MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014638	A	6	6	1652	1657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014638	T	6	6	1662	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014638	T	6	6	1878	1883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014638	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014638	G	8	8	7622	7629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014638	T	6	6	14926	14931	0 %	100 %	0 %	0 %	311063469
7	NC_014638	A	7	7	31534	31540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014638	T	6	6	31717	31722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014638	G	6	6	34478	34483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014638	G	6	6	43121	43126	0 %	0 %	100 %	0 %	311063489
11	NC_014638	G	7	7	45763	45769	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014638	G	8	8	49651	49658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014638	C	6	6	56479	56484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_014638	T	6	6	56680	56685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014638	A	6	6	64615	64620	100 %	0 %	0 %	0 %	311063502
16	NC_014638	A	6	6	65948	65953	100 %	0 %	0 %	0 %	311063503
17	NC_014638	A	6	6	66094	66099	100 %	0 %	0 %	0 %	311063503
18	NC_014638	T	7	7	66908	66914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014638	A	6	6	67888	67893	100 %	0 %	0 %	0 %	311063505
20	NC_014638	A	6	6	68218	68223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014638	A	6	6	71996	72001	100 %	0 %	0 %	0 %	311063510
22	NC_014638	A	7	7	72520	72526	100 %	0 %	0 %	0 %	311063510
23	NC_014638	T	6	6	72537	72542	0 %	100 %	0 %	0 %	311063510
24	NC_014638	C	7	7	74391	74397	0 %	0 %	0 %	100 %	311063511
25	NC_014638	T	6	6	78687	78692	0 %	100 %	0 %	0 %	311063514
26	NC_014638	G	9	9	84705	84713	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014638	A	6	6	85278	85283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014638	A	6	6	88731	88736	100 %	0 %	0 %	0 %	311063525
29	NC_014638	T	6	6	91948	91953	0 %	100 %	0 %	0 %	311063528
30	NC_014638	T	6	6	93190	93195	0 %	100 %	0 %	0 %	311063529
31	NC_014638	T	6	6	93670	93675	0 %	100 %	0 %	0 %	311063530
32	NC_014638	T	6	6	95050	95055	0 %	100 %	0 %	0 %	311063531
33	NC_014638	A	8	8	95070	95077	100 %	0 %	0 %	0 %	311063531
34	NC_014638	C	9	9	96712	96720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_014638	T	6	6	99073	99078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014638	C	6	6	105863	105868	0 %	0 %	0 %	100 %	311063540
37	NC_014638	C	6	6	106688	106693	0 %	0 %	0 %	100 %	311063540
38	NC_014638	A	6	6	110920	110925	100 %	0 %	0 %	0 %	311063544
39	NC_014638	A	6	6	111709	111714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014638	A	7	7	112458	112464	100 %	0 %	0 %	0 %	311063546
41	NC_014638	G	6	6	144365	144370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014638	T	8	8	158509	158516	0 %	100 %	0 %	0 %	311063582
43	NC_014638	G	6	6	159829	159834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014638	C	6	6	159850	159855	0 %	0 %	0 %	100 %	311063584
45	NC_014638	A	6	6	162409	162414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014638	T	6	6	169244	169249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014638	A	6	6	169306	169311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014638	A	6	6	170760	170765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014638	T	6	6	188354	188359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014638	G	9	9	189908	189916	0 %	0 %	100 %	0 %	311063605
51	NC_014638	C	6	6	191048	191053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_014638	C	7	7	196945	196951	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_014638	C	8	8	200854	200861	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_014638	A	6	6	206300	206305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014638	A	6	6	225781	225786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014638	A	6	6	226180	226185	100 %	0 %	0 %	0 %	311063631
57	NC_014638	T	6	6	254315	254320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014638	T	6	6	254898	254903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014638	A	6	6	257543	257548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014638	C	7	7	259197	259203	0 %	0 %	0 %	100 %	311063652
61	NC_014638	C	7	7	264661	264667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_014638	G	6	6	274590	274595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014638	T	6	6	280903	280908	0 %	100 %	0 %	0 %	311063668
64	NC_014638	T	6	6	281279	281284	0 %	100 %	0 %	0 %	311063668
65	NC_014638	A	7	7	281427	281433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014638	C	6	6	283489	283494	0 %	0 %	0 %	100 %	311063672
67	NC_014638	A	6	6	292047	292052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014638	C	9	9	308862	308870	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_014638	G	10	10	310552	310561	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014638	C	10	10	312334	312343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_014638	G	7	7	312372	312378	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014638	T	6	6	313701	313706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014638	C	7	7	318452	318458	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_014638	C	6	6	320902	320907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_014638	T	6	6	332167	332172	0 %	100 %	0 %	0 %	311063706
76	NC_014638	A	6	6	333195	333200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014638	A	6	6	334561	334566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014638	T	6	6	335266	335271	0 %	100 %	0 %	0 %	311063707
79	NC_014638	A	7	7	342076	342082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014638	G	6	6	345525	345530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014638	G	11	11	347448	347458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014638	G	8	8	354301	354308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014638	C	10	10	367285	367294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_014638	A	6	6	367902	367907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014638	T	8	8	368088	368095	0 %	100 %	0 %	0 %	311063731
86	NC_014638	G	12	12	370754	370765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014638	G	10	10	371326	371335	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014638	T	6	6	372040	372045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014638	T	6	6	372233	372238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014638	T	6	6	372420	372425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014638	T	6	6	372686	372691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014638	T	6	6	373020	373025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014638	T	6	6	373116	373121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014638	T	7	7	373404	373410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014638	T	6	6	377331	377336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014638	A	6	6	377379	377384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014638	T	6	6	382093	382098	0 %	100 %	0 %	0 %	311063741
98	NC_014638	T	6	6	382657	382662	0 %	100 %	0 %	0 %	311063741
99	NC_014638	T	6	6	385253	385258	0 %	100 %	0 %	0 %	311063742
100	NC_014638	G	6	6	385933	385938	0 %	0 %	100 %	0 %	311063743
101	NC_014638	G	6	6	403808	403813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014638	A	6	6	405603	405608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014638	A	6	6	413247	413252	100 %	0 %	0 %	0 %	311063766
104	NC_014638	G	9	9	416639	416647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014638	G	6	6	419209	419214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014638	T	7	7	422019	422025	0 %	100 %	0 %	0 %	311063773
107	NC_014638	T	6	6	433581	433586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014638	C	11	11	435757	435767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_014638	T	6	6	445181	445186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014638	A	6	6	448978	448983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014638	T	6	6	457805	457810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014638	A	6	6	458133	458138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014638	A	6	6	462699	462704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014638	G	6	6	465934	465939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014638	T	6	6	485538	485543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014638	T	6	6	487142	487147	0 %	100 %	0 %	0 %	311063824
117	NC_014638	A	6	6	494294	494299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014638	A	6	6	498042	498047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014638	T	6	6	498070	498075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014638	T	6	6	502863	502868	0 %	100 %	0 %	0 %	311063835
121	NC_014638	C	6	6	531926	531931	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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124	NC_014638	A	6	6	555132	555137	100 %	0 %	0 %	0 %	311063862
125	NC_014638	C	9	9	556042	556050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_014638	G	6	6	564984	564989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014638	C	10	10	565221	565230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_014638	C	6	6	572974	572979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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131	NC_014638	A	6	6	600565	600570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014638	C	6	6	606254	606259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_014638	G	6	6	606266	606271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_014638	G	6	6	655196	655201	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_014638	T	6	6	656892	656897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014638	G	8	8	657126	657133	0 %	0 %	100 %	0 %	311063933
140	NC_014638	T	6	6	657615	657620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014638	T	6	6	657752	657757	0 %	100 %	0 %	0 %	311063934
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143	NC_014638	A	6	6	658745	658750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014638	A	6	6	686828	686833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014638	A	7	7	688834	688840	100 %	0 %	0 %	0 %	311063959
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.