MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP02

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014634	TATT	2	8	4038	4045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014634	CAAT	2	8	4398	4405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014634	TAAC	2	8	4599	4606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014634	TAAC	2	8	4652	4659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014634	AAAT	2	8	4852	4859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014634	ATTT	2	8	6603	6610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014634	CTTT	2	8	7002	7009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014634	ACCT	2	8	7505	7512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014634	AGTT	2	8	7839	7846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014634	ATCT	2	8	7872	7879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014634	GTAG	2	8	8153	8160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014634	AGGT	2	8	10537	10544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014634	TTAT	2	8	10693	10700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014634	AATA	2	8	11249	11256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014634	TGTT	2	8	13463	13470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014634	TAGA	2	8	13562	13569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014634	TTTA	2	8	13573	13580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014634	AATT	2	8	14941	14948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014634	TTAT	2	8	17905	17912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014634	ATTT	2	8	19674	19681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014634	TAAA	2	8	19995	20002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014634	TATT	2	8	24100	24107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014634	AATA	2	8	25217	25224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014634	TCTT	2	8	25803	25810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014634	TTTG	2	8	25829	25836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014634	AAGG	2	8	25927	25934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014634	TTTG	2	8	31656	31663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014634	TTTA	2	8	39198	39205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014634	ATGT	2	8	39919	39926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014634	CAAA	2	8	40096	40103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014634	TAAA	2	8	40479	40486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014634	TATG	2	8	41248	41255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014634	AGTA	2	8	41539	41546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014634	ATAG	2	8	41998	42005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014634	AGAA	2	8	44022	44029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014634	GATT	2	8	44710	44717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014634	TGCT	2	8	44843	44850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014634	TTTC	2	8	45408	45415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014634	TAAA	2	8	47183	47190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014634	ATTC	2	8	47437	47444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014634	AAAT	2	8	48258	48265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014634	TGAT	2	8	52213	52220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014634	CTTC	2	8	55474	55481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014634	CTTG	2	8	55546	55553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014634	CTGA	2	8	56145	56152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014634	GCTT	2	8	56264	56271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014634	CATC	2	8	56530	56537	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014634	AAGT	2	8	56570	56577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014634	TATT	2	8	56709	56716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014634	TTCT	2	8	63119	63126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014634	TTTC	2	8	63155	63162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014634	ATTG	2	8	63195	63202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014634	TTTA	2	8	63236	63243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014634	TTAA	2	8	63291	63298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014634	AGTA	2	8	63335	63342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014634	AAGA	2	8	66018	66025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014634	TAAA	2	8	66122	66129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014634	AGGG	2	8	66167	66174	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014634	TGAG	2	8	67083	67090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014634	ATAA	2	8	67532	67539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014634	TGAT	2	8	68201	68208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014634	TTAA	2	8	73597	73604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014634	TAAA	2	8	74517	74524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014634	TCAA	2	8	75223	75230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014634	CAAA	2	8	75457	75464	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014634	TTTC	2	8	84723	84730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014634	AAAT	2	8	84746	84753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014634	AATA	2	8	84869	84876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014634	TTAA	2	8	85002	85009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014634	ACCA	2	8	85030	85037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014634	TAGA	2	8	85393	85400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014634	TCTT	2	8	85605	85612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014634	CTAC	2	8	85944	85951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014634	TATT	2	8	86065	86072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014634	TTCT	2	8	86154	86161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014634	GAAA	2	8	86554	86561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014634	AAAT	2	8	86847	86854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014634	AAGA	2	8	86954	86961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014634	TAAA	2	8	89406	89413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014634	CAAT	2	8	92366	92373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014634	TTTA	2	8	92395	92402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014634	TTAT	2	8	92416	92423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014634	ATTT	2	8	94142	94149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014634	ATTT	2	8	95708	95715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014634	TAAA	2	8	95848	95855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014634	GTAT	2	8	95880	95887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014634	TTAT	2	8	95901	95908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014634	ATTA	2	8	97564	97571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014634	GAAA	2	8	98409	98416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014634	GAAA	2	8	98442	98449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014634	GAAA	2	8	98475	98482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014634	GAAA	2	8	98541	98548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014634	GAAG	2	8	98580	98587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014634	CTAG	2	8	101135	101142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014634	TTAT	2	8	105229	105236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014634	TAAA	2	8	105384	105391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014634	TAAA	2	8	105420	105427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014634	ATCT	2	8	106254	106261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014634	AAAC	2	8	107361	107368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014634	TTAA	2	8	109868	109875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014634	CCTT	2	8	114778	114785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014634	TCCC	2	8	115783	115790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_014634	TTAT	2	8	118521	118528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014634	CAAT	2	8	120871	120878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014634	AAGT	2	8	122583	122590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014634	ATAA	2	8	122640	122647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014634	TTCT	2	8	122942	122949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.