MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP02

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014634	GAATA	2	10	1968	1977	60 %	20 %	20 %	0 %	310780580
2	NC_014634	ATAAA	2	10	6274	6283	80 %	20 %	0 %	0 %	310780585
3	NC_014634	GAAAA	2	10	6685	6694	80 %	0 %	20 %	0 %	310780586
4	NC_014634	TAATT	2	10	7277	7286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014634	TTAAC	2	10	7671	7680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014634	ATTTT	2	10	8271	8280	20 %	80 %	0 %	0 %	310780587
7	NC_014634	ATTGA	2	10	9167	9176	40 %	40 %	20 %	0 %	310780587
8	NC_014634	CTACA	2	10	12498	12507	40 %	20 %	0 %	40 %	310780591
9	NC_014634	GATGC	2	10	12731	12740	20 %	20 %	40 %	20 %	310780591
10	NC_014634	ATACT	2	10	12759	12768	40 %	40 %	0 %	20 %	310780591
11	NC_014634	CTTGT	2	10	13007	13016	0 %	60 %	20 %	20 %	310780591
12	NC_014634	GAATA	2	10	13166	13175	60 %	20 %	20 %	0 %	310780591
13	NC_014634	AACAA	2	10	13446	13455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014634	AGGTT	2	10	13539	13548	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014634	AAAGT	2	10	14726	14735	60 %	20 %	20 %	0 %	310780593
16	NC_014634	GAAAA	2	10	15558	15567	80 %	0 %	20 %	0 %	310780594
17	NC_014634	TTTAA	2	10	18126	18135	40 %	60 %	0 %	0 %	310780597
18	NC_014634	TCCAT	2	10	19187	19196	20 %	40 %	0 %	40 %	310780597
19	NC_014634	ACCTT	2	10	26328	26337	20 %	40 %	0 %	40 %	310780606
20	NC_014634	TATTC	2	10	26631	26640	20 %	60 %	0 %	20 %	310780607
21	NC_014634	TCTAA	2	10	28201	28210	40 %	40 %	0 %	20 %	310780608
22	NC_014634	TCATT	2	10	28794	28803	20 %	60 %	0 %	20 %	310780609
23	NC_014634	TATCT	2	10	29011	29020	20 %	60 %	0 %	20 %	310780609
24	NC_014634	TTTGG	2	10	30682	30691	0 %	60 %	40 %	0 %	310780610
25	NC_014634	CCAAT	2	10	31402	31411	40 %	20 %	0 %	40 %	310780610
26	NC_014634	AAATC	2	10	31816	31825	60 %	20 %	0 %	20 %	310780611
27	NC_014634	CTTCT	2	10	32645	32654	0 %	60 %	0 %	40 %	310780612
28	NC_014634	AAATG	2	10	33063	33072	60 %	20 %	20 %	0 %	310780612
29	NC_014634	TGGTT	2	10	34770	34779	0 %	60 %	40 %	0 %	310780614
30	NC_014634	ACAAA	2	10	35819	35828	80 %	0 %	0 %	20 %	310780614
31	NC_014634	GTAAG	2	10	38659	38668	40 %	20 %	40 %	0 %	310780617
32	NC_014634	GGAAT	2	10	40872	40881	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014634	TAAAA	2	10	41527	41536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014634	ATAGT	2	10	41812	41821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014634	TTGCT	2	10	41840	41849	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014634	AAATT	2	10	42062	42071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014634	ATAAC	2	10	42423	42432	60 %	20 %	0 %	20 %	310780620
38	NC_014634	ACTAT	2	10	42783	42792	40 %	40 %	0 %	20 %	310780620
39	NC_014634	CGATA	2	10	43852	43861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014634	ATTTT	2	10	46165	46174	20 %	80 %	0 %	0 %	310780622
41	NC_014634	ATTTT	2	10	48088	48097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014634	AATCC	2	10	57469	57478	40 %	20 %	0 %	40 %	310780629
43	NC_014634	ATTTA	2	10	60533	60542	40 %	60 %	0 %	0 %	310780630
44	NC_014634	CAATA	2	10	61305	61314	60 %	20 %	0 %	20 %	310780631
45	NC_014634	TCATC	2	10	61445	61454	20 %	40 %	0 %	40 %	310780631
46	NC_014634	TTTCT	2	10	64148	64157	0 %	80 %	0 %	20 %	310780633
47	NC_014634	ATAAA	2	10	65827	65836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014634	ATATA	2	10	66141	66150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014634	TTATA	2	10	69017	69026	40 %	60 %	0 %	0 %	310780639
50	NC_014634	TCTTT	2	10	69416	69425	0 %	80 %	0 %	20 %	310780639
51	NC_014634	TGCTT	2	10	71091	71100	0 %	60 %	20 %	20 %	310780642
52	NC_014634	GTTTT	2	10	71161	71170	0 %	80 %	20 %	0 %	310780642
53	NC_014634	CATAT	2	10	71516	71525	40 %	40 %	0 %	20 %	310780642
54	NC_014634	CTTTT	2	10	71673	71682	0 %	80 %	0 %	20 %	310780642
55	NC_014634	TAGTT	2	10	72316	72325	20 %	60 %	20 %	0 %	310780642
56	NC_014634	TTTTA	2	10	72469	72478	20 %	80 %	0 %	0 %	310780642
57	NC_014634	CTTTT	2	10	72575	72584	0 %	80 %	0 %	20 %	310780642
58	NC_014634	AAATG	2	10	73361	73370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014634	TTTTC	2	10	74808	74817	0 %	80 %	0 %	20 %	310780644
60	NC_014634	TCTCT	2	10	75168	75177	0 %	60 %	0 %	40 %	310780644
61	NC_014634	AGTAT	2	10	79700	79709	40 %	40 %	20 %	0 %	310780649
62	NC_014634	ATGGA	2	10	79926	79935	40 %	20 %	40 %	0 %	310780649
63	NC_014634	GAAAG	2	10	80769	80778	60 %	0 %	40 %	0 %	310780650
64	NC_014634	CAACG	2	10	81831	81840	40 %	0 %	20 %	40 %	310780652
65	NC_014634	TTCAT	2	10	82807	82816	20 %	60 %	0 %	20 %	310780653
66	NC_014634	TACAC	2	10	86887	86896	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014634	TAAAT	2	10	87091	87100	60 %	40 %	0 %	0 %	310780654
68	NC_014634	GCTTT	2	10	89541	89550	0 %	60 %	20 %	20 %	310780657
69	NC_014634	GATAA	2	10	91163	91172	60 %	20 %	20 %	0 %	310780657
70	NC_014634	CAAAA	2	10	91348	91357	80 %	0 %	0 %	20 %	310780657
71	NC_014634	AAAAT	2	10	92179	92188	80 %	20 %	0 %	0 %	310780659
72	NC_014634	CTCAT	2	10	92227	92236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014634	ATATT	2	10	92320	92329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014634	GAACA	2	10	92828	92837	60 %	0 %	20 %	20 %	310780660
75	NC_014634	ATATT	2	10	94425	94434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014634	TTTTC	2	10	95300	95309	0 %	80 %	0 %	20 %	310780661
77	NC_014634	CCTTT	2	10	97825	97834	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014634	AAAGA	2	10	98389	98398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014634	GTTTA	2	10	98770	98779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014634	GATAA	2	10	99318	99327	60 %	20 %	20 %	0 %	310780665
81	NC_014634	TGAAA	2	10	99365	99374	60 %	20 %	20 %	0 %	310780665
82	NC_014634	ATTTA	2	10	101116	101125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014634	ATCCT	2	10	101449	101458	20 %	40 %	0 %	40 %	310780668
84	NC_014634	ATTAT	2	10	102109	102118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014634	TTTAC	2	10	102203	102212	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014634	CATCT	2	10	103030	103039	20 %	40 %	0 %	40 %	310780670
87	NC_014634	ATTCT	2	10	104517	104526	20 %	60 %	0 %	20 %	310780671
88	NC_014634	ATAAG	2	10	104586	104595	60 %	20 %	20 %	0 %	310780671
89	NC_014634	ACAAA	2	10	105651	105660	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014634	ATACT	2	10	106278	106287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014634	AAAAT	2	10	106598	106607	80 %	20 %	0 %	0 %	310780672
92	NC_014634	ATATT	2	10	106742	106751	40 %	60 %	0 %	0 %	310780672
93	NC_014634	AATAT	2	10	108031	108040	60 %	40 %	0 %	0 %	310780673
94	NC_014634	AAAGA	2	10	108278	108287	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014634	TAATT	2	10	109827	109836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014634	GAATA	2	10	109887	109896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014634	GAAAA	2	10	112065	112074	80 %	0 %	20 %	0 %	310780676
98	NC_014634	TGATA	2	10	112547	112556	40 %	40 %	20 %	0 %	310780676
99	NC_014634	TTATT	2	10	112616	112625	20 %	80 %	0 %	0 %	310780676
100	NC_014634	AGTAT	2	10	113992	114001	40 %	40 %	20 %	0 %	310780678
101	NC_014634	GTATT	2	10	114931	114940	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014634	ATATA	2	10	115396	115405	60 %	40 %	0 %	0 %	310780679
103	NC_014634	AATTT	2	10	115582	115591	40 %	60 %	0 %	0 %	310780679
104	NC_014634	TTCTC	2	10	116451	116460	0 %	60 %	0 %	40 %	310780680
105	NC_014634	GAACT	2	10	117579	117588	40 %	20 %	20 %	20 %	310780681
106	NC_014634	ATTTT	2	10	118491	118500	20 %	80 %	0 %	0 %	310780682
107	NC_014634	AAAAT	2	10	118597	118606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014634	ATTTA	2	10	122787	122796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014634	AAATT	2	10	123254	123263	60 %	40 %	0 %	0 %	310780687
110	NC_014634	TATGT	2	10	123530	123539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014634	ATTTT	2	10	123782	123791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014634	TTATT	2	10	124121	124130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.