MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014633	ATTAAT	2	12	2300	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	310779697
2	NC_014633	TCCACT	2	12	4792	4803	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310779701
3	NC_014633	AATATA	2	12	9604	9615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779706
4	NC_014633	TAAAAA	2	12	10410	10421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014633	ATTCTC	2	12	12372	12383	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779711
6	NC_014633	TTTCTT	2	12	13153	13164	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779713
7	NC_014633	TGTATC	2	12	14774	14785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310779715
8	NC_014633	ATTCAA	2	12	17852	17863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310779719
9	NC_014633	TTTTTC	2	12	19356	19367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779722
10	NC_014633	AATCAA	2	12	22460	22471	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310779726
11	NC_014633	TATCTT	2	12	27014	27025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779734
12	NC_014633	TTCACT	2	12	29980	29991	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779737
13	NC_014633	ATCTAT	2	12	30493	30504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779737
14	NC_014633	CTCCTT	2	12	30830	30841	0 %	50 %	0 %	50 %	310779738
15	NC_014633	TCATAC	2	12	36283	36294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310779744
16	NC_014633	AGTACC	2	12	36523	36534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779745
17	NC_014633	AATATA	2	12	36604	36615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014633	TTTCTT	2	12	37806	37817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779747
19	NC_014633	CATTTT	2	12	39555	39566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779753
20	NC_014633	CTCTTC	2	12	39703	39714	0 %	50 %	0 %	50 %	310779753
21	NC_014633	TATTTT	2	12	41151	41162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014633	AATTTT	2	12	41941	41952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779757
23	NC_014633	TGAAAT	2	12	48714	48725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310779770
24	NC_014633	CTTTTA	2	12	56177	56188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014633	CTAGAA	2	12	57221	57232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779779
26	NC_014633	GAAAAA	2	12	57287	57298	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310779779
27	NC_014633	TATAAA	2	12	60525	60536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014633	GAAAAT	2	12	62843	62854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310779786
29	NC_014633	ATTGAT	2	12	64547	64558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779787
30	NC_014633	TGCCAT	2	12	66237	66248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310779790
31	NC_014633	GTAAGA	2	12	66631	66642	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779790
32	NC_014633	TGATAT	2	12	66690	66701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779790
33	NC_014633	TAAAAA	2	12	69088	69099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014633	ATTTTT	2	12	75860	75871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779795
35	NC_014633	ATAAAT	2	12	77204	77215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779796
36	NC_014633	GAATGG	2	12	80919	80930	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310779799
37	NC_014633	TGAAAG	2	12	84121	84132	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014633	TTATTT	2	12	85868	85879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779803
39	NC_014633	TTTTGT	2	12	90203	90214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014633	ACCTTT	2	12	90392	90403	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779805
41	NC_014633	AAAATA	2	12	92496	92507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779808
42	NC_014633	TGCAAC	2	12	93729	93740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779809
43	NC_014633	GTATTT	2	12	95114	95125	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014633	CTAGGT	2	12	97551	97562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310779812
45	NC_014633	TAGAGA	2	12	98693	98704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779814
46	NC_014633	CTTGAA	2	12	100624	100635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310779816
47	NC_014633	TTTTAA	2	12	101426	101437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779818
48	NC_014633	CAAATC	2	12	102083	102094	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310779820
49	NC_014633	ACTTTT	2	12	102412	102423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779820
50	NC_014633	ATGAGT	2	12	105268	105279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779824
51	NC_014633	GCTGTG	2	12	105971	105982	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310779825
52	NC_014633	ATCATT	2	12	109207	109218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779829
53	NC_014633	GCTGCG	2	12	109304	109315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310779829
54	NC_014633	TTTCTT	2	12	111977	111988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779830
55	NC_014633	TCTAAA	2	12	112203	112214	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310779830
56	NC_014633	TAATTA	2	12	114356	114367	50 %	50 %	0 %	0 %	310779835
57	NC_014633	TTAGGT	2	12	116119	116130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310779838
58	NC_014633	TTTAAA	2	12	117805	117816	50 %	50 %	0 %	0 %	310779841
59	NC_014633	TAAAAA	2	12	118224	118235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014633	AATCAG	2	12	119137	119148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779843
61	NC_014633	TTTTAT	2	12	119326	119337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779843
62	NC_014633	TAAACA	2	12	125781	125792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014633	TTTCCT	2	12	129299	129310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310779855
64	NC_014633	CTTCGG	2	12	129365	129376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310779855
65	NC_014633	TTTAAT	2	12	132225	132236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779859
66	NC_014633	GTATAG	2	12	134281	134292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779859
67	NC_014633	TTTTTC	2	12	135140	135151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779860
68	NC_014633	TTTCCT	2	12	136099	136110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310779860
69	NC_014633	TTCCAT	2	12	136579	136590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779860
70	NC_014633	CAGTAA	2	12	138558	138569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779865
71	NC_014633	CTAAAT	2	12	142594	142605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014633	ATAGGT	2	12	148353	148364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779873
73	NC_014633	CGGTGG	2	12	149680	149691	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310779874
74	NC_014633	ATTTTT	2	12	150961	150972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779875
75	NC_014633	AGTTAT	2	12	153778	153789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014633	TTATAT	2	12	156306	156317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014633	TAAAAA	2	12	162072	162083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779881
78	NC_014633	GCAGGA	2	12	162861	162872	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310779882
79	NC_014633	TGCAAT	2	12	163700	163711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310779883
80	NC_014633	AAAAAT	2	12	168380	168391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014633	TAAAAT	2	12	173012	173023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014633	TACATT	2	12	173193	173204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779893
83	NC_014633	TCCCAT	2	12	173460	173471	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310779893
84	NC_014633	CTTTTT	2	12	176330	176341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779896
85	NC_014633	AAATTA	2	12	177033	177044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014633	CTACAG	2	12	179277	179288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779898
87	NC_014633	CAACCT	2	12	179391	179402	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	310779898
88	NC_014633	TAATTA	2	12	181615	181626	50 %	50 %	0 %	0 %	310779900
89	NC_014633	ACTGCA	2	12	185130	185141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779903
90	NC_014633	TTATCA	2	12	187306	187317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779904
91	NC_014633	CTTAAT	2	12	189305	189316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779906
92	NC_014633	TGGATT	2	12	190335	190346	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310779907
93	NC_014633	TACAAT	2	12	190389	190400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310779907
94	NC_014633	AAGACT	2	12	192014	192025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779909
95	NC_014633	ATTAAA	2	12	195424	195435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779911
96	NC_014633	CATTGA	2	12	196314	196325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310779912
97	NC_014633	TATATT	2	12	197204	197215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779913
98	NC_014633	ATTTTT	2	12	197285	197296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779913
99	NC_014633	TGGTTT	2	12	197809	197820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310779913
100	NC_014633	CTTCCT	2	12	198634	198645	0 %	50 %	0 %	50 %	310779914
101	NC_014633	TGAATT	2	12	199035	199046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779915
102	NC_014633	GTTTCT	2	12	206692	206703	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310779919
103	NC_014633	ATTTTT	2	12	207027	207038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779919
104	NC_014633	TAAAAA	2	12	208393	208404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779920
105	NC_014633	AATTGA	2	12	210213	210224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310779922
106	NC_014633	ACTTTA	2	12	211365	211376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014633	CTGGAG	2	12	212206	212217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310779924
108	NC_014633	GCAGAA	2	12	214693	214704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310779926
109	NC_014633	AAGTTG	2	12	216192	216203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779928
110	NC_014633	AACTAC	2	12	216224	216235	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310779928
111	NC_014633	TTTAAC	2	12	216941	216952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779928
112	NC_014633	GAAGTG	2	12	221341	221352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310779932
113	NC_014633	TAAAAA	2	12	222083	222094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014633	AAAATA	2	12	223846	223857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779935
115	NC_014633	CCGTTT	2	12	226752	226763	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310779938
116	NC_014633	TTACTT	2	12	229281	229292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779941
117	NC_014633	CTTTTG	2	12	229305	229316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310779941
118	NC_014633	AATTAA	2	12	231441	231452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779943
119	NC_014633	ATTTTA	2	12	231527	231538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014633	TAAAAT	2	12	232805	232816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014633	GGAATA	2	12	236208	236219	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779947
122	NC_014633	TTTGAA	2	12	241391	241402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779950
123	NC_014633	CCTTTT	2	12	243546	243557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014633	ATTTGA	2	12	245075	245086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014633	AATTGA	2	12	247438	247449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014633	TTTAGA	2	12	248861	248872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779955
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129	NC_014633	ATTAAA	2	12	259772	259783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_014633	ATTTAT	2	12	267213	267224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779973
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175	NC_014633	TCTCAT	2	12	365538	365549	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310780042
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219	NC_014633	ATATTT	2	12	484614	484625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_014633	TGGATT	2	12	485376	485387	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310780159
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225	NC_014633	TTTTCT	2	12	492772	492783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780163
226	NC_014633	GTTTAT	2	12	495595	495606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	310780164
227	NC_014633	CCAAGG	2	12	503752	503763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310780172
228	NC_014633	AAGGGA	2	12	505051	505062	50 %	0 %	50 %	0 %	310780173
229	NC_014633	GTGCAG	2	12	506405	506416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310780174
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231	NC_014633	TAGGAA	2	12	512700	512711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780178
232	NC_014633	TATATT	2	12	513458	513469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_014633	TGCAGC	2	12	514764	514775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310780180
234	NC_014633	ACAAAA	2	12	516640	516651	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	310780182
235	NC_014633	CCCTTG	2	12	519739	519750	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310780185
236	NC_014633	AGAGAA	2	12	520540	520551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310780186
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238	NC_014633	AAAGGC	2	12	524664	524675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310780190
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345	NC_014633	AAACAG	2	12	783148	783159	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310780418
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353	NC_014633	ACTGAA	2	12	798998	799009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310780431
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355	NC_014633	TTTATA	2	12	799902	799913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310780432
356	NC_014633	ATATAG	2	12	801454	801465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310780434
357	NC_014633	ATAAAC	2	12	802002	802013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310780434
358	NC_014633	CCGGAG	2	12	802165	802176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310780434
359	NC_014633	TTCTTT	2	12	803434	803445	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780436
360	NC_014633	CATAAA	2	12	803574	803585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310780436
361	NC_014633	GCTCCT	2	12	804799	804810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310780437
362	NC_014633	CAATAT	2	12	807730	807741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310780440
363	NC_014633	CCCACT	2	12	808999	809010	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	310780442
364	NC_014633	ATTATA	2	12	816098	816109	50 %	50 %	0 %	0 %	310780447
365	NC_014633	TTAAAA	2	12	816357	816368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310780447
366	NC_014633	GAATAT	2	12	817138	817149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310780447
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368	NC_014633	AATTTA	2	12	818164	818175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
369	NC_014633	AAAGCA	2	12	821195	821206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310780453
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371	NC_014633	TTTTAT	2	12	825292	825303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310780456
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374	NC_014633	CTTCCA	2	12	833936	833947	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310780464
375	NC_014633	AACACA	2	12	836384	836395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310780467
376	NC_014633	TGTTCC	2	12	840238	840249	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_014633	CCATCA	2	12	841456	841467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
378	NC_014633	CCAAAT	2	12	845084	845095	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310780473
379	NC_014633	TTGTAG	2	12	845163	845174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310780473
380	NC_014633	CTGATG	2	12	849328	849339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310780479
381	NC_014633	ATGTCA	2	12	852157	852168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780482
382	NC_014633	ACTTTC	2	12	857570	857581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310780486
383	NC_014633	ACATCG	2	12	860158	860169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310780489
384	NC_014633	GCTGTT	2	12	865225	865236	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	310780494
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386	NC_014633	TCCTGC	2	12	866343	866354	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310780495
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389	NC_014633	CTGCTT	2	12	874519	874530	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310780503
390	NC_014633	TTTTTC	2	12	876920	876931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780506
391	NC_014633	TAGATG	2	12	880115	880126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310780509
392	NC_014633	CTTTAT	2	12	882050	882061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
393	NC_014633	TCATAT	2	12	899966	899977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310780529
394	NC_014633	AAAGAG	2	12	902375	902386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
395	NC_014633	GATATA	2	12	904029	904040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310780532
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398	NC_014633	TCTCCT	2	12	916573	916584	0 %	50 %	0 %	50 %	310780543
399	NC_014633	AAATTT	2	12	917718	917729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_014633	AATAAA	2	12	922183	922194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310780548
401	NC_014633	AGCTCT	2	12	922940	922951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310780549
402	NC_014633	TATGGA	2	12	923480	923491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310780549
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409	NC_014633	TATAAA	2	12	952373	952384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_014633	TTTTCT	2	12	952771	952782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780570
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414	NC_014633	TCTAAA	2	12	957519	957530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
415	NC_014633	TCAATA	2	12	959181	959192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310780577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.