MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 plasmid S57

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014629	TCGAT	2	10	230	239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014629	TTGTT	2	10	766	775	0 %	80 %	20 %	0 %	312193366
3	NC_014629	ACTCA	2	10	1553	1562	40 %	20 %	0 %	40 %	312193368
4	NC_014629	TTATT	2	10	2485	2494	20 %	80 %	0 %	0 %	312193369
5	NC_014629	ATTTT	2	10	3192	3201	20 %	80 %	0 %	0 %	312193371
6	NC_014629	ATATT	2	10	4433	4442	40 %	60 %	0 %	0 %	312193372
7	NC_014629	TATAT	2	10	5510	5519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014629	AACAA	2	10	7866	7875	80 %	0 %	0 %	20 %	312193379
9	NC_014629	ATTAC	2	10	8306	8315	40 %	40 %	0 %	20 %	312193380
10	NC_014629	TGATT	2	10	11683	11692	20 %	60 %	20 %	0 %	312193389
11	NC_014629	AATCG	2	10	11996	12005	40 %	20 %	20 %	20 %	312193389
12	NC_014629	CATTC	2	10	12139	12148	20 %	40 %	0 %	40 %	312193389
13	NC_014629	ATGAT	2	10	12418	12427	40 %	40 %	20 %	0 %	312193390
14	NC_014629	AACCG	2	10	15964	15973	40 %	0 %	20 %	40 %	312193397
15	NC_014629	TTGGT	2	10	16554	16563	0 %	60 %	40 %	0 %	312193397
16	NC_014629	ACTAT	2	10	20588	20597	40 %	40 %	0 %	20 %	312193402
17	NC_014629	GGAAA	2	10	22537	22546	60 %	0 %	40 %	0 %	312193405
18	NC_014629	AACGT	2	10	23753	23762	40 %	20 %	20 %	20 %	312193405

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.