MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014633	TAAAAA	2	12	10410	10421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014633	AATATA	2	12	36604	36615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014633	TATTTT	2	12	41151	41162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014633	CTTTTA	2	12	56177	56188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014633	TATAAA	2	12	60525	60536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014633	TAAAAA	2	12	69088	69099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014633	TGAAAG	2	12	84121	84132	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014633	TTTTGT	2	12	90203	90214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014633	GTATTT	2	12	95114	95125	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014633	TAAAAA	2	12	118224	118235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014633	TAAACA	2	12	125781	125792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014633	CTAAAT	2	12	142594	142605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014633	AGTTAT	2	12	153778	153789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014633	TTATAT	2	12	156306	156317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014633	AAAAAT	2	12	168380	168391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014633	TAAAAT	2	12	173012	173023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014633	AAATTA	2	12	177033	177044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014633	ACTTTA	2	12	211365	211376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014633	TAAAAA	2	12	222083	222094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014633	ATTTTA	2	12	231527	231538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014633	TAAAAT	2	12	232805	232816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014633	CCTTTT	2	12	243546	243557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014633	ATTTGA	2	12	245075	245086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014633	AATTGA	2	12	247438	247449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014633	ATTAAA	2	12	259772	259783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014633	AAATAA	2	12	266847	266858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014633	TAAAGA	2	12	312471	312482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014633	ATATTT	2	12	317939	317950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014633	ATTTTT	2	12	325818	325829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014633	AAAAAT	2	12	363754	363765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014633	TAAAAA	2	12	396767	396778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014633	CTTTTT	2	12	409452	409463	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014633	ATTTTT	2	12	419586	419597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014633	ATGCAG	2	12	449739	449750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014633	ATATTT	2	12	484614	484625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014633	TATATT	2	12	513458	513469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014633	AATTTA	2	12	542155	542166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014633	ACTCTA	2	12	563049	563060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014633	TAATAT	2	12	565470	565481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014633	ATTTTT	2	12	586457	586468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014633	CAAATA	2	12	586540	586551	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014633	ATTAAA	2	12	602925	602936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014633	TATTTA	2	12	603336	603347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014633	TAAATT	2	12	616389	616400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014633	ATTACA	2	12	622843	622854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014633	TAAAAA	2	12	666578	666589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014633	AGAAAA	2	12	667809	667820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014633	AATCAA	2	12	680979	680990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014633	ATTCAT	2	12	684831	684842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014633	ATATGA	2	12	701898	701909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014633	ATTTCT	2	12	706537	706548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014633	TGCCAT	2	12	708421	708432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014633	TATAAA	2	12	742570	742581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014633	TCGTAC	2	12	744577	744588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014633	GAATAA	2	12	770060	770071	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014633	AATTTT	2	12	781524	781535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014633	AATTTA	2	12	818164	818175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014633	TGTTCC	2	12	840238	840249	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014633	CCATCA	2	12	841456	841467	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014633	CTTTAT	2	12	882050	882061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014633	AAAGAG	2	12	902375	902386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014633	AAATTT	2	12	917718	917729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014633	CAATAT	2	12	952332	952343	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014633	TATAAA	2	12	952373	952384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014633	TCTAAA	2	12	957519	957530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.