MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 chromosome

Total Repeats: 788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014632	ATCTAA	2	12	1781	1792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310777806
2	NC_014632	GAAAAA	2	12	3648	3659	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777809
3	NC_014632	AAAATA	2	12	4299	4310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310777810
4	NC_014632	GGAAGA	2	12	7202	7213	50 %	0 %	50 %	0 %	310777812
5	NC_014632	AAAAGA	2	12	11113	11124	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777816
6	NC_014632	TAAAAA	2	12	14310	14321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310777817
7	NC_014632	ATGAAT	2	12	14685	14696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777818
8	NC_014632	TGCAGC	2	12	16838	16849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310777819
9	NC_014632	TGCAGT	3	18	18353	18370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310777821
10	NC_014632	CTCTTG	2	12	24880	24891	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310777827
11	NC_014632	AAAGCA	2	12	25941	25952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310777828
12	NC_014632	AATAAA	2	12	26016	26027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310777828
13	NC_014632	TCTTTT	2	12	26204	26215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310777829
14	NC_014632	TGGTAC	2	12	32763	32774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310777836
15	NC_014632	CGGTAC	2	12	33054	33065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310777836
16	NC_014632	AAAAGT	2	12	38934	38945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310777840
17	NC_014632	AAGCTG	2	12	39494	39505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310777840
18	NC_014632	TATTTT	2	12	42454	42465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310777843
19	NC_014632	GGATAT	2	12	44458	44469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310777844
20	NC_014632	TTCTAC	2	12	45303	45314	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310777848
21	NC_014632	AAAGGT	2	12	46148	46159	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310777849
22	NC_014632	ATAACT	2	12	46481	46492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310777850
23	NC_014632	TCATAT	2	12	48041	48052	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310777852
24	NC_014632	AAGATT	2	12	53217	53228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777858
25	NC_014632	TAAAAA	2	12	54317	54328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310777858
26	NC_014632	GATCAG	2	12	63608	63619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310777865
27	NC_014632	GATAAG	2	12	64619	64630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310777865
28	NC_014632	TTTAGG	2	12	68436	68447	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310777868
29	NC_014632	GGAAAA	2	12	76982	76993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310777875
30	NC_014632	TAAATA	2	12	77911	77922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310777876
31	NC_014632	AGAGGA	2	12	78673	78684	50 %	0 %	50 %	0 %	310777877
32	NC_014632	CTTTAT	2	12	87933	87944	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310777886
33	NC_014632	ACATCG	2	12	91977	91988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310777891
34	NC_014632	AAAAGA	2	12	101412	101423	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777902
35	NC_014632	AAATAA	2	12	105487	105498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310777906
36	NC_014632	TGTAGT	2	12	107137	107148	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310777908
37	NC_014632	ATATTC	2	12	114420	114431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310777914
38	NC_014632	GAAACA	2	12	118518	118529	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310777918
39	NC_014632	GCTTTT	2	12	130204	130215	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310777928
40	NC_014632	ATGAGT	2	12	141421	141432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310777937
41	NC_014632	TCCTAC	2	12	145150	145161	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310777939
42	NC_014632	TTTTCT	2	12	146220	146231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310777940
43	NC_014632	ATGAAT	2	12	146240	146251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777940
44	NC_014632	TTTGTT	2	12	148086	148097	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	310777942
45	NC_014632	AAAGTT	2	12	150756	150767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777944
46	NC_014632	TACCTA	2	12	152882	152893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310777946
47	NC_014632	AAGCCA	2	12	154100	154111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	310777947
48	NC_014632	GAAAGA	2	12	155597	155608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310777948
49	NC_014632	TAATAG	2	12	156607	156618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777948
50	NC_014632	GATTTT	2	12	158507	158518	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	310777949
51	NC_014632	GTATAG	2	12	162432	162443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310777953
52	NC_014632	TTAAGG	2	12	163674	163685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310777954
53	NC_014632	GGAAGA	2	12	165676	165687	50 %	0 %	50 %	0 %	310777956
54	NC_014632	AAAAGT	2	12	166770	166781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310777956
55	NC_014632	ATATGA	2	12	168187	168198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777957
56	NC_014632	AAGATG	2	12	171240	171251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310777959
57	NC_014632	GAAAAA	2	12	172123	172134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777961
58	NC_014632	GTAATA	2	12	172815	172826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777961
59	NC_014632	AGAAAA	2	12	174197	174208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777963
60	NC_014632	AAGCTT	2	12	174603	174614	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310777963
61	NC_014632	AAAAAG	2	12	184602	184613	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777972
62	NC_014632	ATTTGG	2	12	189670	189681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310777975
63	NC_014632	GTAGGA	2	12	196283	196294	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310777978
64	NC_014632	CAAAAA	2	12	197241	197252	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	310777980
65	NC_014632	GCATTT	2	12	198273	198284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310777981
66	NC_014632	AGCTGT	2	12	198506	198517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310777981
67	NC_014632	CTGTAG	2	12	198729	198740	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310777982
68	NC_014632	TGGACT	2	12	198847	198858	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310777982
69	NC_014632	TAAATG	2	12	202636	202647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310777983
70	NC_014632	AGTGAC	2	12	206135	206146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310777984
71	NC_014632	AGAGGG	2	12	207306	207317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310777985
72	NC_014632	TATAGC	2	12	211088	211099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310777990
73	NC_014632	AAAAGA	3	18	215592	215609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777993
74	NC_014632	GAAAAA	2	12	224575	224586	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310777998
75	NC_014632	GAATAA	2	12	229108	229119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310778002
76	NC_014632	AGAGGC	2	12	230763	230774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310778004
77	NC_014632	TAACAA	2	12	231223	231234	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310778005
78	NC_014632	TCTACA	2	12	236809	236820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310778011
79	NC_014632	TTTTCT	2	12	239320	239331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310778013
80	NC_014632	TTTATA	2	12	240130	240141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310778013
81	NC_014632	TATATT	2	12	240729	240740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310778013
82	NC_014632	CAAATA	2	12	243987	243998	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310778016
83	NC_014632	ATAAAA	2	12	246270	246281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310778017
84	NC_014632	ATAGAC	2	12	247683	247694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310778018
85	NC_014632	AAAATA	2	12	248215	248226	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310778018
86	NC_014632	TTACAA	2	12	248443	248454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	310778018
87	NC_014632	TATAAT	2	12	254616	254627	50 %	50 %	0 %	0 %	310778024
88	NC_014632	AATTTT	2	12	256255	256266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310778025
89	NC_014632	GGAATA	2	12	257102	257113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310778026
90	NC_014632	TTAGAA	2	12	264292	264303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310778031
91	NC_014632	AAAATA	2	12	264494	264505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310778031
92	NC_014632	AAAAGA	2	12	264693	264704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310778031
93	NC_014632	AAAAGA	2	12	265274	265285	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310778032
94	NC_014632	TTATTT	2	12	268296	268307	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310778035
95	NC_014632	TTTTTG	2	12	268382	268393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	310778035
96	NC_014632	CTAAAA	2	12	272465	272476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310778037
97	NC_014632	ATATAA	2	12	273533	273544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310778038
98	NC_014632	AAAATC	2	12	274615	274626	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	310778039
99	NC_014632	ATCATT	2	12	275642	275653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310778041
100	NC_014632	ATCATT	2	12	275959	275970	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310778042
101	NC_014632	ATATAG	2	12	276879	276890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310778043
102	NC_014632	AAAAAT	2	12	283216	283227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310778047
103	NC_014632	CTTCCT	2	12	288280	288291	0 %	50 %	0 %	50 %	310778053
104	NC_014632	AAAAGT	2	12	290643	290654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310778055
105	NC_014632	GAAAAA	2	12	301772	301783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	310778063
106	NC_014632	ATTTTG	2	12	308070	308081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	310778071
107	NC_014632	ATAAAA	2	12	310882	310893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310778073
108	NC_014632	CGATGA	2	12	311460	311471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310778073
109	NC_014632	GGTAGG	2	12	313086	313097	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	310778074
110	NC_014632	AAAATA	2	12	316360	316371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	310778076
111	NC_014632	GGAATT	2	12	316603	316614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310778077
112	NC_014632	AATGGG	2	12	319609	319620	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310778079
113	NC_014632	ATAAGG	2	12	324278	324289	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310778084
114	NC_014632	ATTATA	2	12	325920	325931	50 %	50 %	0 %	0 %	310778085
115	NC_014632	CTTTTT	2	12	326671	326682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310778085
116	NC_014632	AGTTGC	2	12	328484	328495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310778087
117	NC_014632	ATAGAC	2	12	329308	329319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310778088
118	NC_014632	GGTTTA	2	12	333693	333704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310778091
119	NC_014632	CTCAGT	2	12	336326	336337	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310778093
120	NC_014632	TCCTTA	2	12	339857	339868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310778096
121	NC_014632	CAAAAG	2	12	340523	340534	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310778096
122	NC_014632	AAGAGC	2	12	344788	344799	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310778101
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124	NC_014632	AAAGAT	2	12	347431	347442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310778104
125	NC_014632	AGCAAC	2	12	347659	347670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	310778104
126	NC_014632	ATAATT	2	12	349042	349053	50 %	50 %	0 %	0 %	310778105
127	NC_014632	ACACTG	2	12	352919	352930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310778108
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155	NC_014632	ATTTAA	2	12	445441	445452	50 %	50 %	0 %	0 %	310778197
156	NC_014632	TGTAGA	2	12	449616	449627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310778200
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232	NC_014632	AAAATG	2	12	657045	657056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310778380
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234	NC_014632	GAAAGA	2	12	659257	659268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310778382
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457	NC_014632	GCTTTT	2	12	1177411	1177422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310778884
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459	NC_014632	ATATTT	2	12	1178585	1178596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310778885
460	NC_014632	CAGTGA	2	12	1179757	1179768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310778886
461	NC_014632	TTCTTA	2	12	1180561	1180572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310778887
462	NC_014632	TCTACC	2	12	1180914	1180925	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310778887
463	NC_014632	TGGTAT	2	12	1181689	1181700	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	310778887
464	NC_014632	ACATCG	2	12	1188147	1188158	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310778895
465	NC_014632	TTTCCT	2	12	1189997	1190008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310778897
466	NC_014632	ATTTAT	2	12	1192027	1192038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310778899
467	NC_014632	TCTCAT	2	12	1192118	1192129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310778899
468	NC_014632	CTTTTT	2	12	1192565	1192576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310778899
469	NC_014632	GCTATT	2	12	1198453	1198464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310778906
470	NC_014632	TCCACT	2	12	1198782	1198793	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310778906
471	NC_014632	TCTTTT	2	12	1206023	1206034	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	310778912
472	NC_014632	ATACTT	2	12	1214130	1214141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310778918
473	NC_014632	GCTTTT	2	12	1215757	1215768	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310778920
474	NC_014632	GCTCCT	2	12	1220978	1220989	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	310778924
475	NC_014632	TAAATG	2	12	1221021	1221032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	310778924
476	NC_014632	ATTTGA	2	12	1226015	1226026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	310778926
477	NC_014632	TTATCT	2	12	1230126	1230137	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	310778930
478	NC_014632	CCTAGT	2	12	1232681	1232692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310778932
479	NC_014632	ACTGGC	2	12	1237083	1237094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310778934
480	NC_014632	GTATCA	2	12	1237247	1237258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310778934
481	NC_014632	AGTCAA	2	12	1237282	1237293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310778935
482	NC_014632	CCTGCA	2	12	1239214	1239225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310778938
483	NC_014632	AGTTTC	2	12	1240994	1241005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310778940
484	NC_014632	TCCTAT	2	12	1246869	1246880	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310778946
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486	NC_014632	CTCTTA	2	12	1250187	1250198	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310778950
487	NC_014632	TTTATT	2	12	1253329	1253340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	310778952
488	NC_014632	TGCTAT	2	12	1253854	1253865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310778952
489	NC_014632	TCAGTT	2	12	1255257	1255268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310778953
490	NC_014632	GCATGT	2	12	1255731	1255742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310778953
491	NC_014632	TCTATA	2	12	1256880	1256891	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	310778955
492	NC_014632	ACCAAA	2	12	1265381	1265392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310778961
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494	NC_014632	TACCTT	2	12	1268339	1268350	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	310778963
495	NC_014632	GTAAAA	2	12	1268823	1268834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	310778963
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