MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 chromosome

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014632	TGAGG	2	10	2243	2252	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014632	TATTT	2	10	17046	17055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014632	TAAAA	2	10	18936	18945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014632	ATTAA	2	10	28833	28842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014632	TTACT	2	10	29258	29267	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014632	TAGTT	2	10	31459	31468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014632	TTAAT	2	10	32104	32113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014632	TATTT	2	10	34143	34152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014632	AATAG	2	10	36315	36324	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014632	ATTTT	2	10	37734	37743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014632	AAACA	2	10	40300	40309	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014632	TAAAT	2	10	46273	46282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014632	ATAAA	2	10	48815	48824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014632	TATAT	2	10	51083	51092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014632	ATAAA	2	10	51096	51105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014632	TAGAA	2	10	61914	61923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014632	GATAA	2	10	69627	69636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014632	AAACT	2	10	83933	83942	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014632	GAATT	2	10	84810	84819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014632	TAAAA	2	10	84827	84836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014632	ATAAA	2	10	84840	84849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014632	TAAAT	2	10	90232	90241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014632	ATTGA	2	10	98038	98047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014632	ATAAA	2	10	102832	102841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014632	ATTTA	2	10	103949	103958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014632	TTAAA	2	10	105534	105543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014632	CTAAT	2	10	106738	106747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014632	GAAAA	2	10	106852	106861	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014632	ATAAA	2	10	114567	114576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014632	TAAAT	2	10	120023	120032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014632	ATTTT	2	10	137542	137551	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014632	GAAAA	2	10	139008	139017	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014632	ATTAA	2	10	145441	145450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014632	TGTCA	2	10	153889	153898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014632	ATTTT	2	10	164921	164930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014632	TCACT	2	10	165090	165099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014632	TTTAT	2	10	187379	187388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014632	TCGTG	2	10	191258	191267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014632	TGGGC	2	10	191401	191410	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014632	GGGAG	2	10	192481	192490	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014632	CAATA	2	10	195647	195656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014632	CCAAA	2	10	197890	197899	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014632	TAGGT	2	10	199164	199173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014632	TAAAA	2	10	206776	206785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014632	TCGTG	2	10	219734	219743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014632	TGGGC	2	10	219877	219886	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014632	GGGAG	2	10	220956	220965	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014632	TAAAA	2	10	224122	224131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014632	TTATT	2	10	224467	224476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014632	GTAAA	2	10	224542	224551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014632	ATTTA	2	10	229308	229317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014632	ATATT	2	10	229320	229329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014632	AAGTA	2	10	241218	241227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014632	TCGCT	2	10	241297	241306	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014632	TTTAA	2	10	242121	242130	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014632	AAATC	2	10	246460	246469	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014632	ATGTT	2	10	246492	246501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014632	ATTTA	2	10	254243	254252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014632	AAATT	2	10	262229	262238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014632	AAGAA	2	10	262749	262758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014632	TCTGA	2	10	263942	263951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014632	ATAAA	2	10	266839	266848	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014632	TAAAA	2	10	272678	272687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014632	AATTT	2	10	275249	275258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014632	ATTTT	2	10	278578	278587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014632	TTATA	2	10	279577	279586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014632	ATAAA	2	10	284699	284708	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014632	TATAA	3	15	292936	292950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014632	TAATA	2	10	326894	326903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014632	TTAAA	2	10	327907	327916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014632	CAAAC	2	10	331954	331963	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014632	ATTTT	2	10	334530	334539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014632	TTATT	2	10	341061	341070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014632	TTAAG	2	10	341440	341449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014632	CCTTA	2	10	349554	349563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014632	AAATA	2	10	349568	349577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014632	TAAAT	2	10	379406	379415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014632	AAGGC	2	10	380562	380571	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014632	AAATA	2	10	380615	380624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014632	AATTT	2	10	397206	397215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014632	ATGAA	2	10	397519	397528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014632	AGTTT	2	10	402410	402419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014632	TGATA	2	10	402516	402525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014632	CTTTT	2	10	409652	409661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014632	AATTA	2	10	409752	409761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014632	TAATT	2	10	424664	424673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014632	AGAAT	2	10	434600	434609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014632	TCGCT	2	10	452025	452034	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014632	TTAAA	2	10	457635	457644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014632	TTAAA	2	10	459896	459905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014632	GGGGT	2	10	462818	462827	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014632	AAAGG	2	10	469039	469048	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014632	TGAAA	2	10	470573	470582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014632	AAATT	2	10	472016	472025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014632	TAAAT	2	10	472048	472057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014632	TAAAT	2	10	494824	494833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014632	TTTTA	2	10	513369	513378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014632	ATTAT	2	10	517543	517552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014632	ATACC	2	10	517595	517604	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014632	TTTTG	2	10	519268	519277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014632	AATTT	2	10	524820	524829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014632	ATGAG	2	10	524924	524933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014632	GGATG	2	10	528347	528356	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014632	ATGAT	2	10	534695	534704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014632	TAAAA	2	10	540442	540451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014632	TAAAA	2	10	545601	545610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014632	TTATA	2	10	547932	547941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014632	ATTTT	2	10	547948	547957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014632	TAGTT	2	10	551353	551362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014632	TAAAA	2	10	558621	558630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014632	TTTAA	2	10	572615	572624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014632	AAATA	2	10	583663	583672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014632	TAAAA	2	10	602545	602554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014632	ATCAA	2	10	614178	614187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014632	ATTAA	2	10	623455	623464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014632	TAAAT	2	10	627665	627674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014632	TAGTT	2	10	628124	628133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014632	AAATT	2	10	637043	637052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014632	ATTAT	2	10	641495	641504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014632	AAAAT	2	10	645046	645055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014632	ATTTT	2	10	645632	645641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014632	AAAAT	2	10	645692	645701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014632	AATAG	2	10	664290	664299	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014632	TAGGA	2	10	664358	664367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014632	TTTAA	2	10	713175	713184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014632	ATATT	2	10	726088	726097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014632	AGCGA	2	10	730023	730032	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014632	TTATG	2	10	735743	735752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014632	GATTT	2	10	742884	742893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014632	TAAAA	2	10	764980	764989	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014632	AGCGA	2	10	805529	805538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014632	TTTGA	2	10	811204	811213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014632	CAAAA	2	10	811967	811976	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014632	TAAAA	2	10	826671	826680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014632	TAAAA	2	10	826926	826935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014632	TTAAG	2	10	829253	829262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014632	ATTAA	2	10	832245	832254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014632	AAATT	2	10	832255	832264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014632	AATTA	2	10	832559	832568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014632	AAATT	2	10	833221	833230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014632	TTATT	2	10	833387	833396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014632	TTACT	2	10	836782	836791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014632	AAATT	2	10	839202	839211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014632	AAATT	2	10	846389	846398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014632	CTTTA	2	10	870849	870858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014632	AAAAG	2	10	886488	886497	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014632	GAAAA	2	10	886504	886513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014632	AAAAT	2	10	893760	893769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014632	TAAAT	2	10	942128	942137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.