MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 plasmid S57

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014629	TAA	2	6	390	395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193365
2	NC_014629	TGA	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193365
3	NC_014629	ATT	2	6	476	481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193365
4	NC_014629	CCG	2	6	494	499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193365
5	NC_014629	CAC	2	6	537	542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193365
6	NC_014629	CTT	2	6	578	583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193365
7	NC_014629	AAC	2	6	613	618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193366
8	NC_014629	CAT	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193366
9	NC_014629	ACC	2	6	784	789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193366
10	NC_014629	CCA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193366
11	NC_014629	TTA	2	6	860	865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193366
12	NC_014629	TCT	2	6	922	927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193367
13	NC_014629	CGG	2	6	930	935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193367
14	NC_014629	GGA	2	6	943	948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193367
15	NC_014629	TGA	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193367
16	NC_014629	TTG	2	6	987	992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
17	NC_014629	TAG	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193367
18	NC_014629	TAC	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193367
19	NC_014629	TAA	2	6	1186	1191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193367
20	NC_014629	CGT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193367
21	NC_014629	TTG	2	6	1245	1250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
22	NC_014629	TTA	2	6	1264	1269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193367
23	NC_014629	CCT	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312193367
24	NC_014629	GTT	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
25	NC_014629	GTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193367
26	NC_014629	CTA	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193367
27	NC_014629	TCT	2	6	1462	1467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193367
28	NC_014629	TCA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193367
29	NC_014629	ATC	3	9	1572	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193368
30	NC_014629	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193368
31	NC_014629	TGA	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193369
32	NC_014629	AGA	2	6	2607	2612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193369
33	NC_014629	ATA	2	6	2623	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193369
34	NC_014629	TTG	2	6	2875	2880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193370
35	NC_014629	CAA	2	6	2967	2972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193371
36	NC_014629	ATA	2	6	3084	3089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193371
37	NC_014629	CAC	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193371
38	NC_014629	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193371
39	NC_014629	TTA	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193371
40	NC_014629	CTT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193371
41	NC_014629	TCT	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193371
42	NC_014629	TCT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193371
43	NC_014629	GCT	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193371
44	NC_014629	GTG	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193371
45	NC_014629	GAA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193371
46	NC_014629	TTA	3	9	3846	3854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193371
47	NC_014629	GAA	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193371
48	NC_014629	GAT	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193372
49	NC_014629	TAT	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193372
50	NC_014629	CAA	2	6	4281	4286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193372
51	NC_014629	CAT	2	6	4293	4298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193372
52	NC_014629	AAT	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193372
53	NC_014629	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193372
54	NC_014629	TAA	2	6	5249	5254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193374
55	NC_014629	GAT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193374
56	NC_014629	AGT	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193374
57	NC_014629	TGA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193374
58	NC_014629	TAA	2	6	5624	5629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193375
59	NC_014629	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193375
60	NC_014629	ATG	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
61	NC_014629	GAT	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
62	NC_014629	CGA	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193375
63	NC_014629	GTG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312193375
64	NC_014629	GGA	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312193375
65	NC_014629	AAT	2	6	5848	5853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193375
66	NC_014629	TGA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
67	NC_014629	TGA	3	9	5970	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193375
68	NC_014629	ATA	2	6	6000	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193375
69	NC_014629	CAG	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193376
70	NC_014629	ATA	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193376
71	NC_014629	CAC	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312193376
72	NC_014629	TAA	2	6	6139	6144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193376
73	NC_014629	TGT	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193377
74	NC_014629	ACG	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193377
75	NC_014629	TTA	2	6	7056	7061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193377
76	NC_014629	CAA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193377
77	NC_014629	CGG	2	6	7160	7165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193378
78	NC_014629	ATG	2	6	7243	7248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193378
79	NC_014629	CAA	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193378
80	NC_014629	CAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193378
81	NC_014629	TGT	2	6	7389	7394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193378
82	NC_014629	TGA	2	6	7404	7409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193378
83	NC_014629	TAA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193378
84	NC_014629	TAA	2	6	7530	7535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193378
85	NC_014629	AGC	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193379
86	NC_014629	TAA	2	6	7723	7728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193379
87	NC_014629	AAG	2	6	8158	8163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193380
88	NC_014629	TGA	2	6	8202	8207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193380
89	NC_014629	ATG	2	6	8261	8266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193380
90	NC_014629	TGA	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193381
91	NC_014629	ATA	2	6	8440	8445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193381
92	NC_014629	TGT	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193383
93	NC_014629	CTT	2	6	9156	9161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193383
94	NC_014629	TGA	2	6	9300	9305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193383
95	NC_014629	ATT	2	6	9406	9411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193383
96	NC_014629	CAA	2	6	9745	9750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193383
97	NC_014629	CGG	2	6	9776	9781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193383
98	NC_014629	TGA	2	6	9976	9981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193383
99	NC_014629	TTG	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193383
100	NC_014629	TAA	2	6	10126	10131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193384
101	NC_014629	TTA	2	6	10142	10147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193384
102	NC_014629	CTG	2	6	10572	10577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193385
103	NC_014629	CAA	2	6	10737	10742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312193386
104	NC_014629	ATG	2	6	10802	10807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193386
105	NC_014629	GCT	2	6	10887	10892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193386
106	NC_014629	ATC	2	6	11274	11279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193387
107	NC_014629	GCT	2	6	11501	11506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312193388
108	NC_014629	ATG	2	6	11528	11533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193388
109	NC_014629	GTT	2	6	11541	11546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193388
110	NC_014629	CTT	2	6	11707	11712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193389
111	NC_014629	CCG	2	6	11773	11778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193389
112	NC_014629	TAC	2	6	11779	11784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193389
113	NC_014629	TAA	2	6	11789	11794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193389
114	NC_014629	CTT	2	6	11830	11835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193389
115	NC_014629	TGA	2	6	11866	11871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193389
116	NC_014629	ATC	2	6	11891	11896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193389
117	NC_014629	AAT	2	6	12038	12043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193389
118	NC_014629	TCA	2	6	12123	12128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193389
119	NC_014629	ATA	2	6	12282	12287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193389
120	NC_014629	GAC	2	6	12733	12738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193392
121	NC_014629	GAA	2	6	12766	12771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193392
122	NC_014629	GAA	2	6	12823	12828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193392
123	NC_014629	GAA	2	6	12894	12899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193393
124	NC_014629	AGC	3	9	12904	12912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193393
125	NC_014629	ATG	2	6	13030	13035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193393
126	NC_014629	GAT	2	6	13092	13097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193393
127	NC_014629	ACG	2	6	13330	13335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193394
128	NC_014629	CGG	2	6	13390	13395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312193394
129	NC_014629	CGC	2	6	13414	13419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312193394
130	NC_014629	TGA	2	6	13429	13434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312193394
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252	NC_014629	TAA	2	6	23067	23072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193405
253	NC_014629	ACT	2	6	23083	23088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193405
254	NC_014629	AAT	2	6	23098	23103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193405
255	NC_014629	CAT	2	6	23149	23154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193405
256	NC_014629	ATA	2	6	23164	23169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312193405
257	NC_014629	ATC	2	6	23197	23202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312193405
258	NC_014629	TTC	2	6	23380	23385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312193405
259	NC_014629	GAA	2	6	23413	23418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193405
260	NC_014629	ACG	2	6	23496	23501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312193405
261	NC_014629	GTT	2	6	23705	23710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312193405
262	NC_014629	ATT	2	6	23788	23793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312193405
263	NC_014629	GAA	2	6	23837	23842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312193405

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.