MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ketogulonicigenium vulgare Y25 plasmid pYP12

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014626	CGATG	2	10	832	841	20 %	20 %	40 %	20 %	310830142
2	NC_014626	GCCCC	2	10	1380	1389	0 %	0 %	20 %	80 %	310830144
3	NC_014626	CATCG	2	10	1644	1653	20 %	20 %	20 %	40 %	310830144
4	NC_014626	TCGCC	2	10	2815	2824	0 %	20 %	20 %	60 %	310830145
5	NC_014626	GCCGC	2	10	2961	2970	0 %	0 %	40 %	60 %	310830145
6	NC_014626	CATCG	2	10	3359	3368	20 %	20 %	20 %	40 %	310830145
7	NC_014626	CCCCG	2	10	4922	4931	0 %	0 %	20 %	80 %	310830147
8	NC_014626	CCGGG	2	10	8731	8740	0 %	0 %	60 %	40 %	310830149
9	NC_014626	CAGCG	2	10	9158	9167	20 %	0 %	40 %	40 %	310830149
10	NC_014626	CCATG	2	10	18043	18052	20 %	20 %	20 %	40 %	310830158
11	NC_014626	TGATC	2	10	20684	20693	20 %	40 %	20 %	20 %	310830161
12	NC_014626	GGCGC	2	10	28022	28031	0 %	0 %	60 %	40 %	310830167
13	NC_014626	GAGCT	2	10	31064	31073	20 %	20 %	40 %	20 %	310830169
14	NC_014626	TATGG	2	10	31448	31457	20 %	40 %	40 %	0 %	310830170
15	NC_014626	TCGGC	2	10	33099	33108	0 %	20 %	40 %	40 %	310830172
16	NC_014626	CGCGC	2	10	33202	33211	0 %	0 %	40 %	60 %	310830172
17	NC_014626	TCGCG	2	10	33357	33366	0 %	20 %	40 %	40 %	310830173
18	NC_014626	GGCGC	2	10	34230	34239	0 %	0 %	60 %	40 %	310830174
19	NC_014626	GCCGC	2	10	35497	35506	0 %	0 %	40 %	60 %	310830175
20	NC_014626	GGCGA	2	10	36010	36019	20 %	0 %	60 %	20 %	310830176
21	NC_014626	AGCGC	2	10	42304	42313	20 %	0 %	40 %	40 %	310830183
22	NC_014626	GCGCG	2	10	47437	47446	0 %	0 %	60 %	40 %	310830189
23	NC_014626	CGCGG	3	15	49741	49755	0 %	0 %	60 %	40 %	310830192
24	NC_014626	GCGCC	2	10	49977	49986	0 %	0 %	40 %	60 %	310830192
25	NC_014626	CGCTT	2	10	49990	49999	0 %	40 %	20 %	40 %	310830192
26	NC_014626	TGCCC	2	10	51286	51295	0 %	20 %	20 %	60 %	310830193
27	NC_014626	GCTTG	2	10	51409	51418	0 %	40 %	40 %	20 %	310830193
28	NC_014626	GATCA	2	10	53109	53118	40 %	20 %	20 %	20 %	310830194
29	NC_014626	GGCGG	3	15	54347	54361	0 %	0 %	80 %	20 %	310830195
30	NC_014626	GGCGA	2	10	54479	54488	20 %	0 %	60 %	20 %	310830195
31	NC_014626	CCGGG	2	10	55014	55023	0 %	0 %	60 %	40 %	310830196
32	NC_014626	CCCGC	2	10	58401	58410	0 %	0 %	20 %	80 %	310830200
33	NC_014626	GATCG	2	10	58446	58455	20 %	20 %	40 %	20 %	310830200
34	NC_014626	GGCCG	2	10	58873	58882	0 %	0 %	60 %	40 %	310830200
35	NC_014626	TGCCG	2	10	59198	59207	0 %	20 %	40 %	40 %	310830200
36	NC_014626	GCCTC	2	10	59922	59931	0 %	20 %	20 %	60 %	310830201
37	NC_014626	CCAAG	2	10	61026	61035	40 %	0 %	20 %	40 %	310830203
38	NC_014626	TCGCC	2	10	61798	61807	0 %	20 %	20 %	60 %	310830204
39	NC_014626	GCCGC	2	10	63779	63788	0 %	0 %	40 %	60 %	310830206
40	NC_014626	TCGCC	2	10	64687	64696	0 %	20 %	20 %	60 %	310830207
41	NC_014626	CGGTG	2	10	65366	65375	0 %	20 %	60 %	20 %	310830207
42	NC_014626	GCGCG	2	10	67822	67831	0 %	0 %	60 %	40 %	310830210
43	NC_014626	GCCGC	2	10	68324	68333	0 %	0 %	40 %	60 %	310830210
44	NC_014626	GGGGC	2	10	68485	68494	0 %	0 %	80 %	20 %	310830210
45	NC_014626	TGCCG	2	10	69139	69148	0 %	20 %	40 %	40 %	310830210
46	NC_014626	ATCGC	2	10	71901	71910	20 %	20 %	20 %	40 %	310830213
47	NC_014626	TCAGG	2	10	72190	72199	20 %	20 %	40 %	20 %	310830213
48	NC_014626	GGCGA	2	10	74192	74201	20 %	0 %	60 %	20 %	310830215
49	NC_014626	ATCGG	2	10	74238	74247	20 %	20 %	40 %	20 %	310830215
50	NC_014626	ATGCG	2	10	74732	74741	20 %	20 %	40 %	20 %	310830216
51	NC_014626	GCGCC	2	10	75854	75863	0 %	0 %	40 %	60 %	310830217
52	NC_014626	GACCT	2	10	77547	77556	20 %	20 %	20 %	40 %	310830218
53	NC_014626	GGTCA	2	10	77787	77796	20 %	20 %	40 %	20 %	310830218
54	NC_014626	CCTCG	2	10	79508	79517	0 %	20 %	20 %	60 %	310830220
55	NC_014626	TGACC	2	10	80410	80419	20 %	20 %	20 %	40 %	310830220
56	NC_014626	CGGAT	2	10	80511	80520	20 %	20 %	40 %	20 %	310830220
57	NC_014626	GGCCG	2	10	82032	82041	0 %	0 %	60 %	40 %	310830221
58	NC_014626	TCTGT	2	10	93199	93208	0 %	60 %	20 %	20 %	310830230
59	NC_014626	CACCG	2	10	93363	93372	20 %	0 %	20 %	60 %	310830230
60	NC_014626	CGGGC	2	10	94552	94561	0 %	0 %	60 %	40 %	310830232
61	NC_014626	GATCA	2	10	95272	95281	40 %	20 %	20 %	20 %	310830233
62	NC_014626	GCCGC	2	10	95562	95571	0 %	0 %	40 %	60 %	310830233
63	NC_014626	AGCTG	2	10	98395	98404	20 %	20 %	40 %	20 %	310830235
64	NC_014626	GCGTT	2	10	98674	98683	0 %	40 %	40 %	20 %	310830235
65	NC_014626	CGCAT	2	10	98946	98955	20 %	20 %	20 %	40 %	310830235
66	NC_014626	TTGCC	2	10	99049	99058	0 %	40 %	20 %	40 %	310830235
67	NC_014626	CAAGC	2	10	99106	99115	40 %	0 %	20 %	40 %	310830235
68	NC_014626	GGCCG	2	10	99161	99170	0 %	0 %	60 %	40 %	310830235
69	NC_014626	CGATC	2	10	99245	99254	20 %	20 %	20 %	40 %	310830235
70	NC_014626	GCCGC	2	10	99992	100001	0 %	0 %	40 %	60 %	310830235
71	NC_014626	GGCGC	2	10	100665	100674	0 %	0 %	60 %	40 %	310830236
72	NC_014626	GGCGC	2	10	101193	101202	0 %	0 %	60 %	40 %	310830236
73	NC_014626	GGCGA	2	10	103913	103922	20 %	0 %	60 %	20 %	310830239
74	NC_014626	CCAGA	2	10	104017	104026	40 %	0 %	20 %	40 %	310830239
75	NC_014626	GAACC	2	10	105467	105476	40 %	0 %	20 %	40 %	310830240
76	NC_014626	GATCG	2	10	106011	106020	20 %	20 %	40 %	20 %	310830240
77	NC_014626	CCGAT	2	10	106713	106722	20 %	20 %	20 %	40 %	310830241
78	NC_014626	TGTCG	2	10	110494	110503	0 %	40 %	40 %	20 %	310830245
79	NC_014626	CCGCG	2	10	111701	111710	0 %	0 %	40 %	60 %	310830246
80	NC_014626	TGCGC	2	10	114201	114210	0 %	20 %	40 %	40 %	310830248
81	NC_014626	GGGGC	2	10	115776	115785	0 %	0 %	80 %	20 %	310830250
82	NC_014626	CACCG	2	10	116044	116053	20 %	0 %	20 %	60 %	310830250
83	NC_014626	CGCGG	2	10	117153	117162	0 %	0 %	60 %	40 %	310830251
84	NC_014626	CAGTA	2	10	118297	118306	40 %	20 %	20 %	20 %	310830252
85	NC_014626	CGGAT	2	10	119456	119465	20 %	20 %	40 %	20 %	310830253
86	NC_014626	GCCGC	2	10	119651	119660	0 %	0 %	40 %	60 %	310830253
87	NC_014626	GGTCG	2	10	121045	121054	0 %	20 %	60 %	20 %	310830255
88	NC_014626	CGGCG	2	10	121535	121544	0 %	0 %	60 %	40 %	310830255
89	NC_014626	CGGCG	2	10	125409	125418	0 %	0 %	60 %	40 %	310830259
90	NC_014626	CACGG	2	10	125421	125430	20 %	0 %	40 %	40 %	310830259
91	NC_014626	CTGCC	2	10	125506	125515	0 %	20 %	20 %	60 %	310830259
92	NC_014626	CGGCG	2	10	126251	126260	0 %	0 %	60 %	40 %	310830260
93	NC_014626	GGCCG	2	10	126489	126498	0 %	0 %	60 %	40 %	310830261
94	NC_014626	GCGCC	2	10	126783	126792	0 %	0 %	40 %	60 %	310830261
95	NC_014626	CGCGC	2	10	126883	126892	0 %	0 %	40 %	60 %	310830261
96	NC_014626	ACCGC	2	10	128125	128134	20 %	0 %	20 %	60 %	310830262
97	NC_014626	TGATC	2	10	128663	128672	20 %	40 %	20 %	20 %	310830263
98	NC_014626	GCGAT	2	10	129316	129325	20 %	20 %	40 %	20 %	310830263
99	NC_014626	GGGTC	2	10	131398	131407	0 %	20 %	60 %	20 %	310830266
100	NC_014626	CGCTG	2	10	133275	133284	0 %	20 %	40 %	40 %	310830267
101	NC_014626	CTGGC	2	10	135908	135917	0 %	20 %	40 %	40 %	310830271
102	NC_014626	GCTGC	2	10	136353	136362	0 %	20 %	40 %	40 %	310830272
103	NC_014626	GGCGC	2	10	136779	136788	0 %	0 %	60 %	40 %	310830272
104	NC_014626	TCGGC	2	10	137731	137740	0 %	20 %	40 %	40 %	310830273
105	NC_014626	GTTGG	2	10	140888	140897	0 %	40 %	60 %	0 %	310830277
106	NC_014626	CCGGG	2	10	142952	142961	0 %	0 %	60 %	40 %	310830281
107	NC_014626	AGCGC	2	10	144091	144100	20 %	0 %	40 %	40 %	310830281
108	NC_014626	GACCG	2	10	145975	145984	20 %	0 %	40 %	40 %	310830283
109	NC_014626	GGCCG	2	10	145998	146007	0 %	0 %	60 %	40 %	310830283
110	NC_014626	TGGAA	2	10	146663	146672	40 %	20 %	40 %	0 %	310830283
111	NC_014626	CCCGC	2	10	147431	147440	0 %	0 %	20 %	80 %	310830284
112	NC_014626	GGTTC	2	10	149643	149652	0 %	40 %	40 %	20 %	310830284
113	NC_014626	GCGCG	2	10	151139	151148	0 %	0 %	60 %	40 %	310830285
114	NC_014626	AAGGT	2	10	151381	151390	40 %	20 %	40 %	0 %	310830285
115	NC_014626	TGCGC	2	10	151935	151944	0 %	20 %	40 %	40 %	310830285
116	NC_014626	AGCGC	3	15	155041	155055	20 %	0 %	40 %	40 %	310830288
117	NC_014626	GGCAA	2	10	157046	157055	40 %	0 %	40 %	20 %	310830288
118	NC_014626	GCACG	2	10	158039	158048	20 %	0 %	40 %	40 %	310830289
119	NC_014626	GAGCG	2	10	159631	159640	20 %	0 %	60 %	20 %	310830290
120	NC_014626	AGGCG	2	10	160528	160537	20 %	0 %	60 %	20 %	310830292
121	NC_014626	CGGCG	2	10	161063	161072	0 %	0 %	60 %	40 %	310830293
122	NC_014626	TGCGC	2	10	161352	161361	0 %	20 %	40 %	40 %	310830293
123	NC_014626	CGCAG	2	10	162549	162558	20 %	0 %	40 %	40 %	310830294
124	NC_014626	CGCGC	2	10	164703	164712	0 %	0 %	40 %	60 %	310830296
125	NC_014626	GACCT	2	10	165337	165346	20 %	20 %	20 %	40 %	310830297
126	NC_014626	ATTGA	2	10	165682	165691	40 %	40 %	20 %	0 %	310830297
127	NC_014626	CCCCG	2	10	165877	165886	0 %	0 %	20 %	80 %	310830298
128	NC_014626	ATGCG	2	10	166224	166233	20 %	20 %	40 %	20 %	310830298
129	NC_014626	GGCCC	2	10	169645	169654	0 %	0 %	40 %	60 %	310830301
130	NC_014626	AACGC	2	10	170726	170735	40 %	0 %	20 %	40 %	310830303
131	NC_014626	ATCGC	2	10	171802	171811	20 %	20 %	20 %	40 %	310830305
132	NC_014626	GATCT	2	10	172615	172624	20 %	40 %	20 %	20 %	310830307
133	NC_014626	GTTCT	2	10	173033	173042	0 %	60 %	20 %	20 %	310830308
134	NC_014626	CTCGG	2	10	174360	174369	0 %	20 %	40 %	40 %	310830310
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167	NC_014626	CGCGC	2	10	217615	217624	0 %	0 %	40 %	60 %	310830339
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174	NC_014626	CGATC	2	10	224512	224521	20 %	20 %	20 %	40 %	310830345
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177	NC_014626	TGCGC	2	10	227920	227929	0 %	20 %	40 %	40 %	310830348
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185	NC_014626	ATCCG	2	10	235921	235930	20 %	20 %	20 %	40 %	310830355
186	NC_014626	ACCAG	2	10	236085	236094	40 %	0 %	20 %	40 %	310830355
187	NC_014626	TGCCC	2	10	237110	237119	0 %	20 %	20 %	60 %	310830356
188	NC_014626	GATCG	2	10	237550	237559	20 %	20 %	40 %	20 %	310830357
189	NC_014626	CGCGC	2	10	238578	238587	0 %	0 %	40 %	60 %	310830357
190	NC_014626	GCGCC	2	10	239272	239281	0 %	0 %	40 %	60 %	310830358
191	NC_014626	CGCTG	2	10	240368	240377	0 %	20 %	40 %	40 %	310830359
192	NC_014626	GCGCG	2	10	240755	240764	0 %	0 %	60 %	40 %	310830359
193	NC_014626	GCCGC	2	10	241182	241191	0 %	0 %	40 %	60 %	310830359
194	NC_014626	TCGCC	2	10	242775	242784	0 %	20 %	20 %	60 %	310830361
195	NC_014626	AAATG	2	10	243633	243642	60 %	20 %	20 %	0 %	310830361

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.