MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP12

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014626	TACTT	2	10	10855	10864	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014626	GTGAA	2	10	14432	14441	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014626	GCCCC	2	10	22770	22779	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4	NC_014626	ATTTC	2	10	30079	30088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014626	ACTGG	2	10	41143	41152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014626	GGGCG	2	10	54865	54874	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014626	GCAGG	2	10	55260	55269	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014626	GGGCA	2	10	57223	57232	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014626	AGGGC	2	10	63116	63125	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014626	GGAAA	2	10	64251	64260	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014626	TGGCA	2	10	72571	72580	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014626	TCGAA	2	10	83469	83478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014626	CGGCG	2	10	109332	109341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014626	CCGCG	2	10	109698	109707	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014626	TATGA	2	10	110162	110171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014626	TCTTT	2	10	113651	113660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014626	CCCTC	2	10	152544	152553	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_014626	CCGGA	2	10	153493	153502	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014626	TGAAG	2	10	174205	174214	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014626	GGGTG	2	10	178817	178826	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014626	GGGCC	2	10	181173	181182	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014626	CGCGC	2	10	183930	183939	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014626	GCCCT	2	10	184969	184978	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_014626	GGCGC	2	10	185017	185026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014626	CATGG	2	10	187534	187543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014626	CGCTG	2	10	188978	188987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014626	GCCGC	2	10	193935	193944	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014626	TGGCA	2	10	194174	194183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014626	TTGGG	2	10	194231	194240	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014626	TGCGC	2	10	194724	194733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014626	CGATG	2	10	195344	195353	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014626	TCCTC	2	10	234662	234671	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.