472
30	NC_014638	CCAC	2	8	19220	19227	25 %	0 %	0 %	75 %	311063472
31	NC_014638	GACC	2	8	19997	20004	25 %	0 %	25 %	50 %	311063473
32	NC_014638	CATT	2	8	20280	20287	25 %	50 %	0 %	25 %	311063473
33	NC_014638	GCAC	2	8	20430	20437	25 %	0 %	25 %	50 %	311063473
34	NC_014638	GCTT	2	8	21271	21278	0 %	50 %	25 %	25 %	311063474
35	NC_014638	AACG	2	8	21503	21510	50 %	0 %	25 %	25 %	311063474
36	NC_014638	TGCC	2	8	21619	21626	0 %	25 %	25 %	50 %	311063474
37	NC_014638	CCTC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	0 %	75 %	311063475
38	NC_014638	CAGC	2	8	22802	22809	25 %	0 %	25 %	50 %	311063475
39	NC_014638	GCGT	2	8	23050	23057	0 %	25 %	50 %	25 %	311063475
40	NC_014638	GCGA	2	8	25288	25295	25 %	0 %	50 %	25 %	311063477
41	NC_014638	CCAC	2	8	25387	25394	25 %	0 %	0 %	75 %	311063477
42	NC_014638	GCCT	2	8	25758	25765	0 %	25 %	25 %	50 %	311063477
43	NC_014638	CGGC	2	8	26372	26379	0 %	0 %	50 %	50 %	311063478
44	NC_014638	GACG	2	8	26513	26520	25 %	0 %	50 %	25 %	311063478
45	NC_014638	GTCG	2	8	27055	27062	0 %	25 %	50 %	25 %	311063479
46	NC_014638	CCTT	2	8	27933	27940	0 %	50 %	0 %	50 %	311063480
47	NC_014638	AGCG	2	8	28064	28071	25 %	0 %	50 %	25 %	311063480
48	NC_014638	ACCG	2	8	28130	28137	25 %	0 %	25 %	50 %	311063480
49	NC_014638	CAGA	2	8	28360	28367	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
50	NC_014638	CAGA	2	8	28465	28472	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
51	NC_014638	CGAG	2	8	28663	28670	25 %	0 %	50 %	25 %	311063480
52	NC_014638	TGCC	2	8	28837	28844	0 %	25 %	25 %	50 %	311063480
53	NC_014638	CGCC	2	8	28879	28886	0 %	0 %	25 %	75 %	311063480
54	NC_014638	CCGT	2	8	29064	29071	0 %	25 %	25 %	50 %	311063480
55	NC_014638	GTTC	2	8	29296	29303	0 %	50 %	25 %	25 %	311063480
56	NC_014638	ACGA	2	8	29352	29359	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
57	NC_014638	GTCG	2	8	30653	30660	0 %	25 %	50 %	25 %	311063480
58	NC_014638	CGGC	2	8	30711	30718	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
59	NC_014638	GCCG	2	8	30977	30984	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
60	NC_014638	CCGT	2	8	33419	33426	0 %	25 %	25 %	50 %	311063481
61	NC_014638	CGGC	2	8	33530	33537	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
62	NC_014638	GACG	2	8	33691	33698	25 %	0 %	50 %	25 %	311063481
63	NC_014638	CGGG	2	8	33759	33766	0 %	0 %	75 %	25 %	311063481
64	NC_014638	CGTC	2	8	36323	36330	0 %	25 %	25 %	50 %	311063483
65	NC_014638	CCAG	2	8	37304	37311	25 %	0 %	25 %	50 %	311063485
66	NC_014638	GTTC	2	8	37826	37833	0 %	50 %	25 %	25 %	311063485
67	NC_014638	GCCC	2	8	37963	37970	0 %	0 %	25 %	75 %	311063485
68	NC_014638	GCCG	2	8	38232	38239	0 %	0 %	50 %	50 %	311063485
69	NC_014638	CTGC	2	8	38361	38368	0 %	25 %	25 %	50 %	311063485
70	NC_014638	CGAT	2	8	39263	39270	25 %	25 %	25 %	25 %	311063486
71	NC_014638	TGGC	2	8	40698	40705	0 %	25 %	50 %	25 %	311063488
72	NC_014638	GGCC	2	8	40708	40715	0 %	0 %	50 %	50 %	311063488
73	NC_014638	GCCG	2	8	40878	40885	0 %	0 %	50 %	50 %	311063488
74	NC_014638	CAGC	2	8	41637	41644	25 %	0 %	25 %	50 %	311063488
75	NC_014638	GATC	2	8	42999	43006	25 %	25 %	25 %	25 %	311063489
76	NC_014638	CTCG	2	8	44158	44165	0 %	25 %	25 %	50 %	311063491
77	NC_014638	CCGA	2	8	44204	44211	25 %	0 %	25 %	50 %	311063491
78	NC_014638	TCGC	2	8	45962	45969	0 %	25 %	25 %	50 %	311063493
79	NC_014638	GCCC	2	8	46935	46942	0 %	0 %	25 %	75 %	311063493
80	NC_014638	CCCG	2	8	47060	47067	0 %	0 %	25 %	75 %	311063493
81	NC_014638	GCCG	2	8	47370	47377	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
82	NC_014638	TTCG	2	8	47451	47458	0 %	50 %	25 %	25 %	311063493
83	NC_014638	CGTG	2	8	47631	47638	0 %	25 %	50 %	25 %	311063493
84	NC_014638	ACGA	2	8	48234	48241	50 %	0 %	25 %	25 %	311063494
85	NC_014638	CGTG	2	8	48295	48302	0 %	25 %	50 %	25 %	311063494
86	NC_014638	CGGC	2	8	48537	48544	0 %	0 %	50 %	50 %	311063494
87	NC_014638	GCGA	2	8	49212	49219	25 %	0 %	50 %	25 %	311063494
88	NC_014638	AGAT	2	8	49923	49930	50 %	25 %	25 %	0 %	311063495
89	NC_014638	CGGG	2	8	50417	50424	0 %	0 %	75 %	25 %	311063495
90	NC_014638	CGAC	2	8	50766	50773	25 %	0 %	25 %	50 %	311063495
91	NC_014638	GCTC	2	8	51556	51563	0 %	25 %	25 %	50 %	311063495
92	NC_014638	TCGG	2	8	52077	52084	0 %	25 %	50 %	25 %	311063495
93	NC_014638	GGCC	2	8	52139	52146	0 %	0 %	50 %	50 %	311063495
94	NC_014638	GTTC	2	8	52183	52190	0 %	50 %	25 %	25 %	311063495
95	NC_014638	CTCA	2	8	52262	52269	25 %	25 %	0 %	50 %	311063495
96	NC_014638	GGCC	2	8	53187	53194	0 %	0 %	50 %	50 %	311063496
97	NC_014638	GACG	2	8	53712	53719	25 %	0 %	50 %	25 %	311063496
98	NC_014638	CGCC	2	8	54240	54247	0 %	0 %	25 %	75 %	311063496
99	NC_014638	GCCG	2	8	54720	54727	0 %	0 %	50 %	50 %	311063496
100	NC_014638	CTGC	2	8	54963	54970	0 %	25 %	25 %	50 %	311063496
101	NC_014638	GCGT	2	8	57270	57277	0 %	25 %	50 %	25 %	311063497
102	NC_014638	GCGG	2	8	58535	58542	0 %	0 %	75 %	25 %	311063498
103	NC_014638	TCGG	2	8	58576	58583	0 %	25 %	50 %	25 %	311063498
104	NC_014638	CGGC	2	8	58982	58989	0 %	0 %	50 %	50 %	311063498
105	NC_014638	CGGT	2	8	59095	59102	0 %	25 %	50 %	25 %	311063498
106	NC_014638	GCCG	2	8	59773	59780	0 %	0 %	50 %	50 %	311063499
107	NC_014638	GCGG	2	8	61255	61262	0 %	0 %	75 %	25 %	311063500
108	NC_014638	ATAC	2	8	62183	62190	50 %	25 %	0 %	25 %	311063501
109	NC_014638	GTGG	2	8	63933	63940	0 %	25 %	75 %	0 %	311063502
110	NC_014638	GTTC	2	8	64165	64172	0 %	50 %	25 %	25 %	311063502
111	NC_014638	AATC	2	8	64715	64722	50 %	25 %	0 %	25 %	311063502
112	NC_014638	TGGC	2	8	64775	64782	0 %	25 %	50 %	25 %	311063502
113	NC_014638	TGGT	2	8	64987	64994	0 %	50 %	50 %	0 %	311063502
114	NC_014638	TGAA	2	8	65027	65034	50 %	25 %	25 %	0 %	311063502
115	NC_014638	GATG	2	8	65109	65116	25 %	25 %	50 %	0 %	311063502
116	NC_014638	CCGT	2	8	65575	65582	0 %	25 %	25 %	50 %	311063503
117	NC_014638	GAAA	2	8	66300	66307	75 %	0 %	25 %	0 %	311063503
118	NC_014638	CCGG	2	8	67194	67201	0 %	0 %	50 %	50 %	311063504
119	NC_014638	CCGC	2	8	67492	67499	0 %	0 %	25 %	75 %	311063504
120	NC_014638	GCGT	2	8	67630	67637	0 %	25 %	50 %	25 %	311063504
121	NC_014638	GTCC	2	8	69364	69371	0 %	25 %	25 %	50 %	311063507
122	NC_014638	GCGT	3	12	69461	69472	0 %	25 %	50 %	25 %	311063507
123	NC_014638	CCGG	2	8	69709	69716	0 %	0 %	50 %	50 %	311063507
124	NC_014638	CGGC	2	8	70496	70503	0 %	0 %	50 %	50 %	311063507
125	NC_014638	CGGA	2	8	71270	71277	25 %	0 %	50 %	25 %	311063509
126	NC_014638	CGAA	2	8	72110	72117	50 %	0 %	25 %	25 %	311063510
127	NC_014638	GGTT	2	8	72698	72705	0 %	50 %	50 %	0 %	311063510
128	NC_014638	CAGT	2	8	72737	72744	25 %	25 %	25 %	25 %	311063510
129	NC_014638	AGGT	2	8	72946	72953	25 %	25 %	50 %	0 %	311063510
130	NC_014638	TGTT	2	8	73328	73335	0 %	75 %	25 %	0 %	311063511
131	NC_014638	CGTG	2	8	75817	75824	0 %	25 %	50 %	25 %	311063512
132	NC_014638	TGGT	2	8	75900	75907	0 %	50 %	50 %	0 %	311063512
133	NC_014638	CATG	2	8	76195	76202	25 %	25 %	25 %	25 %	311063512
134	NC_014638	ATGG	2	8	76290	76297	25 %	25 %	50 %	0 %	311063512
135	NC_014638	ATGG	2	8	77046	77053	25 %	25 %	50 %	0 %	311063513
136	NC_014638	GAAG	2	8	78064	78071	50 %	0 %	50 %	0 %	311063514
137	NC_014638	TCCA	2	8	78328	78335	25 %	25 %	0 %	50 %	311063514
138	NC_014638	AATA	2	8	78453	78460	75 %	25 %	0 %	0 %	311063514
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