MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP02

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014634	TAGATC	2	12	1799	1810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780580
2	NC_014634	AGTAAG	2	12	2365	2376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780580
3	NC_014634	ATAAAA	2	12	8442	8453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310780587
4	NC_014634	ATCTTG	2	12	10428	10439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310780588
5	NC_014634	ATGGAT	2	12	19050	19061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310780597
6	NC_014634	CTTCTA	2	12	20324	20335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310780598
7	NC_014634	TTATTC	2	12	21887	21898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310780602
8	NC_014634	CTCTAT	2	12	22488	22499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310780602
9	NC_014634	AGAGAA	2	12	24287	24298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310780603
10	NC_014634	GAAAAA	2	12	25027	25038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310780604
11	NC_014634	TTTGAA	2	12	25516	25527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310780605
12	NC_014634	ATATGA	2	12	26851	26862	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310780607
13	NC_014634	GTCAGT	2	12	28865	28876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310780609
14	NC_014634	CTATAG	2	12	29295	29306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780609
15	NC_014634	ATATTA	2	12	29565	29576	50 %	50 %	0 %	0 %	310780609
16	NC_014634	TAAATT	2	12	30018	30029	50 %	50 %	0 %	0 %	310780609
17	NC_014634	GCAATA	2	12	30780	30791	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310780610
18	NC_014634	ACAGCT	2	12	30810	30821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310780610
19	NC_014634	TCAGGA	2	12	33962	33973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310780613
20	NC_014634	GGATCG	2	12	52930	52941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310780626
21	NC_014634	ATAAAA	2	12	67456	67467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310780637
22	NC_014634	TCTTTT	2	12	70000	70011	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780639
23	NC_014634	ACCTAT	2	12	70649	70660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310780641
24	NC_014634	TCTAGA	2	12	73741	73752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780643
25	NC_014634	TGAAGA	2	12	79591	79602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780649
26	NC_014634	CTAAAG	2	12	84128	84139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310780653
27	NC_014634	ATTGCA	2	12	88195	88206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780655
28	NC_014634	ATTTTG	2	12	88905	88916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	310780656
29	NC_014634	TTTCTC	2	12	90240	90251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310780657
30	NC_014634	AAAAAC	2	12	91240	91251	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	310780657
31	NC_014634	AAATAA	2	12	91335	91346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310780657
32	NC_014634	TTAAAA	2	12	91436	91447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310780657
33	NC_014634	TATAGA	2	12	93848	93859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310780660
34	NC_014634	CTATAG	2	12	108445	108456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780674
35	NC_014634	ACAATT	2	12	117309	117320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310780681
36	NC_014634	ATTACC	2	12	117423	117434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310780681
37	NC_014634	CCGCTG	2	12	117637	117648	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310780681
38	NC_014634	AAAGAA	2	12	121359	121370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310780685
39	NC_014634	ATAAAA	2	12	123330	123341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310780687

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.