MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP02

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014634	TTTG	2	8	48	55	0 %	75 %	25 %	0 %	310780579
2	NC_014634	AGAA	2	8	202	209	75 %	0 %	25 %	0 %	310780579
3	NC_014634	TAAT	2	8	629	636	50 %	50 %	0 %	0 %	310780579
4	NC_014634	TAAA	2	8	1778	1785	75 %	25 %	0 %	0 %	310780580
5	NC_014634	TCTA	2	8	2834	2841	25 %	50 %	0 %	25 %	310780581
6	NC_014634	CAGG	2	8	2842	2849	25 %	0 %	50 %	25 %	310780581
7	NC_014634	TATT	2	8	4038	4045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014634	CAAT	2	8	4398	4405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014634	TAAC	2	8	4599	4606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014634	TAAC	2	8	4652	4659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014634	AAAT	2	8	4852	4859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014634	ATAA	2	8	5946	5953	75 %	25 %	0 %	0 %	310780585
13	NC_014634	GTTC	2	8	6339	6346	0 %	50 %	25 %	25 %	310780585
14	NC_014634	ATTT	2	8	6603	6610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014634	CTTT	2	8	7002	7009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014634	ACCT	2	8	7505	7512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014634	AGTT	2	8	7839	7846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014634	ATCT	2	8	7872	7879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014634	GTAG	2	8	8153	8160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014634	TTGG	2	8	9416	9423	0 %	50 %	50 %	0 %	310780587
21	NC_014634	GTCA	2	8	9482	9489	25 %	25 %	25 %	25 %	310780587
22	NC_014634	CTTG	2	8	10042	10049	0 %	50 %	25 %	25 %	310780588
23	NC_014634	AGGT	2	8	10537	10544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014634	TTAT	2	8	10693	10700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014634	TGCT	2	8	10906	10913	0 %	50 %	25 %	25 %	310780589
26	NC_014634	AGAA	2	8	11029	11036	75 %	0 %	25 %	0 %	310780589
27	NC_014634	AATA	2	8	11249	11256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014634	AATA	2	8	11304	11311	75 %	25 %	0 %	0 %	310780590
29	NC_014634	TGTA	2	8	11424	11431	25 %	50 %	25 %	0 %	310780590
30	NC_014634	AAAT	2	8	11521	11528	75 %	25 %	0 %	0 %	310780591
31	NC_014634	TAAC	2	8	11741	11748	50 %	25 %	0 %	25 %	310780591
32	NC_014634	GCAT	2	8	12003	12010	25 %	25 %	25 %	25 %	310780591
33	NC_014634	GTAC	2	8	12173	12180	25 %	25 %	25 %	25 %	310780591
34	NC_014634	CAAA	2	8	12280	12287	75 %	0 %	0 %	25 %	310780591
35	NC_014634	ACTC	2	8	12310	12317	25 %	25 %	0 %	50 %	310780591
36	NC_014634	TGGT	2	8	12368	12375	0 %	50 %	50 %	0 %	310780591
37	NC_014634	ATTT	2	8	12411	12418	25 %	75 %	0 %	0 %	310780591
38	NC_014634	TGTT	2	8	13463	13470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014634	TAGA	2	8	13562	13569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014634	TTTA	2	8	13573	13580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014634	AGAT	2	8	13827	13834	50 %	25 %	25 %	0 %	310780593
42	NC_014634	ATAA	2	8	14552	14559	75 %	25 %	0 %	0 %	310780593
43	NC_014634	ATGG	2	8	14646	14653	25 %	25 %	50 %	0 %	310780593
44	NC_014634	AATT	2	8	14941	14948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014634	ATTT	2	8	15157	15164	25 %	75 %	0 %	0 %	310780594
46	NC_014634	TGGG	2	8	15601	15608	0 %	25 %	75 %	0 %	310780594
47	NC_014634	ATTC	2	8	15895	15902	25 %	50 %	0 %	25 %	310780594
48	NC_014634	AAAT	2	8	16285	16292	75 %	25 %	0 %	0 %	310780594
49	NC_014634	GAAG	2	8	16447	16454	50 %	0 %	50 %	0 %	310780594
50	NC_014634	CCAA	2	8	17828	17835	50 %	0 %	0 %	50 %	310780596
51	NC_014634	TTAT	2	8	17905	17912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014634	TTTA	2	8	18059	18066	25 %	75 %	0 %	0 %	310780597
53	NC_014634	ATGG	2	8	18318	18325	25 %	25 %	50 %	0 %	310780597
54	NC_014634	TTTA	2	8	18461	18468	25 %	75 %	0 %	0 %	310780597
55	NC_014634	TCAA	2	8	18952	18959	50 %	25 %	0 %	25 %	310780597
56	NC_014634	ATTT	2	8	19674	19681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014634	TAAA	2	8	19995	20002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014634	AATG	2	8	20427	20434	50 %	25 %	25 %	0 %	310780598
59	NC_014634	CTCC	2	8	20765	20772	0 %	25 %	0 %	75 %	310780599
60	NC_014634	TTAG	2	8	20805	20812	25 %	50 %	25 %	0 %	310780599
61	NC_014634	CTTA	2	8	21254	21261	25 %	50 %	0 %	25 %	310780600
62	NC_014634	TAAT	2	8	21265	21272	50 %	50 %	0 %	0 %	310780600
63	NC_014634	GAAT	2	8	21406	21413	50 %	25 %	25 %	0 %	310780600
64	NC_014634	AGAA	2	8	21444	21451	75 %	0 %	25 %	0 %	310780600
65	NC_014634	TCCT	2	8	21638	21645	0 %	50 %	0 %	50 %	310780601
66	NC_014634	AAAG	2	8	21937	21944	75 %	0 %	25 %	0 %	310780602
67	NC_014634	AGAT	2	8	22185	22192	50 %	25 %	25 %	0 %	310780602
68	NC_014634	CCAT	2	8	22906	22913	25 %	25 %	0 %	50 %	310780602
69	NC_014634	CCTT	2	8	22945	22952	0 %	50 %	0 %	50 %	310780602
70	NC_014634	TTCT	2	8	23321	23328	0 %	75 %	0 %	25 %	310780602
71	NC_014634	TGAA	2	8	23594	23601	50 %	25 %	25 %	0 %	310780602
72	NC_014634	TATT	2	8	24100	24107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014634	ATTT	2	8	24955	24962	25 %	75 %	0 %	0 %	310780604
74	NC_014634	AATA	2	8	25217	25224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014634	CCAT	2	8	25371	25378	25 %	25 %	0 %	50 %	310780605
76	NC_014634	TTTC	2	8	25396	25403	0 %	75 %	0 %	25 %	310780605
77	NC_014634	TCTT	2	8	25803	25810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014634	TTTG	2	8	25829	25836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014634	AAGG	2	8	25927	25934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014634	TGGG	2	8	26122	26129	0 %	25 %	75 %	0 %	310780606
81	NC_014634	AATT	2	8	26603	26610	50 %	50 %	0 %	0 %	310780606
82	NC_014634	ATAG	2	8	27186	27193	50 %	25 %	25 %	0 %	310780607
83	NC_014634	TCAG	2	8	27716	27723	25 %	25 %	25 %	25 %	310780607
84	NC_014634	ATTT	2	8	28376	28383	25 %	75 %	0 %	0 %	310780608
85	NC_014634	CAAT	2	8	28571	28578	50 %	25 %	0 %	25 %	310780608
86	NC_014634	AATA	2	8	28903	28910	75 %	25 %	0 %	0 %	310780609
87	NC_014634	AAAT	2	8	29122	29129	75 %	25 %	0 %	0 %	310780609
88	NC_014634	TCTT	2	8	29514	29521	0 %	75 %	0 %	25 %	310780609
89	NC_014634	CATA	2	8	30030	30037	50 %	25 %	0 %	25 %	310780609
90	NC_014634	TAAA	2	8	30111	30118	75 %	25 %	0 %	0 %	310780609
91	NC_014634	TAGT	2	8	30543	30550	25 %	50 %	25 %	0 %	310780610
92	NC_014634	AGAA	2	8	30581	30588	75 %	0 %	25 %	0 %	310780610
93	NC_014634	TAAG	2	8	31005	31012	50 %	25 %	25 %	0 %	310780610
94	NC_014634	TAAA	2	8	31050	31057	75 %	25 %	0 %	0 %	310780610
95	NC_014634	TTTG	2	8	31656	31663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014634	TATT	2	8	32033	32040	25 %	75 %	0 %	0 %	310780611
97	NC_014634	ATCG	2	8	32063	32070	25 %	25 %	25 %	25 %	310780611
98	NC_014634	GTAC	2	8	32270	32277	25 %	25 %	25 %	25 %	310780611
99	NC_014634	AAAG	2	8	32326	32333	75 %	0 %	25 %	0 %	310780611
100	NC_014634	CTTT	2	8	32519	32526	0 %	75 %	0 %	25 %	310780612
101	NC_014634	TAAA	2	8	32534	32541	75 %	25 %	0 %	0 %	310780612
102	NC_014634	GAAA	2	8	32947	32954	75 %	0 %	25 %	0 %	310780612
103	NC_014634	TATG	2	8	33420	33427	25 %	50 %	25 %	0 %	310780612
104	NC_014634	ATTT	2	8	33525	33532	25 %	75 %	0 %	0 %	310780612
105	NC_014634	AAGA	2	8	33906	33913	75 %	0 %	25 %	0 %	310780613
106	NC_014634	TTCC	3	12	34213	34224	0 %	50 %	0 %	50 %	310780613
107	NC_014634	AAAT	2	8	34832	34839	75 %	25 %	0 %	0 %	310780614
108	NC_014634	CCTA	2	8	35387	35394	25 %	25 %	0 %	50 %	310780614
109	NC_014634	ATGT	2	8	35567	35574	25 %	50 %	25 %	0 %	310780614
110	NC_014634	TTAT	2	8	35975	35982	25 %	75 %	0 %	0 %	310780614
111	NC_014634	TAAA	2	8	36419	36426	75 %	25 %	0 %	0 %	310780615
112	NC_014634	TAGG	2	8	37465	37472	25 %	25 %	50 %	0 %	310780617
113	NC_014634	AAAG	2	8	37521	37528	75 %	0 %	25 %	0 %	310780617
114	NC_014634	CAGA	2	8	37632	37639	50 %	0 %	25 %	25 %	310780617
115	NC_014634	TAAA	2	8	37825	37832	75 %	25 %	0 %	0 %	310780617
116	NC_014634	ATTT	2	8	38356	38363	25 %	75 %	0 %	0 %	310780617
117	NC_014634	AAAC	2	8	38561	38568	75 %	0 %	0 %	25 %	310780617
118	NC_014634	CATA	2	8	38953	38960	50 %	25 %	0 %	25 %	310780617
119	NC_014634	TTTA	2	8	39198	39205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014634	ATGT	2	8	39919	39926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014634	CAAA	2	8	40096	40103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014634	GCTG	2	8	40333	40340	0 %	25 %	50 %	25 %	310780618
123	NC_014634	TAAA	2	8	40479	40486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014634	AGAT	2	8	40512	40519	50 %	25 %	25 %	0 %	310780619
125	NC_014634	TTTA	2	8	40543	40550	25 %	75 %	0 %	0 %	310780619
126	NC_014634	TATG	2	8	41248	41255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014634	AGTA	2	8	41539	41546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014634	ATAG	2	8	41998	42005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014634	AGAC	2	8	43345	43352	50 %	0 %	25 %	25 %	310780621
130	NC_014634	AGAT	2	8	43467	43474	50 %	25 %	25 %	0 %	310780621
131	NC_014634	AGAA	2	8	44022	44029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014634	GATT	2	8	44710	44717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014634	TGCT	2	8	44843	44850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014634	TTTC	2	8	45408	45415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014634	ATTA	2	8	46104	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	310780622
136	NC_014634	TCTT	2	8	46541	46548	0 %	75 %	0 %	25 %	310780622
137	NC_014634	CATC	2	8	46652	46659	25 %	25 %	0 %	50 %	310780622
138	NC_014634	TAAA	2	8	47183	47190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014634	ATTC	2	8	47437	47444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014634	AAAT	2	8	48258	48265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014634	AGAT	2	8	50263	50270	50 %	25 %	25 %	0 %	310780623
142	NC_014634	GAAA	3	12	51191	51202	75 %	0 %	25 %	0 %	310780623
143	NC_014634	TTAT	2	8	51769	51776	25 %	75 %	0 %	0 %	310780625
144	NC_014634	TTAA	2	8	52069	52076	50 %	50 %	0 %	0 %	310780625
145	NC_014634	CATA	2	8	52088	52095	50 %	25 %	0 %	25 %	310780625
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.