MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014633	ATTAAT	2	12	2300	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	310779697
2	NC_014633	TCCACT	2	12	4792	4803	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310779701
3	NC_014633	AATATA	2	12	9604	9615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779706
4	NC_014633	ATTCTC	2	12	12372	12383	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779711
5	NC_014633	TTTCTT	2	12	13153	13164	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779713
6	NC_014633	TGTATC	2	12	14774	14785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310779715
7	NC_014633	ATTCAA	2	12	17852	17863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310779719
8	NC_014633	TTTTTC	2	12	19356	19367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779722
9	NC_014633	AATCAA	2	12	22460	22471	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310779726
10	NC_014633	TATCTT	2	12	27014	27025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779734
11	NC_014633	TTCACT	2	12	29980	29991	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779737
12	NC_014633	ATCTAT	2	12	30493	30504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779737
13	NC_014633	CTCCTT	2	12	30830	30841	0 %	50 %	0 %	50 %	310779738
14	NC_014633	TCATAC	2	12	36283	36294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310779744
15	NC_014633	AGTACC	2	12	36523	36534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779745
16	NC_014633	TTTCTT	2	12	37806	37817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779747
17	NC_014633	CATTTT	2	12	39555	39566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779753
18	NC_014633	CTCTTC	2	12	39703	39714	0 %	50 %	0 %	50 %	310779753
19	NC_014633	AATTTT	2	12	41941	41952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779757
20	NC_014633	TGAAAT	2	12	48714	48725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310779770
21	NC_014633	CTAGAA	2	12	57221	57232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779779
22	NC_014633	GAAAAA	2	12	57287	57298	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310779779
23	NC_014633	GAAAAT	2	12	62843	62854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310779786
24	NC_014633	ATTGAT	2	12	64547	64558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779787
25	NC_014633	TGCCAT	2	12	66237	66248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310779790
26	NC_014633	GTAAGA	2	12	66631	66642	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779790
27	NC_014633	TGATAT	2	12	66690	66701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779790
28	NC_014633	ATTTTT	2	12	75860	75871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779795
29	NC_014633	ATAAAT	2	12	77204	77215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779796
30	NC_014633	GAATGG	2	12	80919	80930	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310779799
31	NC_014633	TTATTT	2	12	85868	85879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779803
32	NC_014633	ACCTTT	2	12	90392	90403	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779805
33	NC_014633	AAAATA	2	12	92496	92507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779808
34	NC_014633	TGCAAC	2	12	93729	93740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779809
35	NC_014633	CTAGGT	2	12	97551	97562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310779812
36	NC_014633	TAGAGA	2	12	98693	98704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779814
37	NC_014633	CTTGAA	2	12	100624	100635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310779816
38	NC_014633	TTTTAA	2	12	101426	101437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779818
39	NC_014633	CAAATC	2	12	102083	102094	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310779820
40	NC_014633	ACTTTT	2	12	102412	102423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779820
41	NC_014633	ATGAGT	2	12	105268	105279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779824
42	NC_014633	GCTGTG	2	12	105971	105982	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310779825
43	NC_014633	ATCATT	2	12	109207	109218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779829
44	NC_014633	GCTGCG	2	12	109304	109315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310779829
45	NC_014633	TTTCTT	2	12	111977	111988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779830
46	NC_014633	TCTAAA	2	12	112203	112214	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310779830
47	NC_014633	TAATTA	2	12	114356	114367	50 %	50 %	0 %	0 %	310779835
48	NC_014633	TTAGGT	2	12	116119	116130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310779838
49	NC_014633	TTTAAA	2	12	117805	117816	50 %	50 %	0 %	0 %	310779841
50	NC_014633	AATCAG	2	12	119137	119148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779843
51	NC_014633	TTTTAT	2	12	119326	119337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779843
52	NC_014633	TTTCCT	2	12	129299	129310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310779855
53	NC_014633	CTTCGG	2	12	129365	129376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310779855
54	NC_014633	TTTAAT	2	12	132225	132236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779859
55	NC_014633	GTATAG	2	12	134281	134292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779859
56	NC_014633	TTTTTC	2	12	135140	135151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779860
57	NC_014633	TTTCCT	2	12	136099	136110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310779860
58	NC_014633	TTCCAT	2	12	136579	136590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310779860
59	NC_014633	CAGTAA	2	12	138558	138569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779865
60	NC_014633	ATAGGT	2	12	148353	148364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779873
61	NC_014633	CGGTGG	2	12	149680	149691	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310779874
62	NC_014633	ATTTTT	2	12	150961	150972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779875
63	NC_014633	TAAAAA	2	12	162072	162083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779881
64	NC_014633	GCAGGA	2	12	162861	162872	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310779882
65	NC_014633	TGCAAT	2	12	163700	163711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310779883
66	NC_014633	TACATT	2	12	173193	173204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779893
67	NC_014633	TCCCAT	2	12	173460	173471	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310779893
68	NC_014633	CTTTTT	2	12	176330	176341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779896
69	NC_014633	CTACAG	2	12	179277	179288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779898
70	NC_014633	CAACCT	2	12	179391	179402	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	310779898
71	NC_014633	TAATTA	2	12	181615	181626	50 %	50 %	0 %	0 %	310779900
72	NC_014633	ACTGCA	2	12	185130	185141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310779903
73	NC_014633	TTATCA	2	12	187306	187317	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779904
74	NC_014633	CTTAAT	2	12	189305	189316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779906
75	NC_014633	TGGATT	2	12	190335	190346	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310779907
76	NC_014633	TACAAT	2	12	190389	190400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310779907
77	NC_014633	AAGACT	2	12	192014	192025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779909
78	NC_014633	ATTAAA	2	12	195424	195435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779911
79	NC_014633	CATTGA	2	12	196314	196325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310779912
80	NC_014633	TATATT	2	12	197204	197215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779913
81	NC_014633	ATTTTT	2	12	197285	197296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779913
82	NC_014633	TGGTTT	2	12	197809	197820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310779913
83	NC_014633	CTTCCT	2	12	198634	198645	0 %	50 %	0 %	50 %	310779914
84	NC_014633	TGAATT	2	12	199035	199046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779915
85	NC_014633	GTTTCT	2	12	206692	206703	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310779919
86	NC_014633	ATTTTT	2	12	207027	207038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310779919
87	NC_014633	TAAAAA	2	12	208393	208404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779920
88	NC_014633	AATTGA	2	12	210213	210224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310779922
89	NC_014633	CTGGAG	2	12	212206	212217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310779924
90	NC_014633	GCAGAA	2	12	214693	214704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310779926
91	NC_014633	AAGTTG	2	12	216192	216203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310779928
92	NC_014633	AACTAC	2	12	216224	216235	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310779928
93	NC_014633	TTTAAC	2	12	216941	216952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779928
94	NC_014633	GAAGTG	2	12	221341	221352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310779932
95	NC_014633	AAAATA	2	12	223846	223857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779935
96	NC_014633	CCGTTT	2	12	226752	226763	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310779938
97	NC_014633	TTACTT	2	12	229281	229292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779941
98	NC_014633	CTTTTG	2	12	229305	229316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310779941
99	NC_014633	AATTAA	2	12	231441	231452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779943
100	NC_014633	GGAATA	2	12	236208	236219	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779947
101	NC_014633	TTTGAA	2	12	241391	241402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779950
102	NC_014633	TTTAGA	2	12	248861	248872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779955
103	NC_014633	AGATAA	2	12	252237	252248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310779958
104	NC_014633	TAAATT	2	12	255774	255785	50 %	50 %	0 %	0 %	310779960
105	NC_014633	AAAAGA	2	12	260056	260067	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310779965
106	NC_014633	TAAAAT	2	12	266667	266678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310779972
107	NC_014633	ATTTAT	2	12	267213	267224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310779973
108	NC_014633	GAAATA	2	12	267940	267951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310779973
109	NC_014633	TAGATT	2	12	268325	268336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310779973
110	NC_014633	AAATAA	2	12	269802	269813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310779974
111	NC_014633	TTTTTC	2	12	273891	273902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310779976
112	NC_014633	ATCTAT	2	12	284555	284566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310779984
113	NC_014633	GGTAAA	2	12	287633	287644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779986
114	NC_014633	AAAGTC	2	12	291797	291808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310779988
115	NC_014633	GACAGA	2	12	301141	301152	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310779994
116	NC_014633	GAATAG	2	12	301153	301164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310779994
117	NC_014633	AAAAAG	2	12	301469	301480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310779994
118	NC_014633	TACCGT	2	12	302466	302477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310779995
119	NC_014633	ACTCTG	2	12	302537	302548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310779995
120	NC_014633	ATTTTC	2	12	303730	303741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310779997
121	NC_014633	AGTGGA	2	12	311207	311218	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310780004
122	NC_014633	AGATGG	2	12	314244	314255	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310780005
123	NC_014633	GGAATA	2	12	315395	315406	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780005
124	NC_014633	GGAACA	2	12	321276	321287	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310780010
125	NC_014633	TTCTGT	2	12	322828	322839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310780012
126	NC_014633	TAAATA	2	12	326727	326738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310780017
127	NC_014633	AGAAAA	2	12	327956	327967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310780019
128	NC_014633	CGGGAT	2	12	327988	327999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310780019
129	NC_014633	ATCTGA	2	12	328610	328621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780020
130	NC_014633	TTTTTC	2	12	331485	331496	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780023
131	NC_014633	TAAAGG	2	12	333100	333111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780023
132	NC_014633	AATTTT	2	12	333384	333395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310780023
133	NC_014633	TTCCTG	2	12	334087	334098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310780023
134	NC_014633	TAGGGA	2	12	337088	337099	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310780025
135	NC_014633	CAAGTC	2	12	337435	337446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310780025
136	NC_014633	GTCTTT	2	12	337514	337525	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310780025
137	NC_014633	TTAAAT	2	12	337671	337682	50 %	50 %	0 %	0 %	310780025
138	NC_014633	AAGGAA	2	12	342630	342641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310780029
139	NC_014633	TTAATT	2	12	351016	351027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310780035
140	NC_014633	ATGGCC	2	12	352668	352679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310780035
141	NC_014633	TTTGAA	2	12	352787	352798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310780035
142	NC_014633	TCCCAA	2	12	359093	359104	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	310780038
143	NC_014633	GCCATT	2	12	359834	359845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310780039
144	NC_014633	AAGAAA	2	12	360063	360074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310780039
145	NC_014633	TCTCAT	2	12	365538	365549	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310780042
146	NC_014633	GGGAGA	2	12	372491	372502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310780047
147	NC_014633	AAGACT	2	12	373425	373436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310780049
148	NC_014633	CAGGAG	2	12	376989	377000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310780051
149	NC_014633	CTATAT	2	12	381430	381441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310780057
150	NC_014633	CAGGAG	2	12	386263	386274	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310780062
151	NC_014633	AAAGAC	2	12	387057	387068	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310780062
152	NC_014633	TATTTA	2	12	389878	389889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310780065
153	NC_014633	CACTGC	2	12	391457	391468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310780067
154	NC_014633	ATAGAG	2	12	392044	392055	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780068
155	NC_014633	ATTTCT	2	12	396824	396835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310780073
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157	NC_014633	AGTAAA	2	12	398922	398933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310780074
158	NC_014633	TCTCCG	2	12	405264	405275	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310780081
159	NC_014633	AATATG	2	12	411503	411514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310780086
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172	NC_014633	GCTGTA	2	12	451057	451068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310780121
173	NC_014633	AATAGG	2	12	455382	455393	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310780126
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181	NC_014633	CTACAG	2	12	473755	473766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310780148
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183	NC_014633	CCTGCT	2	12	479520	479531	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310780153
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222	NC_014633	TATTTT	2	12	594112	594123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310780261
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224	NC_014633	CTTATC	2	12	608180	608191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310780276
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226	NC_014633	CTTCTC	2	12	611549	611560	0 %	50 %	0 %	50 %	310780278
227	NC_014633	AGAAAA	2	12	617492	617503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310780280
228	NC_014633	GAGAAG	2	12	618363	618374	50 %	0 %	50 %	0 %	310780280
229	NC_014633	GAAAAA	2	12	625097	625108	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310780285
230	NC_014633	AGTTAT	2	12	626925	626936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310780286
231	NC_014633	ATATTG	2	12	635130	635141	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310780292
232	NC_014633	TTGATT	2	12	646554	646565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	310780303
233	NC_014633	TTCTGT	2	12	647343	647354	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310780303
234	NC_014633	TAAGGC	2	12	651175	651186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310780306
235	NC_014633	TAAGCT	2	12	652548	652559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310780306
236	NC_014633	TTTTCT	2	12	653126	653137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310780306
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337	NC_014633	TCTCCT	2	12	916573	916584	0 %	50 %	0 %	50 %	310780543
338	NC_014633	AATAAA	2	12	922183	922194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310780548
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347	NC_014633	TTTATT	2	12	952875	952886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310780570
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350	NC_014633	TCAATA	2	12	959181	959192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310780577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.