MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP12

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014626	CTCGGC	2	12	1220	1231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830143
2	NC_014626	CGAGGC	2	12	2394	2405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830144
3	NC_014626	CAATAC	2	12	2651	2662	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	310830144
4	NC_014626	CGCAGG	2	12	2753	2764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830145
5	NC_014626	CGCCAG	2	12	4554	4565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830146
6	NC_014626	GTTGCC	2	12	5061	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830147
7	NC_014626	TGCGTC	2	12	11525	11536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830152
8	NC_014626	ATAGGG	2	12	12539	12550	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310830153
9	NC_014626	GGCATC	2	12	12764	12775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310830153
10	NC_014626	TAAAGG	2	12	14187	14198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310830154
11	NC_014626	GGGCAT	2	12	15429	15440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310830155
12	NC_014626	GGCCTC	2	12	16248	16259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830156
13	NC_014626	CCTTGG	2	12	17705	17716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830157
14	NC_014626	GCCAGC	2	12	21869	21880	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830162
15	NC_014626	ACCAGC	2	12	22109	22120	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310830162
16	NC_014626	ACCCGC	2	12	23570	23581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310830163
17	NC_014626	GATCGA	2	12	29250	29261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310830168
18	NC_014626	GGTGCG	2	12	32884	32895	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310830171
19	NC_014626	TGCTGG	2	12	33057	33068	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310830172
20	NC_014626	GCCTTG	2	12	34252	34263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830174
21	NC_014626	TTTTGC	2	12	38138	38149	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	310830178
22	NC_014626	GCCCCT	2	12	38361	38372	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	310830178
23	NC_014626	ATCGCG	2	12	40313	40324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310830181
24	NC_014626	CCAGCT	2	12	43955	43966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310830185
25	NC_014626	TGCCGC	2	12	44603	44614	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830186
26	NC_014626	CCGAGG	2	12	45707	45718	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830187
27	NC_014626	GCTGGC	2	12	49876	49887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830192
28	NC_014626	GCCCGC	2	12	51241	51252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310830193
29	NC_014626	ATCGTC	2	12	51529	51540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310830193
30	NC_014626	GCGCCT	2	12	51636	51647	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830193
31	NC_014626	CCAGCT	2	12	52265	52276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310830194
32	NC_014626	GGTCGG	2	12	52724	52735	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310830194
33	NC_014626	TTGATC	2	12	54378	54389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310830195
34	NC_014626	ATCAGC	2	12	61064	61075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310830203
35	NC_014626	AGATCA	2	12	64729	64740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310830207
36	NC_014626	CCTCGG	2	12	65545	65556	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830207
37	NC_014626	CTGGTC	2	12	65858	65869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830208
38	NC_014626	TCCTGT	2	12	66267	66278	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310830208
39	NC_014626	TGCTGG	2	12	66366	66377	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310830208
40	NC_014626	CCTCGG	2	12	67412	67423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830209
41	NC_014626	CGATGG	2	12	68091	68102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310830210
42	NC_014626	GTCATG	2	12	69044	69055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310830210
43	NC_014626	GGTGAT	2	12	69943	69954	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	310830211
44	NC_014626	ACGGTG	2	12	70802	70813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310830211
45	NC_014626	CGGCCT	2	12	73185	73196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830214
46	NC_014626	GCCCAG	2	12	73766	73777	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830215
47	NC_014626	ACCTCG	2	12	76165	76176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310830217
48	NC_014626	CGGGGG	2	12	78364	78375	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	310830219
49	NC_014626	GGGCCG	2	12	79014	79025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310830219
50	NC_014626	GACCTC	2	12	79757	79768	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310830220
51	NC_014626	CAAGGC	2	12	84259	84270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310830223
52	NC_014626	GGTGCG	2	12	89495	89506	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310830228
53	NC_014626	CGCCCA	2	12	91224	91235	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310830229
54	NC_014626	CCGATG	2	12	93883	93894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310830231
55	NC_014626	CGGGTG	2	12	94599	94610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	310830232
56	NC_014626	CATCAC	3	18	94829	94846	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	310830232
57	NC_014626	GTGCTG	2	12	94928	94939	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310830232
58	NC_014626	ACCGCC	2	12	96553	96564	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310830234
59	NC_014626	GCGGCA	2	12	98410	98421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830235
60	NC_014626	TCGGCC	3	18	98517	98534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830235
61	NC_014626	GGATGC	2	12	101435	101446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310830236
62	NC_014626	GGCGAT	2	12	103810	103821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310830239
63	NC_014626	AGAAAG	2	12	104170	104181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310830239
64	NC_014626	CCCGCC	2	12	104561	104572	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	310830239
65	NC_014626	TGTCAT	2	12	105878	105889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310830240
66	NC_014626	AGGGTC	2	12	106060	106071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310830240
67	NC_014626	CAGCGC	2	12	108614	108625	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830242
68	NC_014626	GAATGA	2	12	113741	113752	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	310830248
69	NC_014626	GGTGCC	2	12	114956	114967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830249
70	NC_014626	GTGGCC	2	12	115843	115854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830250
71	NC_014626	CTTTGC	2	12	115978	115989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	310830250
72	NC_014626	GGCAAA	2	12	116824	116835	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310830250
73	NC_014626	CGGCAC	2	12	121328	121339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830255
74	NC_014626	GCGCCT	2	12	121507	121518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830255
75	NC_014626	GACAAA	2	12	123302	123313	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	310830257
76	NC_014626	CGCGGG	2	12	123526	123537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310830257
77	NC_014626	TGAAGG	2	12	124108	124119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	310830257
78	NC_014626	CGGCGC	2	12	125068	125079	0 %	0 %	50 %	50 %	310830259
79	NC_014626	CAGCGA	2	12	128922	128933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310830263
80	NC_014626	TGGCAA	2	12	129239	129250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310830263
81	NC_014626	GGTCGC	2	12	129251	129262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830263
82	NC_014626	CCTCGG	2	12	131164	131175	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830266
83	NC_014626	GCAGCG	2	12	131941	131952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830266
84	NC_014626	GTCGAC	2	12	132395	132406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310830266
85	NC_014626	CAGTTC	2	12	138955	138966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	310830275
86	NC_014626	AACCTG	2	12	142387	142398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310830280
87	NC_014626	GCCGTC	2	12	146240	146251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830283
88	NC_014626	CTGCCG	2	12	146618	146629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830283
89	NC_014626	TCGAAG	2	12	147879	147890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310830284
90	NC_014626	AAAGCC	2	12	148521	148532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	310830284
91	NC_014626	ACAGGC	2	12	151320	151331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310830285
92	NC_014626	CGCCGG	2	12	161034	161045	0 %	0 %	50 %	50 %	310830293
93	NC_014626	CCTCGG	2	12	163104	163115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830295
94	NC_014626	CCCGAA	2	12	163325	163336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310830295
95	NC_014626	CAGCGC	2	12	165313	165324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830297
96	NC_014626	GAACAG	2	12	168848	168859	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310830301
97	NC_014626	GCGACC	2	12	170087	170098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830302
98	NC_014626	TTCCGG	2	12	170167	170178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830302
99	NC_014626	CGGCTT	2	12	170215	170226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830302
100	NC_014626	GCCGAG	2	12	172579	172590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830307
101	NC_014626	GGCGCG	2	12	176259	176270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310830311
102	NC_014626	GACTTT	2	12	181742	181753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	310830314
103	NC_014626	GCCGGT	2	12	181833	181844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830314
104	NC_014626	CACGGC	2	12	186247	186258	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830316
105	NC_014626	CCGCGA	2	12	186296	186307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830316
106	NC_014626	AGGCCA	2	12	186683	186694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310830316
107	NC_014626	GACCGA	2	12	186786	186797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310830316
108	NC_014626	TGGCGC	2	12	199350	199361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830324
109	NC_014626	CGCTGG	2	12	199455	199466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830324
110	NC_014626	GCACCC	2	12	199761	199772	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310830324
111	NC_014626	CGGCAT	2	12	200155	200166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310830325
112	NC_014626	ACCCTC	2	12	201246	201257	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	310830326
113	NC_014626	GACCTC	2	12	201888	201899	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310830326
114	NC_014626	AGGCCG	2	12	203049	203060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830327
115	NC_014626	GGCGCG	2	12	203744	203755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310830328
116	NC_014626	CGAGGC	3	18	207827	207844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830332
117	NC_014626	CCGAGA	2	12	208811	208822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310830333
118	NC_014626	GCGCCT	2	12	209751	209762	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830333
119	NC_014626	CTGGCG	2	12	210618	210629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830334
120	NC_014626	CGCTGG	2	12	219611	219622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310830342
121	NC_014626	AAGCCC	2	12	223331	223342	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310830345
122	NC_014626	TGATGC	2	12	223710	223721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310830345
123	NC_014626	CCCGAC	2	12	227207	227218	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310830347
124	NC_014626	CGCCTG	2	12	228064	228075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830348
125	NC_014626	GCACCT	2	12	231483	231494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310830351
126	NC_014626	GCCAGC	2	12	232562	232573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830351
127	NC_014626	GGGCTT	2	12	233457	233468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	310830353
128	NC_014626	CGCGCC	2	12	235760	235771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310830355
129	NC_014626	ACGCTG	2	12	236622	236633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310830356
130	NC_014626	CAGCGC	2	12	239489	239500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310830358
131	NC_014626	CCTGAA	2	12	240143	240154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310830359
132	NC_014626	ACGGCG	2	12	240724	240735	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310830359
133	NC_014626	CGCTGC	2	12	242166	242177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310830361
134	NC_014626	AAGCTG	2	12	242381	242392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310830361
135	NC_014626	CGATGA	2	12	242406	242417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310830361
136	NC_014626	GCCTTG	2	12	242499	242510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310830361

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.